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Transcriptome-wide analysis of PIP reductase gene family identified a phenylpropene synthase crucial for the biosynthesis of dibenzocyclooctadiene lignans in Schisandra chinensis

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Synthetic and Systems Biotechnology 2024年第1期9卷 78-87页

作者： tingyan qiang Yu Chen Bin Li Yuqing Dong Xueping Wei Jiushi Liu Bengang Zhang Haitao Liu Peigen Xiao State Key Laboratory of Basis and New Drug Development of Natural and Nuclear Drugs Ministry of EducationInstitute of Medicinal Plant DevelopmentChinese Academy of Medical SciencesPeking Union Medical CollegeBeijing100193China b College of Traditional Chinese Medicine Hebei UniversityBaoding071000China

Phenylpropenes,such as isoeugenol and eugenol,are produced as defend compounds,floral attractants,and flavor constituents by phenylpropene synthases belonging to the PIP reductase ***,isoeugenol is proposed to be involved in the biosynthesis of dibenzocyclooctadiene lignans,the main active compounds of Schisandra chinensis(Turcz.)***(SCF).***,a woody vine plant,is widely used for its medicinal,horticultural,edible,and economic *** this study,nine ScPIP genes were identified and characterized from the transcriptome datasets of *** expression profiles revealed that ScPIP genes were differentially expressed during different developmental stages of *** ScPIPs were selected and cloned as candidate genes encoding phenylpropene synthases according to phylogenetic ***1 was proved to function as isoeugenol synthase(IGS)and designated as ScIGS1 through in vivo functional characterization in Escherichia *** localization analysis demonstrated that ScIGS1 was localized in both the cytoplasm and *** three-dimensional(3D)model of ScIGS1 was obtained using homology ***-directed mutagenesis experiments revealed that the substitution of residues at positions 110 and 113 impacted the product specificity of ScIGS1 and the mutation of Lys157 to Ala abolishing catalytic ***,the kcat values of mutants were lower than that of ScIGS1 using a deep learning *** conclusion,this study provides a basis for further research on PIP reductases and the biosynthetic pathway of dibenzocyclooctadiene lignans.

关键词： Schisandra chinensis(Turcz.)baill. Dibenzocyclooctadiene lignans PIP reductase family Phenylpropenes Isoeugenol synthase

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简化基因组测序技术在植物遗传分析中的应用

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中国农学通报 2022年第8期38卷 25-32页

作者：董雨青魏雪苹强亭燕张本刚齐耀东刘海涛中国医学科学院药用植物研究所北京100193

简化基因组测序(Reduced-representation Genome Sequencing,RRGS)是在二代测序的基础上发展起来的一种基于酶切手段对特定区域进行测序从而降低基因组复杂度的技术。此方法步骤简单,成本低廉,且不依赖参考基因组,便可获得全基因组水平... 详细信息

简化基因组测序(Reduced-representation Genome Sequencing,RRGS)是在二代测序的基础上发展起来的一种基于酶切手段对特定区域进行测序从而降低基因组复杂度的技术。此方法步骤简单,成本低廉,且不依赖参考基因组,便可获得全基因组水平的分子标记。本文总结了简化基因组测序的发展历程及其主要技术种类,归纳了简化基因组测序技术在植物遗传图谱构建、数量性状位点定位及群体遗传学分析等方面的应用价值。同时,提出了简化基因组目前在群体遗传学等分析中存在的缺陷及不足,以期为植物在遗传进化,性状定位等方面的研究手段提供参考。

关键词：简化基因组分子标记遗传图谱数量性状基因座群体遗传

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3 - 57 Dose Calculation Module of the Heavy Ion Treatment Planning System for the HIMM Projects

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IMP & HIRFL Annual Report 2013年第1期 128-129页

作者： Liu Xinguo Li qiang Ma Yuanyuan Shen Guosheng Zhang Huajian Dai Zhongying He Pengbo Fu tingyan Huang Qiyan Yan Yuanlin

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3 - 72 Respiratory Motion Management for Respiratory-gated Radiotherapy

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IMP & HIRFL Annual Report 2013年第1期 143-144页

作者： He Pengbo Li qiang Liu Xinguo Dai Zhongying Zhao Ting Fu tingyan Shen Guosheng Ma Yuanyuan Huang Qiyan Yan Yuanlin

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3 - 61 FLUKE Simulation of Lateral Dose Profiles of Carbon Ion Pencil Beam

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IMP & HIRFL Annual Report 2013年第1期 132-132页

作者： Yan Yuanlin Liu Xinguo Dai Zhongying He Pengbo Ma Yuanyuan Huang Qiyan Shen Guosheng Fu tingyan Li qiang

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3 - 60 Monte Carlo Simulation of Field Patching Technique in Carbon Ion Radiotherapy

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IMP & HIRFL Annual Report 2013年第1期 131-131页

作者： Huang Qiyan Liu Xinguo Dai Zhongying He Pengbo Shen Guosheng Ma Yuanyuan Yan Yuanlin Fu tingyan Li qiang

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3-44 Monte Carlo Simulation Study on Optimizing the Active Beam Delivery System at HIRFL

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IMP & HIRFL Annual Report 2014年第1期 136-137页

作者： Yan Yuanlin Liu Xingguo Dai Zhongying Ma Yuanyuan Huang Qiyan He Pengbo Shen Guosheng Fu tingyan Li qiang 不详

To obtain carbon ion beam suitable for the active spot scanning beam delivery system at the Heavy Ion ResearchFacility in Lanzhou (HIRFL), the Monte Carlo (MC) program SHIELD-HIT12A was used to study the influencesof beam delivery distance and structure period of mini ridge filter on full width at the half maximum (FWHM) ofbeam spot and dose flatness at the iso-center of the treatment room.

关键词： Monte Carlo Simulation

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3-41 Bio-audiovisual Feedback Breathing Guidance Technique for Synchrotron-based Ion Beam Delivery

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IMP & HIRFL Annual Report 2014年第1期 134-134页

作者： Li qiang He Pengbo Liu Xinguo Dai Zhongying Ma Yuanyuan Shen Guosheng Yan Yuanlin Huang Qiyan Fu tingyan 不详

Based on the periodic synchrotron-based beam delivery,a bio-audiovisual feedback breathing guidance technique has been developed to mitigate the interplay between target motion and dynamic beam delivery for ion beam therapy,in which variable beam extraction and generation of individualized breathing guidance curve are two key *** in Fig.1 is the schematic diagram of the breathing guidance *** the simulations with 15 healthy volunteers for the breathing guidance technique,we found not only the treatment efficiency of synchrotron-based pulsed ion beam could be increased effectively,but also the residual movement of respiration during gating window could be reduced.

关键词： Feedback Breathing Guidance

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3 - 56 Heavy IonTreatment Planning System for the HIMM Projects

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IMP & HIRFL Annual Report 2013年第1期 127-127页

作者： Li qiang Liu Xinguo Shen Guosheng Ma Yuanyuan Zhang Huajian Dai Zhongying He Pengbo Fu tingyan Huang Qiyan Yan Yuanlin

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碳离子治疗中分野照射技术的MonteCarlo模拟

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原子核物理评论 2015年第1期32卷 115-120页

作者：黄齐艳刘新国戴中颖贺鹏博申国盛马圆圆闫渊林付廷岩李强中国科学院近代物理研究所兰州730000 中国科学院重离子束辐射生物医学重点实验室兰州730000 中国科学院大学北京100049

为阐述分野照射治疗方式应用于中国科学院近代物理研究所(IMP)肿瘤重离子临床治疗试验研究的理论基础,利用Monte Carlo(MC)软件包Gate/Geant4模拟计算了碳离子束分野照射分野衔接处的横向剂量分布,得到了患者摆位误差±1.0 mm范围内的... 详细信息

为阐述分野照射治疗方式应用于中国科学院近代物理研究所(IMP)肿瘤重离子临床治疗试验研究的理论基础,利用Monte Carlo(MC)软件包Gate/Geant4模拟计算了碳离子束分野照射分野衔接处的横向剂量分布,得到了患者摆位误差±1.0 mm范围内的横向剂量分布和分野衔接处中心剂量随分野间距的变化关系,计算了分野间距5.0 mm的横向剂量分布。将分野间距5.0 mm的分野照射与整野照射的MC结果进行比较,发现:在靶区范围内两者模拟的剂量偏差在6.8%以内,符合程度较好,并提出了在患者定位精确度较高的情况下(即患者治疗体位摆位误差在±1.0 mm范围)解决分野衔接处剂量热点问题的可行方法,从而较大幅度地提高了分野照射时靶区范围内的剂量均匀性。

关键词：碳离子治疗分野照射 Monte Carlo Gate/Geant4 横向剂量分布

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