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Population genomics highlights structural variations in local adaptation to saline coastal environments in woolly grape

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Journal of Integrative Plant Biology 2024年第7期66卷 1408-1426页

作者： Tianhao Zhang Wenjing Peng Hua Xiao shuo cao Zhuyifu Chen Xiangnian Su Yuanyuan Luo Zhongjie Liu Yanling Peng Xiping Yang Guo-Feng Jiang Xiaodong Xu Zhiyao Ma Yongfeng Zhou National Key Laboratory of Tropical Crop Breeding Shenzhen BranchGuangdong Laboratory of Lingnan Modern AgricultureKey Laboratory of Synthetic BiologyMinistry of Agriculture and Rural AffairsAgricultural Genomics Institute at ShenzhenChinese Academy of Agricultural SciencesShenzhen 518000China State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro‐Bioresources Guangxi UniversityNanning 530004China Guangxi Key Laboratory of Forest Ecology and Conservation Guangxi Colleges and Universities Key Laboratory for Cultivation and Utilization of Subtropical Forest PlantationCollege of ForestryGuangxi UniversityNanning 530004China College of Informatics Huazhong Agricultural UniversityWuhan 430070China Guangxi Key Laboratory of Sugarcane Biology College of AgricultureGuangxi UniversityNanning 530004China Key Laboratory of Horticultural Plant Biology Ministry of Education Huazhong Agricultural UniversityWuhan 430070China Zhengzhou Fruit Research Institute Chinese Academy of Agricultural SciencesZhengzhou 450009China National Key Laboratory of Tropical Crop Breeding Tropical Crops Genetic Resources InstituteChinese Academy of Tropical Agricultural SciencesHaikou 571101China

Structural variations(SVs)are a feature of plant genomes that has been largely unexplored despite their significant impact on plant phenotypic traits and local adaptation to abiotic and biotic *** this study,we employed woolly grape(Vitis retordii),a species native to the tropical and subtropical regions of East Asia with both coastal and inland habitats,as a valuable model for examining the impact of SVs on local *** assembled a haplotype-resolved chromosomal reference genome for woolly grape,and conducted population genetic analyses based on whole-genome sequencing(WGS)data from coastal and inland *** demographic analyses revealed recent bottlenecks in all populations and asymmetric gene flow from the inland to the coastal *** total,1,035 genes associated with plant adaptive regulation for salt stress,radiation,and environmental adaptation were detected underlying local selection by SVs and SNPs in the coastal population,of which 37.29% and 65.26% were detected by SVs and SNPs,*** genes such as FSD2,RGA1,and AAP8 associated with salt tolerance were found to be highly differentiated and selected during the process of local adaptation to coastal habitats in SV *** study highlights the importance of SVs in local adaptation;candidate genes related to salt stress and climatic adaptation to tropical and subtropical environments are important genomic resources for future breeding programs of grapevine and its rootstocks.

关键词： climate change grape breeding local adaptation with gene flow salt tolerance viticulture Vitis

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Evolutionary genomics of climatic adaptation and resilience to climate change in alfalfa

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Molecular Plant 2024年第6期17卷 867-883页

作者： Fan Zhang Ruicai Long Zhiyao Ma Hua Xiao Xiaodong Xu Zhongjie Liu Chunxue Wei Yiwen Wang Yanling Peng Xuanwen Yang Xiaoya Shi shuo cao Mingna Li Ming Xu Fei He Xueqian Jiang Tiejun Zhang Zhen Wang Xianran Li Long-Xi Yu Junmei Kang Zhiwu Zhang Yongfeng Zhou Qingchuan Yang Institute of Animal Science Chinese Academy of Agricultural SciencesBeijing 100193China National Key Laboratory of Tropical Crop Breeding Shenzhen BranchGuangdong Laboratory of Lingnan Modern AgricultureKey Laboratory of Synthetic BiologyMinistry of Agriculture and Rural AffairsAgricultural Genomics Institute at ShenzhenChinese Academy of Agricultural SciencesShenzhen 518000China School of Grassland Science Beijing Forestry UniversityBeijing 100083China Department of Agronomy and Horticulture University of Nebraska-LincolnLincolnNE 68583USA Department of Crop and Soil Sciences Washington State UniversityPullmanWA 99163USA U.S.Department of Agriculture-Agricultural Research Service Plant Germplasm Introduction and Testing ResearchProsserWA 99350USA National Key Laboratory of Tropical Crop Breeding Tropical Crops Genetic Resources InstituteChinese Academy of Tropical Agricultural SciencesHaikou 571101China

Given the escalating impact of climate change on agriculture and food security,gaining insights into the evolutionary dynamics of climatic adaptation and uncovering climate-adapted variation can empower the breeding of climate-resilient crops to face future climate ***(Medicago sativa ***),the queen of forages,shows remarkable adaptability across diverse global environments,making it an excellent model for investigating species responses to climate *** this study,we performed population genomic analyses using genome resequencing data from 702 accessions of 24 Medicago species to unravel alfalfa’s climatic adaptation and genetic susceptibility to future climate *** found that interspecific genetic exchange has contributed to the gene pool of alfalfa,particularly enriching defense and stress-response *** introgression between *** ***(***)and alfalfa not only aids alfalfa’s climatic adaptation but also introduces genetic burden.A total of 1671 genes were associated with climatic adaptation,and 5.7%of them were introgressions from *** integrating climate-associated variants and climate data,we identified populations that are vulnerable to future climate change,particularly in higher latitudes of the Northern *** findings serve as a clarion call for targeted conservation initiatives and breeding *** also identified preadaptive populations that demonstrate heightened resilience to climate fluctuations,illuminating a pathway for future breeding ***,this study enhances our understanding about the local adaptation mechanisms of alfalfa and facilitates the breeding of climate-resilient alfalfa cultivars,contributing to effective agricultural strategies for facing future climate change.

关键词： Medicago local adaptation population genetics adaptive introgression genetic vulnerability alfalfa breeding

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基于生境及其植被特征的西北干旱半干旱区城市绿地生态设计途径

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风景园林 2024年第6期31卷 12-18页

作者：许博文刘晖王晶懋曹朔西安建筑科技大学建筑学院

【目的】在地域自然资源的约束及可持续城市绿地建设的现实诉求下,探索能够指导西北干旱半干旱区城市绿地生态设计实践的方法策略,为该地区建立人工干预下的新城市生态过程提供支持。【方法】分别从中、小尺度对城市生境的异质性特征进... 详细信息

【目的】在地域自然资源的约束及可持续城市绿地建设的现实诉求下,探索能够指导西北干旱半干旱区城市绿地生态设计实践的方法策略,为该地区建立人工干预下的新城市生态过程提供支持。【方法】分别从中、小尺度对城市生境的异质性特征进行认知,并对其与城市绿地设计层级、内容的匹配性关系进行分析。【结果】构建出中小尺度城市绿地生态设计框架,并针对西北干旱半干旱区城市绿地建设,划分出4种典型城市绿地生态设计类型及其生态设计分区,提出相应的场地生境多样性优化设计、植物群落多样性设计和科普展示系统设计策略。【结论】将中、小尺度城市生境及其植被特征的形成与维持机制转化为城市绿地生态设计途径,可为西北干旱半干旱区城市绿地生态建设提供理论支持和技术指导。

关键词：城市绿地生物多样性生态设计生境营造植物景观设计西北干旱半干旱区

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Testing the distance-duality relation with a combination of cosmological distance observations

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Research in Astronomy and Astrophysics 2011年第10期11卷 1199-1208页

作者： shuo cao Nan Liang Department of Astronomy Beijing Normal University Beijing 100875 China Center for High Energy Physics Peking University Beijing 100871 China

We propose an accurate test of the distance-duality （DD） relation, η = DL（z）（1 ＋ z）^-2/DA（z） = 1 （where DL and DA are the luminosity distances and angular diameter distances, respectively）, with a combination of cosmological observational data of Type Ia Supernovae （SNe Ia） from the Union2 set and the galaxy cluster sample under an assumption of the spherical model. In order to avoid bias brought on by redshift non-coincidence between observational data and to consider redshift error bars of both clusters and SNe Ia in the analysis, we carefully choose the SNe Ia points which have the minimum acceptable redshift difference of the galaxy cluster sample （│△Z│min = σz,SN ＋σz,cluster）. By assuming η to be a constant and defined as functions of the redshift parameterized by six different expressions, we find that there exists no observable evidence for variations in the DD relation based on the collected data, since related statistical tests are well satisfied within the 1σ confidence level for most cases. Further, considering different values of △z as constraints, we also find that the choice of △z may play an important role in this model-independent test of the DD relation for the spherical sample of galaxy clusters.

关键词： distance scale -- galaxies clusters general -- supernovae general

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H_(2)S-miRNA串扰在神经系统疾病中的研究现状

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中国临床药理学杂志 2024年第11期40卷 1684-1688页

作者：曹硕宋运佳钟晴张蓉孙许涛黑龙江中医药大学基础医学院黑龙江哈尔滨150000

硫化氢(H_(2)S)是新型的内源性神经调节剂,在神经系统疾病中发挥着重要作用。微小RNAs(miRNAs)是神经系统疾病的关键调节因子,主要与靶基因mRNA的3′非翻译区靶向结合,抑制mRNA翻译并阻断其表达来发挥神经保护作用。H_(2)S和miRNA在帕... 详细信息

硫化氢(H_(2)S)是新型的内源性神经调节剂,在神经系统疾病中发挥着重要作用。微小RNAs(miRNAs)是神经系统疾病的关键调节因子,主要与靶基因mRNA的3′非翻译区靶向结合,抑制mRNA翻译并阻断其表达来发挥神经保护作用。H_(2)S和miRNA在帕金森病、脑卒中、脊髓疾病等神经系统疾病的发病过程中也起着重要作用。本文就H_(2)S和miRNA串扰对神经系统疾病的保护作用进行总结,探讨其对神经系统疾病的治疗作用。

关键词：硫化氢微小RNA 神经系统疾病脑血管疾病脊髓疾病神经退行性疾病

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双定刀滑切防缠式香蕉秸秆粉碎还田机设计与试验

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农业机械学报 2024年第2期55卷 36-49页

作者：张喜瑞杨幼铭刘宏新刘俊孝张志富曹硕海南大学机电工程学院海口570228 宿迁学院机电工程学院宿迁223800

针对我国香蕉秸秆粉碎还田作业过程中香蕉秸秆粉碎质量差,秸秆缠绕堵塞等问题,设计了一种双定刀滑切防缠式香蕉秸秆粉碎还田机。基于滑切定理,解析了粉碎刀随轴转动过程中的动态滑切角和粉碎定刀滑切角的相对作用原理,以等速螺线设计L... 详细信息

针对我国香蕉秸秆粉碎还田作业过程中香蕉秸秆粉碎质量差,秸秆缠绕堵塞等问题,设计了一种双定刀滑切防缠式香蕉秸秆粉碎还田机。基于滑切定理,解析了粉碎刀随轴转动过程中的动态滑切角和粉碎定刀滑切角的相对作用原理,以等速螺线设计L形粉碎定刀刀刃曲线,确定了粉碎刀结构参数;对香蕉秸秆缠绕粉碎刀辊进行受力分析,设计防缠绕板并确定装配数量与结构参数;以装置前进速度、粉碎刀辊转速、防缠绕板高度为试验因素,以香蕉秸秆粉碎合格率、抛撒不均匀度和香蕉秸秆缠绕数量为评价指标进行三因素三水平正交试验,建立因素与指标的响应面数学模型。试验结果表明,最优参数组合为作业机前进速度1.5 m/s、防缠绕板高度41.6 mm、粉碎刀辊转速1800 r/min,此时香蕉秸秆粉碎合格率为93.8%,香蕉秸秆缠绕数量为26,香蕉秸秆抛撒不均匀度为12.1%。以最优组合进行田间试验验证,试验结果表明双定刀滑切防缠式香蕉秸秆粉碎还田机整机防缠性能优越,满足设计要求。

关键词：粉碎还田机香蕉秸秆双定刀滑切角防缠

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The distance duality relation and the temperature profile of Galaxy Clusters

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Science China(Physics,Mechanics & Astronomy) 2011年第12期54卷 2260-2264页

作者： cao shuo ZHU ZongHong Department of Astronomy Beijing Normal University Beijing 100875 China

The validity of distance duality relation, η = D L (z)(1 + z) 2 /D A (z) = 1, an exact result required by the Etherington reciprocity theorem, where D A (z) and D L (z) are the angular and luminosity distances, plays an essential part in cosmological observations and model constraints. In this paper, we investigate some consequences of such a relation by assuming η a constant or a function of the redshift. In order to constrain the parameters concerning η, we consider two groups of cluster gas mass fraction data including 52 X-ray luminous galaxy clusters observed by Chandra in the redshift range from 0.3 to 1.273 and temperature range T gas > 4 keV, under the assumptions of two different temperature profiles. We find that the constant temperature profile is in relatively good agreement with no violation of the distance duality relation for both parameterizations of η, while the one with temperature gradient (the Vikhlinin et al. temperature profile) seems to be incompatible even at 99% CL.

关键词： X-rays: galaxies: clusters-(cosmology:) distance scale-cosmology: miscellaneous

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西安市街区尺度生境网络构建的案例与思考

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中国园林 2024年第5期40卷 104-110页

作者：曹朔陈宇许博文邱雪玮刘晖西安建筑科技大学建筑学院西安710055 中国建筑西南设计研究院有限公司成都610042 西安建筑科技大学西北地景研究所西安710055 本刊

城市街区尺度绿色空间呈现破碎化空间格局会对城市生物多样性产生负面影响。街区尺度生境网络是连接场地绿化与城市整体区域生态系统的纽带,是维护城市内部最小生境单元生态系统稳定的基本保障。与宏观尺度相比,街区尺度生境网络构建在... 详细信息

城市街区尺度绿色空间呈现破碎化空间格局会对城市生物多样性产生负面影响。街区尺度生境网络是连接场地绿化与城市整体区域生态系统的纽带,是维护城市内部最小生境单元生态系统稳定的基本保障。与宏观尺度相比,街区尺度生境网络构建在地理信息数据获取、数据精度及土地利用分类等方面均有差异。基于无人机航测数据进行生境制图,并综合运用MSPA、InVEST、MCR等模型进行街区生境网络构建与优化。结果显示:1)基于植被垂直结构特征进行生境制图,可细化表征绿色空间的生境属性;2)街区环境内生境源地呈现面积小、分布散、质量低的特征,即使绿地率较高的小型公园绿地,其生境斑块的生境质量也可能较低;3)受硬质地表分布特征影响,街区生境网络呈现区域分布不均、局地断裂、内外生境割裂的空间格局;4)提取薄弱区域周边生境节点,运用MCR模型构建连通路径,可指导生境节点与生境廊道增补,实现街区生境网络优化。在城市绿地建设从增量发展向存量优化转变的背景下,研究结果可为街区生境网络构建方法向街区绿色空间规划设计方法转化提供思路。

关键词：风景园林城市绿色空间街区生境类型街区生境制图植被垂直结构街区生境网络城市生物多样性

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大跨度变截面连续箱梁悬臂挂篮施工转支架现浇关键设计及结构验算

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工程技术研究 2024年第6期9卷 9-11页

作者：胡哲蒋兴法曹硕浙江数智交院科技股份有限公司浙江杭州310030

悬臂挂篮施工作为大跨度变截面连续箱梁常用的施工方法,被广泛应用于高速公路、铁路桥梁中。但其施工工期较长,且对施工空间有一定要求,部分项目仍有变更为大节段现浇的需求。文章以某(40+60+40)m变截面连续箱梁为例,详细说明了变更施... 详细信息

悬臂挂篮施工作为大跨度变截面连续箱梁常用的施工方法,被广泛应用于高速公路、铁路桥梁中。但其施工工期较长,且对施工空间有一定要求,部分项目仍有变更为大节段现浇的需求。文章以某(40+60+40)m变截面连续箱梁为例,详细说明了变更施工方案后的构造该如何重新设计,并分析了两种施工方案的结构受力差异,以期为同类桥梁变更提供参考。

关键词：悬臂挂篮施工大节段支架现浇构造设计结构验算

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基于非线性输出频率响应函数的液压管路故障诊断研究

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测控技术 2024年第6期43卷 55-60页

作者：曹硕房召东韩朔李桐宇刘向铭中海石油(中国)有限公司天津分公司辽东作业公司天津300451 东北大学机械工程与自动化学院辽宁沈阳110819

航空液压管路系统受到多源激励的影响,在工程应用中经常发生管路系统振动故障。针对长跨距管路系统振动故障定位困难的问题,采用光纤布拉格光栅(Fiber Bragg Grating,FBG)测试技术开展了长跨距管路系统振动信号分布式测量,并提出结合非... 详细信息

航空液压管路系统受到多源激励的影响,在工程应用中经常发生管路系统振动故障。针对长跨距管路系统振动故障定位困难的问题,采用光纤布拉格光栅(Fiber Bragg Grating,FBG)测试技术开展了长跨距管路系统振动信号分布式测量,并提出结合非线性输出频率响应函数(Nonlinear Output Frequency Response Function,NOFRF)分析方法实现液压管路系统卡箍松动和管体碰撞故障的准确定位。采用FBG传感器对长跨距管路系统振动信号进行分布式测量,克服了传统加速度测试过程中的电磁干扰和复杂布线问题;采用NOFRF指标提取卡箍松动和管体碰撞的故障特征,实现了对微弱故障的早期监测和准确定位。试验结果表明,所提方法可有效定位卡箍松动和管体碰撞故障。

关键词：航空液压管路系统故障诊断光纤布拉格光栅分布式测量非线性输出频率响应函数

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