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Chinese Journal of Chemistry 2024年第2期42卷 157-163页

作者： weicai li Lu Tan Yijun Chen Rui liu Zhongyu Qi Shixuan Yuan Zhanwen Huang Siping Wei Xi Du Dong Yi Nuclear Medicine and Molecular Imaging Key Laboratory of Sichuan Province School of PharmacySouthwest Medical UniversityLuzhouSichuan 646000China Department of Chemistry School of Basic Medical ScienceSouthwest Medical UniversityLuzhouSichuan 646000China Department of Pharmacy Affiliated HospitalSouthwest Medical UniversityLuzhouSichuan 646000China

Tetralin-1-carboxamides are frequently incorporated in myriad medicinally important ***,their existing synthetic routes not only suffer from some drawbacks such as tedious procedures,harsh reaction conditions,narrow substrate scope,low yields,and environmental problems,but are also based upon the elaboration of uneasily available non-linear tetralin ***,we describe a metal-and additive-free visible light-induced[4+2]annulation of two simple linear starting materials,namely acrylamides and 2-benzyl-2-bromocarbonyls,through a cascade C(sp^(3))-Br/C(sp^(2))-H bond cleavage,double C-C bond formation,and aromatization *** developed protocol provides a convenient,efficient,and green approach to a variety of tetralin-1-carboxamide derivatives with good functional group ***,the resulting products could also undergo the licl-mediated mono-decarboxylative cyclization process to further furnish the architecturally novel bridged polycyclic imides with excellentcis-diastereoselectivities.

关键词： Annulation Metal-free Photoredox catalysis Tetralin-1-carboxamide Cyclic imides Synthetic methods C-C coupling Radical reactions Reaction mechanisms

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燃料组件格架弹簧刚度模型研究

核动力工程 2024年第2期45卷 154-159页

作者：金渊周赛陈威李伟才张玉相中广核研究院有限公司广东深圳518031

格架弹簧是压水堆燃料组件的关键零部件,其为燃料棒提供夹持功能。刚度是格架弹簧的关键特性,其关系到燃料棒的堆内运行性能。本文基于格架弹簧的结构以及受力特点,给出了格架弹簧的受力分析模型,并推导了理论刚度计算公式,即得到了格... 详细信息

格架弹簧是压水堆燃料组件的关键零部件,其为燃料棒提供夹持功能。刚度是格架弹簧的关键特性,其关系到燃料棒的堆内运行性能。本文基于格架弹簧的结构以及受力特点,给出了格架弹簧的受力分析模型,并推导了理论刚度计算公式,即得到了格架弹簧的理论刚度模型。另外,在商业有限元软件ABAQUS中建立了多种尺寸格架弹簧实体结构的有限元刚度模型,并计算获得了格架弹簧的变形量以及刚度曲线。通过有限元结果与理论刚度模型结果的对比,证明了理论刚度模型的合理性,并分析讨论了理论刚度模型的优缺点。本文首次提出的格架弹簧理论刚度模型可用于代替格架方案设计期间的有限元迭代过程,并能快速获得优化方案的主要设计尺寸。但本文分析方法不能替代实验,在方案固化后仍需开展实验确定格架弹簧的刚度。本文得到的格架弹簧理论模型可为燃料组件格架弹簧参数的快速优化设计提供新的思路。

关键词：燃料组件格架弹簧刚度理论刚度模型有限元方法

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类风湿性关节炎中免疫相关基因表达及免疫细胞的双样本孟德尔随机化分析

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中国组织工程研究 2024年第27期28卷 4312-4318页

作者：范以东秦刚何凯毅龚玉芳李威材吴广涛广西中医药大学广西壮族自治区南宁市530222 广西中医药大学第一附属医院广西壮族自治区南宁市530022 贵港市人民医院广西壮族自治区贵港市537199

背景:类风湿性关节炎是一种慢性全身性自身免疫疾病,研究其涉及的免疫学特征改变对诊断和治疗具有重要意义。目的:通过生物信息学方法筛选类风湿性关节炎中免疫相关生物标志物,分析其免疫细胞浸润变化及与免疫细胞的潜在因果关系。方法... 详细信息

背景:类风湿性关节炎是一种慢性全身性自身免疫疾病,研究其涉及的免疫学特征改变对诊断和治疗具有重要意义。目的:通过生物信息学方法筛选类风湿性关节炎中免疫相关生物标志物,分析其免疫细胞浸润变化及与免疫细胞的潜在因果关系。方法:基于GEO与ImmPort数据库,采用差异表达分析筛选类风湿性关节炎中表达上调的免疫相关基因,采用GO与KEGG富集分析探索这些上调基因的潜在作用。采用支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)、最小绝对收缩和选择算法(Lasso)筛选类风湿性关节炎中免疫特征基因,独立的数据集进行差异验证,绘制特征基因的受试者工作特征曲线评价诊断性能。采用免疫细胞浸润分析类风湿性关节炎中免疫细胞的差异情况及特征基因与免疫细胞的相关性。最后,进行孟德尔随机化分析,以确定免疫细胞中单核细胞与类风湿性关节炎的因果效应。结果与结论:①筛选得到了39个在类风湿性关节炎中高表达的差异基因,GO富集分析显示其主要富集在趋化性、细胞因子活性、免疫受体活性等过程,KEGG富集分析显示其在肿瘤坏死因子信号通路、白细胞外周迁移等途径显著富集;②通过Lasso与SVM-RFE两种机器学习算法确定了5个特征基因,分别为CXCL13、SDC1、IGLC1、PLXNC1和SLC29A3,独立的数据集对特征基因验证发现他们同样在类风湿性关节炎样本中高表达,5个特征基因在2个数据集中的AUC值均大于0.8;③免疫细胞浸润发现大多数免疫细胞如单核细胞、自然杀伤细胞等在类风湿性关节炎样本里表现出更高的浸润水平,相关性分析显示5个特征基因与记忆B细胞、不成熟B细胞等呈正相关性,逆方差加权法发现单核细胞与类风湿性关节炎发病风险相关。

关键词：类风湿性关节炎机器学习免疫浸润全基因组关联研究孟德尔随机化

基于人工神经网络骨关节炎诊断模型的建立与分析

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中国组织工程研究 2024年第16期28卷 2550-2554页

作者：范以东秦刚苏国威肖世富刘俊良李威材吴广涛广西中医药大学广西壮族自治区南宁市530000 广西中医药大学第一附属医院骨病创伤骨科广西壮族自治区南宁市530022

背景:生物信息学领域的快速发展为骨关节炎的诊断提供了新的方法。人工神经网络具有强大的数据计算能力和分类能力,研究表明其在诊断疾病方面表现出了较好的性能。目的:旨在使用人工神经网络建立一种新的骨关节炎诊断预测模型,并通过外... 详细信息

背景:生物信息学领域的快速发展为骨关节炎的诊断提供了新的方法。人工神经网络具有强大的数据计算能力和分类能力,研究表明其在诊断疾病方面表现出了较好的性能。目的:旨在使用人工神经网络建立一种新的骨关节炎诊断预测模型,并通过外部数据集验证其在骨关节炎中的诊断价值。方法:通过GEO数据库搜索下载符合要求的骨关节炎相关数据集,将其分为Train组与Test组。对Train组的基因表达矩阵进行差异分析,筛选差异表达基因。对差异基因进行GO、KEGG富集分析;通过Lasso回归模型、支持向量机模型、随机森林树模型从差异基因中进一步鉴定骨关节炎关键基因。随后使用R软件“neuralnet”包构建基于人工神经网络的骨关节炎诊断模型,5折交叉验证评估模型表现;使用Test组中2个独立的数据集来验证其诊断效果。结果与结论:通过差异分析共得到90个与骨关节炎相关的差异基因,其中33个下调,57个上调。GO富集分析显示其生物过程主要参与白细胞介导的免疫、骨髓白细胞迁移、趋化因子产生等过程;KEGG富集显示差异基因主要富集在类风湿关节炎、白细胞介素17信号通路、破骨细胞分化等通路。通过3种机器学习方法筛选并取交集后共得到5个诊断骨关节炎的关键基因,分别为HMGB2、GADD45A、SLC19A2、TPPP3、FOLR2。Train组中5个关键基因建立的人工神经网络模型显示其准确率为96.36%,曲线下面积(AUC)为0.997,对神经网络模型的5折交叉验证表明其平均AUC>0.9,具有一定的稳健性;Test组中2个独立的数据集结果显示其AUC分别为0.814和0.788。提示:建立的人工神经网络骨关节炎诊断模型具有一定的诊断价值。

关键词：骨关节炎诊断模型人工神经网络机器学习

免疫细胞与膝骨关节炎之间因果作用:一项两样本双向孟德尔随机化分析

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中国组织工程研究 2025年第5期29卷 1081-1090页

作者：吴广涛秦刚何凯毅范以东李威材朱宝刚曹英广西中医药大学广西壮族自治区南宁市530222 广西中医药大学第一附属医院广西壮族自治区南宁市530022

背景:膝骨关节炎是一种常见的关节软骨及周围组织损伤的慢性炎症性疾病,而免疫细胞在膝骨关节炎免疫炎症反应中起到重要作用,但其中的具体机制仍有待深入研究。目的:采用孟德尔随机化方法来评估731种免疫细胞表型与膝骨关节炎风险之间... 详细信息

背景:膝骨关节炎是一种常见的关节软骨及周围组织损伤的慢性炎症性疾病,而免疫细胞在膝骨关节炎免疫炎症反应中起到重要作用,但其中的具体机制仍有待深入研究。目的:采用孟德尔随机化方法来评估731种免疫细胞表型与膝骨关节炎风险之间的潜在因果关系。方法:使用全基因组关联分析(GWAS)目录中公开获取731种免疫细胞表型的全基因组关联分析统计数据(从GCST0001391到GCST0002121)和IEUGWAS数据库中膝骨关节炎的全基因组关联分析数据(ebi-a-GCST007090)。采用逆方差加权法、MR-Egger回归法、加权中位数法、加权模型法和简单模型法来研究免疫细胞与膝骨关节炎之间的因果关系。敏感性分析用于检验孟德尔随机化分析结果是否可靠,然后以同样方法进行反向孟德尔随机化分析。结果与结论:①正向分析结果表明,共有4种免疫细胞表型与膝骨关节炎有显著的因果关系(FDR<0.20),其中B细胞中的CD27 on CD24+CD27+(OR=1.026,P=0.00026,Pfdr=0.18)、髓系细胞中的CD33 on CD33dim HLA DR-(OR=1.014,P=0.00050,Pfdr=0.18)以及Treg细胞中的CD45RA+CD28-CD8br%CD8br(OR=1.001,P=0.00078,Pfdr=0.18)与膝骨关节炎风险呈直接的正向因果关联;单核细胞中PDL-1 on monocyte(OR=0.952,P=0.00098,Pfdr=0.18)与膝骨关节炎风险呈直接的负向因果关联。②反向分析结果表明,当膝骨关节炎作为暴露数据时,与731种免疫细胞表型均不具有显著因果关系(FDR<0.20)。③敏感性分析结果显示:双向孟德尔随机化的Cochran’s Q检验和MR-Egger回归法结果P值均大于0.05,表明免疫细胞表型与膝骨关节炎之间的因果效应分析不存在显著的异质性和多效性。④上述结果证实,CD27 on CD24+CD27+,CD33 on CD33dim HLA DR-,CD45RA+CD28-CD8br%CD8br以及PDL-1 on monocyte免疫细胞表型与膝骨关节炎之间可能具有较为显著的潜在因果关系,这为研究膝骨关节炎的生物学机制及探索膝骨关节炎的早期防治提供有价值的线索,也为干预性药物的开发提供了新的方向。

关键词：骨关节炎膝骨关节炎免疫机制免疫细胞孟德尔随机化因果关系全基因组关联分析逆方差加权法敏感性分析

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利用长水平井实现超薄层未动用储量有效开发——以下二门油田梨树凹区块为例

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石油地质与工程 2024年第3期38卷 18-22页

作者：李伟才刘宇张云杨璐闫荣杰中国石化河南油田分公司勘探开发研究院河南南阳473000 河南省提高石油采收率重点实验室河南南阳473000

泌阳凹陷下二门油田梨树凹区块受有效厚度薄、含油层位单一、储层物性差、单井产量低等因素限制,探明储量动用程度低,开发效果差。为提高该区储量动用程度,积极推广应用水平井开发技术,通过加强油藏地质综合研究,进一步落实了可动用潜力... 详细信息

泌阳凹陷下二门油田梨树凹区块受有效厚度薄、含油层位单一、储层物性差、单井产量低等因素限制,探明储量动用程度低,开发效果差。为提高该区储量动用程度,积极推广应用水平井开发技术,通过加强油藏地质综合研究,进一步落实了可动用潜力;地质工程一体化实施过程中,通过多靶点+近钻头方位伽马技术严控水平段轨迹,提高了储层及油层钻遇符合率;通过优化射孔井段,提高了单井产量,逐步形成了一套适合河南油田薄层油藏长水平井开发技术。现场实施结果表明,水平井实钻水平段长达892 m,储层钻遇符合率为100%,油层钻遇符合率为91.4%,初期日产油14.1 t。该区块水平井的成功实施,为超薄层油藏挖潜技术指出方向,对河南油田未动用储量的有效开发具有一定的指导意义。

关键词：河南油田梨树凹区块未动用储量长水平井薄层油藏

荔枝GRF基因家族的全基因组鉴定及表达分析

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热带生物学报 2024年第2期15卷 190-197页

作者：董晨郑雪文王弋全振炫李伟才中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业农村部热带果树生物学重点实验室广东湛江524091

为揭示荔枝(litchi chinensis)GFR基因的功能,对荔枝生长调控因子(LcGRF)基因家族进行了全基因组鉴定和分析,并研究其在荔枝中的表达模式。基于荔枝基因组数据库,使用生物信息学软件对LcGRFs家族成员进行全基因组鉴定,分析基本理化性质... 详细信息

为揭示荔枝(litchi chinensis)GFR基因的功能,对荔枝生长调控因子(LcGRF)基因家族进行了全基因组鉴定和分析,并研究其在荔枝中的表达模式。基于荔枝基因组数据库,使用生物信息学软件对LcGRFs家族成员进行全基因组鉴定,分析基本理化性质、染色体定位、基因结构、进化关系、蛋白保守基序、顺式作用元件和时空表达情况进行系统分析。共获得12个GRF基因,不均匀地分布在10条染色体上,内含子2~5个。蛋白保守基序分析发现,荔枝GRF蛋白均含有保守的motif1(WRC)和motif2(QLQ),进化分析LcGRF划分为5个亚家族,LcGRFs启动子上存在大量的光、植物激素、非生物胁迫响应以及生长发育相关的顺式作用元件。不同转录组表达模式结果显示,各个组织中呈现出多样化的表达特征,表明不同成员可能在荔枝不同生长发育过程中发挥调控作用,参与调节荔枝的生长发育。研究显示,荔枝GRF家族成员有12个,划分为5个亚家族。

关键词：荔枝生长调控因子生物信息表达模式

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六个荔枝品种的挥发性香气成分比较分析

南方农业 2024年第5期18卷 8-12页

作者：董晨李金枝王弋郑雪文全振炫李伟才中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业农村部热带果树生物学重点实验室广东湛江524091 华南农业大学园艺学院广东广州510642

为了丰富了荔枝品种香气数据,为荔枝果实风味鉴赏提供理论依据,采用顶空固相微萃取(HS-SPME)-气相色谱质谱(GC-MS)联用仪分析法测定6个荔枝品种观音绿、岭丰糯、桂味、妃子笑、灯泡荔和御金球的挥发性风味化合物组分,并进行主成分分析... 详细信息

为了丰富了荔枝品种香气数据,为荔枝果实风味鉴赏提供理论依据,采用顶空固相微萃取(HS-SPME)-气相色谱质谱(GC-MS)联用仪分析法测定6个荔枝品种观音绿、岭丰糯、桂味、妃子笑、灯泡荔和御金球的挥发性风味化合物组分,并进行主成分分析。结果显示,观音绿和御金球的总离子图较相似,妃子笑的峰型与其余5个品种不相似;不同荔枝品种的香气物质主要由烯类、醇类、醛类及烷烃化合物组成,桂味和灯泡荔的香气组分差异小,观音绿、岭丰糯和御金球的香气组分差异较小,表明6个品种香气组分和相对含量具有独特性。

关键词：荔枝品种香气顶空固相微萃取 GC-MS

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基于生物信息学分析骨肉瘤的关键基因和qRT-PCR实验验证

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实用肿瘤杂志 2024年第4期39卷 344-355页

作者：李威材秦刚苏国威刘金富肖世富刘俊良范以东吴广涛广西中医药大学研究生院广西壮族自治区南宁530299 广西中医药大学第一附属医院骨病创伤骨科广西南宁530023

目的利用生物信息学方法筛选出与骨肉瘤(osteosarcoma,OS)相关的关键基因,以作为OS的潜在诊断标志物和新治疗靶点。方法从基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中检索下载2个符合本研究的OS相关数据集(GSE16088和GSE42572)... 详细信息

目的利用生物信息学方法筛选出与骨肉瘤(osteosarcoma,OS)相关的关键基因,以作为OS的潜在诊断标志物和新治疗靶点。方法从基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中检索下载2个符合本研究的OS相关数据集(GSE16088和GSE42572),共包括21例OS组织样本和14例正常骨组织样本。对数据集进行矫正分析鉴定出差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。通过加权基因共表达网络分析方法(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)与DEGs筛选出交集基因。对交集基因进行疾病本体论(Disease Ontology,DO)、基因本体论(Gene Ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书分析(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)和蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络分析。采用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评估该PPI网络degree排名前10位的Hubbe基因的表达水平对OS患者的诊断效能,并以另一个OS数据集GSE19276对Hubbe基因进行验证筛选出关键基因。分析关键基因与浸润性免疫细胞的相关性。收集2020年9月1日至2022年6月30日于广西中医药大学第一附属医院住院手术的4例OS患者的OS组织及其癌旁组织,采用实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time quantitative polymerase chain reaction,qRT-PCR)对关键基因进行实验验证。结果在OS组织与正常骨组织中共筛选出687个DEGs(上调基因523个和下调基因164个)。WGCNA关键模块基因2338个。DEGs与WGCNA关键模块基因共有交集基因545个。DO富集分析结果表明,DEGs与WGCNA结果的交集基因主要与泌尿系统癌症、肾癌、生殖细胞癌、肌肉骨骼系统癌症和胚胎癌等癌症相关。GO富集结果表明,交集基因主要参与骨化的形成、细胞外基质组织和生物矿物组织发育等生物学过程。KEGG通路富集在磷脂酰肌醇3激酶(phosphatidylinositide 3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,PKB,又名Akt)信号通路、过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferators-activated receptor,PPAR)信号通路及流体剪切应力和动脉粥样硬化等信号通路上。PPI网络分析中degree排名前10位的Hubbe基因为磷脂酰肌醇4,5-二磷酸3-激酶催化亚基α(phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha,PIK3CA)、脯氨酰4-羟化酶亚单位α1(prolyl 4-hydroxylase subunit alpha 1,P4HA1)、整合素αⅤ(integrin alphaⅤ,ITGAⅤ)、组蛋白去乙酰化酶2(histone deacetylase 2,HDAC2)、连环蛋白β1(catenin beta 1,CTNNB1)、Ⅲ型胶原蛋白α1(collagen typeⅢalpha 1,COL3A1)、Ⅰ型胶原蛋白α2(collagen typeⅠalpha 2,COL1A2)、转导蛋白β样1X相关蛋白1(transducin beta-like 1X-related protein 1,TBL1XR1)、小核核糖核蛋白多肽G(small nuclear ribonucleoprotein polypeptide G,SNRPG)和Ras相关核蛋白(Ras-related nuclear protein,RAN)。以数据集GSE19276绘制ROC曲线验证Hubbe基因表明,P4HA1和ITGAV的准确度较高(均AUC>0.8且P<0.05)。qRT-PCR实验结果显示,P4HA1和ITGAV mRNA在OS组织中高表达(均P<0.01)。结论P4HA1和ITGAV是OS的潜在生物标志物和治疗靶点。

关键词：骨肉瘤生物信息学差异表达基因加权基因共表达网络分析 qRT-PCR 脯氨酰4-羟化酶亚单位α1 整合素αⅤ

Long-Lasting Filtration of Oily Water by Anti-Fouling Underwater Oleophobic Sand Particles

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Journal of Bionic Engineering 2024年第2期21卷 913-923页

作者： Xingyu liu Junxu Chen Rui Wang Yifan Su Zhangheng Zhou Zezhong Hou Zhuoran li Junhao Zhao weicai Shi Xinquan Yu Zhaopeng Yu Youfa Zhang State Key Laboratory of Advanced Technology for Float Glass CNBM Research Institute for Advanced Glass Materials Group Co.LtdBengbu233000China Jiangsu Key Laboratory of Advanced Metallic Materials School of Materials Science and EngineeringSoutheast UniversityNanjing211189China Research Institute of Petroleum Engineering Technology of Jiangsu Oilfield Yangzhou225009China Kunshan Industrial Technology Research Institute Kunshan215300SuzhouChina School of Automotive Engineering Changshu Institute of TechnologyChangshu215500SuzhouChina

The produced water from the oilfield was purified with filter material and then injected back into the *** serpentine filter material was easy to harden with the increase in filtration amount,which affected the water quality.A superhydrophilic/underwater oleophobic serpentine filter material was successfully prepared by a simple method of coating modification,which exhibited long-lasting filtration of oily water,good filtration and anti-fouling properties,and resistance to *** film-forming material of the superhydrophilic/underwater oleophobic coating was composed of SiO_(2) particles with small size,which could completely and evenly cover the filter *** weight loss was only 7.6%after mechanical stirring for 90 *** with the original filter material,the superhydrophilic/underwater oleophobic serpentine filter material showed a better anti-fouling ability and resistance to *** filtration of crude oil emulsion and oil slick sewage showed a better backwashing *** 35 cycles of continuous filtration of suspended solids in wastewater,the backwashing rate reached 78.4%.The results provided an effective method for the filtration of oily wastewater in the oilfield.

关键词： Serpentine Underwater oleophobic Water immersion resistance Anti-fouling Hardening resistance