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Spike N354 glycosylation augments SARS-CoV-2 fitness for human adaptation through structural plasticity

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National Science Review 2024年第7期11卷 80-94页

作者： Pan Liu Can Yue Bo Meng Tianhe Xiao sijie yang Shuo Liu Fanchong Jian Qianhui Zhu Yuanling Yu Yanyan Ren Peng Wang Yixin Li Jinyue Wang Xin Mao Fei Shao Youchun Wang Ravindra Kumar Gupta Yunlong Cao Xiangxi Wang CAS Key Laboratory of Infection and Immunity National Laboratory of MacromoleculesInstitute of BiophysicsChinese Academy of Sciences University of Chinese Academy of Sciences Cambridge Institute of Therapeutic Immunology&Infectious Disease(CITIID) University of Cambridge Biomedical Pioneering Innovation Center(BIOPIC) Peking University Changping Laboratory Joint Graduate Program of Peking-Tsinghua-NIBS Academy for Advanced Interdisciplinary Studies Peking University Peking-Tsinghua Center for Life Sciences Tsinghua University Chinese Academy of Medical Sciences&Peking Union Medical College

Selective pressures have given rise to a number of SARS-CoV-2 variants during the prolonged course of the COVID-19 pandemic. Recently evolved variants differ from ancestors in additional glycosylation within the spike protein receptor-binding domain(RBD). Details of how the acquisition of glycosylation impacts viral fitness and human adaptation are not clearly understood. Here, we dissected the role of N354-linked glycosylation, acquired by BA.2.86 sub-lineages, as a RBD conformational control element in attenuating viral infectivity. The reduced infectivity is recovered in the presence of heparin sulfate, which targets the‘N354 pocket’ to ease restrictions of conformational transition resulting in a ‘RBD-up’ state, thereby conferring an adjustable infectivity. Furthermore, N354 glycosylation improved spike cleavage and cell–cell fusion, and in particular escaped one subset of ADCC antibodies. Together with reduced immunogenicity in hybrid immunity background, these indicate a single spike amino acid glycosylation event provides selective advantage in humans through multiple mechanisms.

关键词： coronavirus glycosylation viral fitness adjustable infectivity co-factor usage viral evolution conformational modulator

科研团队成员国别差异性的测度、演变及其与团队产出影响力的关系

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情报学报 2024年第7期43卷 818-838页

作者：柳美君步一杨斯杰复旦大学全球公共政策研究院上海200433 北京大学信息管理系北京100871 北京大学信息化与信息管理研究中心北京100871

国际科学合作已成为知识创造的一条重要途径,有利于科学突破的产生。这种合作形式不仅反映了个体科学家的合作动机,还体现了国家在社会经济和科学活动等方面的依赖性与合作性。本文通过考察论文团队成员的国别属性,探讨了成员差异与团... 详细信息

国际科学合作已成为知识创造的一条重要途径,有利于科学突破的产生。这种合作形式不仅反映了个体科学家的合作动机,还体现了国家在社会经济和科学活动等方面的依赖性与合作性。本文通过考察论文团队成员的国别属性,探讨了成员差异与团队产出影响力之间的关系。首先,本文从地理、经济、文化和科学活动等多个维度量化了国家间距离,运用主成分分析法提取了3个主要成分来衡量国家间的综合性差异,并计算了论文成员的差异分数。其次,本文研究了这些差异分数与团队产出影响力之间的关系。研究结果表明,论文成员的文化差异和科研投入差异与团队产出影响力之间呈现显著负相关关系,科学合作差异则与团队产出影响力之间存在显著正相关关系。本文的研究结论为组建、维护和管理跨国科研团队提供了政策建议,有助于提高跨国科研团队的绩效水平。

关键词：科研团队跨国科学合作差异性多样性团队产出影响力

Ti_(53)Ni_(47)形状记忆合金的相变行为及其在模拟体液中的耐蚀性研究

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热加工工艺 2024年第10期53卷 93-96页

作者：罗松羊思洁郑丽四川轻化工大学材料科学与工程学院四川自贡643000

对Ti_(53)Ni_(47)形状记忆合金进行不同温度的退火处理。采用差示扫描量热法(DSC)对其相变点进行测定,研究其相变行为。采用光学显微镜(OM)观察显微组织,利用X射线衍射仪(XRD)进行物相分析,采用Hank's溶液模拟人体体液环境,测试极化曲线... 详细信息

对Ti_(53)Ni_(47)形状记忆合金进行不同温度的退火处理。采用差示扫描量热法(DSC)对其相变点进行测定,研究其相变行为。采用光学显微镜(OM)观察显微组织,利用X射线衍射仪(XRD)进行物相分析,采用Hank's溶液模拟人体体液环境,测试极化曲线,探讨热处理温度对显微组织及耐蚀性的影响。结果表明:不退火或经低温退火后,合金在-30~200℃冷却或加热时不发生相变。经高温退火,合金在20~200℃将发生相变,退火温度升高,转变容易。未退火和经300℃退火的合金室温相为B2相,而经400、500℃退火的合金室温相为B2和B19';合金内部存在黑色点状组织,其原子分数近似为Ti51Ni49。经退火处理,合金在模拟人体体液环境中的耐蚀性得到提升,但并非线性变化,呈一定的波动性。

关键词：形状记忆合金热处理相变点微观组织

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改性阳极泥对沉锗后液中有机物的脱除

有色金属科学与工程 2024年第3期15卷 351-356页

作者：刘然李玉虎杨裕东杨思杰江西理工大学材料冶金化学学部江西赣州341000

单宁沉锗工艺被广泛用于湿法炼锌溶液中低浓度锗的回收,但该方法有机物引入量大,严重影响湿法炼锌系统的高效运转。为此,通过借助TOC、FT-IR、XRD、UV-Vis等表征手段,本文考察了改性阳极泥对沉锗后液中有机物的脱除效果,并揭示了其反应... 详细信息

单宁沉锗工艺被广泛用于湿法炼锌溶液中低浓度锗的回收,但该方法有机物引入量大,严重影响湿法炼锌系统的高效运转。为此,通过借助TOC、FT-IR、XRD、UV-Vis等表征手段,本文考察了改性阳极泥对沉锗后液中有机物的脱除效果,并揭示了其反应机理。结果表明,在温度为80℃,硫酸用量为14 mL/100 g条件下进行阳极泥活化,所得改性阳极泥对沉锗后液中有机物具有良好的脱除效果。阳极泥用量为20 g/L时,TOC脱除率可达66.17%,反应后液TOC浓度可降至58.21 mg/L。这一效果与改性过程中阳极泥中惰性的α-MnO_(2)转化为高活性的MnOOH有关,且硫酸用量和温度对阳极泥改性效果影响较为显著。沉锗后液中主要的有机物为单宁酸及其衍生物,经改性阳极泥处理后,沉锗后液中的单宁酸发生了不完全降解,降解产物主要是小分子量的烃类有机物。

关键词：湿法炼锌有机物改性阳极泥氧化降解

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基于FPGA的软硬件协同纠删码编码加速方案

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计算机工程 2024年第2期50卷 224-231页

作者：杨思捷陈俊奇王勇李树林桂林电子科技大学计算机与信息安全学院广西桂林541004 桂林电子科技大学广西教育大数据与网络安全协同创新中心广西桂林541004

纠删码容错技术已广泛应用于分布式存储系统,相较于多副本容错技术能显著降低数据存储成本,并且具有更高的数据通信可靠性和安全性,但在数据存储过程中不可避免地会引入额外的计算开销并增加编码时延,导致数据写入吞吐量降低。针对该问... 详细信息

纠删码容错技术已广泛应用于分布式存储系统,相较于多副本容错技术能显著降低数据存储成本,并且具有更高的数据通信可靠性和安全性,但在数据存储过程中不可避免地会引入额外的计算开销并增加编码时延,导致数据写入吞吐量降低。针对该问题,提出一种基于现场可编程门列阵(FPGA)的纠删码编码加速方案。首先,利用FPGA的高速并行计算优势对纠删码算法进行硬件加速,并实现并行处理和时序优化。然后,针对上位机与FPGA之间因传输速率和处理速率不一致造成内存中的数据溢出问题,在FPGA上拓展了片外DDR3接口用于数据缓存,提高了通信可靠性,并利用DDR3的随机存取特点实现对数据块的分片。最后,设计基于FPGA的纠删码编码硬件加速架构进行实验验证。实验结果表明,与主流Jerasure 2.0开源纠删码库相比,该方案的数据写入吞吐量提升了2.7~93.0倍,尤其对于小文件的编码写入性能提升更为显著。

关键词：纠删码现场可编程门阵列硬件加速分布式存储模块化设计

科学家研究主题演化速度与科研绩效的关系研究:基于计算机科学领域的分析

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图书情报工作 2024年第6期68卷 72-82页

作者：柳美君石静杨斯杰步一复旦大学全球公共政策研究院上海200433 南京大学信息管理学院南京210023 北京大学信息化与信息管理研究中心北京100871 北京大学信息管理系北京100871

[目的/意义]使用深度学习技术,从时间维度量化科学家研究主题的演化速度,并探究主题演化速度的历史发展及异质性,揭示主题演化速度与科研绩效的关系。[方法/过程]首先,基于1980—2019年全球计算机科学领域近100万科学家的论文数据,使用D... 详细信息

[目的/意义]使用深度学习技术,从时间维度量化科学家研究主题的演化速度,并探究主题演化速度的历史发展及异质性,揭示主题演化速度与科研绩效的关系。[方法/过程]首先,基于1980—2019年全球计算机科学领域近100万科学家的论文数据,使用Doc2vec深度学习方法,测度科学家相邻年份产出论文之间的文本特征距离,测算主题演化速度;然后,剖析研究主题演化速度与科研绩效的关系,并对比不同职业发展状态的科学家在主题演化程度方面的动态发展差异。[结果/结论]研究发现,近四十年来,科学家主题演化速度逐渐放缓,全球计算机科学领域中科学家整体朝向“利用式研究”的发展状态;较低的主题演化速度能带来最好的科研绩效,主题演化速度与科研绩效之间呈现倒U型关系。在职业发展生命周期中,精英科学家的主题演化程度逐渐下降,呈现“逐渐聚焦”的主题演化模式;非精英科学家的主题演化程度在大部分时期处于上升或平稳发展状态。研究结果对学科发展评估、科学家职业发展以及科学政策制定具有一定启示意义。

关键词：研究主题科研绩效 Doc2vec 深度学习利用式研究精英科学家

人血清中97种典型化学污染物暴露特征及健康风险评估

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色谱 2024年第2期42卷 217-223,I0007-I0010页

作者：张明烨曹衍李想寇婧徐启彤阳思洁郑志义刘俊梅素容华中科技大学公共卫生学院环境医学研究所教育部环境与健康重点实验室湖北武汉430030

本研究以我国中部地区某市60名普通成人为研究对象,采用固相萃取结合气相色谱-串联质谱技术(SPE-GC-MS/MS)同时测定人血清样品中97种典型化学污染物的浓度,采用多元线性回归模型分析人口学特征、生活习惯和饮食对血清中化学污染物浓度... 详细信息

本研究以我国中部地区某市60名普通成人为研究对象,采用固相萃取结合气相色谱-串联质谱技术(SPE-GC-MS/MS)同时测定人血清样品中97种典型化学污染物的浓度,采用多元线性回归模型分析人口学特征、生活习惯和饮食对血清中化学污染物浓度的影响,结合已知的生物监测当量(BEs)和人类生物监测(HBM)值计算危害商(HQ)和危害指数(HI)来评估化学污染物单一和累积暴露的健康风险。结果表明,在人体血清中主要检出的污染物为有机氯农药(OCPs)、多氯联苯(PCBs)及多环芳烃(PAHs),其中六氯苯(100.0%)、五氯苯酚(100.0%)、p,p′-滴滴伊(100.0%)、PCB-138(100.0%)、PCB-153(98.3%)、β-六六六(91.7%)、芴(85.0%)和蒽(75.0%)的检出率大于70%。女性血清中β-六六六的浓度水平高于男性;年龄与p,p′-滴滴伊、PCB-138、PCB-153和β-六六六暴露水平呈正相关;p,p′-滴滴伊和β-六六六暴露水平增高可能与肉类摄入频率高有关,蔬菜摄入频率高的人群具有较高的血清五氯苯酚暴露水平。6.7%的成人血清中五氯苯酚HQ大于1,在研究人群中未观察到六氯苯和p,p-滴滴伊暴露的风险,28.3%的研究对象HI值大于1。总体而言,该地区普通成人广泛暴露于各种化学污染物,性别、年龄和饮食可能是影响化学污染物浓度的主要因素,且化学污染物单一和复合暴露的健康风险不容忽视。

关键词：固相萃取气相色谱-串联质谱化学污染物血清健康风险评估

Air sensitivity of electrode materials in Li/Na ion batteries:Issues and strategies

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InfoMat 2022年第6期4卷 83-108页

作者： Ruiwang Zhang sijie yang Haobo Li Tianyou Zhai Huiqiao Li State Key Laboratory of Materials Processing and Die&Mould Technology School of Materials Science and EngineeringHuazhong University of Science and TechnologyWuhanChina

With the development of electrode materials in lithium ion batteries-upgrading from LiCoO_(2)and LiFePO_(4)to Ni-rich layered oxides,and the shifting of battery systems from high cost lithium ion to low cost sodium ion technology,the air sensitivity of the electrode materials has become an increasingly important issue in both production and ***,the air sensitivity of electrode materials must be carefully considered throughout nearly all stages of their life,including material design,synthesis,production,storage,packaging,transportation,and battery ***,a fundamental understanding of the air degradation mechanism of electrode materials and the exploration of new methods to enhance their air stability are of great significance for the development of batteries with better ***,we provide a review of the issues related to air exposure of electrode materials in Li/Na ion batteries,including factors related to air sensitivity,degradation mechanisms,and recent progress in improving their air *** merits and existing challenges of different strategies are presented,and a rational design perspective as well as general principles for evaluating air stability are proposed.

关键词： air sensitivity air stability electrode materials lithium ion batteries sodium ion batteries

A Universal Atomic Substitution Conversion Strategy Towards Synthesis of Large‑Size Ultrathin Nonlayered Two‑Dimensional Materials

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Nano-Micro Letters 2021年第11期13卷 79-91页

作者： Mei Zhao sijie yang Kenan Zhang Lijie Zhang Ping Chen Sanjun yang yang Zhao Xiang Ding Xiaotao Zu Yuan Li Yinghe Zhao Liang Qiao Tianyou Zhai School of Physics University of Electronic Science and Technology of China(UESTC)Chengdu 610054People’s Republic of China State Key Laboratory of Materials Processing and Die&Mould Technology School of Materials Science and EngineeringHuazhong University of Science and Technology(HUST)Wuhan 430074People’s Republic of China School of Materials and Energy Guangdong University of TechnologyGuangzhou 510006People’s Republic of China Key Laboratory of Carbon Materials of Zhejiang Province Institute of New Materials and Industrial TechnologiesCollege of Chemistry and Materials EngineeringWenzhou UniversityWenzhou 325035People’s Republic of China

Nonlayered two-dimensional(2D)materials have attracted increasing attention,due to novel physical properties,unique surface structure,and high compatibility with microfabrication ***,owing to the inherent strong covalent bonds,the direct synthesis of 2D planar structure from nonlayered materials,especially for the realization of large-size ultrathin 2D nonlayered materials,is still a huge ***,a general atomic substitution conversion strategy is proposed to synthesize large-size,ultrathin nonlayered 2D *** nonlayered CdS as a typical example,large-size ultrathin nonlayered CdS single-crystalline flakes are successfully achieved via a facile low-temperature chemical sulfurization method,where pre-grown layered CdI2 flakes are employed as the precursor via a simple hot plate assisted vertical vapor deposition *** size and thickness of CdS flakes can be controlled by the CdI2 *** growth mechanism is ascribed to the chemical substitution reaction from I to S atoms between CdI2 and CdS,which has been evidenced by experiments and theoretical *** atomic substitution conversion strategy demonstrates that the existing 2D layered materials can serve as the precursor for difficult-to-synthesize nonlayered 2D materials,providing a bridge between layered and nonlayered materials,meanwhile realizing the fabrication of large-size ultrathin nonlayered 2D materials.

关键词： Nonlayered 2D materials Large-size ultrathin CdS flakes Atomic substitution conversion Layered-nonlayered structural transformation