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Crystal structure of SARS-CoV-2 nucleocapsid protein RNA binding domain reveals potential unique drug targeting sites

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Acta Pharmaceutica Sinica B 2020年第7期10卷 1228-1238页

作者： sisi Kang Mei Yang Zhongsi hong Liping Zhang Zhaoxia Huang Xiaoxue Chen Suhua He Ziliang Zhou Zhechong Zhou Qiuyue Chen Yan Yan Changsheng Zhang hong Shan Shoudeng Chen Molecular Imaging Center Guangdong Provincial Key Laboratory of Biomedical Imagingthe Fifth Affiliated HospitalSun Yat-sen UniversityZhuhai 519000China Department of Infectious Diseases the Fifth Affiliated HospitalSun Yat-sen UniversityZhuhai 519000China Key Laboratory of Tropical Marine Bio-resources and Ecology Guangdong Key Laboratory of Marine Materia MedicaInstitution of South China Sea Ecology and Environmental EngineeringSouth China Sea Institute of OceanologyChinese Academy of SciencesGuangzhou 510301China Guangdong Provincial Engineering Research Center of Molecular Imaging the Fifth Affiliated HospitalSun Yatsen UniversityZhuhai 519000China Department of Interventional Medicine the Fifth Affiliated HospitalSun Yat-sen UniversityZhuhai 519000China Department of Experimental Medicine the Fifth Affiliated HospitalSun Yat-sen UniversityZhuhai 519000China

The outbreak of coronavirus disease(COVID-19)caused by SARS-CoV-2 virus continually lead to worldwide human infections and ***,there is no specific viral protein-targeted *** nucleocapsid protein is a potential antiviral drug target,serving multiple critical functions during the viral life ***,the structural information of SARS-CoV-2 nucleocapsid protein remains ***,we have determined the 2.7 A crystal structure of the N-terminal RNA binding domain of SARS-CoV-2 nucleocapsid *** the overall structure is similar as other reported coronavirus nucleocapsid protein N-terminal domain,the surface electrostatic potential characteristics between them are *** comparison with mild virus type HCoV-OC43 equivalent domain demonstrates a unique potential RNA binding pocket alongside theβ-sheet *** by in vitro binding studies,our data provide several atomic resolution features of SARS-CoV-2 nucleocapsid protein N-terminal domain,guiding the design of novel antiviral agents specific targeting to SARS-CoV-2.

关键词： COVID-19 Coronavirus SARS-CoV-2 Nucleocapsid protein RNA binding domain Crystal structure Antiviral targeting site

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Jiangnan Shipbuilding Delivers“Panda”Series VLEC

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船舶经济贸易 2022年第5期 62-65页

作者： Zhang Chin Duan sisi Chen Leiting 不详

The 99.000 m3 Type-B very large ethane carrier(VLEC)“PACIFIC INE0S CRENADIER”.built by CSSC Jiangnan Shipbuilding and China Shipbuilding Trading(CSTC),for SPDBFL and Shandong Ocean Group Paeifie Gas Carrier(hong Kon... 详细信息

关键词： Ship Panda Shandong

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Effectiveness of Xiangsha Liujun pills(香砂六君丸)on decreased digestive function in convalescent patients of coronavirus disease 2019:a randomized,double blind,placebo controlled clinical trial

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Journal of Traditional Chinese Medicine 2023年第3期43卷 552-558页

作者： ZHANG Yuehong SHAO Xianzhi ZHAO Qianlong ZHAN Hualong ZHANG Jianhua DU sisi CHEN Jing LIU Yingfang ZHOU Haiwang CHEN Xinsheng hong Ying LIAN Fengmei TONG Xiaolin BA Yuanming Department of Endocrinology Guang’anmen HospitalChina Academy of Chinese Medical SciencesBeijing 100053China Department of Gastroenterology Ezhou Hospital of Traditional Chinese MedicineEzhou 436000China Department of Nephrology Hubei Provincial Hospital of Traditional Chinese MedicineWuhan 430061China

OBJECTIVE:To evaluate the effectiveness and safety of Xiangsha Liujun pills(香砂六君丸) on the decreased digestive function in patients in the recovery phase of the Coronavirus disease 2019(COVID-19).METHODS:A randomized,double blind,placebo controlled clinical trial was conducted.A total of 200 COVID-19 patients in the recovery phase were included in our study in Ezhou Hospital of Traditional Chinese *** 200 subjects were randomly divided into a treatment group(Xiangsha Liujun pills) and a control group(placebo),with 100 in each *** took Xiangsha Liujun pills or placebo orally three times a day for two *** visits were scheduled at week 0(baseline),week 1(the middle of the intervention) and week 2(the end of the intervention) for each eligible *** total efficacy rates for improving the Traditional Chinese Medicine(TCM) symptoms(fatigue,poor appetite,abdominal distension and loose stools) and the disappearance rates of symptoms were observed and compared in the treatment and control *** events were recorded during the study *** 9.4 was used to analyze the ***:A total of 200 patients were included in this study,among which 4 participants withdrew because the drugs did not *** patients were excluded for *** the treatment,there was no significant difference between the TCM symptoms scores of *** 1 week of treatment,the full analysis set(FAS) showed that the efficacy rates for abdominal distension and loose stools in the treatment group were significantly higher than the control group(P 0.05).In addition,the disappearance rate of fatigue in the treatment group was significantly higher than the control group(P

关键词： COVID-19 digestion symptom complex treatment outcome safety recovery phase Xiangsha Liujun pills

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番茄红素对运输引起的雏鹅氧化应激及肝细胞凋亡反应的缓解作用研究

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黑龙江畜牧兽医 2024年第15期 6-13,117页

作者：杨昊天王志强苏景冯国峰黄宇翔邹跃马志刚霍明东张红董佳强吕明哲张国华刘雪松王爽沈思思张艳王欢江波涛钟鹏陈志峰黑龙江省农业科学院畜牧兽医分院黑龙江齐齐哈尔161005 东北农业大学黑龙江省实验动物与比较医学重点实验室哈尔滨150030 黑龙江省动物疫病预防与控制中心哈尔滨150069

为了阐明番茄红素(lycopene,LYC)对雏鹅运输应激的影响,揭示LYC保护作用的关键位点,明确LYC保护雏鹅运输应激的具体作用和分子机制,试验采用模拟运输的模型,将45只雏鹅随机分为对照组、运输应激模型组和LYC处理组,其中对照组不做任何处... 详细信息

为了阐明番茄红素(lycopene,LYC)对雏鹅运输应激的影响,揭示LYC保护作用的关键位点,明确LYC保护雏鹅运输应激的具体作用和分子机制,试验采用模拟运输的模型,将45只雏鹅随机分为对照组、运输应激模型组和LYC处理组,其中对照组不做任何处理,运输应激模型组进行持续6 h的摇床振荡,LYC处理组雏鹅按体重50 mg/kg灌胃LYC 1 h后再进行持续6 h的摇床振荡,对雏鹅进行安乐死处理,快速打开胸腔和腹腔,以脏采血,冰上剥离肝脏组织。通过H.E.染色、生化功能检测、ELISA、实时荧光定量RCR检测等技术,观察肝脏的病理组织学改变,测定生化指标和氧化应激指标及肝脏相关基因表达量。结果表明:与对照组比较,运输应激模型组天门冬氨酸氨基转移酶、丙氨酸氨基转移酶、碱性磷酸酶、乳酸脱氢酶活性及白蛋白、总胆红素含量均极显著升高(P<0.01);LYC处理组各指标均下降,与运输应激模型组比较差异极显著(P<0.01)。运输应激模型组雏鹅肝脏可见明显的细胞坏死、空泡变性、充血等病理损伤,LYC处理组肝脏损伤明显缓解。与对照组比较,运输应激模型组丙二醛含量显著升高(P<0.05),谷胱甘肽还原酶活性和ATP含量极显著降低(P<0.01),超氧化物歧化酶活性显著降低(P<0.05);与运输应激模型组比较,LYC处理组丙二醛含量显著降低(P<0.05),超氧化物歧化酶活性显著升高(P<0.05),谷胱甘肽和ATP含量极显著升高(P<0.01)。与运输应激模型组比较,LYC处理组氧化应激相关因子肝脏核因子E2(Nrf2)、血红素加氧酶-1(HO-1)及醌氧化还原酶1(NQO1)基因相对表达量极显著升高(P<0.01),Kelch样环氧氯丙烷相关蛋白1(Keap1)基因相对表达量极显著降低(P<0.01);炎性因子白细胞介素-1β(IL-1β)、白细胞介素-6(IL-6)和肿瘤坏死因子-α(TNF-α)基因相对表达量显著或极显著降低(P<0.05或P<0.01);肝脏凋亡基因B淋巴细胞瘤/白血病-2相关X蛋白(Bax)基因相对表达量极显著降低(P<0.01),B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)基因相对表达量极显著升高(P<0.01),Bax/Bcl-2极显著降低(P<0.01)。说明LYC可通过影响Nrf2/HO-1/NQO1信号通路提高雏鹅抗氧化能力并且可降低炎性因子的释放,同时影响Bcl-2、Bax等凋亡基因的表达,缓解运输应激对肝脏组织功能及实质的损伤。

关键词：运输应激番茄红素氧化应激凋亡籽鹅肝脏

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白细胞介素-23受体过表达对实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠辅助性T细胞17/调节性T细胞平衡的影响

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中华眼底病杂志 2022年第5期38卷 389-395页

作者：吴怡媛陈思思杨超魏瑞华粘红天津医科大学眼科医院、眼视光学院、眼科研究所国家眼耳鼻喉疾病临床医学研究中心天津市分中心天津市视网膜功能与疾病重点实验室天津300384

目的初步探讨白细胞介素(IL)-23受体(IL-23R)过表达对实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)模型小鼠辅助性T细胞17(Th17细胞)/调节性T细胞(Treg细胞)平衡的影响。方法8周龄雌性C57BL/6J小鼠12只,随机分为LV-Ctrl组、LV-IL-23R组,每组各6只。... 详细信息

目的初步探讨白细胞介素(IL)-23受体(IL-23R)过表达对实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)模型小鼠辅助性T细胞17(Th17细胞)/调节性T细胞(Treg细胞)平衡的影响。方法8周龄雌性C57BL/6J小鼠12只,随机分为LV-Ctrl组、LV-IL-23R组,每组各6只。两组小鼠经尾静脉分别注射LV-Ctrl、LV-IL-23R慢病毒;注射后7 d采用光感受器间维生素A类结合蛋白1-20主动免疫构建EAU小鼠模型。免疫后13 d开始,每2天使用间接检眼镜观察小鼠眼底并进行临床评分。免疫后30 d,苏木精-伊红染色观察小鼠视网膜组织病理学改变。酶联免疫吸附测定检测两组小鼠血清中IL-17水平;流式细胞仪检测Th17细胞和Treg细胞比例;实时荧光定量聚合酶链反应检测IL-23R、IL-17、维甲酸相关孤儿受体γt(RORγt)、IL-10和叉头状转录因子p3(Foxp3)mRNA相对表达量。组间比较采用重复测量方差分析、独立样本Mann-Whitney U检验和独立样本t检验。结果与LV-Ctrl组比较,LV-IL-23R组小鼠视网膜炎症反应更重。免疫后13 d,LV-IL-23R组、LV-Ctrl组小鼠眼底炎症评分差异无统计学意义(t=-2.001,P=0.058);免疫后15~29 d,LV-IL-23R组小鼠眼底炎症评分均高于LV-Ctrl组,差异有统计学意义(t=-4.429、-6.578、-7.768、-10.183、-6.325、-7.304、-4.841、-6.872,P<0.001)。组织病理学检查显示,与LV-Ctrl组比较,LV-IL-23R组眼底炎性细胞浸润增多,视网膜结构破坏更为严重,组织病理学评分显著升高,差异有统计学意义(t=-4.339,P=0.001)。与LV-Ctrl组比较、LV-IL-23R组小鼠脾脏中IL-23R mRNA相对表达量显著升高,差异有统计学意义(Z=2.087,P=0.037);T细胞中IL-17、RORγt mRNA相对表达量增加,IL-10、Foxp3 mRNA相对表达量降低,差异均有统计学意义(t=-6.313、-5.922、4.844、7.572,P=0.003、0.004、0.008、0.002)。与LV-Ctrl组比较、LV-IL-23R组小鼠血清中IL-17水平明显升高,差异有统计学意义(t=-5.423,P=0.002);脾脏和淋巴结中Th17细胞比例明显升高,Treg细胞比例显著降低,差异有统计学意义(t=-4.290、3.700,P=0.002、0.006)。结论IL-23R过表达可促使EAU小鼠的Th17/Treg失衡,加重EAU临床及病理表现。

关键词： Th17细胞 T淋巴细胞,调节性实验性自身免疫性葡萄膜炎白细胞介素-23受体

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基于机器学习的急性期精神分裂症心理理论能力对社会功能的预测作用

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首都医科大学学报 2023年第4期44卷 596-601页

作者：仲捷朱虹郑思思贾竑晓首都医科大学附属北京安定医院国家精神心理疾病临床医学研究中心精神疾病诊断与治疗北京市重点实验室北京100088 首都医科大学人脑保护高精尖创新中心北京100069

目的探讨基于机器学习算法的急性期精神分裂症患者心理理论能力对社会功能的预测作用。方法选取2013至2017年来自首都医科大学附属北京安定医院门诊的急性期精神分裂症患者90例,采用阳性和阴性症状量表(Positive and Negative Syndrome ... 详细信息

目的探讨基于机器学习算法的急性期精神分裂症患者心理理论能力对社会功能的预测作用。方法选取2013至2017年来自首都医科大学附属北京安定医院门诊的急性期精神分裂症患者90例,采用阳性和阴性症状量表(Positive and Negative Syndrome Scale,PANSS)评估急性期精神分裂症患者的精神症状;选取威斯康星卡片分类测验(Wisconsin Card Sorting Test,WCST)中的完成分类数、持续性操作测验(Continuous Performance Test,CPT)平均反应时间、成人韦氏智力量表(Wechsler Adult Intelligence Scale,WAIS)中的数字广度项目评估神经认知;选取心理理论能力中的一级错误信念、二级错误信念、失言识别任务和眼区阅读测试评估社会认知;选用个人与社会功能量表(Personal and Social Functioning Scale,PSP)评估急性期精神分裂症患者的社会功能。应用机器学习算法评估急性期精神分裂症心理理论能力对社会功能的预测作用。结果相关分析结果显示急性期精神分裂症患者的PSP评分与阴性症状(r=-0.271,P=0.010)、WCST完成分类数(r=-0.128,P=0.328)呈负相关,与失言识别评分呈正相关(r=0.410,P<0.001);二级错误信念及失言识别任务对急性期精神分裂症患者的社会功能具有良好的预测作用,曲线下面积(area under the curve,AUC)值为80.9%。结论急性期精神分裂症患者的社会功能损害与阴性症状及心理理论能力密切相关,心理理论能力对急性期精神分裂症患者的社会功能具有良好的预测作用。

关键词：精神分裂症心理理论能力社会功能机器学习

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miR-31-5p过表达对兔自身免疫性干眼外周血Th17细胞的免疫调控作用

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中华实验眼科杂志 2022年第8期40卷 716-723页

作者：高敏赵璐陈思思魏瑞华粘红天津医科大学眼科医院天津医科大学眼视光学院天津医科大学眼科研究所国家眼耳鼻喉疾病临床医学研究中心天津市分中心天津市视网膜功能与疾病重点实验室天津300384

目的探讨慢病毒介导微小RNA(miR)-31-5p过表达对兔自身免疫性干眼模型外周血辅助性T细胞17(Th17)的免疫调控作用。方法构建miR-31-5p重组慢病毒载体。包装miR-31-5p过表达及其对照慢病毒,进行浓缩和滴度测定。建立兔自身免疫性干眼模型... 详细信息

目的探讨慢病毒介导微小RNA(miR)-31-5p过表达对兔自身免疫性干眼模型外周血辅助性T细胞17(Th17)的免疫调控作用。方法构建miR-31-5p重组慢病毒载体。包装miR-31-5p过表达及其对照慢病毒,进行浓缩和滴度测定。建立兔自身免疫性干眼模型,并分离模型兔外周血单个核细胞(PBMC),分别感染miR-31-5p及阴性对照慢病毒颗粒作为miR-31-5p过表达组和对照组,采用实时荧光定量PCR法检测miR-31-5p的表达水平。将2个组PBMC与经γ射线照射后的泪腺上皮细胞共培养,采用实时荧光定量PCR法检测2个组PBMC中Th17细胞特异性转录因子维甲酸相关孤儿核受体C(RORC)、标志性细胞因子白细胞介素-17(IL-17)及Th17细胞极化相关细胞因子IL-1β、IL-6和IL-23的mRNA表达水平;采用Western blot法检测PBMC中IL-17的蛋白表达水平。结果通过测序验证,成功构建miR-31-5p重组慢病毒载体。包装并浓缩miR-31-5p过表达和对照慢病毒颗粒,滴度测定结果分别为3.82×107 TU/ml和3.50×107 TU/ml,满足后续实验需求。实时荧光定量PCR结果显示,miR-31-5p过表达组miR-31-5p相对表达量较对照组显著升高,差异有统计学意义(t=-9.696,P<0.001)。在兔泪腺上皮细胞与PBMC共培养体系中,miR-31-5p过表达组PBMC中的RORC、IL-17 mRNA相对表达量分别为0.33±0.03和0.28±0.09,明显低于对照组的1.00±0.00和1.00±0.00,差异均有统计学意义(t=46.256、13.810,均P<0.05)。Western blot检测结果显示,miR-31-5p过表达组PBMC中IL-17蛋白相对表达量较对照组明显降低,差异有统计学意义(t=4.977,P=0.008)。实时荧光定量PCR结果显示,miR-31-5p过表达组PBMC中IL-6、IL-23和IL-1βmRNA相对表达量较对照组显著下降,差异均有统计学意义(t=220.076、6.641、13.271,均P<0.05)。结论miR-31-5p过表达可能通过下调免疫微环境中IL-6、IL-23、IL-1β等细胞因子的表达负向调控Th17细胞免疫反应。

关键词：干眼干燥综合征 Th17细胞 miR-31-5p 动物模型外周血单个核细胞

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视黄醇结合蛋白1通过激活TAK1促进大鼠乳鼠原代心肌细胞肥大

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中国病理生理杂志 2023年第2期39卷 233-240页

作者：谢菁周艳丽陈思思王继春江洪武汉大学人民医院心血管内科武汉大学心血管病研究所心血管病湖北省重点实验室湖北武汉430000

目的:探究视黄醇结合蛋白1(retinol binding protein 1, Rbp1)在大鼠乳鼠原代心肌细胞肥大中的功能和机制。方法:本研究通过联合分析基因表达数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)中的小鼠心肌肥厚基因芯片数据,寻找在心肌肥厚发生过... 详细信息

目的:探究视黄醇结合蛋白1(retinol binding protein 1, Rbp1)在大鼠乳鼠原代心肌细胞肥大中的功能和机制。方法:本研究通过联合分析基因表达数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)中的小鼠心肌肥厚基因芯片数据,寻找在心肌肥厚发生过程中的关键调控因子,构建该基因过表达及敲减腺病毒并感染大鼠乳鼠原代心肌细胞,利用血管紧张素II(angiotensin II, Ang II)诱导大鼠乳鼠原代心肌细胞肥大模型,研究目的基因对大鼠乳鼠原代心肌细胞肥大的影响,应用Western blot及RT-qPCR探究目的基因调控大鼠乳鼠原代心肌细胞肥大的分子机制。结果:在小鼠心肌肥厚心脏组织中Rbp1的表达显著上调(P<0.01),体外细胞实验显示与对照组相比,Rbp1过表达组的大鼠乳鼠原代心肌细胞面积显著增大,心肌肥厚标志基因心钠肽(atrial natriuretic peptide, Anp)和肌球蛋白重链7(myosin heavy chain 7, Myh7)的表达显著升高(P<0.01),证实Rbp1过表达能促进Ang II诱导的大鼠乳鼠原代心肌细胞肥大;相反,Rbp1敲减则能显著抑制Ang II诱导的大鼠乳鼠原代心肌细胞面积增加和心肌肥厚标志物表达。机制研究显示,Rbp1过表达显著激活转化生长因子β激活激酶1(transforming growth factor-β-activated kinase 1, TAK1)和P38(P<0.01),应用TAK1抑制剂可阻断Rbp1过表达对Ang II诱导大鼠乳鼠原代心肌细胞肥大的促进作用。结论:Rbp1可通过激活TAK1信号通路促进Ang II诱导的大鼠乳鼠原代心肌细胞肥大。

关键词：视黄醇结合蛋白1 大鼠乳鼠原代心肌细胞心肌肥大 TAK1/P38信号通路

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中国城市高密度居住环境对居民脑卒中的影响——对武汉的实证

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China City Planning Review 2022年第3期31卷 15-25页

作者：谢波郑依玲李志刚 An Zihao Li Min(Translated) Liang sisi(Proofread) School of Urban Design Wuhan UniversityWuhanP.R.China Faculty of Architecture The University of Hong KongHong KongP.R.China the School of Urban Design Wuhan University Urban Planning Society of China the Urban Geography Com-mittee of The Geographical Society of China WuhanP.R.China University of Leeds Leedsthe UK 不详

This paper explores the association between high-density urban built environments and stroke through the spatial regression model. An empirical study based on the disease data of Wuhan in 2015 shows that high-density urban built environments have a significant impact on stroke, and that the city center sees a high prevalence of stroke. Among urban built environment elements, net population density, residential land density, and building density are positively correlated with the risk of stroke, whereas the accessibility of community hospitals, parks, fast-food shops, and bus stops is negatively correlated with it. The mechanism analysis demonstrates that urban built environments have an important impact on stroke through such factors as the natural environment, physical activity, dietary habits, and social capital. Accordingly, the paper proposes that during the healthy city planning process in China, it is essential to reduce net population density and building density and relocate the older adults in city centers. In addition, measures should be taken to improve public service facilities at the block level and to control the risk of stroke in the high-density urban built environment.

关键词： urban built environments high density stroke healthy city planning Wuhan

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基于多源遥感数据的灌丛化草原识别技术研究

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航天返回与遥感 2022年第4期43卷 123-137页

作者：张词谦孙斌洪亮高志海王丝丝云南师范大学地理学部昆明650500 中国林业科学研究院资源信息研究所北京100091 国家林业和草原局林业遥感与信息技术重点实验室北京100091 国家遥感中心北京100036

为探索遥感技术在灌丛化草原空间分布识别方面的应用潜力,文章采用GF-2、GF-3和GF-6等多源遥感数据,利用随机森林算法和灌丛植被覆盖度估测模型,分别从分类识别和定量提取角度对内蒙古正镶白旗开展多尺度的灌丛化草原遥感识别技术研究... 详细信息

为探索遥感技术在灌丛化草原空间分布识别方面的应用潜力,文章采用GF-2、GF-3和GF-6等多源遥感数据,利用随机森林算法和灌丛植被覆盖度估测模型,分别从分类识别和定量提取角度对内蒙古正镶白旗开展多尺度的灌丛化草原遥感识别技术研究。结果表明:1)GF-6的纹理信息和GF-3的极化信息对提取灌丛植被覆盖度信息贡献度最高,但在不同尺度下差异明显,整体上尺度较小时纹理信息占优,尺度增大时,极化信息优势凸显;2)二元二次灌丛植被覆盖度估测模型效果最优,在多尺度下均比次优的估测模型精度提高5.95%,23.84%和20.74%;3)基于随机森林算法的草原灌丛化分类识别准确率随尺度增大而降低,整体上均低于以灌丛植被覆盖度为基础的定量监测结果。该研究的部分成果可为我国北方草原的监督管理及合理利用提供一定技术支撑。

关键词：灌丛化草原多源数据多尺度随机森林多元二次模型遥感应用

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