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Plant genome resequencing and population genomics:Current status and future prospects

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Molecular Plant 2023年第8期16卷 1252-1268页

作者： Bo Song weidong ning Di Wei Mengyun Jiang Kun Zhu Xingwei Wang David Edwards Damaris AOdeny Shifeng Cheng Shenzhen Branch Guangdong Laboratory of Lingnan Modern AgricultureGenome Analysis Laboratory of the Ministry of Agriculture and Rural AffairsAgricultural Genomics Institute at ShenzhenChinese Academy of Agricultural SciencesShenzhen 518120China Huazhong Agricultural University College of InformaticsHubei Key Laboratory of Agricultural BioinformaticsWuhanHubeiChina Biotechnology Research Institute Guangxi Academy of Agricultural SciencesNanning 53007China State Key Laboratory of Crop Stress Adaptation and Improvement School of Life SciencesHenan UniversityKaifeng 475004China Shenzhen Research Institute of Henan University Shenzhen 518000China School of Biological Sciences and Institute of Agriculture University of Western AustraliaPerthWAAustralia International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics(ICRISAT)-Eastern and Southern Africa NairobiKenya

Advances in DNA sequencing technology have sparked a genomics revolution,driving breakthroughs in plant genetics and crop ***,the focus has shifted from cataloging genetic diversity in plants to exploring their functional significance and delivering beneficial alleles for crop *** transformation has been facilitated by the increasing adoption of whole-genome *** this review,we summarize the current progress of population-based genome resequencing studies and how these studies affect crop breeding.A total of 187 land plants from 163 countries have been resequenced,comprising 54413 *** part of resequencing efforts 367 traits have been surveyed and 86 genome-wide association studies have been *** important crops,particularly cereals,vegetables,and legumes,have dominated the resequencing efforts,leaving a gap in 49 orders,including Lycopodiales,Liliales,Acorales,Austrobaileyales,and *** resequenced germplasm is distributed across diverse geographic locations,providing a global perspective on plant *** highlight genes that have been selected during domestication,or associated with agronomic traits,and form a repository of candidate genes for future research and *** the opportunities for cross-species comparative genomics,many population genomic datasets are not accessible,impeding secondary *** call for a more open and collaborative approach to population genomics that promotes data sharing and encourages contribution-based credit *** number of plant genome resequencing studies will continue to rise with the decreasing DNA sequencing costs,coupled with advances in analysis and computational *** expansion,in terms of both scale and quality,holds promise for deeper insights into plant trait genetics and breeding design.

关键词： WGRS WGS resequencing genome variation adaptation

精神障碍患者冲动攻击行为影响因素及应对措施研究进展

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临床误诊误治 2024年第15期37卷 86-90页

作者：高明秀安红欣宁卫东秦爱粉李晓玲赵会懂中国人民解放军联勤保障部队第九八〇医院精神心理科石家庄050082 中国人民解放军联勤保障部队第九八〇医院内分泌科石家庄050082 中国人民解放军联勤保障部队第九八〇医院医学信息数据室石家庄050082

冲动攻击行为是精神障碍患者在症状支配下突然出现的伤人、毁物、自伤、自杀等行为,危害性极大。分析精神障碍患者冲动攻击行为影响因素及采取必要可行的应对措施对精神障碍患者的治疗、康复意义重大。本文就目前精神障碍患者冲动攻击... 详细信息

冲动攻击行为是精神障碍患者在症状支配下突然出现的伤人、毁物、自伤、自杀等行为,危害性极大。分析精神障碍患者冲动攻击行为影响因素及采取必要可行的应对措施对精神障碍患者的治疗、康复意义重大。本文就目前精神障碍患者冲动攻击行为影响因素及应对措施研究进行综述,为降低或减少精神障碍患者冲动攻击行为导致的伤害带来些许借鉴。

关键词：精神障碍攻击影响因素分析精神分裂症双相情感障碍癫痫降低风险行为综述

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压电过滤材料的传感性能及其在口罩中的应用

煤炭学报 2024年第7期49卷 3017-3024页

作者：王晨赫伟东毛宁柳静献东北大学资源与土木工程学院辽宁沈阳110819

在劳动保护领域,实时监测劳动者的生理健康状态受到越来越多的关注。因呼吸中包含大量生理学信息,开发具有传感功能的可穿戴设备用于监测佩戴者呼吸状态成为研究热点。传统的商用呼吸监测装置价格昂贵、体积大、不易携带,限制了其在一... 详细信息

在劳动保护领域,实时监测劳动者的生理健康状态受到越来越多的关注。因呼吸中包含大量生理学信息,开发具有传感功能的可穿戴设备用于监测佩戴者呼吸状态成为研究热点。传统的商用呼吸监测装置价格昂贵、体积大、不易携带,限制了其在一线生产场所的使用,例如高粉尘质量浓度的矿山作业环境。为此,基于聚偏氟乙烯(PVDF)的压电性能,利用静电纺丝技术制备出具有传感性能的柔性PVDF纳米纤维膜,将高透气性碳纤维毡与PVDF纳米纤维膜设计为具有三明治结构的传感模块并嵌入到口罩中。传感模块将呼吸气流产生的机械能转化为电能,通过对电信号数据的采集和分析,完成对呼吸强度和呼吸频率的实时监测。结果表明:嵌有传感模块的口罩在不同呼吸状态下产生的压电信号有明显差异,在低强度(15 L/min)、中强度(50 L/min)和高强度(85 L/min)3种呼吸状态下,输出压电电压峰值分别为300、700、1100 mV,电压峰值出现频率分别为18、16、14次/min。因此,基于压电信号电压峰值及其出现频率的分析,可以实现佩戴者呼吸强度和呼吸频率等呼吸参数的实时监测。此外,研究通过XRD、FT-IR、TG等分析方法确定了PVDF纳米纤维膜的压电性与其β相晶体含量有关,为进一步改善PVDF纳米纤维膜的压电性能提供了依据。研发的具有传感功能的口罩可用于矿山工人劳作状态的实时呼吸监测,在工人工作状态异常时反馈给管理人员以便于及时采取处理措施。

关键词：聚偏氟乙烯传感模块呼吸信号监测口罩

分布反馈式太赫兹量子级联激光器在光场自注入下的动力学

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激光与光电子学进展 2024年第15期61卷 1-7页

作者：葛磊楚卫东杨宁北京计算科学研究中心北京应用物理与计算数学研究所

基于Lang-Kobayashi方程并引入可用于描述分布反馈式光栅对腔内光场耦合效应的修正端面反射系数，研究了分布反馈式太赫兹量子级联激光器在不同光场自注入强度下的动力学响应行为。随着自注入光场强度的增加，激光器由稳态向周期态、准... 详细信息

基于Lang-Kobayashi方程并引入可用于描述分布反馈式光栅对腔内光场耦合效应的修正端面反射系数，研究了分布反馈式太赫兹量子级联激光器在不同光场自注入强度下的动力学响应行为。随着自注入光场强度的增加，激光器由稳态向周期态、准周期态，甚至混沌状态过渡，但是太赫兹量子级联激光器和传统半导体激光器相比，可以在更大的自注入强度下保持稳定。移动目标反射物时，工作在稳态、周期态和准周期态下的分布反馈式太赫兹量子级联激光器的输出信号可正确描述反射物的移动规律，但处于混沌状态的激光器输出信号将出现失真。通过与典型稳态解模型对比可知，所提理论模型可提供更精确的输出信号规律。该研究为描述有光栅结构的量子级联激光器的动力学行为提供了理论支撑，也从理论上探索了分布反馈式太赫兹量子级联激光器在自注入成像技术应用中的可能。

关键词：太赫兹量子级联激光器分布反馈式光栅激光自注入

苦豆碱调节IL-6/JAK1/STAT3信号通路对结直肠癌细胞增殖、凋亡和免疫逃逸的影响

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中国免疫学杂志 2024年第7期40卷 1436-1440页

作者：伊亮李伟东王有周宁武威市凉州医院肛肠外科武威733000 兰州市第一人民医院消化科兰州730050

目的:探讨苦豆碱(ALO)调节IL-6/酪氨酸激酶1(JAK1)/信号转导和转录激活因子3(STAT3)通路对结直肠癌(CRC)细胞行为的影响。方法:SW480分为CK组(正常培养的SW480细胞)、ALO低剂量组(ALO-L组,0.2 mmol/L)、ALO中剂量组(ALO-M组,0.4 mmol/L)、ALO高剂量组(ALO-H组,0.8 mmol/L)、ALO-H+激活剂(IL-6激活剂重组人IL-6蛋白)组(0.8 mmol/L+100 ng/ml)。CCK-8、平板克隆实验检测SW480细胞增殖;流式细胞术检测SW480细胞凋亡;Western blot检测细胞中增殖细胞核抗原(PCNA)、Bcl-2相关X蛋白(Bax)、IL-6、p-JAK1、p-STAT3蛋白表达。将自然杀伤细胞NK-92MI分别与上述5组细胞共培养,并依次命名为CK共培养组、ALO-L共培养组、ALO-M共培养组、ALO-H共培养组、ALO-H+激活剂共培养组,检测共培养细胞上清液中TNF-α、IFN-γ水平及共培养体系中NK-92MI的免疫杀伤率。结果:与CK组相比,ALO-L组、ALO-M组、ALO-H组OD_(450)值、克隆形成率、PCNA、IL-6、p-JAK1、p-STAT3蛋白表达降低,细胞凋亡率、Bax蛋白表达升高,且呈剂量依赖性(P<0.05);与ALO-H组相比,ALO-H+激活剂组SW480细胞OD_(450)值、克隆形成率、PCNA、IL-6、p-JAK1、p-STAT3蛋白表达升高,细胞凋亡率、Bax蛋白表达降低(P<0.05);ALO-L共培养组、ALO-M共培养组、ALO-H共培养组上清中TNF-α、IFN-γ水平、NK-92MI细胞免疫杀伤率高于CK共培养组,且呈剂量依赖性(P<0.05);与ALO-H共培养组相比,ALO-H+激活剂共培养组上清中TNF-α、IFN-γ水平、细胞免疫杀伤率降低(P<0.05)。结论:ALO可能通过抑制IL-6/JAK1/STAT3信号通路抑制SW480细胞增殖、免疫逃逸,促进细胞凋亡。

关键词：苦豆碱结直肠癌白细胞介素-6/酪氨酸激酶1/信号转导和转录激活因子3通路免疫逃逸增殖

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不同倾角起伏管油气水三相流动特性数值模拟

电子测量技术 2020年第14期43卷 16-21页

作者：宁卫东张国良王英杰魏磊张宁中国石油集团测井有限公司华北分公司任丘062552

随着水平井和大斜度井的广泛应用,对起伏管内油气水三相流的研究变得异常重要。通过VOF模型模拟不同含气率和倾角下三相流在起伏管中的流动特性,对流型渐变趋势、截面持气率、持水率及井筒内压力分布进行了分析比较。结果表明,低含气率... 详细信息

随着水平井和大斜度井的广泛应用,对起伏管内油气水三相流的研究变得异常重要。通过VOF模型模拟不同含气率和倾角下三相流在起伏管中的流动特性,对流型渐变趋势、截面持气率、持水率及井筒内压力分布进行了分析比较。结果表明,低含气率下,起伏管中流型由分层-分层流转化为间歇-分层流,随着倾角的变大,局部持气率变大,持水率变小,压降曲线震荡加强,气弹的存在引起了压降曲线的波动;较高含气率下,其流型基本不变仍为分层-分层流,起伏管拐角处有周期性"液塞"的存在,倾角对持气率的影响作用减弱,倾角越大气液两相滑脱作用越强烈,井筒内压降越大。

关键词：三相流倾角起伏管流型持气率压力

Dynamic mechanical characterization and optimization of particle-reinforced W-Ni-Fe composites

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Science China(Physics,Mechanics & Astronomy) 2011年第9期54卷 1651-1658页

作者： SONG weidong ning JianGuo State Key Laboratory of Explosion Science and Technology Beijing Institute of Technology Beijing 100081 China

A visco-plastic rate-dependent homogenization theory for particle-reinforced composites was derived and the equivalent elastic constants and the equivalent visco-plastic parameters of these composites were obtained. A framework of homogenization the- ory for particle-reinforced W-Ni-Fe composites, a kind of tungsten alloy, was established. Based on the homogenization theory and a fixed-point iteration method, a unit cell model with typical microstructnres of the composite was established by using dynamic analysis program. The effects of tungsten content, tungsten particle shape and particle size and interface strength on the mechanical properties and the crack propagation of the W-Ni-Fe composite are analyzed under quasi-static and dynamic loadings. The stress-strain curves of the composite are given and the relation between the macro-mechanical characteristics and the microstructure parameters is explored, which provides an important theoretical basis for the optimization of the W-Ni-Fe composites.

关键词： W Ni Fe composite – dynamic mechanical property – microstructure – homogenization theory – optimization

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高校教学模式改革和课程体系优化实践研究

黑龙江科学 2020年第13期11卷 50-51页

作者：宁伟东师东菊周雪迟桂华牡丹江医学院黑龙江牡丹江157011

为了达到向综合性大学转型的标准,改善相关专业的教学模式,优化课程体系,分析了教育教学方式的特征。传统教学模式过度依赖理论讲授,忽视学生个性化的培养,缺乏培养定位,未突出学生的创新实践能力,教学模式和课程体系全面滞后,无法适应... 详细信息

为了达到向综合性大学转型的标准,改善相关专业的教学模式,优化课程体系,分析了教育教学方式的特征。传统教学模式过度依赖理论讲授,忽视学生个性化的培养,缺乏培养定位,未突出学生的创新实践能力,教学模式和课程体系全面滞后,无法适应现代社会需要。对转型期高校新模式教学进行探索,提出EIP-CDIO教学模式、SPOC教学模式和两者结合的应用。应结合社会发展需求和学生个性化发展规律,完善课程体系建设。

关键词：转型发展教学模式改革课程体系优化

趋优变异反向学习的樽海鞘群与蝴蝶混合优化算法

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计算机应用研究 2024年第3期41卷 721-728,763页

作者：黄鑫宇马宁付伟季伟东亓文凤哈尔滨师范大学计算机科学与信息工程学院哈尔滨150025

针对蝴蝶优化算法(butterfly optimization algorithm,BOA)易陷入局部最优,且收敛速度慢和寻优精度低等问题,提出了一种趋优变异反向学习的樽海鞘群与蝴蝶混合优化算法(hybrid optimization algorithm for salp swarm and butterfly with reverse mutation towards optimization learning,OMSSBOA)。引入柯西变异对最优蝴蝶个体进行扰动,避免算法陷入局部最优;将改进的樽海鞘群优化算法(salp swarm algorithm,SSA)嵌入到BOA,平衡算法全局勘探和局部开采的比重,进而提高算法收敛速度;利用趋优变异反向学习策略扩大算法搜索范围并提升解的质量,进而提高算法的寻优精度。将改进算法在10种基准测试函数上进行仿真实验,结果表明,改进算法具有较好的寻优性能和鲁棒性。

关键词：蝴蝶优化算法樽海鞘群优化算法柯西变异趋优变异反向学习领导者策略