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Screening of SSR Core Primers and Construction of Molecular ID for Flue-cured Tobacco Germplasm Resources in Hunan

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Agricultural Biotechnology 2022年第4期11卷 1-6,45页

作者： Hui LI Yinghong TANG shipeng xiang Guang HUO Chutian HUANG College of Life and Environment Science/Hunan University of Arts and Science Changde 415000China Changsha Filiale of Hunan Tobacco Corpation Changsha 410007China Enshi Prefecture Company of Hubei Tobacco Company Enshi 445000China

[Objectives]This study was conducted to establish a reliable and unique molecular ID for flue-cured tobacco germplasm resources in Hunan Province,further improving the efficiency of germplasm collection and identification,and laying a solid material foundation for flue-cured tobacco breeding.[Methods]Twelve pairs of SSR primers with stable amplification and rich polymorphism were screened out from 816 pairs of SSR primers by a step-by-step screening *** core primers of the SSR core primer library,the polymorphism of SSR primers was analyzed,the genetic relationship of 162 flue-cured tobacco germplasm resources was identified,and the molecular ID cards were constructed.[Results]The result of SSR primer polymorphism analysis showed that a total of 57 alleles were detected by 12 pairs of SSR primers in 165 tobacco germplasm resources,with an average of 4.75 alleles per pair of primers;the average diversity of SSR primers was 0.649;and the average value of Shannon's index was *** results of cluster analysis showed that 162 flue-cured tobacco germplasm resources were divided into five *** members of each group were divided based on genome information,which had nothing to do with their geographical ***,12 pairs of SSR primers gave each flue-cured tobacco germplasm resource a unique molecular ID code.[Conclusions]From the above results,we can see that the 12 pairs of SSR primers obtained by screening have stable amplification polymorphism,and can serve as the primers of the core primer library,and can be used to construct the unique molecular ID of flue-cured tobacco germplasm resources.

关键词： Tobacco SSR primer Molecular ID

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地方晒烟种质资源遗传多样性分析与评价

云南农业大学学报（自然科学版） 2019年第6期34卷 915-921页

作者：李辉李德芳向世鹏湖南文理学院生命与环境科学学院湖南常德415000 中国农业科学院麻类研究所湖南长沙410205 湖南省烟草公司长沙市公司湖南长沙410007 湖南农业大学农学院湖南长沙410128

【目的】为更好地收集、鉴定和保存地方晒烟品种,高效率地利用地方晒烟种质资源进行烟草品种选育。【方法】以67份地方晒烟品种的DNA为模板,利用筛选获得的25对SSR引物进行PCR扩增,采用二进制记录SSR分析结果,利用NTSY 2.1进行聚类分析... 详细信息

【目的】为更好地收集、鉴定和保存地方晒烟品种,高效率地利用地方晒烟种质资源进行烟草品种选育。【方法】以67份地方晒烟品种的DNA为模板,利用筛选获得的25对SSR引物进行PCR扩增,采用二进制记录SSR分析结果,利用NTSY 2.1进行聚类分析,利用POPGENE 32.0进行遗传多样性分析。【结果】(1)25对SSR引物共检测到83个多态性位点,品种间的遗传相似系数变异范围为0.60~0.84。(2)遗传相似系数为0.62时,可以将67份晒烟品种分成3个类群,第Ⅰ类包括49份晒烟品种,第Ⅱ类包括13份晒烟品种,第Ⅲ类包括5份晒烟品种。(3)在晒烟资源中观测等位基因数的平均值、有效等位基因数的平均值、观测杂合度的平均值、期望杂合度的平均值分别为3.44个、2.762个、0.168、0.597。平均Nei’s基因多样性指数(H)为0.593,平均Shannon’s指数(I)为1.013。其中期望杂合度的平均值大于0.5。【结论】67份晒烟种质资源之间的遗传多样性较高,晒烟品种间的亲缘关系和品种的地理来源之间无明显相关性。

关键词：晒烟 SSR 遗传多样性

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抗黑胫病地方烟草品种遗传多样性分析与评价

分子植物育种 2020年第4期18卷 1357-1363页

作者：李辉向世鹏李德芳湖南文理学院生命与环境科学学院常德415000 中国农业科学院麻类研究所长沙410205 湖南省烟草公司长沙市公司长沙410007

为了拓宽黑胫病抗性育种亲本材料的遗传背景以及充分发掘和利用地方品种的抗病基因资源,本研究利用筛选获得的25对SSR引物对35份抗黑胫病地方烟草品种进行了亲缘关系聚类分析和遗传多样性分析。结果表明:(1) 25对SSR引物共检测到85个多... 详细信息

为了拓宽黑胫病抗性育种亲本材料的遗传背景以及充分发掘和利用地方品种的抗病基因资源,本研究利用筛选获得的25对SSR引物对35份抗黑胫病地方烟草品种进行了亲缘关系聚类分析和遗传多样性分析。结果表明:(1) 25对SSR引物共检测到85个多态性位点,聚类分析结果表明35份地方烟草品种的遗传相似性系数分布范围为0.57~0.87;(2)在遗传相似性系数为0.57时,可以将35份抗黑胫病地方烟草品种分成两个类群,A类包括20份烤烟品种,B类包括15份晒烟品种。在遗传相似系数0.62烤烟分为2个类群,晒烟分为3分类群;(3)在抗黑胫病地方烟草品种中观测等位基因数的平均值为3.32个;有效等位基因数的平均值为2.651;观测杂合度的平均值为0.395;期望杂合度的平均值为0.596。平均Nei’s基因多样性指数(H)为0.558,平均Shannon’s指数(I)为1.020。不同地方的抗黑胫病烟草品种间具有一定的遗传差异,品种之间具有较高的遗传多样性,且品种间的亲缘关系和品种的地理来源之间具有一定的相关性。

关键词：黑胫病烤烟晒烟遗传多样性

Comparative transcriptome analysis revealed the genotype specific cold response mechanism in tobacco

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Comparative transcriptome analysis revealed the genotype spe...

DTOPSIS法结合隶属函数法综合评价湖南烤烟区试新品种

作者：胡日生 Xianxin Zhu shipeng xiang Youguo Zhan Mingdong Zhu Hanqi Yin Qingming Zhou Lieshu Zhu Xianwen Zhang Zhi Liu 湖南省烟草公司 College of Agronomy Hunan Agricultural University Central-South Agricultural Experiment Station of China Tobacco Kunming Municipal Tobacco Company Hunan Rice Research Institute

Cold stress is a major adverse environmental factor that affects plant growth, development, productivity and quality. In the present study, comparative genome-wide transcriptome analysis on two tobacco(Nicotiana tobacum L.) cultivars, cold-tolerant NC567 and cold-sensitive Taiyan8, was performed using RNA-seq technology. After the first assembly, total length of unigenes is from 101,308,644 to 123,781,795 bp, the N50 length is from 1357 to 1475 bp, and 152,688 unigenes in NC567 and 144,160 unigenes in Taiyan8 were identified, respectively. Functional classification of cold-responsive(COR) genes showed that the genes involved in cell wall metabolism, transcription factors, ubiquitin-proteasome system(UPS) and signaling are over-represented, and the COR genes are specifically induced during cold stress in NC567. Pathway analysis revealed the significant enrichment of the COR genes in plant circadian clock. Taken together, the present study suggested the positive roles of the highly induced expression of the COR genes and the conserved mechanism of circadian clock related genes in tobacco response to cold stress, and provided some valuable genes for crop improvement to cope with cold stress.

关键词： cold stress transcriptome tobacco circadian clock

来源： cnki会议评论

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cnki会议

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分子植物育种 2020年第7期18卷 2409-2415页

作者：姚旺向世鹏周清明黎娟湖南农业大学农学院长沙410128 湖南省烟草公司长沙市公司长沙410007

为丰富烤烟评价体系以及更好地筛选烤烟新品种提供可靠依据,本研究运用DTOPSIS法结合隶属函数法对2017年湖南省烤烟新品种区试试验4个点的数据进行综合评价。评价结果为V7:HKDN-2>V10:云烟87>V6:C81-2-2>V8:20930>V4:E9>V1:CS1542>V3:CS... 详细信息

为丰富烤烟评价体系以及更好地筛选烤烟新品种提供可靠依据,本研究运用DTOPSIS法结合隶属函数法对2017年湖南省烤烟新品种区试试验4个点的数据进行综合评价。评价结果为V7:HKDN-2>V10:云烟87>V6:C81-2-2>V8:20930>V4:E9>V1:CS1542>V3:CS1545>V5:09-18-3>V9:K326>V2:SY15215。结果表明V7:HKDN-2和V6:C81-2-2的综合评价值最高,与品种的实际表现基本一致,值得继续种植研究;V2:SY15215综合评价结果最低,不宜继续种植研究本研究结果为丰富烤烟评价体系以及更好地筛选烤烟新品种提供可靠依据。

关键词： DTOPSIS法隶属函数法烤烟品种综合评价

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社会科学学者中文论文代表作抽选的影响因素

图书馆论坛 2024年第1期44卷 86-93页

作者：包翔王世鹏刘桂锋江苏大学图书馆江苏大学科技信息研究所

代表作是评价学者学术水平的重要依据,探究学者在代表作抽选时的影响因素,对学者学术水平的展示和代表作制度的实施具有重要意义。文章结合代表作特点,以管理学、法学和图书馆、情报与文献学等3个社会科学学科的学者作为研究对象,归纳... 详细信息

代表作是评价学者学术水平的重要依据,探究学者在代表作抽选时的影响因素,对学者学术水平的展示和代表作制度的实施具有重要意义。文章结合代表作特点,以管理学、法学和图书馆、情报与文献学等3个社会科学学科的学者作为研究对象,归纳学者在代表作抽选过程中的影响因素并设计李克特五级量表,通过在因子分析中提取特征值大于1的主要因素,采用最大方差旋转法归纳修正后的因素,最终构建代表作抽选的多元回归模型。研究发现:代表作的学术属性、新颖属性、社会属性、时间属性、传承属性等5种因素是影响社科学者代表作抽选的主要因素,不同学科学者在代表作抽选时的侧重点不同。

关键词：代表作抽选因子分析回归模型

浏阳植烟土壤pH和有机质时空变异及丰缺评价

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云南农业大学学报（自然科学版） 2017年第1期32卷 134-139页

作者：唐春闺李帆杨红武向世鹏李强湖南省烟草公司长沙市公司湖南长沙410007 湖南农业大学烟草研究院湖南长沙410128

为探明浏阳烟区土壤pH和有机质时空变异特征,并为土壤pH和有机质合理管控提供参考,以浏阳市2000年和2014年耕地土壤pH和有机质为研究对象,利用半方差函数及克里格插值等方法,对县域土壤pH和有机质时空变异特征和丰缺状况进行了评价。结... 详细信息

为探明浏阳烟区土壤pH和有机质时空变异特征,并为土壤pH和有机质合理管控提供参考,以浏阳市2000年和2014年耕地土壤pH和有机质为研究对象,利用半方差函数及克里格插值等方法,对县域土壤pH和有机质时空变异特征和丰缺状况进行了评价。结果表明:14年间土壤pH提高了0.30,增幅为5.57%,土壤有机质下降了2.89 g/kg,降幅为8.89%;14年来土壤有机质和pH块金效应增加,说明土壤有机质和pH空间结构减弱,随机变异性增强;土壤pH适宜等级的面积比2000年增加了29.07%,低等级的面积比2000年减少了28.59%;有机质含量适宜等级的面积比2000年减少了8.39%,高等级的耕地面积比2000年增加了8.15%。由此可见,浏阳烟区植烟土壤酸碱度变得更适宜烤烟生产,而有机质含量两极分化严重,变得不利于烤烟生产,因此在生产上应继续坚持施用生石灰的调节土壤pH,同时针对不同区域有机质的变化做好有机物料投入工作。

关键词：烟区土壤 pH 有机质时空变异

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湘西植烟土壤有机质和全氮时空变异特征研究

土壤 2020年第2期52卷 372-377页

作者：向世鹏向德明田峰张黎明黎娟周米良田明慧李强湖南农业大学农学院长沙410128 湖南省烟草公司湘西州公司湖南吉首416000 湖南省烟草公司长沙市公司长沙410007

为揭示湖南省湘西州烟区土壤有机质(SOM)和全氮(TN)的时空变异特征和为合理施用有机肥和氮肥提供科学依据,采用经典统计学、地统计学和GIS等方法,对湘西州2000年和2015年植烟土壤SOM和TN时空变异特征进行了研究。结果表明:2015年SOM和T... 详细信息

为揭示湖南省湘西州烟区土壤有机质(SOM)和全氮(TN)的时空变异特征和为合理施用有机肥和氮肥提供科学依据,采用经典统计学、地统计学和GIS等方法,对湘西州2000年和2015年植烟土壤SOM和TN时空变异特征进行了研究。结果表明:2015年SOM和TN平均含量较2000年分别增加了5.03g/kg和0.31g/kg,增幅分别达21.39%和21.99%,SOM和TN含量的最小值变小,变异系数、最大值和极差变大,Moran’sI指数标准化Z值下降,块金效应增加;SOM和TN含量"低""适宜"等级面积分别下降了3.42%、37.73%和2.04%、44.43%,"高""极高"等级面积分别增加了32.21%、8.94%和35.67%、10.80%。表明湘西植烟土壤SOM和TN含量和变异同时增加,SOM和TN空间自相关性减弱,随机变异性增强。植烟土壤SOM与TN含量表现出极显著的正线性相关,SOM的矿化释放是TN的一个主要来源。

关键词：湘西植烟土壤有机质全氮时空变异

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永州烤烟糖碱含量的空间变异特征分析

中国农学通报 2011年第23期27卷 150-154页

作者：黎娟周清明邓小华刘逊向世鹏湖南农业大学农学院长沙410128 中国烟草中南农业试验站长沙410128

为揭示永州烟区烤烟糖、碱空间变异性,为烟区规划和卷烟工业企业原料采购提供指导。针对湖南省永州烟区2007—2009年的C3F等级烤烟样品,采用地统计学方法分析其总糖、还原糖、烟碱含量和糖碱比值的区域特征及空间变异特性。结果表明,永... 详细信息

为揭示永州烟区烤烟糖、碱空间变异性,为烟区规划和卷烟工业企业原料采购提供指导。针对湖南省永州烟区2007—2009年的C3F等级烤烟样品,采用地统计学方法分析其总糖、还原糖、烟碱含量和糖碱比值的区域特征及空间变异特性。结果表明,永州大部分烟区总糖含量在27.4%～29.2%之间,还原糖含量在25.8%～27.5%之间,烟碱含量在2.4%～2.6%之间,糖碱比在12.1～13.6之间,总糖、还原糖含量及糖碱比在空间分布上均呈从东向西递减的趋势,烟碱含量分布与之相反,呈从西向东递减的趋势。永州烟区植烟县烤烟烟碱含量普遍在湖南省优质烤烟适宜范围内,总糖、还原糖含量除道县西部、江永县北部区域外普遍偏高。

关键词：烤烟总糖还原糖烟碱空间分布