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miR-557 suppresses hepatocellular carcinoma cell proliferation and migration via downregulating CBX4

BIOCELL 2024年第7期48卷 1071-1079页

作者： XULONG SUN wentao ding CHAO JIANG ZHIAN FANG Department of Orthopedics Shanghai General HospitalShanghai Jiao Tong University School of MedicineShanghai200080China Department of General Surgery Shanghai General HospitalShanghai Jiao Tong University School of MedicineShanghai200080China Department of Thoracic Surgery Shanghai Chest HospitalShanghai Jiao Tong University School of MedicineShanghai200030China Department of Radiology Zhongda HospitalSoutheast University School of MedicineNanjing210009China

Introduction:Hepatocellular carcinoma(HCC),a prevalent malignancy,poses signiﬁcant challenges with high tumor heterogeneity and poor ***(miRNAs)play a pivotal role in *** abnormalities in microRNA-557(miR-557)expression have been implicated in various cancer types,its role in HCC remains ***,there is a need to explore the function of microRNA-557 in ***:Candidate miRNAs were identiﬁed through screening in GSE108724 and ***-time PCR was employed to analyze the expression level of miR-557 in hepatoma cell lines and *** viability and migration assays were applied to assess the impact of miR-557 on HCC cell ***,the miR-557 target was predicted through three algorithms(Targetscan,miRWalk,and miRanda),and this was conﬁrmed through luciferase assay and Western ***:In this study,miR-557 was identiﬁed in two datasets and expressed at a low level in both hepatoma cell lines and ***,high expression of miR-557 in HCC cells inhibited ***,low expression of miR-557 enhanced tumor proliferation and *** chromobox 4(CBX4)was identiﬁed as a direct target of *** CBX4 inﬂuenced the functional impact of miR-557 on HCC cell ***:Taken together,our study contributed to elucidating the hepatoma molecular heterogeneity and provided novel insights into miR-557 role and its target CBX4 in HCC,suggesting its potential as a future effectively druggable target for HCC intervention.

关键词： Hepatocellular carcinoma miR-557 Chromobox 4 Hepatocarcinogenesis

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文物保护建筑勘察评估方法——以上海市岳阳路45号住宅为例

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建筑科技 2024年第5期8卷 16-18,24页

作者：丁文韬上海市建筑科学研究院有限公司上海200032

上海市岳阳路45号住宅房屋原为独立式花园住宅,后改作办公使用,为区级文物保护单位。对房屋结构进行了全面勘察,综合材料特性测量数据和承载力计算结果,评估了房屋的完损等级,鉴定了房屋的抗震性能,为后续的修缮和改造工作提供了技术依据。

关键词：文物保护建筑勘察结构检测承载力计算抗震鉴定完损评估

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大豆地方种质资源鲜籽粒可溶性糖含量的全基因组关联分析

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中国农业科学 2024年第11期57卷 2079-2091页

作者：张玉梅丁文涛蓝新隆李清华胡润芳郭娜林国强赵晋铭福建省农业科学院作物研究所/福建省特色旱作物品种选育工程技术研究中心/福建省蔬菜遗传育种重点实验室生物育种钟山实验室南京农业大学农学院/国家大豆生物育种产教融合创新平台/农业农村部大豆生物学与遗传育种重点实验室/作物遗传与种质创新全国重点实验室莆田市农业科学研究所

【目的】可溶性糖含量是鲜食大豆重要的品质性状之一，研究大豆鲜籽粒可溶性糖含量的遗传变异，深入解析可溶性糖含量的遗传机制，为鲜食大豆种质创新及品质育种提供依据。【方法】利用来自东北大豆生态区、北方大豆生态区、黄淮海大豆... 详细信息

【目的】可溶性糖含量是鲜食大豆重要的品质性状之一，研究大豆鲜籽粒可溶性糖含量的遗传变异，深入解析可溶性糖含量的遗传机制，为鲜食大豆种质创新及品质育种提供依据。【方法】利用来自东北大豆生态区、北方大豆生态区、黄淮海大豆生态区和南方大豆生态区的133份大豆地方种质，在2021年连江春季、福清春季和秋季3个环境下对鲜籽粒可溶性糖含量进行表型测定，结合82 187个高质量SNP标记，基于混合线性模型MLM（Q+K）对可溶性糖含量进行全基因组关联分析，挖掘可溶性糖含量显著相关的SNP位点，并以显著SNP位点为中心，两端各扩展119.07 kb连锁不平衡衰减距离为候选区间，根据候选区间内基因的注释和组织表达信息预测候选基因。【结果】3个环境下，鲜籽粒可溶性糖含量的变异范围为3.37—33.84 mg·g-1，遗传变异系数为24.59%—32.69%，可溶性糖含量遗传率为68.14%。通过全基因组关联分析，连江春季、福清春季和秋季3个环境下分别检测到与鲜籽粒可溶性糖含量显著关联的SNP有6、8和22个，表型变异解释率为12.43%—29.27%，以表型变异解释率较高的9个显著SNP位点所在的候选区间进行搜索，共获得86个基因，结合基因注释和组织表达信息，进一步筛选到9个候选基因，主要涉及转录因子、糖蛋白家族和糖类合成转运等生物学过程。其中，Glyma.01g016500、Glyma.13g042100、Glyma.16g131800和Glyma.16g155300在大豆种子及荚中表达水平较高，可作为大豆鲜籽粒可溶性糖的最具潜力候选基因。【结论】通过全基因组关联分析，检测到36个与鲜籽粒可溶性糖含量显著关联的SNP，进一步筛选出9个候选基因可能参与大豆鲜籽粒可溶性糖含量的调控，其中，Glyma.01g016500、Glyma.13g042100、Glyma.16g131800和Glyma.16g155300可作为调控大豆鲜籽粒可溶性糖含量的关键目标基因。

关键词：大豆鲜籽粒可溶性糖含量全基因组关联分析候选基因

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基于跨模态注意力融合的煤炭异物检测方法

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工矿自动化 2024年第1期50卷 57-65页

作者：曹现刚李虎王鹏吴旭东向敬芳丁文韬西安科技大学机械工程学院西安710054 陕西省矿山机电装备智能检测重点实验室西安710054

为解决原煤智能化洗选过程中煤流中夹杂的异物对比度低、相互遮挡导致异物图像检测时特征提取不充分的问题,提出了一种基于跨模态注意力融合的煤炭异物检测方法。通过引入Depth图像构建RGB图像与Depth图像的双特征金字塔网络(DFPN),采... 详细信息

为解决原煤智能化洗选过程中煤流中夹杂的异物对比度低、相互遮挡导致异物图像检测时特征提取不充分的问题,提出了一种基于跨模态注意力融合的煤炭异物检测方法。通过引入Depth图像构建RGB图像与Depth图像的双特征金字塔网络(DFPN),采用浅层的特征提取策略提取Depth图像的低级特征,用深度边缘与深度纹理等基础特征辅助RGB图像深层特征,以有效获得2种特征的互补信息,从而丰富异物特征的空间与边缘信息,提高检测精度;构建了基于坐标注意力与改进空间注意力的跨模态注意力融合模块(CAFM),以协同优化并融合RGB特征与Depth特征,增强网络对特征图中被遮挡异物可见部分的关注度,提高被遮挡异物检测精度;使用区域卷积神经网络(R-CNN)输出煤炭异物的分类、回归与分割结果。实验结果表明:在检测精度方面,该方法的AP相较两阶段模型中较优的Mask transfiner高3.9%;在检测效率方面,该方法的单帧检测时间为110.5 ms,能够满足异物检测实时性需求。基于跨模态注意力融合的煤炭异物检测方法能够以空间特征辅助色彩、形状与纹理等特征,准确识别煤炭异物之间及煤炭异物与输送带之间的差异,从而有效提高对复杂特征异物的检测精度,减少误检、漏检现象,实现复杂特征下煤炭异物的精确检测与像素级分割。

关键词：煤炭异物检测实例分割双特征金字塔网络跨模态注意力融合 Depth图像坐标注意力改进空间注意力

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重组大肠杆菌发酵条件优化提高D-阿洛酮糖3-差向异构酶活性的研究

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食品与发酵工业 2024年第4期50卷 253-259页

作者：刘微微常楚婷冯敬杰张家赫李飞胜丁文涛王昌禄天津科技大学食品科学与工程学院天津300457

功能性稀有糖D-阿洛酮糖主要由基因工程菌株表达D-阿洛酮糖3-差向异构酶(D-allulose 3-epimerase,DAE)催化果糖生产。该研究以表达DAE的重组大肠杆菌为研究对象,利用单因素试验对发酵培养基的碳源、氮源、金属离子等成分进行优化,获得... 详细信息

功能性稀有糖D-阿洛酮糖主要由基因工程菌株表达D-阿洛酮糖3-差向异构酶(D-allulose 3-epimerase,DAE)催化果糖生产。该研究以表达DAE的重组大肠杆菌为研究对象,利用单因素试验对发酵培养基的碳源、氮源、金属离子等成分进行优化,获得了最佳的培养基组合:蔗糖10 g/L、大豆蛋白胨15 g/L、(NH4)2SO_(4)3 g/L、KH2PO_(4)3 g/L、MgSO_(4)0.5 g/L、MnSO_(4)0.025 mmol/L。在此基础上,利用单因素试验对培养条件进行研究,确定了最佳发酵诱导时间(10 h)、接种量(3%,摇瓶)、装液量(30%)以及异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(isopropyl-beta-D-thiogalactopyranoside,IPTG)添加浓度(1 mmol/L),使OD_(600)增加了1.46倍,酶活提高了2.57倍。在此基础上,利用5 L发酵罐进行放大发酵实验,确定了最佳诱导时间。在最佳条件下,经过18 h的诱导发酵,菌体OD_(600)最高值达51.8,干重达到21.5 g/L,酶活达到103.8 U/mL。当细胞添加量为0.014 g DCW/L时,以500 g/L D-果糖为底物,pH为7,50℃,1 h转化率达28.76%,D-阿洛酮糖最高生成量可达149.74 g/L。该研究对D-阿洛酮糖3-差向异构酶的发酵生产具有参考价值。

关键词： D-阿洛酮糖-3-差向异构酶重组大肠杆菌高密度发酵发酵优化重组蛋白

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Toward a rapid and convenient nanoplastic quantification method in laboratory-scale study based on fluorescence intensity

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Frontiers of Environmental Science & Engineering 2024年第5期18卷 117-126页

作者： Ruiqi Yan Sen Lin Qian ding Lei Zhang Xia Yu wentao Zhao Qian Sui State Environmental Protection Key Laboratory of Environmental Risk Assessment and Control on Chemical Process School of Resources and Environmental EngineeringEast China University of Science and TechnologyShanghai200237China State Key Laboratory of Pollution Control and Resource Reuse College of Environmental Science and EngineeringTongji UniversityShanghai200092China Shanghai Institute of Pollution Control and Ecological Security Shanghai200092China

The thorough investigation of nanoplastics(NPs)in aqueous environments requires efficient and expeditious quantitative analytical methods that are sensitive to environmentally relevant NP concentrations and convenient to *** analysis-based quantitative methods have been acknowledged as effective and rapid approaches for quantifying NP concentrations in laboratory-scale ***,we compared three commonly used optical response indicators,namely fluorescence intensity(FI),ultraviolet absorbance,and turbidity,to assess their performance in quantifying ***,orthogonal experiments were conducted to evaluate the influence of various water quality parameters on the preferred indicator-based quantification *** results revealed that FI exhibits the highest correlation coefficient(>0.99)with NP ***,the limit of quantification(LOQ)for various types of NPs is exceptionally low,ranging from 0.0089 to 0.0584 mg/L in ultrapure water,well below environmentally relevant *** variations in water quality parameters such as pH,salinity,suspended solids(SS),and humic acid,a robust relationship between detectable FI and NP concentration was ***,an increased matrix,especially SS in water samples,results in an enhanced LOQ for ***,the quantitative method remains applicable in real water bodies,especially in drinking water,with NP LOQ as low as 0.0157–0.0711 mg/*** exceeds the previously reported detectable concentration for 100 nm NPs at 40µg/mL using surface-enhanced Raman *** study confirms the potential of FI as a reliable indicator for the rapid quantification of NPs in aqueous environments,offering substantial advantages in terms of both convenience and cost-effectiveness.

关键词： Nanoplastic quantification Fluorescence intensity Drinking water Limit of quantification(LOQ) Matrix effects

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基于代谢组学的白黄链霉菌TD-1高产帕马霉素代谢机制

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食品科学技术学报 2024年第4期42卷 114-124页

作者：刘秀雨李丽李王强丁文涛刘欢欢李贞景路来风郭庆彬王昌禄天津科技大学食品科学与工程学院天津300457 天津科技大学省部共建食品营养与安全国家重点实验室天津300457

真菌毒素给食品安全带来了重大威胁,帕马霉素对病原真菌有良好的生物抑菌活性。为提高帕马霉素产量,基于代谢组学分析方法,研究了白黄链霉菌(Streptomyces alboflavus)T D-1在两种不同发酵培养基(添加与不添加1,2-丙二醇)中生长及代谢... 详细信息

真菌毒素给食品安全带来了重大威胁,帕马霉素对病原真菌有良好的生物抑菌活性。为提高帕马霉素产量,基于代谢组学分析方法,研究了白黄链霉菌(Streptomyces alboflavus)T D-1在两种不同发酵培养基(添加与不添加1,2-丙二醇)中生长及代谢、胞内代谢产物及代谢通路的差异,对代谢产物的变化进行了评估和分析,结合显著差异代谢产物含量变化与代谢通路的交互关系,揭示了帕马霉素生物合成的高产机理。结果表明:培养基添加1,2-丙二醇后,白黄链霉菌T D-1产帕马霉素产量明显提高。利用气相色谱-质谱联用技术,鉴定出27种显著差异胞内代谢产物与帕马霉素生物合成密切相关,主要参与中心碳代谢、氨基酸代谢及脂肪酸代谢通路。此外,通过采用添加主要显著差异前体物策略,添加谷氨酸使帕马霉素产量提高102.33%。基于代谢组学分析确定添加前体物方法,可有效提高帕马霉素产量。本研究旨在为防治粮食加工食品的黄曲霉及黄曲霉毒素污染,从源头保障食品安全提供技术参考。

关键词：帕马霉素代谢组学白黄链霉菌T D-1 1,2-丙二醇前体物

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酶法制备瓜尔胶水解物的体外酵解特性分析

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食品研究与开发 2024年第6期45卷 90-98页

作者：王金梦孙春晓吴勃王云龙丁文涛郭庆彬王昌禄天津科技大学食品科学与工程学院天津300457 杭州保安康生物技术有限公司浙江杭州310014 天津科技大学省部共建食品营养与安全国家重点实验室天津300457

为研究不同分子量的瓜尔胶(guar gum,GG)水解物对肠道菌群的影响,以瓜尔胶为原料,通过酶解法制备3种不同分子量的瓜尔胶水解物(guar gum hydrolysate,GGH),其分子量分别为32.41 kDa(GGH-1)、10.15 kDa(GGH-2)和5.89 kDa(GGH-3),采用猪... 详细信息

为研究不同分子量的瓜尔胶(guar gum,GG)水解物对肠道菌群的影响,以瓜尔胶为原料,通过酶解法制备3种不同分子量的瓜尔胶水解物(guar gum hydrolysate,GGH),其分子量分别为32.41 kDa(GGH-1)、10.15 kDa(GGH-2)和5.89 kDa(GGH-3),采用猪结肠消化物构建体外酵解模型,研究GG及其水解产物的体外酵解特性。结果表明:在酵解过程中,GG和3种GGH的分子量逐渐降低,总糖含量显著降低,还原糖含量先增后减。酵解体系的pH值均显著降低(P<0.05),GGH-1显著促进总短链脂肪酸、乙酸、丁酸的生成,GGH-3显著促进丙酸的生成。GG和不同分子量的GGH均可以提高乳杆菌属和梭菌属的相对丰度,抑制链球菌属的增长,其中GGH-3对肠道菌群组成的影响最为显著。

关键词：瓜尔胶瓜尔胶水解物体外酵解短链脂肪酸肠道菌群

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Simultaneous Degradation, Dehalogenation, and Detoxification of Halogenated Antibiotics by Carbon Dioxide Radical Anions

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Engineering 2024年第6期37卷 78-86页

作者： Yanzhou ding Xia Yu Shuguang Lyu Huajun Zhen wentao Zhao Cheng Peng Jiaxi Wang Yiwen Zhu Chengfei Zhu Lei Zhou Qian Sui State Environmental Protection Key Laboratory of Environmental Risk Assessment and Control on Chemical Process School of Resources and Environmental EngineeringEast China University of Science and TechnologyShanghai 200237China Shanghai Institute of Pollution Control and Ecological Security Shanghai 200092China State Key Laboratory of Pollution Control and Resource Reuse College of Environmental Science and EngineeringTongji UniversityShanghai 200092China Shanghai Academy of Environmental Sciences Shanghai 200233China

Despite the extensive application of advanced oxidation processes(AOPs)in water treatment,the efficiency of AOPs in eliminating various emerging contaminants such as halogenated antibiotics is constrained by a number of *** moieties exhibit strong resistance to oxidative radicals,affecting the dehalogenation and detoxification *** address these limitations of AOPs,advanced reduction processes(ARPs)have been ***,a novel nucleophilic reductant—namely,the carbon dioxide radical anion(CO_(2)^(·-))—is introduced for the simultaneous degradation,dehalogenation,and detoxification of florfenicol(FF),a typical halogenated *** results demonstrate that FF is completely eliminated by CO_(2)^(·-),with approximately 100%of Cland 46%of Freleased after 120 min of *** detoxification is observed,which exhibits a linear response to the release of free inorganic halogen ions(R2=0.97,p75%)in degrading a series of halogenated antibiotics,including chloramphenicol(CAP),thiamphenicol(THA),diclofenac(DLF),triclosan(TCS),and ciprofloxacin(CIP).The system shows high tolerance to the pH of the solution and the presence of natural water constituents,and demonstrates an excellent degradation performance in actual groundwater,indicating the strong application potential of CO_(2)^(·-)-based ARPs in real ***,this study elucidates the feasibility of CO_(2)^(·-)for the simultaneous degradation,dehalogenation,and detoxification of halogena

关键词： Carbon dioxide radical anions Advanced reduction processes Halogenated antibiotics Dehalogenation Detoxification

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ROS-responsive nanoparticles targeting inflamed colon for synergistic therapy of inflammatory bowel disease via barrier repair and anti-inflammation

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Nano Research 2024年第6期17卷 5409-5423页

作者： ding Wang Qi Jiang Ruoyu Shen Lijun Peng wentao Zhou Tingting Meng Fuqiang Hu Jianwei Wang Hong Yuan College of Pharmaceutical Science Zhejiang UniversityHangzhou 310058China Jinhua Institute of Zhejiang University Jinhua 321299China The Second Affiliated Hospital Zhejiang University School of Medicine Hangzhou 310009China

The destruction of the intestinal barrier is likely to cause an increase in intestinal permeability and cause pathological *** studies have demonstrated that intestinal barrier function plays an important role in the occurrence and development of inflammatory bowel disease(IBD).Oral administration is the most common route for intestinal *** this study,a synergistic strategy is proposed for IBD management through active barrier repair combined with anti-inflammatory treatment,which can interrupt the pathological process of IBD,resulting in the significantly improved efficacy of existing *** on the specific pH values and high reactive oxygen species(ROS)levels in inflammatory sites of IBD,an orally administrated ROS-responsive drug delivery system targeting inflamed colon has been designed,and confirmed in vitro and in *** anti-inflammatory drug dexamethasone acetate(Dex)and the barrier function regulator LY294002 are delivered by the synthesized nanocarrier to treat IBD synergistically by inhibiting inflammation and actively repairing the intestinal barrier through tight junctions(TJs).The accumulation of nanocarriers in the inflamed colon and synergistic efficacy has been validated in mice with *** brief,a drug delivery system and a therapeutic strategy for IBD are successfully developed.

关键词： nanotechnology reactive oxygen species(ROS)-responsive targeted delivery inflammatory bowel disease(IBD) intestinal barrier combination treatment

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