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A genome scan of recent positive selection signatures in three sheep populations

Journal of Integrative Agriculture 2016年第1期15卷 162-174页

作者： ZHAO Fu-ping wei cai-hong ZHANG Li LIU Jia-sen WANG Guang-kai ZENG Tao DU Li-xin National Center for Molecular Genetics and Breeding of Animal Institute of Animal Sciences Chinese Academy of Agricultural Sciences Institute of Animal Science Inner Mongolia Academy of Agricultural & Animal Husbandry Sciences College of Animal Science and Technology Sichuan Agricultural University

Domesticated sheep have been exposed to artificial selection for the production of fiber, meat, and milk as well as to natural selection. Such selections are likely to have imposed distinctive selection signatures on the sheep genome. Therefore, detecting selection signatures across the genome may help elucidate mechanisms of selection and pinpoint candidate genes of interest for further investigation. Here, detection of selection signatures was conducted in three sheep breeds, Sunite （n=66）, German Mutton （n=159）, and Dorper （n=93）, using the Illumina OvineSNP50 Genotyping BeadChip array. Each animal provided genotype information for 43 273 autosomal single nucleotide polymorphisms （SNPs）. We adopted two complementary haplotype-based statistics of relative extended haplotype homozygosity （REHH） and the cross-popu- lation extended haplotype homozygosity （XP-EHH） tests. In total, 707,755, and 438 genomic regions subjected to positive selection were identified in Sunite, German Mutton, and Dorper sheep, respectively, and 42 of these regions were detected using both REHH and XP-EHH analyses. These genomic regions harbored many important genes, which were enriched in gene ontology terms involved in muscle development, growth, and fat metabolism. Fourteen of these genomic regions overlapped with those identified in our previous genome-wide association studies, further indicating that these genes under positive selection may underlie growth developmental traits. These findings contribute to the identification of candidate genes of interest and aid in understanding the evolutionary and biological mechanisms for controlling complex traits in Chinese and western sheep.

关键词： selection signature detection sheep genome REHH test XP-EHH test SNP chip

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ROC curves in evaluation of serum fibrosis indices for hepatic fibrosis

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World Journal of Gastroenterology 2002年第6期8卷 1073-1076页

作者： Min Zheng wei-Min cai hong-Lei Weng Rong-Hua Liu,Institute of Infectious Diseases,First Affiliated Hospital,School of Medicine,Zhejiang University,Hangzhou 310003 Zhejiang Province,China Institute of Infectious Diseases First Affiliated Hospital School of Medicine Zhejiang University Hangzhou 310003 Zhejiang Province China. charming-hz@***

AIM: Use Receiver operating characteristic (ROC) curves to find out the relationship between serum level of hyaluronic acid (HA), type Ⅲ procollagen (PCⅢ), N-terminal procollagen Ⅲ peptide (PⅢNP), laminin (LN), type Ⅳ collagen (C-Ⅳ) and hepatic fibrosis, as well as to determine their value in clinical ***: 114 serum samples from chronic hepatitis patients were assayed for fibrosis indices including HA, PCⅢ, PⅢNP, LN and Ⅳ-C with radioimmunoassay (RIA). Liver biopsy was also performed in all these patients and the biopsy material was examined ***: ROC curves analysis showed that area under the curve (AUC) of PⅢNP, HA, PCⅢ, C-Ⅳ and LN was 0.800,0.728, 0.727, 0.583 and 0.463, respectively. The analysis also showed that PⅢNP (r=0.452), HA (r=0.497) and PCⅢ (r=0.404) have greater diagnosis performances than C-Ⅳ (r=0.238) and LN (r=0.128) according to fibrosis staging. The sensitivity of HA plus PⅢNP was 55.1%, it was the most sensitive combination. Combined three or more than three indices that based on HA, the specificity was 100 %.Using combination assays can improve the specificity, but its sensitivity was not high. Serum fibrosis indices increased as the grade of inflammation aggravated. But only PⅢNP and PCⅢ had significant difference between G1 and G2 (PⅢNP: 13.16±8.07 VS8.32±5.09; PCⅢ: 164.22±65.69 VS 138.23±77.63). The coefficient correlation of the results of inflammation grade and fibrosis staging to HA was 0.525 and 0.553 respectively, that to PCⅢ, 0.446 and 0.412, that to LN, 0.234 and 0.194, and that to Ⅳ-C, 0.363 and 0.351, ***: Serum fibrosis indices can indicate tendency of hepatic fibrosis, but it cannot replace liver biopsy. However, as diagnostic markers, more efficient serum fibrosis indices for the diagnosis of hepatic fibrosis need to be explored.

关键词：肝纤维化血清纤维化指标 ROC曲线评价

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Diagnostic value of platelet derived growth factor-BB,transforming growth factor-131,matrix metalloproteinase-1,and tissue inhibitor of matrix metalloproteinase-1 in serum and peripheral blood mononuclear cells for hepatic fibrosis

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World Journal of Gastroenterology 2003年第11期9卷 2490-2496页

作者： Bin-Bin Zhang wei-Min cai hong-Lei Weng Zhong-Rong Hu Jun Lu Min Zheng Rong-Hua Liu, Institute of Infectious Diseases, First Affiliated Hospital, School of Medicine, Zhejiang University, Hangzhou 310003, Zhejiang Province, China Institute of Infectious Diseases First Affiliated Hospital School of Medicine Zhejiang University Hangzhou 310003 Zhejiang Province China. zbb-2051@***

AIM: Noninvasive diagnosis of hepatic fibrosis has become the focus because of the limited biopsy, especially in the surveillance of treatment and in screening hepatic fibrosis. Recently, regulatory elements involved in liver fibrosis, such as platelet derived growth factor-BB (PDGF-BB), transforming growth factor-β1(TGF-β1), matrix metalloproteinase-1 (MMP-1), and tissue inhibitor of matrix metalloproteinase-1 (TIMP-1), have been studied extensively. To determine whether these factors or enzymes could be used as the indices for the diagnosis of hepatic fibrosis, we investigated them by means of receiver operating characteristic (ROC) curve. METHODS: Serum samples from sixty patients with chronic viral hepatitis B and twenty healthy blood donors were assayed to determine the level of PDGF-BB, TGF-β1, MMP-1, and TIMP-1 with ELISA, and HA, PCIII, C-IV, and LNlevel with RIA. The message RNA (mRNA) expression of TIMP-1 and MMP-1 in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) was detected by RT-PCR and Northern blot hybridization. Liver biopsy was performed in all patients. The biopsy samples were histopatholocjically examined. The trial was double-blind controlled. RESULTS: The serum level of PDGF-BB, TIMP-1, the ratio of TIMP-1 and MMP-1 (TIMP-1/MMP-1), mRNA expression of TIMP-1 (TIMP-lmRNA), and the ratio of TIMP-lmRNA and MMP-lmRNA (TIMP-lmRNA/MMP-lmRNA) in patients was significantly higher than those in the healthy blood donors (t=2.514-11.435, P=0.000-0.016). The serum level of PDGF-BB, TIMP-1, TIMP-1/MMP-1, and TIMP-lmRNA was positively correlated with fibrosis stage and inflammation grade (r=0.239-0.565, P=0.000-0.033), while the serum level of MMP-1 was negatively correlated with fibrosis stage and inflammation grade, and TIMP-lmRNA/MMP-lmRNA was positively correlated with inflammation grade. Through the analysis by ROC curve, serum PDGF-BB was the most valuable marker, and its sensitivity was the highest among the nine indices. The markers with the highest spe

关键词：外周血基质多发蛋白酶-1 单核细胞肝纤维化转化生长因子血小板衍化生长因子

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基于DSP的矿用运输机车调速系统设计

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煤炭技术 2017年第9期36卷 204-206页

作者：魏宏财辽源职业技术学院吉林辽源136201

针对传统矿用直流驱动型运输机车可靠性低以及寿命短等问题,设计了一种基于开关磁阻电机的矿用运输机车调速系统。首先给出了系统的设计方案,详细介绍了直流电源、驱动电路、电流位置检测电路等硬件电路;根据系统的运行特性对系统软件... 详细信息

针对传统矿用直流驱动型运输机车可靠性低以及寿命短等问题,设计了一种基于开关磁阻电机的矿用运输机车调速系统。首先给出了系统的设计方案,详细介绍了直流电源、驱动电路、电流位置检测电路等硬件电路;根据系统的运行特性对系统软件进行了设计。最后通过实验验证了所设计调速系统的良好性能。

关键词：矿用运输机车开关磁阻电机调速系统 DSP

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A Digital Rights Management System with P2P Mechanism

A Digital Rights Management System with P2P Mechanism

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2011 4th IEEE International Conference on Computer Science and Information Technology(ICCSIT 2011)

作者： LIN Zeming CHEN Kun CHEN Benqing WANG Youbang cai wei-hong Department of Computer Science and Technology Shantou University

ISBN: (纸本)9781612848334

This paper designs a Digital Rights Management System with P2P mechanism which proposes new media encryption techniques and media distribution techniques based on the characteristics of DRM and P2P Mechanisms in which two different distribution modes are proposed, hybrid distributed mode and pure distributed mode, then illustrates the two modes respectively and compares with each other on performance and security. It not only protects the copyright of digital media but also takes advantage of characteristics of P2P on transmission and distributed computing making encrypted media spread over more apace in the DRM commerce architectures.

关键词： DRM P2P Random key Machine fingerprints

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发展县域循环经济的探索——以德化县发展循环经济为例

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林业经济问题 2006年第6期26卷 562-565页

作者：蔡卫红福建省泉州市水利局福建泉州362000

对循环经济理念下县域经济从构建到完善,从主导产业的选择到三次产业结构的配置等一系列问题进行了探讨,并以德化县为例阐明循环经济体系的建设是一个不断完善的过程,建议德化县在已有的循环经济的雏形上进一步完善高质高效的县域循环... 详细信息

对循环经济理念下县域经济从构建到完善,从主导产业的选择到三次产业结构的配置等一系列问题进行了探讨,并以德化县为例阐明循环经济体系的建设是一个不断完善的过程,建议德化县在已有的循环经济的雏形上进一步完善高质高效的县域循环经济体系,保证该循环经济的可持续性。

关键词：循环经济县域经济可持续发展德化

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基于选择性马尔可夫模型的缓存预取策略

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通信学报 2010年第2期31卷 58-66页

作者：蔡伟鸿肖水韦岗熊智黄敏华华南理工大学电子与信息学院广东广州510006 汕头大学计算机系广东汕头515063

通过分析研究现有流媒体缓存管理算法和用户的访问行为特征,提出了一种新的基于选择性马尔可夫模型的缓存预取策略。该策略通过序列合并方法对用户访问拖曳行为进行建模,采用状态剪枝优化方法FP_Vlike得到选择性马尔可夫模型FPMM_Vlike... 详细信息

通过分析研究现有流媒体缓存管理算法和用户的访问行为特征,提出了一种新的基于选择性马尔可夫模型的缓存预取策略。该策略通过序列合并方法对用户访问拖曳行为进行建模,采用状态剪枝优化方法FP_Vlike得到选择性马尔可夫模型FPMM_Vlike,并在此之上结合替换算法LRU-2构建出一种流媒体代理服务器缓存预取机制FPVlike_LRU-2。仿真结果表明,在访问延时降低量方面,FPVlike_LRU-2要比FP_LRU-2、SP_LRU-2、LRU-2分别高出10%、12%、17%,且在最佳的情况下该值能够达到60%以上。

关键词：选择性马尔可夫模型代理服务器延时降低量缓存预取

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应用服务器集群能耗与性能平衡的在线实时优化

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控制与决策 2021年第11期36卷 2589-2598页

作者：熊智赵悦源许建龙蔡玲如蔡伟鸿汕头大学计算机系广东汕头515063 智能制造技术教育部重点实验室(汕头大学) 广东汕头515063

如何根据负载状况实时优化应用服务器集群的部署,以在能耗与性能之间取得平衡是急需解决的重要问题.对此,提出一种应用服务器集群能耗与性能平衡的在线实时优化策略,优化目标是最小化能耗与请求丢弃速率的加权值,优化内容包括各服务器... 详细信息

如何根据负载状况实时优化应用服务器集群的部署,以在能耗与性能之间取得平衡是急需解决的重要问题.对此,提出一种应用服务器集群能耗与性能平衡的在线实时优化策略,优化目标是最小化能耗与请求丢弃速率的加权值,优化内容包括各服务器的开关和CPU频率.该策略包括小规模集群优化(SSCOpt)和大规模集群优化(LSCOpt)两种方案:前者定义大量的变量,将集群优化描述成线性混合整数规划问题,然后采用软件包求解;后者通过分析能耗和负载模型的特性定义很少的变量,将集群优化描述成非线性混合整数规划问题,并提出一种基于花朵授粉算法和变量融合的求解算法.测试结果表明:当集群规模较小时,SSCOpt方案能快速求得全局最优部署;当集群规模较大时,LSCOpt方案能快速求得很好的次优部署.

关键词：应用服务器集群能耗性能平衡实时优化混合整数规划花朵授粉算法变量融合

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多边开发银行体系中的亚投行:一个比较分析框架

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当代财经 2017年第7期 46-57页

作者：陈伟光王欢蔡伟宏广东外语外贸大学金融学院广东广州510006

亚洲基础设施投资银行是中国参与全球金融治理的标志性成果和制度化载体。作为多边开发银行体系中的新成员,亚投行体现了多个方面的创新:在准入和决策机制方面,亚投行是一个开放、包容、顺应国际关系民主化趋势的区域组织;在治理结构方... 详细信息

亚洲基础设施投资银行是中国参与全球金融治理的标志性成果和制度化载体。作为多边开发银行体系中的新成员,亚投行体现了多个方面的创新:在准入和决策机制方面,亚投行是一个开放、包容、顺应国际关系民主化趋势的区域组织;在治理结构方面,亚投行力求简单高效,寻求利益兼顾与决策效率之间的平衡;在业务运作方面,亚投行与其他金融机构形成合作和竞争关系,其资本结构和成员国信誉有助于获得AAA评级;在绩效评价方面,亚投行创新制度设计,有效降低行政管理成本,并保证社会效益目标的实现。未来亚投行在运营中需要借鉴其他多边开发银行的成功经验,加强风险管理和从业人员选拔、培育。

关键词：多边开发银行全球金融治理开发性金融亚洲基础设施投资银行

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分布式入侵检测系统安全通信机制研究

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计算机工程与设计 2006年第4期27卷 608-611页

作者：蔡伟鸿刘震汕头大学计算机系广东汕头515063

现有的IDS多采用集中统一收集和分析数据的体系结构,这种体系结构的入侵检测系统存在单点失效和可扩展性问题。论文在分析现有分布式入侵检测系统结构基础上,提出了一个基于任务分发机制的分布式入侵检测系统体系架构。同时为了保证各Ag... 详细信息

现有的IDS多采用集中统一收集和分析数据的体系结构,这种体系结构的入侵检测系统存在单点失效和可扩展性问题。论文在分析现有分布式入侵检测系统结构基础上,提出了一个基于任务分发机制的分布式入侵检测系统体系架构。同时为了保证各Agent通信的信息保密性和完整性,重点研究设计了基于XML的信息交换格式,并进而设计了一个基于PKI基础设施,ECC和DES对称、非对称加密技术的安全信息交互协议框架,可以有效地保证各Agent通信安全。

关键词：入侵检测 XML PKI ECC 信息交互协议

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