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VAE-KRnet and its Applications to Variational Bayes

Communications in Computational Physics 2022年第4期31卷 1049-1082页

作者： Xiaoliang Wan shuangqing wei Department of Mathematics Center for Computation and TechnologyLouisiana State UniversityBaton Rouge 70803USA Division of Electrical&Computer Engineering Louisiana State UniversityBaton Rouge 70803USA

In this work,we have proposed a generative model,called VAE-KRnet,for density estimation or approximation,which combines the canonical variational autoencoder(VAE)with our recently developed flow-based generativemodel,called *** is used as a dimension reduction technique to capture the latent space,and KRnet is used to model the distribution of the latent *** a linear model between the data and the latent variable,we show that VAE-KRnet can be more effective and robust than the canonical ***-KRnet can be used as a density model to approximate either data distribution or an arbitrary probability density function(PDF)known up to a ***-KRnet is flexible in terms of *** the number of dimensions is relatively small,KRnet can effectively approximate the distribution in terms of the original random *** high-dimensional cases,we may use VAE-KRnet to incorporate dimension *** important application of VAE-KRnet is the variational Bayes for the approximation of the posterior *** variational Bayes approaches are usually based on the minimization of the Kullback-Leibler(KL)divergence between the model and the *** highdimensional distributions,it is very challenging to construct an accurate densitymodel due to the curse of dimensionality,where extra assumptions are often introduced for *** instance,the classical mean-field approach assumes mutual independence between dimensions,which often yields an underestimated variance due to *** alleviate this issue,we include into the loss the maximization of the mutual information between the latent random variable and the original random variable,which helps keep more information from the region of low density such that the estimation of variance is *** experiments have been presented to demonstrate the effectiveness of our model.

关键词： Deep learning variational Bayes uncertainty quantification Bayesian inverse problems generative modeling

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Safety, immunogenicity and protective effectiveness of heterologous boost with a recombinant COVID-19 vaccine (Sf9 cells) in adult recipients of inactivated vaccines

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Signal Transduction and Targeted Therapy 2024年第3期9卷 1165-1173页

作者： Wenxin Luo Jiadi Gan Zhu Luo shuangqing Li Zhoufeng Wang Jiaxuan Wu Huohuo Zhang Jinghong Xian Ruixin Cheng Xiumei Tang Yi Liu Ling Yang Qianqian Mou Xue Zhang Yi Chen weiwen Wang Yantong Wang Lin Bai Xuan wei Rui Zhang Lan Yang Yaxin Chen Li Yang Yalun Li Dan Liu weimin Li Lei Chen Department of Pulmonary and Critical Care Medicine West China HospitalSichuan UniversityChengduChina Institute of Respiratory Health Frontiers Science Center for Disease-related Molecular NetworkWest China HospitalSichuan UniversityChengduChina Precision Medicine Center Precision Medicine Key Laboratory of Sichuan ProvinceWest China HospitalSichuan UniversityChengduChina State Key Laboratory of Respiratory Health and Multimorbidity West China HospitalChengduChina Institute of Respiratory Health and Multimorbidity West China HospitalSichuan UniversityChengduChina Clinical Trial Center West China HospitalSichuan UniversityChengduChina General Practice Medical Center West China HospitalSichuan UniversityChengduChina Fangcao Community Health Service Center of Chengdu High-tech Zone ChengduChina The Research Units of West China Chinese Academy of Medical SciencesWest China HospitalChengduChina West China School of Nursing Sichuan UniversityChengduChina Department of Infection Control West China HospitalSichuan UniversityChengduChina Department of Pathology West China HospitalSichuan UniversityChengduChina Department of Respiratory and Critical Care Medicine the First Affiliated Hospital of Chongqing Medical UniversityChongqingChina Department of Neurology West China HospitalSichuan UniversityChengduChina

Vaccines have proven effective in protecting populations against COVID-19,including the recombinant COVID-19 vaccine(Sf9 cells),the first approved recombinant protein vaccine in *** this positive-controlled trial with 85 adult participants(Sf9 cells group:n=44;CoronaVac group:n=41),we evaluated the safety,immunogenicity,and protective effectiveness of a heterologous boost with the Sf9 cells vaccine in adults who had been vaccinated with the inactivated vaccine,and found a post-booster adverse events rate of 20.45%in the Sf9 cells group and 31.71%in the CoronaVac group(p=0.279),within 28 days after booster *** group reported any severe adverse *** the Sf9 cells vaccine booster,the geometric mean titer(GMT)of binding antibodies to the receptor-binding domain of prototype SARS-CoV-2 on day 28 post-booster was significantly higher than that induced by the CoronaVac vaccine booster(100,683.37 vs.9,451.69,p<0.001).In the Sf9 cells group,GMTs of neutralizing antibodies against pseudo SARS-CoV-2 viruses(prototype and diverse variants of concern[VOCs])increased by 22.23–75.93 folds from baseline to day 28 post-booster,while the CoronaVac group showed increases of only 3.29–10.70 ***,neutralizing antibodies against live SARS-CoV-2 viruses(prototype and diverse VOCs)increased by 68.18–192.67 folds on day 14 post-booster compared with the baseline level,significantly greater than the CoronaVac group(19.67–37.67 folds).A more robust Th1 cellular response was observed with the Sf9 cells booster on day 14 post-booster(mean IFN-γ+spot-forming cells per 2×105 peripheral blood mononuclear cells:26.66 vs.13.59).Protective effectiveness against symptomatic COVID-19 was approximately twice as high in the Sf9 cells group compared to the CoronaVac group(68.18%vs.36.59%,p=0.004).Our study findings support the high protective effectiveness of heterologous boosting with the recombinant COVID-19 vaccine(Sf9 cells)against symptomatic COVID-19 of dive

关键词： protective vaccine boost

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基于T2加权MRI瘤周和瘤内影像组学模型术前预测上皮性卵巢癌FIGO分期

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磁共振成像 2024年第6期15卷 100-106页

作者：王心怡魏明翔陈双庆南京医科大学姑苏学院苏州市立医院南京医科大学附属苏州医院放射科苏州215000

目的探讨基于T2加权MRI瘤周和瘤内影像组学模型预测上皮性卵巢癌(epithelial ovarian cancer,EOC)国际妇产科联盟(International Federation of Gynecology and Obstetrics,FIGO)分期的准确性与价值。材料与方法回顾性分析苏州市立医院... 详细信息

目的探讨基于T2加权MRI瘤周和瘤内影像组学模型预测上皮性卵巢癌(epithelial ovarian cancer,EOC)国际妇产科联盟(International Federation of Gynecology and Obstetrics,FIGO)分期的准确性与价值。材料与方法回顾性分析苏州市立医院(中心一)及苏州大学附属第一医院(中心二)共189例EOC患者的临床及影像资料,其中87例为FIGOⅠ/Ⅱ期,102例为FIGOⅢ/Ⅳ期。中心一的患者数据用于模型训练,中心二的数据作为外部验证集。基于肿瘤边界勾画感兴趣区域(region of interest,ROI),并分别向外扩展2 mm、4 mm、6 mm、8 mm和10 mm以获得多重瘤周信息。从瘤内及各瘤周ROI分别提取1223个影像组学特征。使用单因素分析、相关性分析、最小冗余最大相关及最小绝对收缩和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)算法进行特征筛选。比较各瘤周外扩范围的影像组学模型在训练集中的效能,以选择最优的外扩范围构建瘤周模型;并进一步构建瘤内模型及临床模型。通过列线图将三者结合构建联合模型。将各模型应用于外部验证集,并通过受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic,ROC)分析评估诊断效能。采用DeLong检验对比模型之间诊断效能的差异。结果瘤周影像组学模型在2 mm的外扩范围下表现最优,其训练集ROC曲线下面积(area under the curve,AUC)达0.840。在外部验证集中,联合模型诊断性能最佳,其具有最佳的准确度(74.2%)、特异度(80.8%)及AUC(0.837)。基于DeLong检验,联合模型显著优于瘤周模型(P=0.047)。结论基于T2加权MRI的瘤周、瘤内影像组学方法,有潜力有效预测上皮性卵巢癌的FIGO分期,其中联合瘤周瘤内影像组学及临床信息的模型表现最佳。该模型有望帮助临床医生更好地评估患者状况并制订个性化的治疗方案。

关键词：卵巢癌国际妇产科联盟分期影像组学瘤周磁共振成像

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一种基于地貌—斜坡结构划分斜坡单元的区域滑坡易发性评价研究

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地质论评 2024年第S1期70卷 231-235页

作者：陈刚程光军彭双庆张伟王丽萍重庆市地质矿产勘查开发局南江水文地质工程地质队重庆401120 重庆市二零八地质环境研究院有限公司重庆400700 重庆交通大学重庆400000 重庆科技大学重庆400030

针对水文分析法划分斜坡单元无法揭示地质环境边界特征,不利于高精度滑坡评价问题。笔者等以涪陵区为研究对象,结合地形地貌、斜坡结构类型提出一种基于地貌—斜坡结构法划分斜坡单元的方法。从面积极差、形态指数两参数与水文分析法进... 详细信息

针对水文分析法划分斜坡单元无法揭示地质环境边界特征,不利于高精度滑坡评价问题。笔者等以涪陵区为研究对象,结合地形地貌、斜坡结构类型提出一种基于地貌—斜坡结构法划分斜坡单元的方法。从面积极差、形态指数两参数与水文分析法进行对比,验证了该方法的合理性。并选取8个评价指标,采用层次分析法—多因子综合叠加模型,对两类方法下滑坡易发性进行精度对比.

关键词：斜坡单元斜坡结构易发性地貌

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WH-m/M相乘复合码扩频系统的互扰统计特性

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电子学报 1999年第7期27卷 5-8页

作者：任勇魏双庆山秀明清华大学电子工程系

本文建立了复合码ＤＳＣＤＭＡ扩频系统的数学模型，推导了多址干扰的数学表示，定义了用户之间的互扰因子，并进行了计算．研究发现：在扩频比相同的条件下，若ＰＮ序列周期大于扩频比，且序列的伪随机性较好，则采用ＷＨｍ／Ｍ复... 详细信息

本文建立了复合码ＤＳＣＤＭＡ扩频系统的数学模型，推导了多址干扰的数学表示，定义了用户之间的互扰因子，并进行了计算．研究发现：在扩频比相同的条件下，若ＰＮ序列周期大于扩频比，且序列的伪随机性较好，则采用ＷＨｍ／Ｍ复合序列与采用ｍ、Ｍ序列的扩频系统，其互扰因子均呈高斯分布，且数字特征相同；当ＰＮ序列周期等于扩频比时，互扰因子不具有高斯分布特性．该结论不要求扩频比足够大，而且对同步和异步ＤＳＣＤＭＡ通信系统都适用．

关键词： DS-CDMA WH序列 m序列 M序列扩频通信系统

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紫外光对不同埋藏环境丝织品的劣化影响研究

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复旦学报（自然科学版） 2024年第1期63卷 106-114页

作者：龚德才杨文敏胡霜晴陈黄茜魏莎妮雷琼李顺张杨中国科学技术大学科技史与科技考古系安徽合肥230026 景德镇市文化广电新闻出版旅游局江西景德镇333003 荆州文物保护中心湖北荆州434020 湖北大学历史文化学院湖北武汉430062

利用扫描电镜、傅立叶红外、热重分析、氨基酸分析等现代分析技术对紫外光照下模拟不同埋藏环境丝织品的劣化差异进行探究,结果表明:紫外光照射使丝织品表面产生脆性断口、黄度值增加、断裂强力下降、无规卷曲/β-折叠含量比值上升、热... 详细信息

利用扫描电镜、傅立叶红外、热重分析、氨基酸分析等现代分析技术对紫外光照下模拟不同埋藏环境丝织品的劣化差异进行探究,结果表明:紫外光照射使丝织品表面产生脆性断口、黄度值增加、断裂强力下降、无规卷曲/β-折叠含量比值上升、热最大分解速率温度下降,酪氨酸、大侧基氨基酸的含量减少。紫外光对不同埋藏环境丝织品的劣化影响各不一样,其中对有氧埋藏环境和碱埋藏环境丝织品的破坏更严重。因此博物馆馆藏丝织品保存条件的选择应当根据埋藏环境差异进行细化,对有氧环境和碱环境出土丝织品要格外注意紫外光防护。此外,丝织品的热最大分解速率温度的下降与紫外光照射时间呈线性关系,可以用于量化评估丝织品的劣化程度。

关键词：丝织品埋藏环境馆藏环境紫外光劣化差异

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隐高斯树的分层合成——一种基于信息论解决合成问题的方法

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信息通信技术 2018年第1期12卷 35-41页

作者： Ali Moharrer 魏双庆骆源路易斯安那州立大学巴吞鲁日70803 上海交通大学上海200240 上海交大-中国联通-广视通达大数据联合实验室上海200240

文章基于高斯分布提出一种信息论的启发式合成方法:根据给定的联合密度,研究产生随机向量的机制,从而引出(隐)高斯树结构;依赖于已知的树结构,构造分层的连续的合成方案,达到使用足够数量的公共随机变量来合成希望密度的研究目的。算法... 详细信息

文章基于高斯分布提出一种信息论的启发式合成方法:根据给定的联合密度,研究产生随机向量的机制,从而引出(隐)高斯树结构;依赖于已知的树结构,构造分层的连续的合成方案,达到使用足够数量的公共随机变量来合成希望密度的研究目的。算法中所使用的公共随机源由树顶层的隐变量、独立可加性高斯噪声、以及表达变量之间模糊性的伯努利符号三部分组成。文章所提出的方法不但可以揭示数据隐含的内部联系,而且适用于在机器学习领域中产生仿真数据。

关键词：信息论隐高斯树随机向量合成公共信息连续合成

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基于无人机多光谱遥感的油菜地上部生物量估算

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南方农业 2024年第13期18卷 172-177页

作者：董泽宇吕双庆魏宇翔朱雨威孟宪昕塔里木大学农学院新疆阿拉尔843300 塔里木大学南疆干旱区特色作物遗传改良与高效生产兵团重点实验室新疆阿拉尔843300

建立一种高效监测油菜地上部生物量(Aboveground biomass,AGB)的无损方法用于反映作物生长状况。以浙油50和沣油737等2个油菜品种为研究对象,通过无人机搭载多光谱仪获取油菜的多光谱影像,提取油菜冠层5个单波段反射率和10个植被指数,... 详细信息

建立一种高效监测油菜地上部生物量(Aboveground biomass,AGB)的无损方法用于反映作物生长状况。以浙油50和沣油737等2个油菜品种为研究对象,通过无人机搭载多光谱仪获取油菜的多光谱影像,提取油菜冠层5个单波段反射率和10个植被指数,筛选与油菜地上部生物量相关性显著的光谱特征参数,采用随机森林(RF)、BP神经网络(BP)、支持向量机(SVM)3种方法建立地上部生物量估测模型。采用决定系数R^(2)(Coefficient of determination)、均方根误差(Root mean square error,RMSE)和相对分析误差(Relative predication deviation,RPD)对模型的估算精度进行评价。浙油50、沣油737、浙油50+沣油737的地上部生物量估算模型在测试集上,均表现为RF模型R^(2)最大、RMSE值最小、RPD值最大,分别为0.609、0.238 kg·m^(-2)、1.600;0.725、0.364 kg·m^(-2)、1.919;0.627、0.423 kg·m^(-2)、1.639。通过无人机采集作物多光谱影像,可以构建基于光谱特征参数的作物地上部生物量估算模型,随机森林模型精度最佳,为研究的最佳建模方法。

关键词：油菜地上部生物量无人机多光谱遥感 BP神经网络随机森林支持向量机

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不同耐药程度尿路致病性大肠埃希菌黏附水平差异性分析

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中华临床感染病杂志 2017年第1期10卷 43-48页

作者：陈妍妍曹阳刘双庆宋巍魏殿军天津医科大学第二医院检验科 300211 天津医科大学总医院院内感染管理科 300050

目的探讨不同耐药程度尿路致病性大肠埃希菌黏附水平的差异.方法连续收集2012年3月至2015年10月天津地区四家三级甲等医院尿液样本分离的非重复感染大肠埃希菌100株,结合药物敏感性试验,将大肠埃希菌分为敏感组（50株）和耐药组（50株... 详细信息

目的探讨不同耐药程度尿路致病性大肠埃希菌黏附水平的差异.方法连续收集2012年3月至2015年10月天津地区四家三级甲等医院尿液样本分离的非重复感染大肠埃希菌100株,结合药物敏感性试验,将大肠埃希菌分为敏感组（50株）和耐药组（50株）.采用聚合酶链反应（PCR）和实时荧光定量PCR方法检测菌株I型菌毛fimH、fimA、fimB基因和P型菌毛papA、papB、papC、papGII基因及其相对表达量,采用酵母细胞黏附试验和红细胞凝血试验分别检测I型菌毛及P型菌毛的黏附能力.数据分析采用 χ2检验和t（Z）检验.结果耐药组中papGII基因的检出率为42.0%,高于敏感组（16.0%）,两组差异有统计学意义（χ2=8.208,P〈0.05）,fimH、fimA、fimB、papA、papB和papC基因在两组中的检出率差异无统计学意义（P值均〉0.05）.敏感组中fimH、fimB和papC基因相对表达量高于耐药组（Z=3.427,t=5.182和8.120,P〈0.05）;黏附试验表明敏感组菌株I型菌毛的黏附能力（64.0%）高于耐药组（40.0%）（χ2=5.769,P〈0.05）.结论耐药组I型菌毛的黏附能力下降与菌株的适应性代价有关,fim及pap基因簇编码的其他基因的转录和缺失可能对I型菌毛及P型菌毛的黏附功能产生影响.

关键词：泌尿道致病性大肠杆菌抗药性黏附素纤毛,细菌

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中药渣催化热解特性与产物分布规律

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广东化工 2024年第4期51卷 103-106页

作者：吕永兴洪国栋姜维熊伟蔡进廷孙一博张元甲胡双清华润环保发展有限公司广东深圳518052 中国科学院广州能源研究所广东广州510640

本研究探索了一系列用于中药渣快速热解的Al MCM-41、β30、HY、ZSM-5商业分子筛类催化剂,进行了热重分析(TGA),Py-GC/MS联用仪分析,对中药渣原样和不同分子筛掺杂中药渣快速热解液相产物的化学组分进行了测定,重点讨论了热解温度、催... 详细信息

本研究探索了一系列用于中药渣快速热解的Al MCM-41、β30、HY、ZSM-5商业分子筛类催化剂,进行了热重分析(TGA),Py-GC/MS联用仪分析,对中药渣原样和不同分子筛掺杂中药渣快速热解液相产物的化学组分进行了测定,重点讨论了热解温度、催化剂种类等参数对热解油组成分布的影响规律。与中药渣原料直接热解相比,加入分子筛催化剂在中药渣快速热解中生产芳烃的效率更高,且更有效抑制了酚类和酮类化合物的生成。当热解温度为700℃时,4种催化剂对应热解油中酚类含量分别为9.9%、11.8%、11.3%和16.9%,酮类含量分别为10.9%、10.6%、20.2%和13.4%。分析结果表明,ZSM-5芳烃相对含量可达到7.2%,更加适用于中药渣的催化热解。

关键词：中药渣热解催化剂化学组分

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