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An atlas of immune cell transcriptomes in human immunodeficiency virus-infected immunological non-responders identified marker genes that control viral replication

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Chinese Medical Journal 2023年第22期136卷 2694-2705页

作者： Yahong Chen Xin Li shuran liu Wen Ao Jing Lin Zhenting Li Shouli Wu Hanhui Ye Xiao Han Dongliang Li Department of infection Mengchao Hepatobiliary Hospital of Fujian Medical UniversityFuzhouFujian 350025China Department of infection Fuzong Clinical Medical College of Fujian Medical UniversityFuzhouFujian 362002China College of Biological Science and Engineering Fuzhou UniversityFuzhouFujian 350025China Fujian Provincial Center for Disease Control and Prevention No.76 Jintai RoadFuzhouFujian 350001China Department of Hepatobiliary Medicine 900th Hospital of Joint Logistics Support Forces of the Chinese PLAFuzhouFujian 350000China

Background:Previous studies have examined the bulk transcriptome of peripheral blood immune cells in acquired immunodeficiency syndrome patients experiencing immunological non-responsiveness.This study aimed to investigate the characteristics of specific immune cell subtypes in acquired immunodeficiency syndrome patients who exhibit immunological non-responsiveness.Methods:A single-cell transcriptome sequencing of peripheral blood mononuclear cells obtained from both immunological responders(IRs)(CD4^(+)T-cell count>500)and immunological non-responders(INRs)(CD4^(+)T-cell count<300)was conducted.The transcriptomic profiles were used to identify distinct cell subpopulations,marker genes,and differentially expressed genes aiming to uncover potential genetic factors associated with immunological non-responsiveness.Results:Among the cellular subpopulations analyzed,the ratios of monocytes,CD16^(+)monocytes,and exhausted B cells demonstrated the most substantial differences between INRs and IRs,with fold changes of 39.79,11.08,and 2.71,respectively.In contrast,the CD4^(+)T cell ratio was significantly decreased(0.39-fold change)in INRs compared with that in IRs.Similarly,the ratios of natural killer cells and terminal effector CD8^(+)T cells were also lower(0.37-fold and 0.27-fold,respectively)in the INRs group.In addition to several well-characterized immune cell-specific markers,we identified a set of 181 marker genes that were enriched in biological pathways associated with human immunodeficiency virus(HIV)replication.Notably,ISG15,IFITM3,PLSCR1,HLA-DQB1,CCL3L1,and DDX5,which have been demonstrated to influence HIV replication through their interaction with viral proteins,emerged as significant monocyte marker genes.Furthermore,the differentially expressed genes in natural killer cells were also enriched in biological pathways associated with HIV replication.Conclusions:We generated an atlas of immune cell transcriptomes in HIV-infected IRs and INRs.Host genes associated with HIV replication were identified as mark

关键词： Single-cell transcriptome sequencing Human immunodeficiency virus Immunological non-responsiveness CD4 T cell CD8 T cell Natural killer cells HIV replication

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Targeting FAPα-positive lymph node metastatic tumor cells suppresses colorectal cancer metastasis

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Acta Pharmaceutica Sinica B 2024年第2期14卷 682-697页

作者： shuran Fan Ming Qi Qi Qi Qun Miao Lijuan Deng Jinghua Pan Shenghui Qiu Jiashuai He Maohua Huang Xiaobo Li Jie Huang Jiapeng Lin Wenyu Lyu Weiqing Deng Yingyin He Xuesong liu Lvfen Gao Dongmei Zhang Wencai Ye Minfeng Chen State Key Laboratory of Bioactive Molecules and Druggability Assessment Jinan UniversityGuangzhou 510632China Guangdong Province Key Laboratory of Pharmacodynamic Constituents of Traditional Chinese Medicine and New Drugs Research College of PharmacyJinan UniversityGuangzhou 510632China School of Medicine Jinan UniversityGuangzhou 510632China School of Traditional Chinese Medicine Jinan UniversityGuangzhou 510630China The First Affiliated Hospital of Jinan University Guangzhou 510632China State Key Laboratory of Chemical Oncogenomics Guangdong Provincial Key Laboratory of Chemical BiologyTsinghua Shenzhen International Graduate SchoolShenzhen 518055China

Lymphatic metastasis is the main metastatic route for colorectal cancer, which increases the risk of cancer recurrence and distant metastasis. The properties of the lymph node metastatic colorectal cancer(LNM-CRC) cells are poorly understood, and effective therapies are still lacking. Here, we found that hypoxia-induced fibroblast activation protein alpha(FAPα) expression in LNM-CRC cells. Gain-or loss-function experiments demonstrated that FAPα enhanced tumor cell migration, invasion, epithelial-mesenchymal transition, stemness, and lymphangiogenesis via activation of the STAT3 pathway. In addition, FAPα in tumor cells induced extracellular matrix remodeling and established an immunosuppressive environment via recruiting regulatory T cells, to promote colorectal cancer lymph node metastasis(CRCLNM). Z-GP-DAVLBH, a FAPα-activated prodrug, inhibited CRCLNM by targeting FAPα-positive LNM-CRC cells. Our study highlights the role of FAPα in tumor cells in CRCLNM and provides a potential therapeutic target and promising strategy for CRCLNM.

关键词： Lymphaticmetastasis Colorectal cancer Fibroblastactivation proteinα FAPα-activated prodrug Epithelial-mesenchymal

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罗茨真空泵新型偏心渐开线型不对称转子的构建与性能研究

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真空科学与技术学报 2024年第1期44卷 78-86页

作者：张轩宇刘俊材王君杨舒然中国石油大学(华东)新能源学院青岛266580

罗茨转子作为罗茨真空泵的重要组成部件,对罗茨真空泵性能影响极大。为了解决传统渐开线型转子在渐开线与圆弧连接处存在不光滑连接点,导致泄漏加剧,运行效率下降的问题,文章采用偏心渐开线与齿顶、齿根圆弧平滑相连,提出了一种偏心渐... 详细信息

罗茨转子作为罗茨真空泵的重要组成部件,对罗茨真空泵性能影响极大。为了解决传统渐开线型转子在渐开线与圆弧连接处存在不光滑连接点,导致泄漏加剧,运行效率下降的问题,文章采用偏心渐开线与齿顶、齿根圆弧平滑相连,提出了一种偏心渐开线型不对称转子。建立了偏心渐开线型不对称转子的几何模型,分析了转子的几何参数对面积利用率等性能的影响。结果表明:随着圆心角增大及节圆半径减小,所提出的偏心渐开线型不对称转子的面积利用率提高;与传统渐开线型转子相比,所提出的偏心渐开线型不对称转子每转排量提升了17.2%,出口流量脉动降低9.8%,出口压力脉动降低7.9%。研究内容对罗茨真空泵的发展具有重要的意义。

关键词：罗茨转子偏心渐开线面积利用系数压力脉动流量脉动

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CAT-1偶极场超导磁体的悬浮控制与仿真

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核技术 2024年第6期47卷 141-148页

作者：王亚林刘云辉张国书杜俊杰杨舒然龚宇东东华理工大学机械与电子工程学院南昌330013 东华理工大学核科学与工程学院南昌330013

“天环一号”(China Astro-Torus 1,CAT-1)是一个悬浮偶极场磁约束装置,主要用于偶极场等离子体物理实验研究,要求中心悬浮超导磁体在无冷却和无电源条件下稳定悬浮至少5 h。本文设计了超导托举磁体与中心悬浮磁体环耦合的悬浮控制系统... 详细信息

“天环一号”(China Astro-Torus 1,CAT-1)是一个悬浮偶极场磁约束装置,主要用于偶极场等离子体物理实验研究,要求中心悬浮超导磁体在无冷却和无电源条件下稳定悬浮至少5 h。本文设计了超导托举磁体与中心悬浮磁体环耦合的悬浮控制系统,为确保1200 kg、5 MA中心悬浮磁体环稳定悬浮,完成了控制系统的Simulink模型建立和仿真,基于Routh-Hurwitz稳定判据,研究了PID(Proportion-Integral-Derivative)控制策略对稳定控制影响,确定了稳定控制参数选取的范围:理想条件下PD(Proportion-Derivative)控制系统上升时间为0.1545 s、峰值时间为0.6283 s、调节时间0.0848 s。结果表明:基于PD控制能够在较短的时间内将悬浮超导环恢复在预设平衡位置,采用合适的启动方式可极大地降低电路的负载。本结果为悬浮超导悬浮偶极场装置设计研发提供了关键技术支撑。

关键词： CAT-1 偶极场磁约束磁悬浮超导环悬浮控制

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高效液相色谱-四级杆/静电场轨道阱高分辨率质谱测定大米中的四种香精

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现代食品科技 2024年第6期40卷 303-310页

作者：刘芸李优张庶冉李静静丁涛柳菡张军蓓南京海关动植物与食品检测中心江苏南京210001 上海海关动植物与食品检验检疫技术中心上海200000 上海大学生命科学学院上海200444

对大米中四种香精采用高效液相色谱-四极杆/静电场轨道阱高分辨率质谱建立了检测方法。大米样品经水溶液浸泡,加入酸化的乙腈提取、涡旋震荡12 min、离心后,提取液过C18固相萃取柱,流出液过0.45μm滤膜。梯度洗脱采用乙腈-0.1%(V/V)甲... 详细信息

对大米中四种香精采用高效液相色谱-四极杆/静电场轨道阱高分辨率质谱建立了检测方法。大米样品经水溶液浸泡,加入酸化的乙腈提取、涡旋震荡12 min、离心后,提取液过C18固相萃取柱,流出液过0.45μm滤膜。梯度洗脱采用乙腈-0.1%(V/V)甲酸水溶液为流动相,分析色谱柱采用Agilent EclipsePlus C18(100 mm×2.1 mm,1.8μm)。质谱采用正离子模式,采用Full MS/dd-MS2扫描模式,以一级质谱提取的母离子对应峰面积进行定量,以自动触发扫描所得的二级子离子进行定性确证,外标法定量。四种香精香兰素、甲基香兰素、乙基香兰素、香豆素在所建立的色谱条件下分离度较好。该方法对四种香精的检测限可达15μg/kg,定量限可达50μg/kg,在5~500 ng/mL质量浓度范围内线性关系良好,相关系数均大于0.99。在三个浓度水平下进行加标验证,四种香精的平均回收率为79.0%~95.8%、相对标准偏差(RSD)为3.1%~7.7%。该方法样品处理过程简单,回收率高、稳定性好,可以用于大米中四种香精的筛查和确证,为规范大米中香精的使用具有重要意义。

关键词：香兰素高效液相色谱-四级杆/静电场轨道肼高分辨率质谱大米

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城市地面塌陷灾害风险评估研究

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地质与勘探 2024年第1期60卷 63-75页

作者：余满仓吕敦玉孟舒然张建羽刘松波王翠玲中国地质科学院水文地质环境地质研究所河北石家庄050061 中国地质大学(武汉)工程学院湖北武汉430074 中国地质调查局第四纪年代学与水文环境演变重点实验室河北石家庄050061

随着城市化进程不断加快,城市地下空间安全问题引起广泛关注。本文以影响地下空间安全的典型灾害-地面塌陷为例,开展可能性风险评估研究,为降低地面塌陷灾害损失提供理论支撑。城市地面塌陷成因复杂,为了保证评价过程和结果的客观全面,... 详细信息

随着城市化进程不断加快,城市地下空间安全问题引起广泛关注。本文以影响地下空间安全的典型灾害-地面塌陷为例,开展可能性风险评估研究,为降低地面塌陷灾害损失提供理论支撑。城市地面塌陷成因复杂,为了保证评价过程和结果的客观全面,通过调研对塌陷引发因素进行了总结,从管道因素、病害体因素、环境因素三个方面建立风险发生可能性评价指标体系,并使用AHP-熵权法-灰色关联法组合评价,建立地面塌陷风险评价模型。将该模型应用于郑州市典型地下空洞工程案例进行评估分析,结果表明:地面塌陷风险评价结果与实测结果相符,证明了评估模型的科学性,同时为城市地面塌陷预防提供了决策参考。

关键词：城市地面塌陷风险评价影响因子权重灰色关联法郑州市

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宠物食品安全性评估中的风险及应对策略

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中国饲料 2024年第1期 125-129页

作者：张庶冉曹晨刘月明王逸伦王敏上海海关动植物与食品检验检疫技术中心上海200135 浦东海关上海200120

本文通过分析我国宠物食品行业现状概况,结合宠物食品监管相关规定,梳理出宠物食品安全性评估中的潜在风险。风险分析结果客观上暴露出宠物食品安全性评估工作中存在薄弱环节,急需在标准制修订、协同治理运行机制等方面提出应对措施,旨... 详细信息

本文通过分析我国宠物食品行业现状概况,结合宠物食品监管相关规定,梳理出宠物食品安全性评估中的潜在风险。风险分析结果客观上暴露出宠物食品安全性评估工作中存在薄弱环节,急需在标准制修订、协同治理运行机制等方面提出应对措施,旨在给宠物饲料相关企业及行业从业人员提供参考。

关键词：宠物食品安全性评估法规体系

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航拍多光谱田间秸秆覆盖量反演模型的建立与优化

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光学精密工程 2024年第11期32卷 1773-1787页

作者：刘媛媛孙宇高雪冰王利斌王跃勇刘梦琪崔舒然吉林农业大学信息技术学院(智慧农业研究院) 吉林长春130118 吉林农业大学工程技术学院吉林长春130118 长春市农业机械研究院吉林长春130052 吉林省农业机械研究院吉林长春130022

保护性耕作是农业耕地可持续性发展的重要方法,已被世界多地采用,秸秆覆盖量实现从“有无”到“多少”的进一步判定,是秸秆还田检测的重要指标。通过无人机搭载多光谱相机航拍研究区内春秋两季遥感数据,并同步测定玉米秸秆覆盖量。首先... 详细信息

保护性耕作是农业耕地可持续性发展的重要方法,已被世界多地采用,秸秆覆盖量实现从“有无”到“多少”的进一步判定,是秸秆还田检测的重要指标。通过无人机搭载多光谱相机航拍研究区内春秋两季遥感数据,并同步测定玉米秸秆覆盖量。首先,通过遥感数据提取光谱反射率并构建光谱指数,采用相关系数法筛选出对秸秆覆盖量敏感的波段变量和光谱变量,作为模型输入变量;然后,采用支持向量机(Support Vector Machine,SVM)、随机森林(Random Forest,RF)、BP神经网络(Back Propagation Neural Network,BPNN)和极限学习机(Extreme Learning Machine,ELM)4种机器学习算法,建立玉米秸秆覆盖量的反演模型,比较不同时期和不同研究区域的模型精度;最后,为解决预测性能受其模型参数影响较大问题,引入遗传算法(Genetic Algorithm,GA)和粒子群算法(Particle Swarm Optimization,PSO),并提出遗传-粒子群混合算法(Genetic-Particle Swarm Optimization,GA-PSO),利用它们的互补性提高模型的性能,完成区域内秸秆覆盖量的估算。实验结果表明,基于GA-PSO优化的RF算法玉米秸秆覆盖量反演模型取得了最佳的反演效果,其中R^(2)达到了0.74。同时,对比分析不同数据的反演结果,均较为真实地反映了区域内秸秆覆盖量,估测准确率达到91.36%,说明可以通过优化模型实现结果估算。研究为保护性耕作秸秆还田量检测提供科学参考,亦为其他作物秸秆覆盖量估测提供了可靠的模型反演方法。

关键词：多光谱图像机器学习秸秆覆盖量无人机遗传算法粒子群算法

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果树果实脱落调控机理研究进展

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植物科学学报 2024年第1期42卷 125-133页

作者：刘亚龙欧春青张艳杰李舒然叶宇姜淑苓王斐中国农业科学院果树研究所农业农村部园艺作物种质资源利用重点实验室辽宁兴城125100

果实脱落是果树生长发育过程中非常重要的一个阶段,是指果实脱离树体的过程,关乎果树生存、生长、繁殖和经济价值,因此解析调控果树果实脱落的分子机制对改良果树品种、提高果实品质显得尤为重要。果实脱落一般发生在离区,离区的产生和... 详细信息

果实脱落是果树生长发育过程中非常重要的一个阶段,是指果实脱离树体的过程,关乎果树生存、生长、繁殖和经济价值,因此解析调控果树果实脱落的分子机制对改良果树品种、提高果实品质显得尤为重要。果实脱落一般发生在离区,离区的产生和接受脱落刺激信号导致果实脱落是一个多种基因参与的调控过程,是细胞结构、碳水化合物、细胞壁代谢酶、乙烯合成及信号转导过程等多种因素作用的结果,但各影响因素的功能有待进一步挖掘,各影响因素之间的关系也有待进一步完善。基于此,本文通过对果树果实脱落过程中离区的形成和结构变化、碳水化合物、乙烯等物质的含量及相关基因的表达进行综述,以期为果实脱落机理研究提供新思路,也为果树生产过程中科学调控果实脱落、提高果实品质、减少损失提供理论依据。

关键词：果实脱落离区果胶酶纤维素酶乙烯转录因子

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与流感病毒NP互作的宿主靶点及栀子环烯醚萜苷抗流感病毒的机制

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中国实验方剂学杂志 2024年第13期30卷 60-66页

作者：杨晓微包蕾张宇刘宪耿子涵李舒冉张敬升崔晓兰郭姗姗中国中医科学院中药研究所北京100700

目的:探索与流感病毒核蛋白(NP)相互作用的宿主因子,研究其对流感病毒复制的影响,以及栀子环烯醚萜苷(IGE)抑制流感病毒的作用机制。方法:利用酵母双杂交系统筛选与流感病毒NP相互作用的宿主因子;通过免疫共沉淀实验对异质核糖核蛋白(HN... 详细信息

目的:探索与流感病毒核蛋白(NP)相互作用的宿主因子,研究其对流感病毒复制的影响,以及栀子环烯醚萜苷(IGE)抑制流感病毒的作用机制。方法:利用酵母双杂交系统筛选与流感病毒NP相互作用的宿主因子;通过免疫共沉淀实验对异质核糖核蛋白(HNRNPD)、氨基葡萄糖6磷酸脱氨酶1(GNPDA1)、Poly/rC结合因子1(PCBP1)、激活信号转导和转录激活因子(STAT)蛋白1抑制因子(PIAS1)进行验证;通过双荧光素酶实验比较PIAS1和HNRNPD对流感病毒复制的影响,并检测在转染核糖核蛋白体复合物(RNP)及PIAS1敲低的情况下,给予栀子环烯醚萜苷对流感病毒复制的影响。将ICR小鼠随机分为正常组、模型组、达菲组和IGE高、中、低剂量组,每组10只。除正常组外各组滴鼻感染甲型流感病毒FM1株建立病毒性肺炎模型。IGE高、中、低剂量组分别给予50、25、12.5 mg∙kg^(-1)IGE灌胃,达菲组给予27.5 mg∙kg^(-1)达菲灌胃,正常组和模型组灌服等体积蒸馏水,连续4 d。实验结束后,蛋白免疫印迹法检测肺组织中PIAS1、NP、磷酸化(p)-STAT3、STAT3、p-STAT1、STAT1的蛋白表达。结果:在酵母双杂交实验中,发现了16个流感病毒NP的潜在互作宿主靶点;免疫共沉淀实验发现HNRNPD和PIAS1可以与流感病毒NP相互作用;双荧光素酶报告实验中PIAS1敲低和过表达都可明显影响IAV RNP活性(P<0.05,P<0.01),HNRNPD对IAV RNP的影响差异无统计学意义;IGE高、低剂量组均可使流感病毒复制减少(P<0.05),并可逆转PIAS1敲低导致的流感病毒复制增加(P<0.05,P<0.01)。IGE各剂量组不同程度地降低感染小鼠肺组织PIAS1、NP、p-STAT3、p-STAT1、STAT1的表达量(P<0.05,P<0.01)。结论:PIAS1和流感病毒NP相互作用,并能够抑制流感病毒的复制,栀子环烯醚萜苷可能通过PIAS1/STAT1通路抑制IAV RNP的活性,从而发挥抗病毒作用。

关键词：激活信号转导和转录激活因子(STAT)蛋白1抑制因子(PIAS1) 甲型流感病毒流感病毒核蛋白(NP) 栀子环烯醚萜苷核糖核蛋白

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