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Homology Model and Ligand Binding Interactions of the Extracellular Domain of the Human α4β2 Nicotinic Acetylcholine Receptor

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Journal of Biomedical Science and Engineering 2016年第1期9卷 41-100页

作者： Shu Mao Hui Wen Ng Michael Orr Heng Luo Hao Ye weigong ge Weida Tong Huixiao Hong Division of Bioinformatics and Biostatistics National Center for Toxicological Research U.S. Food and Drug Administration Jefferson AR USA School of Pharmacy and Bioengineering Chongqing University of Technology Chongqing China Division of Nonclinical Science Office of Science Center for Tobacco Products U.S. Food and Drug Administration Silver Spring MD USA Division of Systems Biology National Center for Toxicological Research U.S. Food and Drug Administration Jefferson AR USA

Addiction to nicotine, and possibly other tobacco constituents, is a major factor that contributes to the difficulties smokers face when attempting to quit smoking. Amongst the various subtypes of nicotinic acetylcholine receptors (nAChRs), the α4β2 subtype plays an important role in mediating the addiction process. The characterization of human α4β2-ligand binding interactions provides a molecular framework for understanding ligand-receptor interactions, rendering insights into mechanisms of nicotine addiction and may furnish a tool for efficiently identifying ligands that can bind the nicotine receptor. Therefore, we constructed a homology model of human α4β2 nAChR and performed molecular docking and molecular dynamics (MD) simulations to elucidate the potential human α4β2-ligand binding modes for eleven compounds known to bind to this receptor. Residues V96, L97 and F151 of the α4 subunit and L111, F119 and F121 of the β2 subunit were found to be involved in hydrophobic interactions while residues S153 and W154 of the α4 subunit were involved in the formation of hydrogen bonds between the receptor and respective ligands. The homology model and its eleven ligand-bound structures will be used to develop a virtual screening program for identifying tobacco constituents that are potentially addictive.

关键词： Nicotinic Acetylcholine Receptors Homology Model Ligand-Receptor Interactions

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Pitfall of genome-wide association studies: Sources of inconsistency in genotypes and their effects

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Journal of Biomedical Science and Engineering 2012年第10期5卷 557-573页

作者： Huixiao Hong Lei Xu Zhenqiang Su Jie Liu weigong ge Jie Shen Hong Fang Roger Perkins Leming Shi Weida Tong Bioinformatics Graduate Program University of Arkansas at Little Rock/University of Arkansas for Medical Sciences Little Rock AR 72079 USA Division of Bioinformatics and Biostatistics National Center for Toxicological Research US Food and Drug Administration Jefferson AR 72079 USA ICF International at National Center for Toxicological Research US Food and Drug Administration Jefferson AR 72079 USA School of Materials Science and Engineering Chang’an University Xi’an China

Personalized medicine will improve heath outcomes and patient satisfaction. However, implementing personalized medicine based on individuals’ biological information is far from simple, requiring genetic biomarkers that are mainly developed and used by the pharmaceutical companies for selecting those patients who benefit more, or have less risk of adverse drug reactions, from a particular drug. genome-wide Association Studies (GWAS) aim to identify genetic variants across the human genome that might be utilized as genetic biomarkers for diagnosis and prognosis. During the last several years, high-density genotyping SNP arrays have facilitated GWAS that successfully identified common genetic variants associated with a variety of phenotypes. However, each of the identified genetic variants only explains a very small fraction of the underlying genetic contribution to the studied phenotypic trait. The replication studies demonstrated that only a small portion of associated loci in the initial GWAS can be replicated, even within the same populations. Given the complexity of GWAS, multiple sources of Type I (false positive) and Type II (false negative) errors exist. The inconsistency in genotypes that caused either by the genotypeing experiment or by genotype calling process is a major source of the false GWAS findings. Accurate and reproducible genotypes are paramount as inconsistency in genotypes can lead to an inflation of false associations. This article will review the sources of inconsistency in genotypes and discuss its effect in GWAS findings.

关键词： genotype Association Reproducibility Inconsistency Batch Effect genotyping Platform

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复方壳聚糖降脂颗粒剂的研究

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广西医科大学学报 1999年第3期16卷 303-304页

作者：葛为公黄崇基周长坚广西桂林医学院福建中医药研究院

目的：壳聚糖和中药研制成复方降脂颗粒剂。方法：合成水溶性羧甲基壳聚糖，与山楂叶、决明子等提取物配制成颗粒剂，进行毒性试验和临床观察。结果：３０例高脂血症患者服用６周后，降低ＴＣ和ＴＧ有效率分别为８４．２％和６９．２％... 详细信息

目的：壳聚糖和中药研制成复方降脂颗粒剂。方法：合成水溶性羧甲基壳聚糖，与山楂叶、决明子等提取物配制成颗粒剂，进行毒性试验和临床观察。结果：３０例高脂血症患者服用６周后，降低ＴＣ和ＴＧ有效率分别为８４．２％和６９．２％，增高ＨＤＬ－Ｃｈ有效率为６８．８％。结论：本制剂制备工艺成熟、质量稳定，是治疗高脂血症安全有效的药剂。

关键词：水溶性壳聚糖中药提取物复方降脂颗粒剂

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复方壳聚糖消痤乳膏的制备和临床观察

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蛇志 1999年第2期11卷 17-18页

作者：葛为公黄崇基符甲寅桂林医学院上海化工专科学校

目的制备复方壳聚糖乳膏并用于寻常痤疮的临床观察。方法研制以壳聚糖和苦杏仁酸等为主药的复方消痤乳膏。结果３４例寻常痤疮患者用上述消痤乳膏治疗３周总有效率为９４．１２％。结论消痤乳膏可作为治疗寻常痤疮的一种安全、稳定、有... 详细信息

目的制备复方壳聚糖乳膏并用于寻常痤疮的临床观察。方法研制以壳聚糖和苦杏仁酸等为主药的复方消痤乳膏。结果３４例寻常痤疮患者用上述消痤乳膏治疗３周总有效率为９４．１２％。结论消痤乳膏可作为治疗寻常痤疮的一种安全、稳定、有效的制剂。

关键词：壳聚糖苦杏仁酸寻常痤疮乳膏制备

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《魏文贞故事》书名、佚文及其流播日本考辨

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河南大学学报（社会科学版） 2023年第2期63卷 129-133,156页

作者：葛继勇郑州大学外国语与国际关系学院、亚洲研究院河南郑州450001

有关唐代名臣魏征的言行录,尤其是魏征逝世后由他人所编的《魏文贞故事》与《魏郑公谏录》两者关系,后世著录相异,学界也众说纷纭。实际上,王方庆所撰《魏文贞故事》(《魏文贞故书》)与《魏文贞公故事》《魏征故事》为同一书籍。至南宋... 详细信息

有关唐代名臣魏征的言行录,尤其是魏征逝世后由他人所编的《魏文贞故事》与《魏郑公谏录》两者关系,后世著录相异,学界也众说纷纭。实际上,王方庆所撰《魏文贞故事》(《魏文贞故书》)与《魏文贞公故事》《魏征故事》为同一书籍。至南宋,《魏文贞故事》十卷被再编为《魏郑公谏录》五卷。日本类书《明文抄》中引用的《魏文贞故事》四条佚文,与现存《魏郑公谏录》的相关内容一致。传入日本的《魏文贞故事》六卷应是王方庆《魏文贞故事》十卷中的一部分。

关键词：《魏文贞故事》《魏郑公谏录》书名演变中日书籍交流

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