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High-quality draft genome sequence of Streptomyces agglomeratus 5-1-8 with strong anti-MRSA ability, isolated from the frozen soil of Tibet in China

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Research in Cold and Arid Regions 2017年第5期9卷 503-510页

作者： XiMing Chen Ling Zhang HaiLi Sun ShuYan Li sijing chang QingFeng Zhang BingLin Zhang Tuo Chen GuangXiu Liu Paul Dyson Key Laboratory of Desert and Desertification Northwest Institute of Eco-Environment and Resources Chinese Academy of Sciences Lanzhou Gansu 730000 China Key Laboratory of Extreme Environmental Microbial Resources and Engineering of Gansu Province Lanzhou Gansu 730000 China Xinjiang Institute of Ecology and Geography Chinese Academy of Science Urumqi Xinjiang 830011 China School of Chemistry and Environment Science Lanzhou City University Lanzhou Gansu 730000 China College of Chemistry and Chemical Engineering Lanzhou University Lanzhou Gansu 730000 China School of Life Sciences Lanzhou University Lanzhou Gansu 730000 China Institute of Life Science College of Medicine Swansea University Singleton Park Swansea SA2 8PP UK

Streptomyces agglomeratus 5-1-8 with strong anti methicillin-resistant Staphylococcus aureus(MRSA)ability,isolated from the frozen soil of Tibet in China,has a strong ability to kill the multi-drugs-resistant *** identify the second-ary metabolism ability of this strain,we describe here the phenotypic characteristics of this strain,along with its high-quality draft genome sequence,its annotation,and *** 7.1M draft genome encodes 6,284 putative open reading frames(ORFs),of which 4,416 ORFs were assigned with clusters of orthologous genes(COG)***,65 t RNA genes and 24 r RNA operons were *** genome contains 12 gene clusters involved in antibiotics production and 1 gene cluster involved in anticancer-compounds production;4 gene clusters belong to polyketides and nonribosomal peptides,1gene cluster belong to the butyrolactone,4 gene clusters belong to the bacteriocin or lantipeptide,and 3 gene clusters belong to the *** genome-sequence data will facilitate efforts to probe the potential of new antibiotics to kill multidrugs-resistant MRSA.

关键词： Streptomyces antibiotic multi-drugs-resistant MRSA genome gene cluster

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尼罗蓝在筛选PHB高产菌株中的应用研究

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生物技术通报 2010年第3期26卷 181-184页

作者：薛林贵赵旭景春娥常思静兰州交通大学化学与生物工程学院兰州730070

建立一种简便、高效、可靠的初筛方法是PHB高产菌株筛选的关键。以芽孢杆菌(BacillusP-9)为试验材料,对各种PHB产生菌筛选方法进行了比较,最终确定尼罗蓝染色法为一种最佳方法。并且对试验程序进行了优化,确定尼罗蓝染液的最佳浓度为0.2... 详细信息

建立一种简便、高效、可靠的初筛方法是PHB高产菌株筛选的关键。以芽孢杆菌(BacillusP-9)为试验材料,对各种PHB产生菌筛选方法进行了比较,最终确定尼罗蓝染色法为一种最佳方法。并且对试验程序进行了优化,确定尼罗蓝染液的最佳浓度为0.225mg/L,菌株的最佳染色时间为培养后96h。进一步证实了尼罗蓝染色法为一种值得推广的PHB产生菌初筛方法。

关键词：尼罗蓝聚β-羟基丁酸高产菌筛选荧光

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青藏高原土壤中一株原油降解菌的作用机制探究

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冰川冻土 2018年第5期40卷 1037-1046页

作者：常思静杨蕊琪章高森刘光琇陈拓中国科学院西北生态环境资源研究院冰冻圈科学国家重点实验室甘肃兰州730000 中国科学院大学北京100049 中国科学院西北生态环境资源研究院甘肃省极端环境微生物资源与工程重点实验室甘肃兰州730000 中国科学院西北生态环境资源研究院沙漠与沙漠化重点实验室甘肃兰州730000

分别采用原油和丙酮酸作为碳源培养Pedobacter steynii DX4细胞,采用Illumina高通量测序技术对两种碳源条件下细胞的转录组进行测序,测序数据拼接组装后共得到7 693个Unigene,其中有5 017个Unigene获得CDS注释。对Unigene进行筛选共获得... 详细信息

分别采用原油和丙酮酸作为碳源培养Pedobacter steynii DX4细胞,采用Illumina高通量测序技术对两种碳源条件下细胞的转录组进行测序,测序数据拼接组装后共得到7 693个Unigene,其中有5 017个Unigene获得CDS注释。对Unigene进行筛选共获得1 195个差异表达基因,约占Unigene总数的15. 5%,对差异表达基因进行功能分析发现,在原油为碳源的生长条件下,DX4细胞中Luciferase-like monooxygenase基因和卤代烷脱氢酶基因表达水平显著提高,这两个基因可能在DX4细胞中催化烷烃末端氧化反应。KEGG分析显示,以原油为碳源的DX4细胞中的脂肪酸降解途径中发现了8个UPDEGs、苯酸盐降解途径中发现了10个UPDEGs,揭示了细胞对原油中烷烃和芳香烃类物质的降解通路。此外,关于信号处理、物质转运、胞外多糖合成以及细胞趋向运动代谢途径的基因表达水平上调,表明DX4细胞可能依赖细胞趋向运动和合成生物表面活性物质来辅助原油降解。

关键词：微生物原油降解代谢途径青藏高原

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80 MeV/u C-12离子诱变选育PHB高产菌株

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核技术 2010年第4期33卷 284-288页

作者：薛林贵赵旭常思静张红武振华景春娥兰州交通大学化学与生物工程学院兰州730070 中国科学院近代物理研究所兰州730000

用80MeV/u12C6+离子对一株积累聚β-羟基丁酸酯(PHB)的芽孢杆菌(BacillusP-9)进行诱变选育,最终获得PHB高产株菌G15,其PHB产量达2.93g/L,与出发菌株相比较,PHB积累量提高了1.5倍。研究结果表明,本试验辐照最佳剂量为15Gy。重离子辐照诱... 详细信息

用80MeV/u12C6+离子对一株积累聚β-羟基丁酸酯(PHB)的芽孢杆菌(BacillusP-9)进行诱变选育,最终获得PHB高产株菌G15,其PHB产量达2.93g/L,与出发菌株相比较,PHB积累量提高了1.5倍。研究结果表明,本试验辐照最佳剂量为15Gy。重离子辐照诱变育种效果显著,具有广阔的发展应用前景。

关键词：聚β-羟基丁酸重离子诱变高产菌

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纤维素酶在燃料乙醇工业中的应用研究进展

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酿酒科技 2009年第3期 98-102页

作者：景春娥赵旭常思静薛林贵兰州交通大学化学与生物工程学院甘肃兰州730070

现代社会面临着严重的能源危机,发展燃料乙醇作为化石燃料的替代品已经成为国际上的共识。归纳了燃料乙醇生产原料选择方面的关键问题,总结了微生物直接转化、同步糖化发酵、糖化发酵二段法以及固定化细胞发酵等生物转化方式的主要研究... 详细信息

现代社会面临着严重的能源危机,发展燃料乙醇作为化石燃料的替代品已经成为国际上的共识。归纳了燃料乙醇生产原料选择方面的关键问题,总结了微生物直接转化、同步糖化发酵、糖化发酵二段法以及固定化细胞发酵等生物转化方式的主要研究进展,在此基础上对我国利用纤维质原料生产乙醇的研究前景进行了展望,旨在为开展同类工作提供理论依据。

关键词：燃料乙醇纤维素酶应用研究

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一株产嗜铁素耐镉菌的分离及其对黑麦草种子萌发的作用

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微生物学通报 2021年第6期48卷 1895-1906页

作者：武雯雯薛林贵张璐王韶梅常思静李明聪刘映彤何园园兰州交通大学化学与生物工程学院甘肃兰州730070

【背景】产嗜铁素细菌(Siderophore-ProducingBacteria,SPB)是一类耐重金属性能较好的促生微生物,将其应用于土壤重金属污染修复方面的研究已成为该领域的研究热点。【目标】为重金属镉污染土壤修复提供种质资源,并探究产嗜铁素细菌对C... 详细信息

【背景】产嗜铁素细菌(Siderophore-ProducingBacteria,SPB)是一类耐重金属性能较好的促生微生物,将其应用于土壤重金属污染修复方面的研究已成为该领域的研究热点。【目标】为重金属镉污染土壤修复提供种质资源,并探究产嗜铁素细菌对Cd2+胁迫下黑麦草种子萌发的影响。【方法】采用微生物分离纯化技术,从甘肃省临泽县宏鑫矿业尾矿区采集土壤样品,分离筛选出一株能够产嗜铁素且耐镉胁迫的菌株,采用16SrRNA基因序列鉴定该菌株,并测定其嗜铁素螯合基团结构类型及生长和产嗜铁素曲线,对菌株嗜铁素分离纯化后测定其荧光强度并进行紫外光谱扫描,最后探究嗜铁素及其产生菌对Cd2+胁迫下黑麦草种子萌发的影响。【结果】经鉴定该菌为假单胞菌属(Pseudomonassp.W-STS-8),能产生一种黄绿色嗜铁素——脓菌素(Pyoverdine),该嗜铁素同时具有异羟肟酸型和儿茶酚型2种螯合结构;其嗜铁素产量在菌株生长稳定期的后期达到最大值(68%),而且嗜铁素产量与菌株生物量呈正相关。嗜铁素经分离纯化后,在紫外灯(254 nm)下可见荧光,在400 nm处具有紫外光谱特征吸收峰。该菌及其嗜铁素对Cd2+胁迫下黑麦草种子萌发实验结果表明,与对照相比,经W-STS-8菌悬液和嗜铁素处理后黑麦草种子发芽率显著上升,分别提高了73.14%和150.92%。【结论】对该菌株的深入研究,可为重金属镉污染土壤的微生物-植物联合修复的生态修复工程提供种质资源和科学基础。

关键词：荧光嗜铁素耐镉菌株分离黑麦草种子发芽率

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一氧化氮对增强UV-B胁迫下螺旋藻抗氧化酶活性的影响

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天水师范学院学报 2009年第5期29卷 25-30页

作者：薛林贵李师翁张宝芹常思静兰州交通大学化学与生物工程学院甘肃兰州730070

为了探讨一氧化氮对增强的UV-B胁迫下螺旋藻生理代谢的影响,通过测定细胞内蛋白质含量及抗氧化酶活性的变化证实了0.5mmol/L的一氧化氮(Nitric oxide,NO)供体硝普钠(Sodium nitroprusside,SNP)对增强UV-B胁迫下的螺旋藻(Spirulina plate... 详细信息

为了探讨一氧化氮对增强的UV-B胁迫下螺旋藻生理代谢的影响,通过测定细胞内蛋白质含量及抗氧化酶活性的变化证实了0.5mmol/L的一氧化氮(Nitric oxide,NO)供体硝普钠(Sodium nitroprusside,SNP)对增强UV-B胁迫下的螺旋藻(Spirulina platensis 794)细胞内蛋白质代谢及抗氧化系统产生明显影响.实验结果显示,NO能够显著诱导增强的UV-B胁迫下螺旋藻细胞内蛋白质含量的增加,促进正常生长条件下螺旋藻细胞内抗氧化酶活性的提高.说明NO对增强UV-B胁迫下的螺旋藻794细胞有保护作用,可以减轻UV-B胁迫对螺旋藻细胞引起的氧化损伤,这为进一步探讨NO信号及其与其他信号分子之间相互作用、相互关联来调节细胞的生理生化过程,以减缓UV-B胁迫下的氧化损伤机理提供了科学依据.

关键词：螺旋藻 UV-B胁迫一氧化氮蛋白质抗氧化酶

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缺氧诱导因子-1α在肺癌组织中的表达及其与肺癌淋巴道转移关系的研究

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华中科技大学学报（医学版） 2010年第3期39卷 331-335页

作者：周思静金常娥刘建盛文超华中科技大学同济医学院附属同济医院综合科武汉430030 华中科技大学同济医学院附属同济医院呼吸内科武汉430030

目的研究缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)与肺癌淋巴道转移的关系及其可能的作用机制。方法采用免疫组织化学方法检测72例肺癌组织、癌周组织和20例正常肺组织中HIF-1α、血管内皮生长因子-C(VEGF-C)及转化生长因子-α(TGF-α)的表达,采用D2... 详细信息

目的研究缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)与肺癌淋巴道转移的关系及其可能的作用机制。方法采用免疫组织化学方法检测72例肺癌组织、癌周组织和20例正常肺组织中HIF-1α、血管内皮生长因子-C(VEGF-C)及转化生长因子-α(TGF-α)的表达,采用D2-40免疫组织化学法标记组织标本中的淋巴管并测定微淋巴管密度(LMVD),对各因子表达水平的相关性及癌周组织中LMVD与临床病理特征的关系进行统计学分析。结果 D2-40免疫组化染色显示,微淋巴管主要集中在癌周组织,癌周组织LMVD的高低与肺癌淋巴结转移具有正相关性。HIF-1α、VEGF-C和TGF-α在肺癌组织中的表达水平明显高于正常肺组织(均P<0.05);HIF-1α的表达水平与VEGF-C、TGF-α表达水平及癌周组织LMVD呈正相关(r值分别为0.452、0.396及0.444,均P<0.05),VEGF-C的表达与TGF-α表达水平及癌周组织LM-VD呈正相关(r值分别为0.357及0.523,均P<0.05)。结论 HIF-1α在肺癌组织中的表达与肺癌淋巴结转移显著相关。HIF-1α可能通过上调肺癌组织中TGF-α和VEGF-C的表达,从而参与肺癌的淋巴道转移过程。

关键词：肺癌微淋巴管密度缺氧诱导因子-1α 血管内皮生长因子-C 转化生长因子-α

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Removing microplastics from aquatic environments:A critical review

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Environmental Science and Ecotechnology 2023年第1期13卷 37-53页

作者： Yusheng Pan Shu-Hong Gao chang Ge Qun Gao sijing Huang Yuanyuan Kang Gaoyang Luo Ziqi Zhang Lu Fan Yongming Zhu Ai-Jie Wang School of Chemistry and Chemical Engineering Harbin Institute of TechnologyHarbin150090China State Key Laboratory of Urban Water Resource and Environment School of Civil&Environmental EngineeringHarbin Institute of Technology ShenzhenShenzhen518055China State Key Joint Laboratory of Environment Simulation and Pollution Control School of EnvironmentTsinghua UniversityBeijing100084China Department of Ocean Science and Engineering Southern University of Science and TechnologyShenzhenChina Southern Marine Science and Engineering Guangdong Laboratory(Guangzhou) GuangzhouChina Key Laboratory of Environmental Biotechnology Research Center for Eco-Environmental SciencesChinese Academy of SciencesBeijing100085China

As one of the typical emerging contaminants,microplastics exist widely in the environment because of their small size and recalcitrance,which has caused various ecological *** paper summarizes current adsorption and removal technologies of microplastics in typical aquatic environments,including natural freshwater,marine,drinking water treatment plants(DWTPs),and wastewater treatment plants(WWTPs),and includes abiotic and biotic degradation technologies as one of the removal ***,numerous studies have shown that enrichment technologies have been widely used to remove microplastics in natural freshwater environments,DWTPs,and *** removal of microplastics via WWTPs is critical to reduce the release to the natural environment as a key connection point to prevent the transfer of microplastics from society to natural water *** technology has outstanding pre-degradation effects on microplastics,and the isolated microbial strains or enriched communities can degrade up to 50%or more of pre-processed ***,more research focusing on microplastic degradation could be carried out by combining physical and chemical pretreatment with subsequent microbial *** addition,the current recovery technologies of microplastics are introduced in this *** is incredibly challenging because of the small size and dispersibility of microplastics,and the related technologies still need further *** paper will provide theoretical support and advice for preventing and controlling the ecological risks mediated by microplastics in the aquatic environment and share recommendations for future research on the removal and recovery of microplastics in various aquatic environments,including natural aquatic environments,DWTPs,and WWTPs.

关键词： Aquatic environment Enrichment and removal Microplastics Wastewater treatment plants

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第三方惩罚对合作的溢出效应:基于社会规范的解释

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心理学报 2021年第7期53卷 758-772页

作者：陈思静邢懿琳翁异静黎常浙江科技学院经济与管理学院杭州310023 浙江工商大学工商管理学院杭州310018

第三方惩罚对合作的维系可能来自经济功能或规范提示功能。先前研究没有区分这两种功能,因而未能回答:当惩罚不足以影响违规收益时,是否还能促进合作?实验1(N=252)发现即使第三方惩罚无法降低违规收益,依然能抑制自利行为。实验2(N=179... 详细信息

第三方惩罚对合作的维系可能来自经济功能或规范提示功能。先前研究没有区分这两种功能,因而未能回答:当惩罚不足以影响违规收益时,是否还能促进合作?实验1(N=252)发现即使第三方惩罚无法降低违规收益,依然能抑制自利行为。实验2(N=179)发现受过惩罚的违规者在其后的独裁者博弈表现出了更高的合作水平。2(是否旁观惩罚)×2(旁观前后)设计的实验3(N=179)显示,旁观惩罚后被试的合作水平显著高于旁观前,也高于未旁观惩罚的被试。后两个实验中,社会规范在惩罚与合作之间均起中介作用。这进一步证实惩罚对合作的促进在很大程度上是通过规范激活来实现的,并存在两种溢出效应:惩罚抑制了曾经的违规者(纵向溢出效应)和旁观者(横向溢出效应)在新博弈情境下的自私行为。这两种溢出效应的发现补充了文献中占主导地位的经济学解释,并为理解人类社会长时间、大规模的合作提供了新视角。

关键词：第三方惩罚社会规范合作聚焦理论溢出效应

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