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第五届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会高通量时代的生物信息学与系统生物学

作者： Jianzhao Gao Yajun sheng Gang Hu Kui Wang shiyi shen Jishou Ruan the school of mathematical sciences and LPMC Nankai University

Background:Protein folding rates vary by several orders of magnitude and they depend on the topology of the fold and the size and composition of the sequence. Methods:We proposed an new method to predict the folding rate which is based on the information dynamic function. Results:The predictor includes three linear regressions for proteins with two-state, multi-state,and unknown(mixed-state) folding *** method achieves the correlation 0.9 for two-state,0.86 for multistate and 0.85 for *** with other methods, our method achieves higher correlation. Conclusions:Our method can be used to predict the folding *** provides a new way to understand the folding rate.

关键词： information dynamic function protein folding rate linear regression

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关于信源的Tunstall编码方法

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应用数学学报 2000年第3期23卷 367-376页

作者：杨军符方伟沈世镒南开大学数学科学学院天津300071

在信源编码理论中，Ｔｕｎｓｔａｌｌ码是渐近最优的Ｖ－Ｂ码（Ｖ代表变长消息，Ｂ代表定长码字）．本文进一步研究了Ｔｕｎｓｔａｌｌ码的性质，给出了Ｔｕｎｓｔａｌｌ码的码率的新的上界，刻划了Ｔｕｎｓｔａｌｌ树和扩展次数之间的... 详细信息

在信源编码理论中，Ｔｕｎｓｔａｌｌ码是渐近最优的Ｖ－Ｂ码（Ｖ代表变长消息，Ｂ代表定长码字）．本文进一步研究了Ｔｕｎｓｔａｌｌ码的性质，给出了Ｔｕｎｓｔａｌｌ码的码率的新的上界，刻划了Ｔｕｎｓｔａｌｌ树和扩展次数之间的一些较深刻的内在联系，并且给出了一个寻找ε－最优的Ｔｕｎｓｔａｌｌ码的扩展次数的算法．

关键词：信源编码变长-定长编码熵 Tunstall编码码率

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循环码的周期分布的新的计算公式

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通信学报 1996年第2期17卷 1-6页

作者：符方伟沈世镒南开大学

本文在［１］文的基础上进一步分析了循环码的周期分布的性质，给出了新的计算方法和公式，并且确定了一些熟知的循环码的周期分布。

关键词：循环码周期分布 Hamming码 BCH码编码理论

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等重码的一些新结果

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通信学报 1997年第1期18卷 17-21页

作者：符方伟沈世镒南开大学

本文给出两种构造二元非线性等重码的方法，这些方法是［１］文构造二元非线性循环等重码方法的改进。通过我们的构造方法可以得到几类二元最优等重码。

关键词：等重码极长码 Plotkin界 Johnson界

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关于不变随机场外推与内插的几点注记

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工程数学学报 1984年第2期 23-29页

作者：沈世镒南开大学

In this paper, the Kolmogorov’s interpolation and forecasting error formulas of the stationary sequence are extended. In the case of weak invariable random field, these formulas are similar.

关键词：平稳序列随机场密度矩阵内插外推注记

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广义差错长序列的数据库搜索及其快速算法

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计算机工程与应用 2006年第1期42卷 20-22页

作者：沈世镒胡刚夏树涛南开大学数学科学学院天津300071 深圳清华大学研究生院深圳518055

所谓广义差错是指同时可能具有符号改变、插入与删除的差错,在数据库搜索中如何对具有广义差错的语句进行搜索是近期计算科学发展的重要问题,尤其是对长序列的搜索问题的研究还很少开展。论文对此问题进行讨论,并给出它的快速算法。

关键词：广义差错长序列的数据库搜索快速算法

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关于保密系统中Bayes对手的若干注记

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通信学报 1986年第3期 25-30页

作者：沈世镒南开大学

本文证明了以下定理:对一个保密系统,如信源是遍历的,密钥空间是周期的,且不同密钥的密分概率分布是不同的,那么在充分长的密文被窃听时,这个密钥将被Bayes对手打开。

关键词：保密系统定理 Bayes 密钥空间信源判决函数决策函数对手注记

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分组卷积码的门限叠代判决译码法

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通信学报 1982年第2期 1-7页

作者：沈世镒南开大学

本文给出了一种译码方法,称之为“分组卷积码的门限叠代判决译码法”。该法综合了分组码与卷积码的特点,同时也综合了***与“信息门限判决”译码的思想。它的主要性能有:1.码率R_t能接近信道容量C;2.译码平均误差可任意小;3.对于每比特... 详细信息

本文给出了一种译码方法,称之为“分组卷积码的门限叠代判决译码法”。该法综合了分组码与卷积码的特点,同时也综合了***与“信息门限判决”译码的思想。它的主要性能有:1.码率R_t能接近信道容量C;2.译码平均误差可任意小;3.对于每比特译码的平均计算量与平均存储量是常数N与M,它们由R_t与C的值来决定。

关键词：门限判决计算量存储量译码法矩阵数学分析译码方法平均误差测量误差向量独立同分布卷积码信道容量随机变量概率论

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特征向量计算的神经网络方法

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应用数学学报 2000年第2期23卷 233-239页

作者：赵占芸沈世镒跃虎南开大学数学系天津300071 南京理工大学应用数学系南京210094

矩阵特征向量计算在实际问题中有着广泛应用．本文采用神经网络计算方法来研究主元分析（ＰＣＡ）和次元分析（ＭＣＡ）问题．我们首先考虑单神经元的情况（ｐ＝１），给出了求矩阵最大特征元和最小特征元的算法．然后对多神经元情形（... 详细信息

矩阵特征向量计算在实际问题中有着广泛应用．本文采用神经网络计算方法来研究主元分析（ＰＣＡ）和次元分析（ＭＣＡ）问题．我们首先考虑单神经元的情况（ｐ＝１），给出了求矩阵最大特征元和最小特征元的算法．然后对多神经元情形（ｐ＞１），给出了抽取矩阵主元和次元的算法．和目前许多已知的算法不一样，在我们ＰＣＡ的算法中改变矩阵的负号就能够得到ＭＣＡ问题的解．

关键词：神经网络学习算法特征向量矩阵计算

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平衡的相关免疫函数的一种构造方法

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南开大学学报（自然科学版） 1999年第4期32卷 84-86,93页

作者：陈鲁生符方伟沈世镒南开大学数学系天津300071

首先讨论resilient函数,推广了文献[1]的一个结论。

关键词： resilient函数相关免疫函数平衡函数布尔函数

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