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Global COVID-19 Pandemic Waves: Limited Lessons Learned Worldwide over the Past Year

Engineering 2022年第6期8卷 91-98页

作者： Yongyue Wei Jinxing Guan Xiao Ning Yuelin Li Liangmin Wei sipeng shen Ruyang Zhang Yang Zhao Hongbing shen Feng Chen Department of Epidemiology and Biostatistics School of Public HealthNanjing Medical UniversityNanjing 211166China China International Cooperation Center for Environment and Human Health&Center for Global Health Nanjing Medical UniversityNanjing 211166China Department of Biomedical Engineering School of Biological Science and Medical EngineeringSoutheast UniversityNanjing 210096China Institute for Social and Economic Research and Policy Columbia UniversityNew YorkNY 10027USA

The occurrence of coronavirus disease 2019(COVID-19)was followed by a small burst of cases around the world;afterward,due to a series of emergency non-pharmaceutical interventions(NPIs),the increas-ing number of confirmed cases slowed down in many ***,the lifting of control measures by the government and the public’s loosening of precautionary behaviors led to a sudden increase in cases,arousing deep concern across the *** deep concern across the *** study evaluates the situation of the COVID-19 pandemic in countries and territories worldwide from January 2020 to February *** to the time-varying reproduction number(R(t))of each country or territory,the results show that almost half of the countries and territories in the world have never controlled the *** the countries and territories that had once contained the occurrence,nearly half failed to maintain their prevention and control,causing the COVID-19 pandemic to rebound across the world—resulting in even higher waves in half of the rebounding countries or *** work also proposes and uses a time-varying country-level transmission risk score(CTRS),which takes into account both R(t)and daily new cases,to demonstrate country-level or territory-level transmission potential and ***-varying hierarchical clustering of time-varying CTRS values was used to successfully reveal the countries and territories that contributed to the recent aggravation of the global pandemic in the last quarter of 2020 and the beginning of 2021,and to identify countries and territories with an increasing risk of COVID-19 transmission in the near ***,a regression analysis indicated that the introduction and relaxation of NPIs,including workplace closure policies and stay-at-home requirements,appear to be associated with recent global transmission *** conclu-sion,a systematic evaluation of the global COVID-19 pandemic over the past year indicates that

关键词： COVID-19 Global pandemic Prevention and control effect

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Transmission dynamics model and the coronavirus disease 2019 epidemic:applications and challenges

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Medical Review 2022年第1期2卷 89-109页

作者： Jinxing Guan Yang Zhao Yongyue Wei sipeng shen Dongfang You Ruyang Zhang Theis Lange Feng Chen Departments of Epidemiology and Biostatistics School of Public HealthNanjing Medical UniversityNanjing 211166JiangsuChina China International Cooperation Center for Environment and Human Health Center for Global HealthNanjing Medical UniversityNanjing 211166JiangsuChina Center of Biomedical BigData Nanjing Medical UniversityNanjing 211166JiangsuChina Department of Public Health University of CopenhagenCopenhagenDenmark

Since late 2019,the beginning of coronavirus disease 2019(COVID-19)pandemic,transmission dynamics models have achieved great development and were widely used in predicting and ***,we provided an introduction to the history of disease transmission,summarized transmission dynamics models into three main types:compartment extension,parameter extension and population-stratified extension models,highlight the key contribution of transmission dynamics models in COVID-19 pandemic:estimating epidemiological parameters,predicting the future trend,evaluating the effectiveness of control measures and exploring different possibilities/***,we pointed out the limitations and challenges lie ahead of transmission dynamics models.

关键词： compartment model coronavirus disease 2019 novel coronavirus pneumonia SEIR SIR transmission dynamics model.

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Implementation of Clinical Diagnostic Criteria and Universal Symptom Survey Contributed to Lower Magnitude and Faster Resolution of the COVID-19 Epidemic in Wuhan

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Engineering 2020年第10期6卷 1287-1293页

作者： Yongyue Wei Liangmin Wei Yue Jiang sipeng shen Yang Zhao Yuantao Hao Zhicheng Du Jinling Tang Zhijie Zhang Qingwu Jiang Liming Li Feng Chen Hongbing shen Department of Epidemiology and Biostatistics Center for Global HealthSchool of Public HealthNanjing Medical UniversityNanjing 211166China Department of Medical Statistics.School of Public Health Sun Yat-sen UniversityGuangzhou 510080China Guangzhou Women and Children's Medical Center Guangzhou 510623China Department of Epidemiology and Biostatistics School of Public HealthFudan UniversityShanghai 200032China Department of Epidemiology and Biostatistics School of Public HealthPeking UniversityBeijing 100191China

自新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019, COVID-19)疫情发生以来,中国大多数的病例集中在武汉市。虽然早期病例数和死亡人数迅速增加,但通过采取多种防控措施,疫情得以快速遏制。纵观全球,疫情已蔓延至全球六大洲的187个国家,确... 详细信息

自新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019, COVID-19)疫情发生以来,中国大多数的病例集中在武汉市。虽然早期病例数和死亡人数迅速增加,但通过采取多种防控措施,疫情得以快速遏制。纵观全球,疫情已蔓延至全球六大洲的187个国家,确诊病例数已超过300万,这一数字仍在快速增长。在此特殊背景下,有必要对我国疫情防控措施开展科学的、定量的评估,为全球疫情防控提供决策依据。为此,本研究评估了临床诊断标准实施和全城症状排查对武汉市疫情控制的贡献。考虑COVID-19的传播机理、隔离措施等,建立SEIR+Q传播动力学模型。基于武汉市截至2020年2月14日官方公布的每日确诊病例数和未确诊的临床诊断病例数进行建模,并预测2月14日以后的疫情态势。基于实际疫情数据,与模型预测趋势相比较,评价防控措施效果。结果显示,若维持2月14日以前防控措施不变,那么预测将于3月25日和4月29日,每日新增病例数分别降至100例和10例以下,将于5月31日首次现零。而事实上,截至3月6日,武汉市每日新增病例数降至100例以下,截至3月11日降至10例以下,3月18日首次实现零增长,较之模型预测结果分别提前了19 d、49 d和74 d。截至3月30日,实际累计病例数为50 006例,比模型预测值减少19 951例。有效再生数[effective reproductive number, R(t)]分析显示,2月6-10日的第一次全城症状排查后,R(t)显现出下降趋势,2月12-14日的临床诊断标准实施和2月17-19日的第二次全城症状排查后,R(t)显现出较大的降幅,与实际情况较为一致。综上所述,武汉市临床诊断标准的实施和全城症状排查等综合防控措施成效显著,可为世界各国的疫情防控决策提供科学依据。

关键词： COVID-19 SEIR+Q传染病动力学模型临床诊断标准全城症状排查干预效果评价

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基于动态基本再生数的新型冠状病毒肺炎疫情防控现状评估

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中华流行病学杂志 2020年第4期41卷 466-469页

作者：黄丽红沈思鹏余平魏永越复旦大学附属中山医院生物统计室上海200032 南京医科大学公共卫生学院生物统计学系 211166 上海市静安区疾病预防控制中心 200072

目的对全国各省份的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情防控现状进行分析,建立预测模型预估现有防控措施预期成效,为决策部门提供科学信息。方法基于COVID-19疫情网络公开数据,估计全国、各省份以及武汉市不同时间基本再生数(R0)的动态变化... 详细信息

目的对全国各省份的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情防控现状进行分析,建立预测模型预估现有防控措施预期成效,为决策部门提供科学信息。方法基于COVID-19疫情网络公开数据,估计全国、各省份以及武汉市不同时间基本再生数(R0)的动态变化R0(t),以评估在现有防控措施下,COVID-19传染速率随时间变化的趋势,预估现有防控措施的预期成效。结果从结果稳定性考虑,选择累积确诊病例数>100例的地区进行分析,共24个省份纳入分析。在疫情初期,全国整体R0(t)不稳定,数值较大,误差也较大。随着防控措施的进一步加强,R0(t)普遍在1月下旬开始呈现下降趋势,2月始下降趋势稳定。截至数据分析日,纳入分析的24个省份中已有18个省份(75%)R0(t)降到1以下。这为有条件地开放人员流动提供了信息。结论动态R0(t)有助于动态评估COVID-19传染速率变化情况,本次疫情防控措施已初显成效,如能继续保持,全国疫情有望短期内得到全面控制。

关键词：新型冠状病毒肺炎动态基本再生数统计预测

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SEIR动力学模型辅助北京市新发地新型冠状病毒肺炎疫情传播起始时间溯源和防控效果评价

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中华流行病学杂志 2020年第11期41卷 1772-1776页

作者：魏永越官锦兴赵杨沈思鹏陈峰南京医科大学公共卫生学院全球健康中心211166

目的推测2020年6月北京市新发地新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情首例感染的传播时间起点,辅助传染病溯源,评价当前综合防控效果。方法根据北京市卫生健康委员会官方报告统计每日发病人数,建立SEIR传染病动力学模型,基于每日发病人数拟... 详细信息

目的推测2020年6月北京市新发地新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情首例感染的传播时间起点,辅助传染病溯源,评价当前综合防控效果。方法根据北京市卫生健康委员会官方报告统计每日发病人数,建立SEIR传染病动力学模型,基于每日发病人数拟合动力学模型,并搜寻本次疫情的传播时间起点;考虑不同的防控效果而拟合6月12日至7月1日的累计发病人数,以评估当前综合防控措施效果。结果北京市新发地疫情传播首例感染应起始于5月22日至5月28日之间(累计概率为95%),起始于5月25日的概率最大(23%)。本次疫情R0为4.22(95%CI:2.88~7.02)。模型拟合结果提示,截至6月11日,累计发病为99例(95%CI:77~121),符合实际情况。若不加控制,则截至7月1日累计发病估计将达到65090例(95%CI:39068~105037)。截至7月1日,较之无防控措施的理论情况,实际感染人数减少了99%。自6月12日起,北京市采取了强有力的综合防控措施,疫情实际走势接近于传播率降低95%的推演结果,敏感性分析支持这一结果。结论针对突发性疫情,传染病动力学模型可用来辅助推演传染病传播起始时间,辅助疫情溯源。北京市针对本次突发疫情所及时采取的综合防控措施迅速控制了95%以上的传播途径,减少了99%的感染人数,快速遏制了疫情,对于未来疫情防控具有重要的指导意义。

关键词：新型冠状病毒肺炎传染病动力学模型传染病溯源

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TRIZ理论在地方工科大学“双创”教育中的引入模式研究

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创新创业理论研究与实践 2021年第7期4卷 91-92,132页

作者：郭艺沈思鹏福州大学福建福州350108 福州福大科技园管理有限公司福建福州350002

在深化高等教育供给侧结构性改革的过程中,高校创新创业教育发展迅速,但普遍存在同质化现象,创新创业内涵缺失。如果不能够改善这种情况,将会对高等教育的人才培养带来影响。为了改善高等教育人才培养现状,增强创新创业教育效果,该文通... 详细信息

在深化高等教育供给侧结构性改革的过程中,高校创新创业教育发展迅速,但普遍存在同质化现象,创新创业内涵缺失。如果不能够改善这种情况,将会对高等教育的人才培养带来影响。为了改善高等教育人才培养现状,增强创新创业教育效果,该文通过归纳分析影响大学生创新创业能力的因素,提出在大学生创新创业能力培养中引入TRIZ理论,运用TRIZ理论分析地方高校创新创业的问题,为传统的创新创业人才培养模式提供了新的思路,为地方高校成果转化提供了新的方向。

关键词：高校创新创业 TRIZ理论

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常见新型冠状病毒肺炎疫情预测方法及其评价

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中国卫生统计 2020年第3期37卷 322-326页

作者：黄丽红魏永越沈思鹏朱畴文陈峰复旦大学附属中山医院生物统计室 200032 复旦大学临床流行病学与循证医学中心复旦大学附属中山医院南京医科大学公共卫生学院生物统计学系

自新型冠状病毒肺炎疫情发生以来,一些学者利用疫情公开数据建立预测模型。所用预测方式包括曲线拟合、传染病动力学模型及人工智能算法三大类。传统的曲线拟合预测方式无法考虑传染病特征,预测结果并不可靠。传染病动力学模型是本次疫... 详细信息

自新型冠状病毒肺炎疫情发生以来,一些学者利用疫情公开数据建立预测模型。所用预测方式包括曲线拟合、传染病动力学模型及人工智能算法三大类。传统的曲线拟合预测方式无法考虑传染病特征,预测结果并不可靠。传染病动力学模型是本次疫情预测应用最多的一类,能够考虑传染病的传播速度、传播模式及各种防控措施等因素,但由于考虑的参数不可能全面,且参数可能在疫情不同阶段发生动态变化,因此预测效果往往不佳,但对早期预警、防控决策支持及防控效果评价具有重要应用价值。人工智能方法可以综合考虑不同防控措施以及多种因素的影响,如果考虑得当,预测效果将会有所提高。在综合利用动力学模型优势的基础上,尽可能多地考虑不同影响因素,利用人工智能构建仿真模型,将是一个新的发展趋势。

关键词：新型冠状病毒肺炎传染病模型统计预测动力学模型人工智能

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全球新型冠状病毒肺炎疫情对我国的输入风险评估

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中华流行病学杂志 2020年第10期41卷 1582-1587页

作者：沈思鹏魏永越赵杨姜玥官锦兴陈峰南京医科大学公共卫生学院全球健康中心211166

目的评估全球新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情对我国的输入风险。方法基于收集的疫情数据(各国家每日累计确诊病例数、境外输入病例累计确诊病例数)、人口学数据(各国人口密度、人口数)、旅客潜在来源群体信息(华侨华人常住人口数、在... 详细信息

目的评估全球新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情对我国的输入风险。方法基于收集的疫情数据(各国家每日累计确诊病例数、境外输入病例累计确诊病例数)、人口学数据(各国人口密度、人口数)、旅客潜在来源群体信息(华侨华人常住人口数、在外中国留学生数、海外务工人员数、来华留学生数、航班旅客数估计)和全球健康安全指数(GHS)等信息,进行近期(2月1日-4月25日)和未来(4月26日-)风险分析及预测,构建输入风险得分。结果各国境外输入病例数、累计确诊数、罹患率、华侨华人数、境外留学生数、来华留学生数、航班乘客数和GHS变量间有较强的正相关性。近期风险分析中,俄罗斯输入病例明显较高,英国、美国、法国、西班牙次之。在未来风险预测中,通过各国罹患率指数和平均每日入境乘客数估计值两项信息,评估美国、新加坡等44个国家为未来潜在高风险国家。结论通过COVID-19疫情各国家输入风险评估,可以识别近期及未来的高风险区域,为加强疫情防控,为最终战胜疫情提高帮助。

关键词：新型冠状病毒肺炎境外输入世界流行趋势风险预测

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Sex disparity of lung cancer risk in non-smokers:a multicenter population-based prospective study based on China National Lung Cancer Screening Program

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Chinese Medical Journal 2022年第11期135卷 1331-1339页

作者： Zheng Wu Fengwei Tan Zhuoyu Yang Fei Wang Wei Cao Chao Qin Xuesi Dong Yadi Zheng Zilin Luo Liang Zhao Yiwen Yu Yongjie Xu Jiansong Ren Jufang Shi Hongda Chen Jiang Li Wei Tang sipeng shen Ning Wu Wanqing Chen Ni Li Jie He Office of Cancer Screening National Cancer CenterNational Clinical Research Center for CancerCancer HospitalChinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical CollegeBeijing 100021China Key Laboratory of Cancer Data Science Chinese Academy of Medical SciencesBeijing 100021China Department of Thoracic Surgery National Cancer CenterNational Clinical Research Center for CancerCancer HospitalChinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical CollegeBeijing 100021China PET-CT Center National Cancer CenterNational Clinical Research Center for CancerCancer HospitalChinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical CollegeBeijing 100021China Department of Epidemiology Center for Global HealthSchool of Public HealthNanjing Medical UniversityNanjingJiangsu 211166China Jiangsu Key Lab of Cancer Biomarkers Prevention and TreatmentCollaborative Innovation Center for Cancer Personalized MedicineNanjing Medical UniversityNanjingJiangsu 211166China Department of Diagnostic Radiology National Cancer CenterNational Clinical Research Center for CancerCancer HospitalChinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical CollegeBeijing 100021China.

Background: Non-smokers account for a large proportion of lung cancer patients, especially in Asia, but the attention paid to them is limited compared with smokers. In non-smokers, males display a risk for lung cancer incidence distinct from the females-even after excluding the influence of smoking;but the knowledge regarding the factors causing the difference is sparse. Based on a large multicenter prospective cancer screening cohort in China, we aimed to elucidate the interpretable sex differences caused by known factors and provide clues for primary and secondary ***: Risk factors including demographic characteristics, lifestyle factors, family history of cancer, and baseline comorbidity were obtained from 796,283 Chinese non-smoking participants by the baseline risk assessment completed in 2013 to 2018. Cox regression analysis was performed to assess the sex difference in the risk of lung cancer, and the hazard ratios (HRs) that were adjusted for different known factors were calculated and compared to determine the proportion of excess risk and to explain the existing risk ***: With a median follow-up of 4.80 years, 3351 subjects who were diagnosed with lung cancer were selected in the analysis. The lung cancer risk of males was significantly higher than that of females;the HRs in all male non-smokers were 1.29 (95% confidence interval [CI]: 1.20-1.38) after adjusting for the age and 1.38 (95% CI: 1.28-1.50) after adjusting for all factors, which suggested that known factors could not explain the sex difference in the risk of lung cancer in non-smokers. Known factors were 7% (|1.29-1.38|/1.29) more harmful in women than in men. For adenocarcinoma, women showed excess risk higher than men, contrary to squamous cell carcinoma;after adjusting for all factors, 47% ([1.30-1.16]/[1.30-1]) and 4% ([7.02-6.75]/[7.02-1])) of the excess risk was explainable in adenocarcinoma and squamous cell carcinoma. The main causes of gender differences in l

关键词： Lung cancer Non-smoker Sex disparity Excess risk Risk factor

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Elevated platelet count appears to be associated with increased risk of lung cancer:a Mendelian Randomization Analysis

Elevated platelet count appears to be associated with increa...

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2017年中国卫生统计学学术年会

作者： Ying Zhu Yongyue Wei Ruyang Zhang Qianwen Shi Xuesi Dong sipeng shen The Transdisciplinary Research in Cancer of the Lung(TRICL) Research Team Rayjean J.Hung Christopher Amos Yang Zhao David C.Christiani Feng Chen Department of Biostatistics School of Public HealthNanjing Medical University Department of Environmental Health Harvard School of Public Health China International Cooperation Center(CICC) for Environment and Human Health Nanjing Medical University

＜正＞Background:Platelets have been recognized as an important element in coagulation and inflammation,and activated platelets appear to link to cancer risk and progression through diverse ***,causal relationship between platelet count（PLT）and risk of lung cancer is still ***:To evaluate the causal relationship of PLT with lung cancer by Mendelian

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