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Identification of heptapeptides targeting a lethal bacterial strain in septic mice through an integrative approach

Signal Transduction and Targeted Therapy 2022年第8期7卷 3054-3068页

作者： Xiaoyan Zhang Shan Li Haihua Luo shuyue He Huangda Yang Lei Li tian tian Qizheng Han Jiacong Ye Chenyang Huang Aihua Liu Yong Jiang Guangdong Provincial Key Laboratory of Proteomics State Key Laboratory of Organ Failure ResearchDepartment of PathophysiologySchool of Basic Medical SciencesSouthern Medical UniversityGuangzhou 510515China Department of Respiratory and Critical Care Medicine Nanfang HospitalSouthern Medical UniversityGuangzhouChina

Effectively killing pathogenic bacteria is key for the treatment of *** various anti-infective drugs have been used for the treatment of sepsis,the therapeutic effect is largely limited by the lack of a specific bacterium-targeting delivery *** study aimed to develop antibacterial peptides that specifically target pathogenic bacteria for the treatment of *** lethal bacterial strain Escherichia coli MSI001 was isolated from mice of a cecal ligation and puncture(CLP)model and was used as a target to screen bacterial binding heptapeptides through an integrative bioinformatics approach based on phage display technology and high-throughput sequencing(HTS).Heptapeptides binding to *** MSI001 with high affinity were acquired after normalization by the heptapeptide frequency of the library.A representative heptapeptide VTKLGSL(VTK)was selected for fusion with the antibacterial peptide LL-37 to construct the specific-targeting antibacterial peptide *** found that,in comparison with LL37,VTK-LL37 showed prominent bacteriostatic activity and an inhibitive effect on biofilm formation in *** vivo experiments demonstrated that VTK-LL37 significantly inhibited bacterial growth,reduced HMGB1 expression,alleviated lesions of vital organs and improved the survival of mice subjected to CLP ***,membrane DEGP and DEGQ were identified as VTKbinding proteins by proteomic *** study provides a novel strategy for targeted pathogen killing,which is helpful for the treatment of sepsis in the era of precise medicine.

关键词： inhibited organs strain

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马卵巢石蜡切片制作体系的优化

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黑龙江动物繁殖 2021年第6期29卷 4-9页

作者：陶力神英超阿鲁斯伊敏娜才文道力玛王希生田书岳芒来格日乐其木格内蒙古农业大学动物科学学院/内蒙古自治区马属动物遗传育种与繁殖重点实验室/农业农村部马属动物遗传育种与繁殖科学观测实验站/内蒙古农业大学马属动物研究中心呼和浩特010018

为了建立和优化马卵巢石蜡切片制作体系,为完善马属动物繁殖理论知识奠定基础,试验以2~3岁蒙古马为研究对象,选择6匹健康母马卵巢组织,对比了不同固定方法、组织脱水方法、浸蜡方法及苏木精-伊红(Hematoxylin and Eosin,H.E.)染色体系... 详细信息

为了建立和优化马卵巢石蜡切片制作体系,为完善马属动物繁殖理论知识奠定基础,试验以2~3岁蒙古马为研究对象,选择6匹健康母马卵巢组织,对比了不同固定方法、组织脱水方法、浸蜡方法及苏木精-伊红(Hematoxylin and Eosin,H.E.)染色体系对石蜡切片制作效果的影响。结果表明:大于0.5 cm卵巢组织片段、经过3种固定液均达不到有效支持后期石蜡切片制作的条件;马卵巢石蜡切片制作需组织片段小于0.5 cm并采用Bouin固定液进行75%酒精浸泡24 h→85%酒精浸泡1 h→95%浸泡酒精2 h→100%酒精2 h脱水;二甲苯透明剂中放置10 min×2次;纯蜡与二甲苯按1∶1比例混合并浸蜡40 min→纯蜡Ⅰ40 min→纯蜡Ⅱ0.05 Mpa真空浸蜡40 min条件,以此为制作马卵巢组织石蜡切片的最佳体系。

关键词：马卵巢切片制作石蜡切片 H.E.染色

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套管井阵列声波测井仪器与油气层识别技术

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石油仪器 2007年第3期21卷 37-40页

作者：沈建国熊艳蔡朝鹏张蕊田素月肖坤德黄奇源王世震苏克晓天津大学声波测井实验室中原油田地球物理测井公司

文章通过现场10口井的实验结果,肯定了在套管井中可以测量到砂岩地层的纵、横波时差。并且在已知的气层进行了裸眼井纵、横波时差和套管井纵、横波的对比,两者吻合得比较好。这样,利用地层的纵、横波时差信息便可以对以往的老井、低产... 详细信息

文章通过现场10口井的实验结果,肯定了在套管井中可以测量到砂岩地层的纵、横波时差。并且在已知的气层进行了裸眼井纵、横波时差和套管井纵、横波的对比,两者吻合得比较好。这样,利用地层的纵、横波时差信息便可以对以往的老井、低产井以及报废井的气层、疑难油层以及可疑油气层进行重新认识,特别是油层附近未射孔的干层和水层。因为,这时测量的声波时差不受泥浆滤液(或者浸入)的影响,对气层的显示更明显。本研究为套管井地层评价提供了一个新的技术手段,为剩余油气识别提供了一种新的方法。

关键词：阵列声波测井气层纵波时差横波时差

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Single-cell Sequencing Reveals Clearance of Blastula Chromosomal Mosaicism in In Vitro Fertilization Babies

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Genomics, Proteomics & Bioinformatics 2022年第6期20卷 1224-1231页

作者： Yuan Gao Jinning Zhang Zhenyu Liu shuyue Qi Xinmeng Guo Hui Wang Yanfei Cheng Shuang tian Minyue Ma Hongmei Peng Lu Wen Fuchou Tang Yuanqing Yao Biomedical Pioneering Innovation Center School of Life SciencesPeking UniversityBeijing 100871China Department of Gynaecology and Obstetrics The First Medical Center of PLA General HospitalBeijing 100853China Peking-Tsinghua Center for Life Sciences Academy for Advanced Interdisciplinary StudiesPeking UniversityBeijing 100871China Reproductive Medicine and Prenatal Diagnosis Center The University of Hong Kong-Shenzhen HospitalShenzhen 518053China Beijing Advanced Innovation Center for Genomics MOE Key Laboratory of Cell Proliferation and DifferentiationBeijing 100871China

Although chromosomal mosaic embryos detected by trophectoderm(TE)biopsy offer healthy embryos available for transfer,high-resolution postnatal karyotyping and chromosome testing of the transferred embryos are ***,we applied single-cell multi-omics sequencing for seven infants with blastula chromosomal mosaicism detected by TE *** chromosome ploidy was examined by single-cell genome analysis,with the cellular identity being identified by single-cell transcriptome analysis.A total of 1616 peripheral leukocytes from seven infants with embryonic chromosomal mosaicism and three control ones with euploid TE biopsy were analyzed.A small number of blood cells showed copy number alterations(CNAs)on seemingly random locations at a frequency of 0%-2.5%per ***,none of the cells showed CNAs that were the same as those of the corresponding TE *** blastula chromosomal mosaicism may be fully self-corrected,probably through the selective loss of the aneuploid cells during development,and the transferred embryos can be born as euploid infants without mosaic CNAs corresponding to the TE *** results provide a new reference for the evaluations of transferring chromosomal mosaic embryos in certain situations.

关键词： Mosaicism Pre-implantation genetic testing for aneuploidy Next-generation sequencing Single-cell multi-omics sequencing Mosaic embryo transfer

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环境微生物的资源挖掘、代谢机制及其群落代谢功能的研究进展

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厦门大学学报（自然科学版） 2022年第3期61卷 470-483页

作者：林筱岚杨姝悦田蕴厦门大学生命科学学院滨海湿地生态系统教育部重点实验室福建厦门361102

自然生境中分布着数量极其庞大、种类繁多的微生物,它们在物质循环、能量流动、环境保护和人类健康等方面担当着重要的角色.然而,天然微生物种群大多由未培养微生物组成,对于在纯培养条件下详细研究这些生物体的生物化学和生理学来说,... 详细信息

自然生境中分布着数量极其庞大、种类繁多的微生物,它们在物质循环、能量流动、环境保护和人类健康等方面担当着重要的角色.然而,天然微生物种群大多由未培养微生物组成,对于在纯培养条件下详细研究这些生物体的生物化学和生理学来说,是个巨大的难题.由于自然微生物群落的高度复杂性,在原位进行代谢潜能的鉴别和表征也是困难重重.分子生物学技术的发展和高通量组学测序分析技术的出现部分弥补了传统研究方法的局限性.随着分子生物学技术如微量分析和生物标记的发展,很多新的微生物谱系被发现和分离,新的微生物代谢方式被阐明,使得研究者对环境微生物的认知不断被修正、完善和拓展.本文综述近年来本研究团队采用经典微生物学方法与现代分子生物学技术相结合的手段,从分子、细胞及群落水平上对环境微生物资源挖掘、有毒污染物分解代谢、微生物驱动元素循环的功能表征等方面的研究进展,并对今后的研究进行展望.

关键词：环境微生物资源微生物群落代谢机制元素循环

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在自己的道路上成长:《小小小小的火》的旅行叙事

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西安外国语大学学报 2024年第4期32卷 114-118页

作者：刘抒悦田俊武英国诺丁汉大学文化、语言和地区研究学院北京航空航天大学外国语学院

华裔美国文坛新星伍绮诗在《小小小小的火》中展现了三位女性在旅途中的成长,探讨了母性情感、亚裔歧视、美国民族意识和优绩主义偏见等议题。本文聚焦小说中的华裔单身母亲、流浪艺术家、白人中产精英,指出女性旅行书写凭借不稳定因素... 详细信息

华裔美国文坛新星伍绮诗在《小小小小的火》中展现了三位女性在旅途中的成长,探讨了母性情感、亚裔歧视、美国民族意识和优绩主义偏见等议题。本文聚焦小说中的华裔单身母亲、流浪艺术家、白人中产精英,指出女性旅行书写凭借不稳定因素、紧张因素、叙事介入、戏剧性反讽和自由引语等技巧塑造出圆形人物,勾勒出扣人心弦的叙事进程,并引导读者踏上阅读旅行,不断修正叙事判断。伍绮诗由此在故事情节、叙事结构和读者阐释三个层面生成旅行意义,突破了传统华裔文学中对族裔问题的单一聚焦,呈现不同种族与阶级的女性成长,反思美国当代社会弊病,拓宽了华裔文学和旅行叙事的创作边界。

关键词：《小小小小的火》华裔美国文学旅行叙事成长

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一种新的基于Markov链模型的用户行为异常检测方法

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信号处理 2006年第3期22卷 440-444页

作者：邬书跃田新广高立志张尔扬湖南科技大学信息与电气工程学院湘潭411201 国防科技大学电子科学与工程学院长沙410073

提出一种新的基于Markov链模型的用户行为异常检测方法。该方法利用一阶齐次Markov链对网络系统中合法用户的正常行为进行建模,将Markov链的状态同用户执行的shell命令序列联系在一起,并引入一个附加状态;在检测阶段,基于状态序列的出... 详细信息

提出一种新的基于Markov链模型的用户行为异常检测方法。该方法利用一阶齐次Markov链对网络系统中合法用户的正常行为进行建模,将Markov链的状态同用户执行的shell命令序列联系在一起,并引入一个附加状态;在检测阶段,基于状态序列的出现概率对用户当前行为的异常程度进行分析,并根据Markov链状态的实际含义和用户行为的特点, 采用了较为特殊的判决准则。与Lane T提出的基于隐Markov模型的检测方法相比,该方法的计算复杂度较低,更适用于在线检测。而同基于实例学习的检测方法相比,该方法则在检测准确率方面具有较大优势。文中提出的方法已在实际入侵检测系统中得到应用,并表现出良好的检测性能。

关键词：入侵检测 Markov链异常检测 shell命令

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钢渣构筑Fe-CSH吸附溶液中Pb(Ⅱ)、Cu(Ⅱ)、Zn(Ⅱ)性能及机理

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化工进展 2024年第10期43卷 5867-5880页

作者：单书月罗中秋周新涛尚波田鑫聪阎崔蓉昆明理工大学化学工程学院云南昆明650500

以钢渣为原位源、硅酸钠为活化剂合成多级孔结构的铁质水合硅酸钙(Fe-CSH),并将其作为吸附剂高效去除溶液中的Pb(Ⅱ)、Cu(Ⅱ)、Zn(Ⅱ)等重金属。重点探究初始溶液pH、Fe-CSH投加量和溶液初始浓度对Pb(Ⅱ)、Cu(Ⅱ)、Zn(Ⅱ)吸附性能的影响... 详细信息

以钢渣为原位源、硅酸钠为活化剂合成多级孔结构的铁质水合硅酸钙(Fe-CSH),并将其作为吸附剂高效去除溶液中的Pb(Ⅱ)、Cu(Ⅱ)、Zn(Ⅱ)等重金属。重点探究初始溶液pH、Fe-CSH投加量和溶液初始浓度对Pb(Ⅱ)、Cu(Ⅱ)、Zn(Ⅱ)吸附性能的影响,并通过吸附动力学、热力学以及X射线衍射、傅里叶变换红外光谱、扫描电子显微镜、透射电子显微镜、比表面积分析、X射线光电子能谱等手段对其吸附机理进行解析。结果表明,Fe-CSH对Pb(Ⅱ)、Cu(Ⅱ)、Zn(Ⅱ)的吸附过程均符合拟二级动力学模型,对Pb(Ⅱ)、Cu(Ⅱ)的吸附符合Langmuir模型,而对Zn(Ⅱ)的吸附更符合Freundlich模型,去除容量分别为1546mg/g、483mg/g和369mg/g;通过物理吸附、离子交换、沉淀和配位络合等作用机制实现重金属Pb(Ⅱ)、Cu(Ⅱ)、Zn(Ⅱ)的高效去除。本研究遵循“以废治废”环保理念,对利用固体废弃物合成吸附剂的资源化利用和污水净化处理都具有重要意义。

关键词：钢渣重金属铁质水合硅酸钙吸附性能吸附机理

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镁营养对大豆苗期生长及根系形态构型的影响

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华南农业大学学报 2024年第3期45卷 321-328页

作者：刘昭阳李书悦毛婧莹燕涵梁翠月陆星田江华南农业大学资源环境学院/根系生物学研究中心广东广州510642

【目的】镁是植物生长必需的矿质营养元素,研究大豆在不同镁浓度下的苗期生长情况及根系三维构型的动态变化。【方法】以磷高效大豆品种‘粤春03-3’为研究对象,营养液培养,设置镁浓度为0、262.5、525.0、787.5和1050.0μmol/L,分析苗... 详细信息

【目的】镁是植物生长必需的矿质营养元素,研究大豆在不同镁浓度下的苗期生长情况及根系三维构型的动态变化。【方法】以磷高效大豆品种‘粤春03-3’为研究对象,营养液培养,设置镁浓度为0、262.5、525.0、787.5和1050.0μmol/L,分析苗期大豆的生长发育状况。在此基础上,利用根系三维定量系统对正常镁处理(525.0μmol/L,对照)及缺镁处理(0μmol/L)的大豆根系三维构型进行动态定量化分析。【结果】与525.0μmol/L对照相比,0μmol/L缺镁处理大豆的地上部干质量、根冠比、老叶SPAD、总根长和根系总表面积分别减少89.04%、48.67%、51.42%、93.36%和94.31%。而其他3个镁浓度条件下,大豆生长与对照差异较小。根系三维构型研究发现,与对照相比,随着处理时间的延长,缺镁处理显著降低大豆根系的总根长、总根表面积、根重心、根尖数、凸包体积、最大根宽、最小根宽、最大根深、最大根宽/最大根深,对根系充实度、分根繁茂度和根体积分布的影响较小。【结论】本研究明确了大豆对外界镁有效性的适应范围较广,借助优化的根系三维重建技术,阐明缺镁显著降低大豆根系的总根长、根尖数、根重心、最大根宽等,但对根系充实度、分根繁茂度、根体积分布动态变化规律的影响较小。研究结果对大豆镁肥的合理施用和镁营养诊断有一定的指导意义。

关键词：大豆镁苗期生长根系三维定量根系构型

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瞬时感受器电位香草酸受体1抑制剂在神经病理性疼痛中的研究进展

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分子诊断与治疗杂志 2020年第10期12卷 1424-1428页

作者：盛树悦田映红张兴梅南方医科大学第一临床医学院广东广州510515 南方医科大学基础医学院实验教学管理中心广东广州510515 南方医科大学基础医学院神经生物学教研室广东广州510515

神经病理性疼痛(NPP)是当今社会中十分常见的一种症状,引起神经病理性疼痛的具体机制还不清楚,且尚未出现能够有效治疗神经病理性疼痛的药物。近年来研究者发现瞬时感受器电位(TRP)通道参与细胞内多种反应,其中瞬时感受器电位香草酸受体... 详细信息

神经病理性疼痛(NPP)是当今社会中十分常见的一种症状,引起神经病理性疼痛的具体机制还不清楚,且尚未出现能够有效治疗神经病理性疼痛的药物。近年来研究者发现瞬时感受器电位(TRP)通道参与细胞内多种反应,其中瞬时感受器电位香草酸受体1(TRPV1)与神经病理性疼痛关系最为密切,可能是治疗神经病理性疼痛的重要靶点之一。文章综述了神经病理性疼痛的概况与TRP通道家族的组成与功能,重点阐述了TRPV1抑制剂作为靶向药物在神经病理性疼痛中的研究进展,旨在为神经病理性疼痛的药物治疗提供新的研究方向。

关键词：神经病理性疼痛瞬时感受器电位香草酸受体1 抑制剂

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