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Elite,transformable haploid inducers in maize

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The Crop Journal 2024年第1期12卷 314-319页

作者： Brent Delzer Dawei Liang David Szwerdszarf Isadora Rodriguez Gonzalo Mardones Sivamani Elumalai Francine Johnson Samson Nalapalli Rachel Egger Erin Burch Kerry Meier Juan Wei Xiujuan Zhang Huaping Gui Huaibing jin Huan Guo Kun Yu Yubo Liu Becky Breitinger Ana Poets Jason Nichols wan Shi David Skibbe Qiudeng Que Timothy Kelliher Seeds Development Syngenta SeedsJanesvilleWI 53546USA Seeds Research Syngenta Biotechnology China Co.Ltd.Beijing 102206China Centro de Investigación de Cultivos Arica Syngenta R&DArica 1000000Chile Syngenta S.A. Proyecto la SoledadGraneros 2880000Chile Seeds Research Syngenta Crop Protection LLCRTPNC 27709USA Seeds Development Syngenta SeedsSlaterIA 50244USA

The introduction of alleles into commercial crop breeding pipelines is both time consuming and *** technologies that are disrupting traditional breeding processes are doubled haploid(DH)breeding and genome editing(GE).Recently,these techniques were combined into a GE trait delivery system called HI-Edit(Haploid Inducer-Edit).In HI-Edit,the pollen of a haploid inducer line is reprogrammed to deliver GE traits to any variety,obviating recurrent *** HI-Edit to operate at scale,an efficient transformable HI line is needed,but most maize varieties are recalcitrant to transformation,and haploid inducers are especially difficult to transform given their aberrant reproductive *** marker assisted selection and a three-tiered testing scheme,we report the development of new Iodent and Stiff Stalk maize germplasm that are transformable,have high haploid induction rates,and exhibit a robust,genetically-dominant anthocyanin native trait that may be used for rapid haploid *** show that transformation of these elite‘‘HI-Edit”lines is enhanced using the BABYBOOM and WUSCHEL morphogenetic ***,we evaluate the HI-Edit performance of one of the lines against both Stiff Stalk and non-Stiff Stalk *** strategy and results of this study should facilitate the development of commercially scalable HI-Edit systems in diverse crops.

关键词： Zea mays L Doubled haploids Transformation Genome editing QTL

OsPRMT6a-mediated arginine methylation of OsJAZ1 regulates jasmonate signaling and spikelet development in rice

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Molecular Plant 2024年第6期17卷 900-919页

作者： Kun Dong Fuqing Wu Siqi Cheng Shuai Li Feng Zhang Xinxin Xing Xin jin Sheng Luo Miao Feng Rong Miao Yanqi Chang Shuang Zhang Xiaoman You Peiran wang Xin Zhang Cailin Lei Yulong Ren Shanshan Zhu Xiuping Guo Chuanyin Wu Dong-Lei Yang Qibing Lin Zhijun Cheng Jianmin wan State Key Laboratory of Crop Gene Resources and Breeding National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic ImprovementInstitute of Crop SciencesChinese Academy of Agricultural SciencesBeijing 100081China State Key Laboratory for Crop Genetics and Germplasm Enhancement Nanjing Agricultural UniversityNanjing 210095China

Although both protein arginine methylation(PRMT)and jasmonate(JA)signaling are crucial for regulating plant development,the relationship between these processes in the control of spikelet development remains *** this study,we used the CRISPR/Cas9 technology to generate two OsPRMT6a loss-of-function mutants that exhibit various abnormal spikelet ***,we found that OsPRMT6a can methylate arginine residues in JA signal repressors OsJAZ1 and *** showed that arginine methylation of OsJAZ1 enhances the binding affinity of OsJAZ1 with the JA receptors OsCOI1a and OsCOI1b in the presence of JAs,thereby promoting the ubiquitination of OsJAZ1 by the SCF^(OsCOI1a/OsCOI1b) complex and degradation via the 26S *** process ultimately releases OsMYC2,a core transcriptional regulator in the JA signaling pathway,to activate or repress JA-responsive genes,thereby maintaining normal plant(spikelet)***,in the osprmt6a-1 mutant,reduced arginine methylation of OsJAZ1 impaires the interaction between OsJAZ1 and OsCOI1a/OsCOI1b in the presence of *** a result,OsJAZ1 proteins become more stable,repressing JA responses,thus causing the formation of abnormal spikelet ***,we discovered that JA signaling reduces the OsPRMT6a mRNA level in an OsMYC2-dependent manner,thereby establishing a negative feedback loop to balance JA *** further found that OsPRMT6a-mediated arginine methylation of OsJAZ1 likely serves as a switch to tune JA signaling to maintain normal spikelet development under harsh environmental conditions such as high ***,our study establishes a direct molecular link between arginine methylation and JA signaling in rice.

关键词： protein arginine methylation jasmonate signaling negative feedback loop spikelet development adaptation to heat stress rice

Atom-referenced and stabilized soliton microcomb

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Science China(Physics,Mechanics & Astronomy) 2024年第2期67卷 2-8页

作者： Rui Niu Shuai wan Tian-Peng Hua Wei-Qiang wang Zheng-Yu wang jin Li Zhu-Bo wang Ming Li Zhen Shen Yu Robert Sun Shui-Ming Hu Brent ELittle Sai Tak Chu Wei Zhao Guang-Can Guo Chang-Ling Zou Yun-Feng Xiao Wen-Fu Zhang Chun-Hua Dong State Key Laboratory of Transient Optics and Photonics Xi’an Institute of Optics and Precision MechanicsChinese Academy of SciencesXi’an 710119China CAS Key Laboratory of Quantum Information University of Science and Technology of ChinaHefei 230026China CAS Center for Excellence in Quantum Information and Quantum Physics University of Science and Technology of ChinaHefei 230026China University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049China Department of Chemical Physics University of Science and Technology of ChinaHefei 230026China Department of Physics and Materials Science City University of Hong KongHong Kong 999077China State Key Laboratory for Mesoscopic Physics and Frontiers Science Center for Nano-optoelectronics School of PhysicsPeking UniversityBeijing 100871China

For the applications of the frequency comb in microresonators,it is essential to obtain a fully frequency-stabilized microcomb laser *** this study,we present a system for generating a fully atom-referenced stabilized soliton *** pump light around 1560.48 nm is locked to an ultra-low-expansion(ULE)*** pump light is then frequency-doubled and referenced to the atomic transition *** repetition rate of the soliton microcomb is injection-locked to an atomic-clockstabilized radio frequency(RF)source,leading to mHz stabilization at 1 *** a result,all comb lines have been frequencystabilized based on the atomic reference and the ULE cavity,achieving a very high precision of approximately 18 Hz at 1 s,corresponding to the frequency stability of 9.5×10^(-14).Our approach provides a fully stabilized microcomb experiment scheme with no requirement of f-2f technique,which could be easily implemented and generalized to various photonic platforms,thus paving the way towards the ultraprecise optical sources for high precision spectroscopy.

关键词： microcavity frequency comb dissipative Kerr solitons fully stabilized microcomb

基于注意力机制残差神经网络的近红外芒果种类定性建模方法

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光谱学与光谱分析 2024年第8期44卷 2262-2267页

作者：王书涛万金丛刘诗瑜张金清王玉田燕山大学电气工程学院仪器科学与工程系河北秦皇岛066004 河北大学质量技术监督学院河北保定071002

现代光谱检测技术的飞速发展与深度学习紧密相关,作为一种端到端的模型,深度神经网络可以从光谱中得到更多信息,从而提升模型鲁棒性。为探究近红外光谱结合深度学习对芒果种类定性预测的可行性,提出一种基于卷积注意力机制(CBAM)的一维... 详细信息

现代光谱检测技术的飞速发展与深度学习紧密相关,作为一种端到端的模型,深度神经网络可以从光谱中得到更多信息,从而提升模型鲁棒性。为探究近红外光谱结合深度学习对芒果种类定性预测的可行性,提出一种基于卷积注意力机制(CBAM)的一维残差神经网络(1D-AD-ResNet-18)模型。为降低光谱中冗余信息的干扰,在传统一维残差神经网络(1D-ResNet-18)中嵌入CBAM卷积注意力模块,该模块可重点关注光谱局部有用信息;为避免梯度消失、过拟合情况发生,使用解决网络“退化”问题的ResNet-18。对于186个芒果样本,采用70%的样本进行训练,30%的样本进行测试,采用准确度(Accuracy)、精确率(Precision)、召回率(Recall)、F1值(F1-score)、宏观平均值(Macro-average)以及加权平均值(Weighted-average)作为模型评价指标。建立传统1D-ResNet-18、SNV-SVM和PCA-KNN三种对比模型,与上述三种方法作对比,所建立的1D-AD-ResNet-18模型取得最优预测结果,四种定性分析模型的准确率分别为96.42%,80.35%,76.78%和67.85%。结果表明,1D-AD-ResNet-18模型实现了对芒果种类的准确识别与分类,为近红外光谱定性分析芒果种类提供了新思路。

关键词：芒果种类识别 CBAM注意力机制近红外光谱残差网络

基于R-Vine Copula的财险公司经济资本度量与分散化效益研究

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保险研究 2024年第6期 55-69页

作者：郑敏郑苏晋刘皖中央财经大学保险学院中央财经大学中国精算研究院中国财产再保险有限责任公司

经济资本在保险公司内部风险管理和资本配置等方面发挥着至关重要的作用,它能够准确地反映保险公司所面临的风险状况,并为风险的有效管理与资本的合理配置提供重要依据。本文以财险公司的经济资本为研究对象,在传统资产负债模型的框架下... 详细信息

经济资本在保险公司内部风险管理和资本配置等方面发挥着至关重要的作用,它能够准确地反映保险公司所面临的风险状况,并为风险的有效管理与资本的合理配置提供重要依据。本文以财险公司的经济资本为研究对象,在传统资产负债模型的框架下,通过R-Vine Copula风险聚合方法对资产和负债进行联合建模,进而计算经济资本并分析相应的分散化效益,并与监管方法进行比较。研究结果表明财险公司的资产和负债存在复杂的依赖关系,利用Vine结构可以更加全面、精确地描述这两者之间的非对称和非线性相关性,同时拟合数据的尾部特征,进而获得更为稳健的净资本估计量,以及更为真实的经济资本需求和相应的分散效益。相较于偿付能力规则下的线性聚合方法,R-Vine Copula风险聚合方法能充分利用资产变量和负债变量之间的相关性信息,适宜用作计算经济资本的内部模型。该模型以风险为导向,为研究资产和负债的联动关系提供一个新的方法,可以帮助财险公司更好地管理风险,并提升整体业务的稳定性和可持续发展能力。

关键词：经济资本 R-Vine Copula 分散化效益破产概率

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西藏退化草地植被和土壤特征及其关系

环境科学 2024年第9期45卷 5341-5350页

作者：李晴婉古晋锴李庆琳李婉池向生建唐国勇中国林业科学研究院高原林业研究所昆明650233 南京林业大学风景园林学院南京210037 云南大学国际河流与生态安全研究院昆明650504

为探究区域尺度上西藏草地退化特征,收集西藏第二次草原普查成果中草地退化数据及国家青藏高原科学数据中心12个植被和土壤参数数据,利用ArcMap在栅格数据上随机选取10000个样点(剔除非草地、沙化和盐碱化草地数据,剩余7949个有效样点)... 详细信息

为探究区域尺度上西藏草地退化特征,收集西藏第二次草原普查成果中草地退化数据及国家青藏高原科学数据中心12个植被和土壤参数数据,利用ArcMap在栅格数据上随机选取10000个样点(剔除非草地、沙化和盐碱化草地数据,剩余7949个有效样点),采取多值提取到点的方法提取每个样点退化和参数数据,分析西藏退化草地植被和土壤特征及其关系,并基于以上指标进行随机森林建模来预测草地生态系统变化趋势.结果表明:①西藏草地主要以高寒草原类和高寒草甸类为主,分别占有效样点45.83%和41.15%;②随草地退化程度加剧,在17个草地类型中,草地型种类的数量逐渐下降,以紫花针茅(Stipa purpurea)和青藏苔草(Carex moorcroftii)等为优势物种的草地型占比下降,杂类草和金露梅(Dasiphora fruticosa)等占比增加;③随退化程度加剧,植被指标普遍呈下降趋势,土壤全氮、全磷、全钾和有机碳降低,土壤pH和容重升高,土壤水分变化不明显;④土壤水分、全氮、全磷、全钾、有机碳、植被覆盖度、植被净初级生产力、归一化植被指数、地上生物量和生物多样性生境指数之间均呈正相关关系,但与土壤pH和容重呈负相关关系,且随退化程度加剧,各指标之间的相关系数降低;⑤随机森林模拟结果表明,在退化过程中土壤容重和生物多样性生境指数的贡献率均超过12%,模型预测准确率达到78%.研究揭示西藏草地退化主要与土壤容重和生物多样性生境指数密切相关,即土壤容重越大或生物多样性生境指数越小,草地退化程度可能越重,可为以后草地保护与管理提供科学依据.

关键词：西藏草地退化植被指标土壤理化性质相关性随机森林

左室流出道ΔVpeak和ΔVTI对胃肠肿瘤术后急性循环衰竭老年患者容量反应性的预测效果

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中华麻醉学杂志 2024年第4期44卷 457-460页

作者：万静洁徐丽解进苏州大学附属第一医院麻醉手术科苏州215000

目的评价左室流出道峰值速度呼吸变异度(ΔVpeak)和速度时间积分呼吸变异度(ΔVTI)对胃肠肿瘤术后急性循环衰竭老年患者容量反应性的预测效果。方法选择于2022年6月至2023年7月在本院择期行胃肠肿瘤手术后转入ICU且存在急性循环衰竭的... 详细信息

目的评价左室流出道峰值速度呼吸变异度(ΔVpeak)和速度时间积分呼吸变异度(ΔVTI)对胃肠肿瘤术后急性循环衰竭老年患者容量反应性的预测效果。方法选择于2022年6月至2023年7月在本院择期行胃肠肿瘤手术后转入ICU且存在急性循环衰竭的老年患者76例,性别不限,年龄65~90岁。被动抬腿(PLR)试验前测定脉压变异度(PPV)。采用经胸超声心动图测量并计算ΔVpeak、ΔVTI和每搏量(SV)。PLR试验后SV增加(ΔSV)大于10%为患者存在容量反应性,并将患者分为2组:有反应组和无反应组。PPV、ΔVpeak、ΔVTI与ΔSV相关性采用Pearson相关分析。绘制受试者工作特征曲线,并计算曲线下面积(AUC),评估PPV、ΔVpeak和ΔVTI预测容量反应性的准确性。结果有反应组36例,无反应组40例。与无反应组相比,有反应组PPV、ΔVpeak和ΔVTI升高(P<0.05)。PPV、ΔVpeak、ΔVTI与ΔSV呈正相关(rPPV=0.485,95%CI 0.291~0.640;rΔVpeak=0.734,95%CI 0.610~0.823;rΔVTI=0.754,95%CI 0.636~0.837;P<0.001)。PPV预测容量反应性的AUC为0.686,截断值为8%,灵敏度为80.6%,特异度为47.5%;ΔVpeak预测容量反应性的AUC为0.868,截断值为12.2%,灵敏度为69.4%,特异度为90.0%;ΔVTI预测容量反应性的AUC为0.885,截断值为12.7%,灵敏度为77.8%,特异度为87.5%。结论左室流出道ΔVpeak和ΔVTI可准确预测胃肠肿瘤术后急性循环衰竭老年患者的容量反应性。

关键词：血管容量超声心动描记术,多普勒老年人胃肠肿瘤

计及时变演化特征的硅泡沫垫层非线性黏弹性模型研究

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应用数学和力学 2024年第2期45卷 167-174页

作者：范志庚万强牛红攀靳凡中国工程物理研究院总体工程研究所四川绵阳621900

基于黏弹性基本理论,引入材料非线性特征,考虑了材料加载、保载应力松弛历史、老化效应以及黏弹性模型各运动单元退化的差异性,并从两种老化机制出发,获得了老化硅泡沫垫层力学模型以及长时应力松弛硅泡沫垫层接续加载力学模型.模型机... 详细信息

基于黏弹性基本理论,引入材料非线性特征,考虑了材料加载、保载应力松弛历史、老化效应以及黏弹性模型各运动单元退化的差异性,并从两种老化机制出发,获得了老化硅泡沫垫层力学模型以及长时应力松弛硅泡沫垫层接续加载力学模型.模型机理清晰,能够反映材料服役历史信息及其对力学效应的影响.

关键词：硅泡沫垫层非线性黏弹性应力松弛老化力学模型

针对周期偏移声信标的广义二阶时延差水声定位模型

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声学学报 2024年第1期49卷 28-37页

作者：刘淼杨卓万光明孙思博付进哈尔滨工程大学水声技术全国重点实验室哈尔滨150001 工业和信息化部海洋信息获取与安全工信部重点实验室(哈尔滨工程大学) 哈尔滨150001 哈尔滨工程大学水声工程学院哈尔滨150001 中国舰船研究设计中心武汉430064 北京锐智集数电子有限公司北京100195

针对具有周期偏移的声信标定位问题,提出了一种广义二阶时延差水声定位模型。将传统二阶时延差拓展至不需要等周期间隔选取定位节点的广义情况,从而进一步提高定位精度;同时,引入松弛算法实现定位节点的最优化,并引入密度聚类算法以提... 详细信息

针对具有周期偏移的声信标定位问题,提出了一种广义二阶时延差水声定位模型。将传统二阶时延差拓展至不需要等周期间隔选取定位节点的广义情况,从而进一步提高定位精度;同时,引入松弛算法实现定位节点的最优化,并引入密度聚类算法以提高输入时延野值的鲁棒性。仿真及湖试数据处理结果表明,该模型相对于传统时延差模型或二阶时延差模型具有更高的定位精度。所提模型实现了针对周期漂移声信标的高精度定位,典型使用场景下的定位精度可达到3 m。

关键词：水声定位声信标长基线定位定位模型