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Quantitative and qualitative subgenomic RNA profiles of SARS-CoV-2 in respiratory samples: A comparison between Omicron BA.2 and non-VOC-D614G

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Virologica Sinica 2024年第2期39卷 218-227页

作者： Zigui Chen Rita Way Yin Ng Grace Lui Lowell Ling Agnes S.Y.Leung Chit Chow siaw shi boon Wendy C.S.Ho Maggie Haitian Wang Renee Wan Yi Chan Albert Martin Li David Shu Cheong Hui Paul Kay Sheung Chan Department of Microbiology Faculty of MedicineThe Chinese University of Hong KongHong KongChina Department of Medicine and Therapeutics Faculty of MedicineThe Chinese University of Hong KongHong KongChina Department of Anaesthesia and Intensive Care Faculty of MedicineThe Chinese University of Hong KongHong KongChina Department of Paediatrics Faculty of MedicineThe Chinese University of Hong KongHong KongChina Department of Anatomical and Cellular Pathology Faculty of MedicineThe Chinese University of Hong KongHong KongChina Jockey Club School of Public Health and Primary Care Faculty of MedicineThe Chinese University of Hong KongHong KongChina Stanley Ho Centre for Emerging Infectious Diseases Faculty of MedicineThe Chinese University of Hong KongHong KongChina

The SARS-CoV-2 Omicron variants are notorious for their transmissibility,but little is known about their subgenomic RNA(sgRNA)*** study applied RNA-seq to delineate the quantitative and qualitative profiles of canonical sgRNA of 118 respiratory samples collected from patients infected with Omicron BA.2 and compared with 338 patients infected with non-variant of concern(non-VOC)-D614G.A unique characteristic profile depicted by the relative abundance of 9 canonical sgRNAs was reproduced by both BA.2 and non-VOCD614G regardless of host gender,age and presence of ***,such profile was lost in samples with low viral load,suggesting a potential application of sgRNA pattern to indicate viral activity of individual patient at a specific time point.A characteristic qualitative profile of canonical sgRNAs was also reproduced by both BA.2 and *** presence of a full set of canonical sgRNAs carried a coherent correlation with crude viral load(AUC¼0.91,95%CI 0.88–0.94),and sgRNA ORF7b was identified to be the best surrogate marker allowing feasible routine application in characterizing the infection status of individual *** potentials in using sgRNA as a target for vaccine and antiviral development are worth pursuing.

关键词： Coronavirus SARS-CoV-2 Omicron BA.2 Non-VOC-D614G RNA-seq Subgenomic RNA(sgRNA)

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Was Wuhan the early epicenter of the COVID-19 pandemic?——a critique

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National Science Review 2023年第4期10卷 19-21页

作者： Yanan Cao Lingling Chen Hua Chen Yupeng Cun Xiaofeng Dai Hongli Du Feng Gao Fengbiao Guo Yalong Guo Pei Hao Shunmin He Shunping He XiongLei He Zheng Hu boon-Peng Hoh Xin Jin Qian Jiang Qinghua Jiang Asifullah Khan Hong-Zhi Kong Jinchen Li Shuai Cheng Li Ying Li Qiang Lin Jianquan Liu Qi Liu Jian Lu Xuemei Lu Shujin Luo Qinghua Nie Zilong Qiu Tieliu shi Xiaofeng Song Jianzhong Su Sheng-ce Tao Chaolong Wang Chuan-Chao Wang Guo-Dong Wang Jiguang Wang Qi Wu Shaoyuan Wu Shuhua Xu Yu Xue Wenjun Yang Zhaohui Yang Kai Ye Yuan-Nong Ye Li Yu Fangqing Zhao Yiqiang Zhao Weiwei Zhai Dandan Zhang Liye Zhang Houfeng Zheng Qi Zhou Tianqi Zhu Ya-ping Zhang Institut Pasteur of Shanghai Chinese Academy of Sciences Institute of Biophysics Chinese Academy of Sciences Institute of Hydrobiology Chinese Academy of Sciences School of Life Sciences Sun Yat-sen University Institute of Synthetic Biology Shenzhen Institute of Advanced TechnologyChinese Academy of Sciences Faculty of Medicine and Health Sciences University College Sedaya International School of Medicine South China University of Technology Department of Medical Genetics Capital Institute of Pediatrics School of Life Science and Technology Harbin Institute of Technology Department of Biochemistry Abdul Wali Khan University Ruijin Hospital Shanghai Jiao Tong University Xiangya Hospital Central South University Department of Computer Science City University of Hong Kong College of Life Science and Technology Foshan University South China Sea Institute of Oceanology Chinese Academy of Sciences College of Ecology Lanzhou University School of Life Sciences and Technology Tongji University School of Life Sciences Peking University Kunming Institute of Zoology Chinese Academy of Sciences College of Animal Science South China Agricultural University Institute of Neuroscience Chinese Academy of Sciences College of Life Science and Technology Guangxi University School of Life Sciences East China Normal University Nanjing University of Aeronautics and Astronautics Wenzhou Institute University of Chinese Academy of Sciences Institute of Systems Biomedicine Shanghai Jiao Tong University Tongji Medical College Huazhong University of Science and Technology School of Life Sciences Xiamen University Division of Life Science and Department of Chemical and Biological Engineering The Hong Kong University of Science and Technology Institute of Microbiology Chinese Academy of Sciences School of Life Sciences Jiangsu Normal University School of Life Sciences Fudan University Beijing Institute of Genomics Chinese Academy of Sciences College of Life Science and Technology Huazhong University of Science and Technology International Cen

Recently, Worobey et al.(2022) published a report entitled ‘The Huanan Seafood Wholesale Market in Wuhan was the early epicenter of the COVID-19 pandemic’ that succinctly summarizes their study [1]. A pre-print version of this study had earlier elicited a series of highprofile media coverages [2,3]. All these reports deliver a social-political message that the Huanan market is the epicenter of COVID-19.

关键词： SARS-COV-2 ORIGIN

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低渗透油藏二氧化碳混相驱注采方式研究——以克拉玛依油田X区克下组低渗透油藏为例

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中国地质 2022年第2期49卷 485-495页

作者：李玮师庆三董海海侯锐新疆大学地质与矿业工程学院新疆乌鲁木齐830047 新疆油田公司勘探开发研究院新疆克拉玛依834000 新疆正天华能环境工程技术有限公司新疆乌鲁木齐830047

【研究目的】克拉玛依油田X区克下组低渗透油藏存在物性差、水驱开发采收率低等问题,影响了油田的可持续发展。CO_(2)是全球变暖的主要成分,世界各国都在想方设法减少CO_(2)的排放量,本文试图利用CO_(2)驱油气方式提高该油藏的采收率,... 详细信息

【研究目的】克拉玛依油田X区克下组低渗透油藏存在物性差、水驱开发采收率低等问题,影响了油田的可持续发展。CO_(2)是全球变暖的主要成分,世界各国都在想方设法减少CO_(2)的排放量,本文试图利用CO_(2)驱油气方式提高该油藏的采收率,变害为利。【研究方法】文章选取研究区60余口取心井目标层位岩心样品,开展扫描电镜及压汞测试分析等研究,系统梳理储层孔隙结构特征。采用油藏数值模拟方法对CO_(2)连续气驱与CO_(2)水气交替驱参数进行了优选,对比了各种开发方式的驱油效果。【研究结果】最后得到了最优的驱油方案:采用CO_(2)水气交替驱方法,15口井连续注气4年后全部转水气交替注入,气水比为2∶1;气水比10年后调整为1∶1。数值模拟预测,注气开发15年,预测最终采收率将提高30%。【结论】通过现场试注结果表明,试采效果注气后产油量较水驱阶段有明显提高,试采效果注气后产油量是水驱阶段的1.85倍,有明显提高,对实现老区稳产和油田可持续发展具有十分重要的意义。

关键词：低渗透油藏细管试验 CO_(2)水气交替驱 CO_(2)连续气驱数值模拟油气勘查工程克拉玛依油田新疆

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河乐广场

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建筑实践 2020年第6期3卷 66-71页

作者： Wenchian shi Jeroen Zuidgeest Hui Hsin Liao Angel Sanchez Navarro Stephan boon Xiaoting Chen Chi Yi Liao Dong Min Lee Andrea Anselmo Yi-Chien Liao Zuliandi Azli Olivier Sobels Winy Maas Daria Scagliola(摄) 无不详 MVRDV建筑规划事务所

地点:中国台湾台南市Location:Tainan,China Taiwan河乐广场是一个都市公共空间设计项目。市中心一处老旧的商场"台南中国城"被改造成植物环绕的城市潟湖,植物长成丛林后将会让城市、自然和水岸重新连结。整体规划在台南运河东侧重塑了... 详细信息

地点:中国台湾台南市Location:Tainan,China Taiwan河乐广场是一个都市公共空间设计项目。市中心一处老旧的商场"台南中国城"被改造成植物环绕的城市潟湖,植物长成丛林后将会让城市、自然和水岸重新连结。整体规划在台南运河东侧重塑了一条"T"型轴线,以新的景观策略整合原台南中国城基地和1km长的海安路。除公共广场和都市景观水池外,项目还包括改善公共交通道路,使交通流量减少,并统一从地下突出于公共空间的大型通风井颜色,削弱其视觉存在感。

关键词：公共空间设计公共广场景观水池整体规划公共交通交通流量台南市南运河

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不同品种藜麦营养与功能活性成分比较及应用

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食品安全质量检测学报 2022年第3期13卷 681-687页

作者：王洁周思璇常诗洁赵立艳陈贵堂中国药科大学工学院南京211198 江苏省沿海农业发展有限公司南京210019 南京农业大学食品科技学院南京210095

藜麦作为"伪谷物"的代表,是目前唯一一种能够满足人体基本营养需求的单体植物,不仅基本营养成分丰富而且富含多酚、黄酮、皂苷等多种功能活性成分。在过去的几十年,藜麦被广泛应用到了各个领域,其中功能食品领域更是将其视为一些特殊人... 详细信息

藜麦作为"伪谷物"的代表,是目前唯一一种能够满足人体基本营养需求的单体植物,不仅基本营养成分丰富而且富含多酚、黄酮、皂苷等多种功能活性成分。在过去的几十年,藜麦被广泛应用到了各个领域,其中功能食品领域更是将其视为一些特殊人群的福音。目前,针对藜麦开发的相关产品很多,但由于藜麦种质具有一定的基因变异性,因此品种间的营养特性会有所差异,而营养成分和功能活性成分上的差异往往会对人体健康产生不同的促进作用。本文对各地不同品种间藜麦的基本营养成分和功能活性成分的差异进行了综述,并展望了针对藜麦营养与功能特性的开发应用前景,以期为研究者针对不同人群合理选择不同营养特性的藜麦开发相关功能性产品提供参考。

关键词：藜麦品种营养成分功能活性成分开发前景

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面向生产性流程问题解决的裁剪规则

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机械设计 2019年第3期36卷 42-49页

作者：谭震张建辉谭若诗杨二顺河北工业大学机械工程学院天津300130 国家技术创新方法与实施工具工程技术研究中心天津300130 风帆有限责任公司河北保定071021

流程是操作序列,即研究对象不是由元件组成,而是由一系列的操作或者工艺组成,流程问题所研究的工程系统是一种产品的流程。由于流程与产品之间存在区别,应用功能裁剪解决流程中的产品制造、安装、运行等问题时,裁剪方法并不完全适用。... 详细信息

流程是操作序列,即研究对象不是由元件组成,而是由一系列的操作或者工艺组成,流程问题所研究的工程系统是一种产品的流程。由于流程与产品之间存在区别,应用功能裁剪解决流程中的产品制造、安装、运行等问题时,裁剪方法并不完全适用。该研究以现有的流程裁剪规则提取原理为约束,结合流程各类有用功能的特点,提出一套更合理的、高操作性的流程裁剪规则,并构建流程裁剪过程模型。可对已有的流程现状进行有效地改进和创新,有利于提高流程问题的解决效率。

关键词： TRIZ 流程裁剪流程功能分析流程裁剪规则

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