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Systematic analysis of DNA polymerases as therapeutic targets in pan-cancers

BIOCELL 2024年第1期48卷 123-138页

作者： ZHENHUA LI HUILAI LV FAN zhang ZIMING ZHU QIANG GUO MINGBO WANG CHAO HUANG LIJUAN CHEN wenpan zhang YUN LI ZIQIANG TIAN Department of Thoracic Surgery Fourth Hospital of Hebei Medical UniversityShijiazhuang050011China Department of Thoracic Surgery The First Hospital of XingtaiXingtai054001China Department of Thoracic Surgery Affiliated Hospital of Hebei UniversityBaoding050017China Shanghai OrigiMed Co. Ltd.Shanghai200000China Department of Thoracic Surgery The Seventh Affiliated Hospital of Sun Yat-sen UniversityShenzhen518107China

Introduction:DNA polymerases are crucial for maintaining genome stability and influencing ***,the clinical implications of DNA polymerases in tumorigenesis and their potential as anti-cancer therapy targets are not well ***:We conducted a systematic analysis using TCGA Pan-Cancer Atlas data and Gene Set Cancer Analysis results to examine the expression profiles of 15 DNA polymerases(POLYs)and their clinical *** also evaluated the prognostic value of POLYs by analyzing their expression levels in relation to overall survival time(OS)using Kaplan-Meier survival ***,we investigated the correlations between POLY expression and immune cells,DNA damage repair(DDR)pathways,and *** sensitivity analysis was performed to assess the relationship between POLY expression and drug ***:Our analysis revealed that 14 out of 15 POLYs exhibited significantly distinct expression patterns between tumor and normal samples across most cancer types,except for DNA nucleotidylexotransferase(DNTT).Specifically,POLD1 and POLE showed elevated expression in almost all cancers,while POLQ exhibited high expression levels in all cancer *** POLYs showed heightened expression in specific cancer subtypes,while others exhibited low ***-Meier survival curves demonstrated significant prognostic value of POLYs in multiple cancers,including PAAD,KIRC,and *** analysis further validated these *** patterns of POLYs varied significantly among different cancer types and were associated with poorer survival *** correlations were observed between the expression of POLY members and immune cells,DDR pathways,and *** sensitivity analysis indicated an inverse relationship between POLY expression and drug ***:Our comprehensive study highlights the significant role of POLYs in cancer development and identifies them as promising prognostic and

关键词： DNA polymerases(POLYs) Prognostic biomarker The Cancer Genome Atlas(TCGA) Ubiquitination network

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激光制导武器对抗半实物仿真弹干视线角模拟精度分析

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激光与光电子学进展 2015年第1期52卷 103-111页

作者：李慧甘霖张文攀梁巍巍中国洛阳电子装备试验中心河南洛阳471003

研究了激光制导武器对抗半实物仿真系统高重频激光干扰试验中弹干视线角动态模拟过程,分析了弹干视线角模拟精度分析的完整过程。全面分析了影响弹干视线角模拟精度的几何误差、控制误差和光学系统误差源,并采用一种多体系统误差分析建... 详细信息

研究了激光制导武器对抗半实物仿真系统高重频激光干扰试验中弹干视线角动态模拟过程,分析了弹干视线角模拟精度分析的完整过程。全面分析了影响弹干视线角模拟精度的几何误差、控制误差和光学系统误差源,并采用一种多体系统误差分析建模理论,建立了弹干视线角模拟误差模型。设计了弹干视线角模拟误差实验测试方法,通过误差建模和实验测试相结合可得到弹干视线角模拟误差模型中的误差项。提出了采用残差分析或蒙特卡罗仿真方法进行弹干视线角模拟精度分析,得到视线角模拟误差估计值及变化规律。

关键词：激光技术高重频激光激光干扰弹干视线角多体系统

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激光干扰CCD规则亮点分布原理研究

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红外与激光工程 2016年第11期45卷 113-117页

作者：陈前荣亓凤杰王彦斌张文攀李华光电对抗测试评估技术重点实验室河南洛阳471003 中国洛阳电子装备试验中心河南洛阳471003

激光干扰CCD时光的传输过程的研究,对激光干扰CCD干扰图像的仿真、干扰效果的分析等具有重要意义。理论分析了考虑探测器表面反射时的激光干扰CCD时光的传输过程。由于透镜的作用,首先激光会聚焦到探测器表面。聚焦光会被探测器表面反... 详细信息

激光干扰CCD时光的传输过程的研究,对激光干扰CCD干扰图像的仿真、干扰效果的分析等具有重要意义。理论分析了考虑探测器表面反射时的激光干扰CCD时光的传输过程。由于透镜的作用,首先激光会聚焦到探测器表面。聚焦光会被探测器表面反射。由于CCD探测面是网格状分布,反射光的分布会被这一结构调制。反射后的光经过透镜,会成像在某些平面上。根据透镜中光的传输计算发现,因为透镜的傅里叶变换作用,光阑平面上会出现周期性的亮点分布。由于光阑平面上不透光的部分的反射,亮点会再次成像在探测器表面上。仿真了亮点被光阑平面上不透光部分的反射后,经过光阑后面的透镜又成像在探测器上的过程,得到了规则的周期性的亮点分布。实验结果验证了这一理论。

关键词：激光干扰 CCD 光传输规则亮点

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基于实测数据的激光高重频干扰效果数学仿真

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红外与激光工程 2013年第7期42卷 1710-1715页

作者：殷瑞光张文攀刘艳芳王敏梁巍巍电子信息系统复杂电磁环境效应国家重点实验室中国人民解放军63892部队

为了解决激光高重频干扰效果评估的问题,设计了高重频激光干扰导引头实物实验,利用实测数据建立了干扰效果模型。通过比较实验情况与数学仿真战情中导引头工作状态的区别,验证了模型的可信度。分析了光斑大小和能量分布、激光入射光线... 详细信息

为了解决激光高重频干扰效果评估的问题,设计了高重频激光干扰导引头实物实验,利用实测数据建立了干扰效果模型。通过比较实验情况与数学仿真战情中导引头工作状态的区别,验证了模型的可信度。分析了光斑大小和能量分布、激光入射光线与导引头轴线夹角、导引头接收能量密度等因素对制导信号生成的影响。采用蒙特卡洛方法对激光高重频引诱干扰和扰乱干扰情况下制导炸弹进行了弹道仿真,对其落点分布进行了分析。

关键词：激光制导武器激光导引头实测数据激光高重频弹道仿真

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对激光精确制导武器干扰效果仿真评估标准初探

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红外与激光工程 2013年第4期42卷 900-903页

作者：张文攀刘艳芳殷瑞光赵宏鹏汪亚电子信息系统复杂电磁环境效应国家重点实验室中国人民解放军63892部队

为了解决对激光精确制导武器干扰效果仿真评估的问题,需要利用闭环实验方法获得的激光精确制导武器落点进行评估并建立以落点为评价对象的效果评估标准。文中采用概率论与数理统计方法得到了对激光精确制导武器干扰效果仿真评估标准建... 详细信息

为了解决对激光精确制导武器干扰效果仿真评估的问题,需要利用闭环实验方法获得的激光精确制导武器落点进行评估并建立以落点为评价对象的效果评估标准。文中采用概率论与数理统计方法得到了对激光精确制导武器干扰效果仿真评估标准建立方法,采用柯尔莫哥罗夫-斯米尔诺夫检验手段确定了某激光精确制导武器的落点分布规律并建立了对该激光精确制导武器角度欺骗干扰效果评估标准,评估了某角度欺骗干扰设备对该激光精确制导武器的干扰效果。该标准可以较为准确地评估角度欺骗干扰设备对激光精确制导武器的干扰效果,初步解决了对激光精确制导武器干扰效果数学仿真评估的问题。

关键词：评估标准光电对抗仿真圆概率误差激光制导武器柯尔莫哥罗夫-斯米尔诺夫检验

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激光损伤四象限探测器对制导武器的影响

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红外与激光工程 2013年第10期42卷 2672-2676页

作者：梁巍巍殷瑞光李慧赵宏鹏张文攀中国洛阳电子装备试验中心河南洛阳471003

对激光损伤四象限探测器对制导武器的影响进行了研究。首先,简述了激光硬损伤光电探测器机理和四象限探测器目标探测定位原理;接着,建立四象限探测器模型,针对不同损伤情况,计算了归一化探测曲线和探测器偏移量;然后,将不同损伤情况下... 详细信息

对激光损伤四象限探测器对制导武器的影响进行了研究。首先,简述了激光硬损伤光电探测器机理和四象限探测器目标探测定位原理;接着,建立四象限探测器模型,针对不同损伤情况,计算了归一化探测曲线和探测器偏移量;然后,将不同损伤情况下的角偏差信号送入激光制导炸弹运动控制模型,得到了不同四象限探测器损伤状态下激光制导炸弹弹道曲线;最后,分析了四象限探测器不同损伤距离下激光制导武器的脱靶量。研究表明,四象限探测器损伤程度和损伤距离都会对激光制导武器产生影响。该研究结果对大功率激光压制半主动激光制导武器效果评估有一定帮助。

关键词：激光损伤四象限探测器激光制导武器压制干扰

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径向偏振调制对聚焦光斑匀滑及偏振特性的影响

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强激光与粒子束 2015年第12期27卷 103-108页

作者：任广森孙全吴武明宁禹陈前荣张文攀中国洛阳电子装备试验中心河南洛阳471003 国防科学技术大学光电科学与工程学院长沙410073

基于标量衍射理论建立了光谱色散平滑(SSD)、随机相位板(RPP)和偏振匀滑(PS)联用的光束匀滑方案数值仿真模型。以斑纹对比度和偏振度为主要评价参量,利用该模型研究了径向偏振调制的匀滑及消偏振特性。研究表明,径向偏振调制可以有效降... 详细信息

基于标量衍射理论建立了光谱色散平滑(SSD)、随机相位板(RPP)和偏振匀滑(PS)联用的光束匀滑方案数值仿真模型。以斑纹对比度和偏振度为主要评价参量,利用该模型研究了径向偏振调制的匀滑及消偏振特性。研究表明,径向偏振调制可以有效降低聚焦光斑斑纹对比度和偏振度。使用半波片拼接方式产生近似径向偏振光时,拼接单元数对匀滑及偏振特性影响较小,8片拼接的匀滑效果已与理想径向偏振光几乎一致。对比分析了径向偏振调制、正交偏振调制和双折射楔三种PS方式,结果表明,由于三种PS方式本质上的一致性,光束的匀滑及偏振特性差别较小。

关键词：径向偏振光束光束匀滑偏振匀滑

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激光干扰试验中光纤耦合效率与稳定性研究

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应用激光 2011年第4期31卷 296-298页

作者：李慧胡欣殷瑞光甘霖张文攀 63880部队博士后科研工作站 63892部队

光纤耦合效率的大小与稳定性直接影响激光干扰试验中能量的模拟精度。对1.06μm脉冲激光器与多模光纤直接耦合时的耦合效率进行了实验研究,分析了激光束相对光纤接收端面不同角度入射与光纤以正弦甩动情况下的耦合效率及稳定性,结果表明... 详细信息

光纤耦合效率的大小与稳定性直接影响激光干扰试验中能量的模拟精度。对1.06μm脉冲激光器与多模光纤直接耦合时的耦合效率进行了实验研究,分析了激光束相对光纤接收端面不同角度入射与光纤以正弦甩动情况下的耦合效率及稳定性,结果表明:光纤运动情况下,耦合效率下降很小,偏转光纤接收端面,由于反射损耗的影响耦合效率明显下降,光纤耦合效率变化在3%～5%,稳定性较好,总体耦合效率满足激光干扰试验的使用要求。

关键词：光纤光学耦合效率耦合稳定性不同入射角

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Sequence-based ultra-dense genetic and physical maps reveal structural variations of allopolyploid cotton genomes

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江苏省遗传学会第九次会员代表大会暨学术研讨会

作者： WANG Sen CHEN Jiedan zhang wenpan HU Yan CHANG Lijing FANG Lei WANG Qiong LV Fenni WU Huaitong SI Zhanfeng CHEN Shuqi CAO Caiping ZHU Xiefei ZHOU Baoliang GUO Wangzhen zhang Tianzhen State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement Cotton Hybrid R ＆ D Engineering Center （the Ministry of Education） Nanjing Agricultural University

SNPs are the most abundant polymorphism type, and have been explored in many crop genomic studies, including rice and maize. SNP discovery in allotetraploid cotton genomes has lagged behind that of other crops due to their complexity and polyploidy. In this study, genome-wide SNPs are detected systematically using next-generation sequencing and efficient SNP genotyping methods, and used to construct a linkage map and characterize the structural variations in polyploid cotton genomes. We construct anultra-denseinterspecificgeneticmap comprising 4,999,048 SNP loci distributed unevenly in 26 allotetraploid cotton linkage groups and covering 4,042 cM. The map is used to order tetraploid cotton genome scaffolds for accurate assembly of G. hirsutum acc. TM-1. Recombination rates and hotspots are identified across the cotton genome by comparing the assembled draft sequence and the genetic map. Using this map, genome rearrangements and centromeric regions are identified in tetraploid cotton by combining information from the publicly-available G. raimondii genome with fluorescent in situ hybridization analysis. We report the genotype-by-sequencing method used to identify millions of SNPs between G. hirsutum and G. barbadense. We construct and use an ultra-dense SNP map to correct sequence mis-assemblies, merge scaffolds into pseudomolecules corresponding to chromosomes, detect genome rearrangements, and identify centromeric regions in allotetraploid cottons. We find that the centromeric retro-element sequence of tetraploid cotton derived from the D subgenome progenitor might have invaded the A subgenome centromeres after allotetrapolyploid formation. This study serves as a valuable genomic resource for genetic research and breeding of cotton.

关键词： F cotton WGS SNPs genotyping linkage map rearrangement centromeric region

来源： cnki会议评论

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甘蔗染色体研究近况

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热带作物学报 2016年第7期37卷 1430-1436页

作者：沈姣王凯张文盼董广蕊石岩张积森福建师范大学生命科学院福建福州350108 福建农林大学基因与生物技术研究中心福建福州350002

甘蔗是非整倍性异源多倍体作物,遗传背景高度复杂,其细胞生物学研究难度大。近年分子标记技术以及原位杂交技术等快速发展使甘蔗细胞学研究也取得明显进展。本文主要围绕甘蔗核型、染色体行为、原位杂交技术在甘蔗上的应用展开综述,以... 详细信息

甘蔗是非整倍性异源多倍体作物,遗传背景高度复杂,其细胞生物学研究难度大。近年分子标记技术以及原位杂交技术等快速发展使甘蔗细胞学研究也取得明显进展。本文主要围绕甘蔗核型、染色体行为、原位杂交技术在甘蔗上的应用展开综述,以期为高倍体植物细胞学研究提供参考。

关键词：甘蔗多倍体染色体原位杂交技术

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