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TP53-specific mutations serve as a potential biomarker for homologous recombination deficiency in breast cancer:a clinical next-generation sequencing study

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Precision Clinical Medicine 2024年第2期7卷 122-131页

作者： Yongsheng Huang shuwei ren Linxiaoxiao Ding Yuanling jiang Jiahuan Luo Jinghua Huang Xinke Yin Jianli Zhao Sha Fu Jianwei Liao Cellular&Molecular Diagnostics Center Sun Yat-sen Memorial HospitalSun Yat-sen UniversityGuangzhou 510120China Guangdong Provincial Key Laboratory of Malignant Tumor Epigenetics and Gene Regulation Sun Yat-sen Memorial HospitalSun Yat-sen UniversityGuangzhou 510120China Department of Clinical Laboratory The Sixth Affliated HospitalSun Yat-sen UniversityGuangzhou 510655China Breast Tumor Center Sun Yat-sen Memorial HospitalSun Yat-sen UniversityGuangzhou 510120China Guangzhou Regenerative Medicine and Health Guangdong LaboratorySun Yat-sen Memorial HospitalSun Yat-sen UniversityGuangzhou 510120China

Background:TP53 mutations and homologous recombination deficiency(HRD)occur frequently in breast ***,the characteristics of TP53 pathogenic mutations in breast cancer patients with/without HRD are not ***:Clinical next-generation sequencing(NGS)of both tumor and paired blood DNA from 119 breast cancer patients(BRCA-119 cohort)was performed with a 520-gene ***,tumor mutation burden(TMB),and genomic HRD scores were assessed from NGS *** data from 47 breast cancer patients in the HRD test cohort were analyzed for further ***:All TP53 pathogenic mutations in patients had somatic origin,which was associated with the protein expression of estrogen receptor and progestogen *** to patients without TP53 pathologic mutations,patients with TP53 pathologic mutations had higher levels of HRD scores and different genomic *** frequency of TP53 pathologic mutation was higher in the HRDhigh group(HRD score≥42)relative to that in the HRD-low group(HRD scorerent mutational characteristics between the HRD-low and HRD-high ***53-specific mutation subgroups had diverse genomic features and ***,TP53 pathogenic mutations predicted the HRD status of breast cancer patients with an area under the curve(AUC)of ***53-specific mutations,namely HRD-low mutation,HRD-high mutation,and HRD common mutation,predicted the HRD status of breast cancer patients with AUC values of 0.32,0.72,and 0.58,***,TP53 HRD-high mutation and HRD common mutation combinations showed the highest AUC values(0.80)in predicting HRD ***:TP53-specific mutation combinations predict the HRD status of patients,indicating that TP53 pathogenic mutations could serve as a potential biomarker for poly-ADP-ribose polymerase(PARP)inhibitors in breast cancer patients.

关键词： next-generation sequencing homologous recombination deficiency TP53 breast cancer

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小麦籽粒储藏特征挥发物质分析与品质评价

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核农学报 2024年第11期38卷 2155-2164页

作者：刘雨任书炜孙倩倩张瑞张磊郭波莉李明张影全中国农业科学院农产品加工研究所/农业农村部粮油加工综合利用技术集成实验室北京100193 上海理工大学健康科学与工程学院上海200093

粮食储藏及其品质鉴别对于保障粮食安全和减少粮食损失至关重要。为筛选小麦籽粒储藏过程中的关键挥发性物质,本研究将小麦籽粒于40℃、相对湿度65%的环境下进行为期28 d的储藏,选取储藏0、7、14、21、28 d的小麦籽粒样品,分析其中挥发... 详细信息

粮食储藏及其品质鉴别对于保障粮食安全和减少粮食损失至关重要。为筛选小麦籽粒储藏过程中的关键挥发性物质,本研究将小麦籽粒于40℃、相对湿度65%的环境下进行为期28 d的储藏,选取储藏0、7、14、21、28 d的小麦籽粒样品,分析其中挥发性物质、萌发率、脂肪酸值、丙二醛(MDA)含量、过氧化氢酶(CAT)、过氧化物酶(POD)和超氧化物歧化酶(SOD)活性的变化规律。结果表明,随着储藏时间的延长,总挥发性物质含量显著降低,MDA含量显著增加(21~28 d除外),萌发率和抗氧化保护酶(CAT、POD、SOD)活性总体呈下降趋势。通过小麦挥发性物质与储藏品质指标之间的相关性分析,确定叔丁醇、2-己烯醛、乙二醇二甲醚、2-戊基呋喃、庚醛、辛醛、3-甲基-2-丁烯醛、1-辛烯-3-酮、异亚丙基丙酮为小麦籽粒储藏关键挥发性物质;逐步线性判别分析显示,上述特征挥发性物质对不同储藏时间下样品的正确分类效果达98%,可作为小麦籽粒储藏品质的鉴别指标。本研究可为粮食储藏过程中的品质鉴别提供技术支撑。

关键词：小麦籽粒特征挥发物质粮食储藏品质鉴别

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三阴性乳腺癌组织中微RNA-331-3p和跨膜蛋白119水平变化与临床预后的相关性

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安徽医药 2024年第8期28卷 1582-1586页

作者：宋家木任书伟丁小崇宋洋信阳市中心医院肿瘤外科河南信阳464000

目的探究三阴性乳腺癌(TNBC)组织中微RNA-331-3p(miR-331-3p)和跨膜蛋白119(TMEM119)水平变化与临床预后的相关性。方法选取2017年1月至2019年1月在信阳市中心医院行手术治疗的98例TNBC病人的癌组织以及癌旁组织,分别作为TNBC组和癌旁... 详细信息

目的探究三阴性乳腺癌(TNBC)组织中微RNA-331-3p(miR-331-3p)和跨膜蛋白119(TMEM119)水平变化与临床预后的相关性。方法选取2017年1月至2019年1月在信阳市中心医院行手术治疗的98例TNBC病人的癌组织以及癌旁组织,分别作为TNBC组和癌旁组。在术后3年对所有病人进行随访,分为预后良好组为23例,预后不良组为75例。通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测miR-331-3p和TMEM119的表达水平;采用Pearson法分析TNBC组织中miR-331-3p和TMEM119表达水平的相关性;分析miR-331-3p和TMEM119水平与TNBC病人预后的关系;影响TNBC病人预后的影响因素采用Cox回归的方法进行分析。结果TNBC组TMEM119(1.53±0.24)的表达水平与癌旁组相比(1.01±0.13)显著上升,miR-331-3p(0.74±0.13)的表达水平与癌旁组(1.02±0.11)相比显著下降(t=41.53、41.53,P<0.05)。Pearson相关性分析结果显示,miR-331-3p和TMEM119表达水平呈负相关关系(r=−0.49,P<0.001)。miR-331-3p和TMEM119表达水平与肿瘤长径、TNM分期、腋窝淋巴结转移有关(P<0.05)。miR-331-3p高表达组病人3年内生存率16/49(32.65%)高于低表达组7/49(14.29%);TMEM119高表达组病人3年内生存率4/49(8.16%)低于低表达组19/49(38.78%)(Z=4.60,P=0.032;Z=12.78,P<0.001)。预后不良组miR-331-3p(0.65±0.13)表达水平与预后良好组(1.03±0.12)相比显著降低,TMEM119(1.69±0.27)表达水平与预后良好组(1.02±0.14)相比显著升高(t=38.74、33.30,P<0.05)。结果显示,TNM分期(HR=5.88)、miR-331-3p(HR=2.45)和TMEM119(HR=2.86)表达水平是影响TNBC病人预后的危险因素(P<0.05)。结论TNBC病人癌组织中miR-331-3p低表达,TMEM119高表达,二者水平与预后评估密切相关。

关键词：三阴性乳腺癌微小RNA-331-3p 跨膜蛋白119 预后

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HYDROFORMYLATION OF ETHYLENE CATALYZED BY HOMOGENEOUS METAL CLUSTERS

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分子催化 1989年第S1期3卷 88-93页

作者： Fu Hongxiang, Luo Yuzong , Zhang shuwei, ren Xu (Lanzhou Institute of Chemical Physics, Chinese Academy of Sciences, Lanzhou, China)

This paper deals with a study of hydroformylation of ethylene catalyzed by homoge-neous metal clusters.〔PhCH2Me3N〕〔FeCo3（CO）12〕and〔PhCH2Me3N〕〔RuCO3（CO）12〕show high catalytic activity for the hydroform ylation of ethylene compared with YCCo3（CO）9,CO4（CO）10（PPh）2,Co2（CO）6（PBu3）2,and Fe2（CO）4（C5H5）2.The reacton rate ofheteronuclear clusters is faster than that with homonuclear *** effect of tempera-ture and pressure on hydroformylation of ethylene with〔PhCH2Me3〕〔FeCo3（CO）12〕ascatalyst was *** experimental *** that the conversion of ethylene exceeds90% with a selectivity up to 95% at temperature 130℃ and pressure 3.9 *** studiedwith high pressure in situ infrared spectroscopic method,PhCCo3（CO）9 was found to havehigher thermostability than 〔PhCH2Me3N〕〔FeCo3（CO）12〕.

关键词： FeCo faster selectivity tempera spectroscopic crystalline catalyzed silica deals carbonyl

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地市级三甲医院重症医学学科建设的思考——来自河南省信阳市的经验

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中华危重病急救医学 2019年第3期31卷 264-265页

作者：任书伟信阳市中心医院河南信阳464000 中国医院协会河南省医院协会河南省抗癌协会、头颈外科专业委员会、甲状腺肿瘤专业委员会河南省医学会甲状腺外科学分会

重症医学学科水平是衡量一家现代化医院综合实力的重要指标,也是体现医院管理水平的一面镜子。河南省信阳市是革命老区,信阳市中心医院是河南省较早获批的三级甲等综合医院,也是信阳地区医疗卫生系统的龙头单位。如何通过建设强有力的... 详细信息

重症医学学科水平是衡量一家现代化医院综合实力的重要指标,也是体现医院管理水平的一面镜子。河南省信阳市是革命老区,信阳市中心医院是河南省较早获批的三级甲等综合医院,也是信阳地区医疗卫生系统的龙头单位。如何通过建设强有力的重症医学专科,为医院各学科以及全市危重患者提供坚强的保障基础,需要医院管理者思考。只有保持清醒的头脑,把保障全市人民的健康作为头等大事,不断学习先进的理念和管理经验,勇于承担责任,才能跟上全省乃至全国重症医学发展的步伐。

关键词：重症医学学科建设发展地位

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Reform and Practice of Immersive Teaching in Environmental Acoustics

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Journal of Contemporary Educational Research 2021年第12期5卷 32-37页

作者： Haitao Wang Xiangyang Zeng Ye Lei shuwei ren Xiaoyan Zhang School of Marine Science and Technology Northwestern Polytechnical UniversityXi’an 710072Shaanxi ProvinceChina

Environmental Acoustics is a professional course that educates students majoring in *** by practical equipment and other factors,the teaching effect of knowledge points relevant to subjective auditory perception contained in the course is *** the course of Spatial Hearing and 3D Stereo as an example,this study develops a virtual simulation experiment system for the topic of subjective hearing perception in order to carry out the reform and practice of immersive *** with the virtual simulation experiment project with high sense of presence,students are supported by the actual auditory perception effect in the whole learning process and have achieved good learning effect.

关键词： Environmental Acoustics Virtual simulation experiment Immersive teaching

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Identification of potential crucial genes associated with WNT-activity of colorectal cancer based on gene expression profile

Identification of potential crucial genes associated with WN...

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2018年浙江省医学遗传学学术年会

作者： Xuezi Tu shuwei ren Xuejian Tu Zhenyu Wang Lingjun Zhang Huanli Wang Longjin Jin Wenzhou Medical University School of Laboratory Medicine and Life Sciences Wenzhou City Third People's Hospital Shandong Qianfoshan Hospital People's Hospital of Ningyang County

Purpose:Wnt signaling is closely related to colorectal cancer,high Wnt activity sustains colorectal cancer stem cell(CSC) precursors during the transition from colitis to cancer,leading the development and progression of colorectal ***,it’ s necessary to identify differentially expressed genes(DEGs) of different Wnt activity and to find the potential targets of colorectal CSCs for overcoming colorectal ***:DEGs of different Wnt activity were screened out by GE02 ***,gene ontology(GO) and pathway enrichment analysis were carried out by DAVID ***,the protein-protein interaction network was constructed by STRING *** plug-in Cyto-hubba was used to get the algorithms of PPI network in *** then chose proteins with higher algorithm scores among 12 algorithms and use Funrich to get the common hub genes including FGA,A2 M,IGF1,TGFB2,PDGFB,and ***,by different analysis between colorectal cancer and normal tissues,we got the common genes relative mRNA expression from Oncomine ***:Among three databases GSE32408,GSE17375 and GSE33112,a total of 102 common DEGs,such as TIAM1,A2 M and MMP13 were screened *** functional enrichment analysis showed that the genes were associated with immunity,extracellular items,and binding-related *** pathway analysis was related to Pathways in cancer,Gap junction,and Proteoglycans in ***-protein interaction network construction revealed that common hub genes,including FGA,A2 M,IGF1,TGFB2,PDGFB,and *** their mRNA expression levels were significantly higher in colorectal cancer than in normal colon tissues,which revealed they may play important role in the progression of colorectal ***:In summary,we found 102 DEGs and hub genes that might explain the mechanisms of different Wnt activity as well as the characteristics of CSCs,which may play important role in the progression of colorectal cancer.

关键词： Wnt activity Differentially expressed genes Function enrichment analysis Protein-protein interaction Colorectal cancer

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MEMS系统中微平板结构声振耦合性能研究

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力学学报 2016年第4期48卷 907-916页

作者：唐宇帆任树伟辛锋先卢天健西安交通大学航天航空学院多功能材料与结构教育部重点实验室西安710049 西安交通大学航天航空学院机械结构强度与振动国家重点实验室西安710049

微机电系统(micro-electro-mechanical system,MEMS)是指内部微结构尺寸在微米甚至纳米量级的微电子机械装置,是一个独立的智能系统.长宽厚均处于微米量级的微平板为MEMS中的典型结构,其声学和力学特性直接影响MEMS的性能.针对同时受声... 详细信息

微机电系统(micro-electro-mechanical system,MEMS)是指内部微结构尺寸在微米甚至纳米量级的微电子机械装置,是一个独立的智能系统.长宽厚均处于微米量级的微平板为MEMS中的典型结构,其声学和力学特性直接影响MEMS的性能.针对同时受声压激励和气膜力(通过考虑相同尺寸微平板振动引入)作用的四边简支微平板结构,应用Cosserat理论和Hamilton原理,建立了考虑微尺度效应(本征长度和Knudsen数)影响的声振耦合理论模型,并通过多重Fourier展开法求解了耦合方程,得到了系统的传声损失结果.通过频域分析,考虑微平板的不同振动频率、振动幅度和板间距,系统研究了不同尺度效应下微结构中气体薄膜所产生的阻尼力对微平板结构传声特性的影响.研究发现尺度效应对于微结构的声振特性影响巨大,振动行为对微结构的传声特性也有很大影响,控制并减小微平板的振动幅度以及增大微平板的间距都能够提高微平板的声振性能.研究结果为MEMS中微平板的稳定性优化设计提供了理论参考.

关键词： MEMS 微平板气膜力传声损失

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方形蜂窝夹层曲板的振动特性研究

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西安交通大学学报 2015年第3期49卷 129-135页

作者：任树伟孟晗辛锋先卢天健慈军耿丽西安交通大学轻质结构和材料多学科研究中心西安710049 西安交通大学机械结构强度与振动国家重点实验室西安710049 广东顺德西安交通大学研究院广东佛山528300 东莞市永强汽车制造有限公司广东东莞523407

针对专用车辆罐体的方形蜂窝夹层封头,研究了四边简支方形蜂窝夹层曲板结构的振动特性。以Hoff夹层板理论为基础,通过能量法将蜂窝层芯等效为面内各向同性夹层,并考虑曲率的影响,建立了四边简支方形蜂窝夹层板振动理论模型。基于有限元... 详细信息

针对专用车辆罐体的方形蜂窝夹层封头,研究了四边简支方形蜂窝夹层曲板结构的振动特性。以Hoff夹层板理论为基础,通过能量法将蜂窝层芯等效为面内各向同性夹层,并考虑曲率的影响,建立了四边简支方形蜂窝夹层板振动理论模型。基于有限元软件建立了考虑蜂窝层芯细节的有限元模型,对理论模型结果进行了验证,两者结果取得良好吻合。通过理论模型和有限元模型研究了夹层几何参数及内压对蜂窝夹层曲板结构固有频率和振动模态的影响。研究表明:蜂窝夹层曲板的振动模态与均质实心曲板振动模态相似,其固有频率随着内压的增大而提高,相同质量的蜂窝夹层曲板固有频率远高于均质实心曲板的同阶固有频率。所得结果为蜂窝夹层曲板结构的动力学优化设计提供了必要的理论参考。

关键词：专用车辆罐体封头方形蜂窝夹层曲板内压固有频率振动模态

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黑龙江省科技成果转化中的政府职能分析

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科技管理研究 2010年第15期30卷 16-18页

作者：洪亮任树伟沈洪涛黑龙江科技学院黑龙江哈尔滨150027

根据黑龙江省科技成果转化的现状,深入总结黑龙江省政府在科研管理职能上存在的问题和不足,结合实际情况,提出改进意见,促进政府相关职能部门提高在科技成果转化率上的作用。

关键词：科技成果转化政府职能科技管理

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