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A k-mer-based pangenome approach for cataloging seed-storage-protein genes in wheat to facilitate genotype-to-phenotype prediction and improvement of end-use quality

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Molecular Plant 2024年第7期17卷 1038-1053页

作者： Zhaoheng Zhang Dan Liu Binyong Li wenxi Wang Jize Zhang Mingming Xin Zhaorong Hu Jie Liu Jinkun Du Huiru Peng Chenyang Hao Xueyong Zhang Zhongfu Ni Qixin Sun Weilong Guo Yingyin Yao Frontiers Science Center for Molecular Design Breeding Key Laboratory of Crop Heterosis and Utilization(MOE)and Bejing Key Laboratory of Crop Genetic ImprovementChina Agricultural UniversityBeijing100193China Key Laboratory of Crop Gene Resources and Breeding Institute of Crop ScienceChinese Academy of Agricultural SciencesBejingChina

Wheat is a staple foodfor more than 35%of the world's population,with wheatflourused to make hundreds of baked *** end-use quality is a major breeding target;however,improving it is especially time-consuming and ***,genes encoding seed-storage proteins(ssPs)form multigene families and are repetitive,with gaps commonplace in several genome *** overcome these barriers and efficiently identify superior wheat SSP alleles,we developed"PanSK"(Pan-SSP k-mer)for genotype-to-phenotype prediction based on an SsP-based pangenome *** uses 29-mer sequences that represent each ssP gene at the pangenomic level to reveal untapped diversity across landraces and modern ***-wide association studies with k-mers identified 23 Ssp genes associated with end-use quality that represent novel targets for *** evaluated the effect of rye secalin genes on end-use quality and found that removal of w-secalins from 1BL/1RS wheat translocation lines is associated with enhanced end-use ***,using machine-learning-based prediction inspired by PanSK,we predicted the quality phenotypes with high accuracy from genotypes *** study provides an effective approach for genome design based on ssP genes,enabling the breeding of wheat varieties with superior processing capabilities and improved end-use quality.

关键词： wheat seed-storage protein end-use quality k-mer pangenome genomic prediction

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Groundwater contaminant source identification considering unknown boundary condition based on an automated machine learning surrogate

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Geoscience Frontiers 2024年第1期15卷 402-416页

作者： Yaning Xu wenxi Lu Zidong Pan Chengming Luo Yukun Bai Shuwei Qiu Key Laboratory of Groundwater Resources and Environment Ministry of EducationJilin UniversityChangchun 130021China Jilin Provincial Key Laboratory of Water Resources and Environment Jilin UniversityChangchun 130021China College of New Energy and Environment Jilin UniversityChangchun 130021China School of Water Resources and Environment Hebei GEO UniversityShijiazhuang 050031China

Groundwater contamination source identification(GCSI)is a prerequisite for contamination risk evaluation and efficient groundwater contamination remediation *** boundary condition generally is set as known variables in previous GCSI ***,in many practical cases,the boundary condition is complicated and cannot be estimated accurately in *** the boundary condition as known variables may seriously deviate from the actual situation and lead to distorted identification *** the results of GCSI are affected by multiple factors,including contaminant source information,model parameters,boundary condition,***,if the boundary condition is not estimated accurately,other factors will also be estimated *** study focuses on the unknown boundary condition and proposed to identify three types of unknown variables(contaminant source information,model parameters and boundary condition)*** simulation-optimization(S-O)method is applied to GCSI,the huge computational load is usually reduced by building surrogate ***,when building surrogate models,the researchers need to select the models and optimize the hyperparameters to make the model powerful,which can be a lengthy *** automated machine learning(AutoML)method was used to build surrogate model,which automates the model selection and hyperparameter optimization in machine learning engineering,largely reducing human operations and saving *** accuracy of AutoML surrogate model is compared with the surrogate model used in eXtreme Gradient Boosting method(XGBoost),random forest method(RF),extra trees regressor method(ETR)and elasticnet method(EN)respectively,which are automatically selected in AutoML *** results show that the surrogate model constructed by AutoML method has the best accuracy compared with the other four *** study provides reliable and strong support for GCSI.

关键词： Groundwater contamination source Boundary condition Automated machine learning Surrogate model

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核反应堆系统多维度多物理场耦合有限元分析研究

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原子能科学技术 2024年第2期58卷 257-271页

作者：巫英伟贺亚男章静田文喜苏光辉秋穗正西安交通大学核科学与技术学院陕西省先进核能技术重点实验室陕西西安710049

核反应堆系统庞杂且运行环境严苛,存在多物理场耦合的复杂现象。早期开发的多物理场耦合软件具有扩展性和通用性不足的缺点。因此,搭建多物理场耦合框架,针对耦合问题中的关键技术开展研究,对加快我国自主化多物理场耦合平台开发进程具... 详细信息

核反应堆系统庞杂且运行环境严苛,存在多物理场耦合的复杂现象。早期开发的多物理场耦合软件具有扩展性和通用性不足的缺点。因此,搭建多物理场耦合框架,针对耦合问题中的关键技术开展研究,对加快我国自主化多物理场耦合平台开发进程具有重要意义。本文介绍了西安交通大学核反应堆热工水力研究室开发的核反应堆多维度多物理场耦合有限元分析平台,主要包含热工流体计算模型的开发、燃料性能分析技术的研究以及多物理场耦合框架的建立等工作。在热工流体计算方面,开展了核反应堆系统两相流分析模型和液态金属快堆子通道分析模型研究,开发了系统分析程序NUSAC和子通道分析程序FLARE;在燃料性能分析技术方面,开展了包覆颗粒弥散燃料和板状燃料的性能分析研究,开发了针对多种燃料的燃料性能分析程序BEEs;在多物理场耦合分析方面,搭建了多物理场耦合框架,结合热工水力、中子物理和燃料性能分析程序,实现了核反应堆多物理场耦合的精细分析。本文搭建的核反应堆系统多维度多物理场耦合有限元分析平台可为核反应堆系统多维度多物理场耦合高保真数值模拟分析提供有力支持。

关键词：多物理场有限元系统分析子通道燃料性能

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生物慢滤系统处理微污染水体的试验研究:两种滤料的对比

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复旦学报（自然科学版） 2024年第2期63卷 276-290页

作者：王文喜熊楠杨晓英何坚复旦大学环境科学与工程系上海200433

滤料的特性是决定生物慢滤系统对各类污染物去除效果的主要因素之一,然而国内外在不同滤料的生物慢滤系统净化效能比较和微生物机制方面的研究十分有限。本研究选用石英砂和活性炭作为生物慢滤系统的滤料,比较了它们在污染物去除和微生... 详细信息

滤料的特性是决定生物慢滤系统对各类污染物去除效果的主要因素之一,然而国内外在不同滤料的生物慢滤系统净化效能比较和微生物机制方面的研究十分有限。本研究选用石英砂和活性炭作为生物慢滤系统的滤料,比较了它们在污染物去除和微生物群落方面的异同,并在滤料堵塞时开展了反冲洗实验。结果表明,两柱均需要26 d完成挂膜。挂膜完成后,活性炭柱对浊度、CODMn和氨氮的去除率分别为92.18%、65.53%和99.37%,而石英砂柱的去除率分别为91.89%、42.91%和98.87%,活性炭柱的去除率优于石英砂柱。在挂膜期间,石英砂柱和活性炭柱都出现了亚硝酸盐氮和硝酸盐氮的积累现象。石英砂柱主要的优势菌群为A0839和Rhodobacter,而活性炭柱主要的优势菌群为Ramlibacter、Pseudomonas和Leptospirillum,从微生物群落的角度解释了活性炭柱对有机物和总氮的去除效果优于石英砂柱。活性炭滤料的穿透深度大于石英砂滤料,石英砂柱的滤料主要是前40 cm发生堵塞,而活性炭柱的滤料是前60 cm发生堵塞。在滤料膨胀系数为30%时,石英砂柱和活性炭柱的反冲洗强度分别为6.83 L·m^(-2)·s^(-1)、3.16 L·m^(-2)·s^(-1),活性炭柱的反冲洗水量比石英砂柱少了53.7%。本研究为农村地区慢滤系统滤料的选择提供了技术依据,为滤料的堵塞问题提供了经济可行的解决方案,为该技术在农村供水技术中的应用提供了技术支持。

关键词：微污染水生物慢滤滤料微生物群落挂膜

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正义观的隐喻视角:从罗尔斯、蒲鲁东到马克思

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北京大学学报（哲学社会科学版） 2024年第2期61卷 45-55页

作者：张文喜中国人民大学哲学院北京100872

当代政治哲学有一个预设前提是:“正义”这个语词有着概念的清晰性和明确性。但这仍然是“词”或者“辞”或者“话”意义上说的。罗尔斯讨论正义这个概念及其构造社会正义原则时,把理想性或者理性意义上衍生出的逻辑作为一种任务。隐喻... 详细信息

当代政治哲学有一个预设前提是:“正义”这个语词有着概念的清晰性和明确性。但这仍然是“词”或者“辞”或者“话”意义上说的。罗尔斯讨论正义这个概念及其构造社会正义原则时,把理想性或者理性意义上衍生出的逻辑作为一种任务。隐喻已经决定了这个概念的否定性运动。这一点也在蒲鲁东关于正义的定义之中明白地显示出来。在唯物史观中考察正义,隐喻思维作为人类把握正义概念的引导性思维,将资本主义社会视为有关正义女神的现代神话。它一方面作为资本主义以商品为基础的价值观体系的反射、投射、在场和方向性的显像,另一方面作为空洞的意识形态的浮光掠影、误导性的幻象、模仿,以及伪造逻辑这块正当性底布上的花卉。依“基础和上层建筑”这一隐喻,正义概念恰恰是指向隐喻或者从隐喻过渡到概念领域。正义的新的表现形式要能够出现,很显然就需要以更伟大的作为来产生效果。

关键词：正义隐喻概念史批判马克思

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爱与感性原则：马克思对费尔巴哈哲学改造的批判

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教学与研究 2024年第4期 16-27页

作者：张文喜中国人民大学哲学院

一度时期，费尔巴哈曾构成黑格尔与马克思之间思想内在联络的重要一环。在脱离黑格尔哲学时，费尔巴哈提出了从抽象的天上降到现实的地上的人类概念。这个概念深刻着古代天文学的寓意。它刚好与从天体秩序转向大地法则的视角相映衬。费... 详细信息

一度时期，费尔巴哈曾构成黑格尔与马克思之间思想内在联络的重要一环。在脱离黑格尔哲学时，费尔巴哈提出了从抽象的天上降到现实的地上的人类概念。这个概念深刻着古代天文学的寓意。它刚好与从天体秩序转向大地法则的视角相映衬。费尔巴哈哲学表明，既然各个天体都自成一类，地上的人就直观个体而言也当整全而非零碎。但从马克思描绘的人类的社会概念看，费尔巴哈仍然在直观中表达了神圣人的理念存在。为了解决建立在人们现实差别基础上的人与人统一问题，马克思告别哲学转向人的对象性活动。马克思讨论哲学命题外表之下的初衷是推进费尔巴哈哲学改造。明确现代世界中的我们应对人类因感性的类直观而存在的理念和人类因爱而存在的理念进行新的批判。特别是对费尔巴哈的两性哲学原则作出新的关注。费尔巴哈人学为人类作为一个整体一直盼望与自然和谐地生活提供了一篇序章。

关键词：感性爱天体秩序费尔巴哈马克思

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多层各向异性包壳力学模型开发与应用

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核动力工程 2024年第S1期45卷 110-116页

作者：张睿潇贺亚男巫英伟田文喜秋穗正苏光辉西安交通大学动力工程多相流国家重点实验室西安710049

由高致密度纯SiC和SiC纤维/基体复合材料(SiCf/SiC)组成的多层SiC复合包壳是当前事故容错燃料(ATF)包壳的热门选型,当前应用的典型燃料性能分析程序缺乏对于SiCf/SiC材料各向异性力学行为的建模能力,为提高燃料性能分析中复合SiC包壳力... 详细信息

由高致密度纯SiC和SiC纤维/基体复合材料(SiCf/SiC)组成的多层SiC复合包壳是当前事故容错燃料(ATF)包壳的热门选型,当前应用的典型燃料性能分析程序缺乏对于SiCf/SiC材料各向异性力学行为的建模能力,为提高燃料性能分析中复合SiC包壳力学计算的准确性,本文开发了一套适用于多层各向异性材料的力学模型,并将其集成到燃料性能分析程序FRAPCON4.0中,采用多层SiC包壳热力耦合算例对模型正确性进行了验证。实现了对具有正交各向异性力学特性和多轴类塑性行为的SiC复合包壳的力学计算功能,分析了双层SiC包壳燃料元件堆内稳态运行工况的性能。本研究建立的力学模型适用于任意多层圆柱结构燃料元件,并具备正交各向异性力学参数及行为的分析能力,可应用于多种新型燃料元件分析。

关键词： SiC包壳事故容错燃料(ATF) 芯块-包壳机械相互作用(PCMI) 各向异性材料

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去时空医疗时代特色医院制剂服务——基于矛盾论的互联网药学服务

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医药导报 2023年第3期42卷 443-446页

作者：何正贺雯茜熊微袁龙祁星星李娟方建国刘东华中科技大学同济医学院附属同济医院药学部武汉430030

在信息技术飞速发展的时代,医院和卫生事业正迅速冲破时间和空间束缚。人民群众日益增长的健康需求与市场缺如的特色医院制剂供给是目前民众医疗保障的矛盾之一。去时空医疗时代特色医院制剂的药学服务成为解决就医难、看病贵的一个重... 详细信息

在信息技术飞速发展的时代,医院和卫生事业正迅速冲破时间和空间束缚。人民群众日益增长的健康需求与市场缺如的特色医院制剂供给是目前民众医疗保障的矛盾之一。去时空医疗时代特色医院制剂的药学服务成为解决就医难、看病贵的一个重要策略。近年来,在国家“互联网+医疗服务”大政策背景支持下,各种模式互联网医院迅速发展。该文通过分析相关政策,立足华中科技大学同济医学院附属同济医院互联网医院及医院特色制剂服务实践,基于矛盾论论述特色的医院制剂,以期为全国互联网医院的医院制剂可持续发展提供参考。

关键词：去时空医疗互联网医院药学服务特色制剂

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女性议价能力与家庭储蓄行为——基于中国家庭金融调查数据的研究

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劳动经济研究 2024年第1期12卷 57-82页

作者：邹薇尹文玺武汉大学经济与管理学院

高储蓄率是中国经济的一个突出特征。2010-2020年中国国民储蓄率呈现明显下降趋势,而同期女性议价能力则出现上升趋势。基于此本文构建了女性议价能力与家庭储蓄行为的理论模型,从家庭内部权力分布的视角分析中国国民储蓄率下降的原因... 详细信息

高储蓄率是中国经济的一个突出特征。2010-2020年中国国民储蓄率呈现明显下降趋势,而同期女性议价能力则出现上升趋势。基于此本文构建了女性议价能力与家庭储蓄行为的理论模型,从家庭内部权力分布的视角分析中国国民储蓄率下降的原因。本文使用2011-2019年五期中国家庭金融调查(CHFS)数据进行实证检验,研究结果表明女性议价能力的提升显著降低了家庭储蓄规模。女性议价能力作用于家庭储蓄行为的机制包括教育支出、社会网络以及移动支付。本文结论丰富了女性议价能力影响家庭储蓄决策的理论框架,提供了探讨国民储蓄率变化和制定关注家庭内部不平等、建立扩大内需长效机制公共政策的微观机制和证据支持。

关键词：家庭内部不平等女性议价能力家庭储蓄行为

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基于等效励磁电感的SiC串联器件型中压双有源桥变换器的软开关技术

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电工技术学报 2024年第12期39卷 3732-3745页

作者：陈润田李楚杉姚文熙李武华何湘宁浙江大学电气工程学院杭州310027 浙江大学伊利诺伊大学厄巴纳香槟校区联合学院海宁314400

基于SiC串联器件的双有源桥变换器因具有开关损耗小、功率密度高、能量控制简单等优势,有望成为中压变换场景中实现高频隔离的优选方案。为保证SiC串联器件的可靠均压,各器件上并联大容值缓冲电容,然而该设计使变换器在传输功率较低时... 详细信息

基于SiC串联器件的双有源桥变换器因具有开关损耗小、功率密度高、能量控制简单等优势,有望成为中压变换场景中实现高频隔离的优选方案。为保证SiC串联器件的可靠均压,各器件上并联大容值缓冲电容,然而该设计使变换器在传输功率较低时难以实现零电压开通,严重影响变换器的整体效率和串联器件的可靠运行。该文通过构建SiC串联器件型中压双有源桥变换器多模态运行模型并深入分析其运行特性,提出一种基于等效励磁电感的无源软开关技术。所提技术可通过优化外接传输电感位置的方式实现中压侧等效励磁电感参数调节,从而在无额外控制前提下实现SiC串联器件的软开关范围扩展。最后,设计了4 kV/1 kV实验样机,实现了100 kW下运行。实验结果显示,所提出的软开关技术能显著地扩展变换器中SiC串联器件的软开关范围,在保证SiC串联器件均压稳定性的同时能够大幅降低变换器在轻载运行时的功耗。

关键词：电力电子变压器双有源桥变换器 SiC MOSFET 串联器件软开关

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