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Molecular cytogenetic map visualizes the heterozygotic genome and identifies translocation chromosomes in Citrus sinensis

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Journal of Genetics and Genomics 2023年第6期50卷 410-421页

作者： shipeng song Hui Liu Luke Miao Li He Wenzhao Xie Hong Lan Changxiu Yu Wenkai Yan Yufeng Wu Xiao-peng Wen Qiang Xu Xiuxin Deng Chunli Chen National Key Laboratory for Germplasm Innovation and Utilization for Fruit and Vegetable Horticultural Crops Hubei Hongshan LaboratoryWuhanHubei 430070China College of Life Science and Technology Huazhong Agricultural UniversityWuhanHubei 430070China National-local Joint Engineering Laboratory of Citrus Breeding and Cultivation/Horticulture Institute Sichuan Academy of Agricultural SciencesChengduSichuan 610066China National Key Laboratory of Crop Genetics and Improvement Huazhong Agricultural UniversityWuhanHubei 430070China Hubei Province Engineering Research Center of Legume Plants College of Life ScienceJianghan UniversityWuhanHubei 430056China State Key Laboratory for Crop Genetics and Germplasm Enhancement Bioinformatics CenterAcademy for Advanced Interdisciplinary StudiesNanjing Agricultural UniversityNanjingJiangsu 210095China Key Laboratory of Plant Resource Conservation and Germplasm Innovation in Mountainous Region(Ministry of Education) Institute of AgrobioengineeringCollege of Life ScienceGuizhou UniversityGuiyangGuizhou 550025China

Citrus sinensis is the most cultivated and economically valuable Citrus species in the world,whose genome has been assembled by three generation sequencings.However,chromosome recognition remains a problem due to the small size of chromosomes,and difficulty in differentiating between pseudo and real chromosomes because of a highly heterozygous genome.Here,we employ fluorescence in situ hybridization(FISH)with 9 chromosome painting probes,30 oligo pools,and 8 repetitive sequences to visualize 18 chromosomes.Then,we develop an approach to identify each chromosome in one cell through single experiment of oligo-FISH and Chromoycin A3(CMA)staining.By this approach,we construct a high-resolution molecular cytogenetic map containing the physical positions of CMA banding and 38 sequences of FISH including centromere regions,which enables us to visualize significant differences between homologous chromosomes.Based on the map,we locate several highly repetitive sequences on chromosomes and estimate sizes and copy numbers of each site.In particular,we discover the translocation regions of chromosomes 4 and 9 in C.sinensis“Valencia.”The high-resolution molecular cytogenetic map will help improve understanding of sweet orange genome assembly and also provide a fundamental reference for investigating chromosome evolution and chromosome engineering for genetic improvement in Citrus.

关键词： Chromosomalmarker FISH CMA banding Genomic heterozygosity Chromosomal translocation Sweet orange

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Perioperative treatment of liver transplantation

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Discussion of Clinical Cases 2014年第1期1卷 12-18页

作者： Shengbin Zhang Rui Liu shipeng song Weiqing Wang Jin Zhao Xiaoshi Dong The Third Affiliated Hospital of Inner Mongolia Medical University HohhotChina

A case of liver transplantation in the department of general surgery of the third affiliated hospital of Inner Mongolia medical school was collected and analyzed on the basis of diagnosis,physical examination and treatment.Liver transplantation was very complicated,accompanied by various postoperative complications.So this paper aims to share experience of perioperative management of liver transplantation among physicians.

关键词： Liver transplantation Perioperative treatment Perioperative management

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Analysis of diagnosis and treatment of heterotopic pancreas

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Discussion of Clinical Cases 2015年第2期2卷 23-28页

作者： shipeng song Rui Liu Shengbin Zhang Tianyong Zhao Jin Zhao Zhijian Zhang The Third Affiliated Hospital of Inner Mongolia Medical University HohhotChina

A case of heterotopic pancreas in the Third Affiliated Hospital of Inner Mongolia Medical University was recorded and analyzed on the basis of diagnosis,physical examination and treatment.Misdiagnosis of gastrointestinal stromal tumor(GIST)is very common since it is a rare disease.So this paper aims to enhance the doctors’awareness of GIST during clinical practice.

关键词： Heterotopic pancreas Diagnosis Treatment

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Contactin-associated protein-like 2(CNTNAP2)mutations impair the essentialα-secretase cleavages,leading to autism-like phenotypes

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Signal Transduction and Targeted Therapy 2024年第4期9卷 1625-1636页

作者： Qing Zhang Mengen Xing Zhengkai Bao Lu Xu Yang Bai Wanqi Chen Wenhao Pan Fang Cai Qunxian Wang shipeng Guo Jing Zhang Zhe Wang Yili Wu Yun Zhang Jia-Da Li Weihong song Oujiang Laboratory(Zhejiang Lab for Regenerative Medicine Vision and Brain Health)Zhejiang Key Laboratory of Alzheimer's DiseaseZhejiang Provincial Clinical Research Center for Mental DisordersSchool of Mental Health and Wenzhou Kangning HospitalThe Second Affiliated Hospital and Yuying Children's HospitalInstitute of AgingWenzhou Medical UniversityWenzhouZhejiang 325035China Townsend Family Laboratories Department of PsychiatryBrain Research CenterThe University of British Columbia2255 Wesbrook MallVancouverBC V6T 1Z3Canada Chongqing Key Laboratory of Translational Medical Research in Cognitive Development and Learning and Memory Disorders Ministry of Education Key Laboratory of Child Development and DisordersChildren's Hospital of Chongqing Medical UniversityChongqing 400014China Center for Medical Genetics Hunan Key Laboratory of Animal Models for Human DiseasesHunan Key Laboratory of Medical GeneticsHunan International Scientific and Technological Cooperation Base of Animal Models for Human DiseasesSchool of Life SciencesCentral South UniversityChangsha 410078 HunanChina The National Clinical Research Center for Geriatric Disease Xuanwu HospitalCapital Medical UniversityBeijing 100053Chin

Mutations in the Contactin-associated protein-like 2(CNTNAP2)gene are associated with autism spectrum disorder(ASD),and ectodomain shedding of the CNTNAP2 protein plays a role in its function.However,key enzymes involved in the C-terminal cleavage of CNTNAP2 remain largely unknown,and the effect of ASD-associated mutations on this process and its role in ASD pathogenesis remain elusive.In this report we showed that CNTNAP2 undergoes sequential cleavages by furin,ADAM10/17-dependent a-secretase and presenilindependent y-secretase.We identified that the cleavage sites of ADAM10 and ADAM17 in CNTNAP2 locate at its C-terminal residue I79 and L96,and the main a-cleavage product C79 by ADAM10 is required for the subsequent y-secretase cleavage to generate CNTNAP2 intracellular domain(CICD).ASD-associated CNTNAP2 mutations impair the a-cleavage to generate C79,and the inhibition leads to ASDIlike repetitive and social behavior abnormalties in the Cntnap2l1254T knock-in mice.Finaly,exogenous expression of 79 improves autism-ike phenotypes in the Cntnap2^(11254T) knock-in and Cntnap2^(-/-)knockout mice.This data demonstrates that the a-secretase is essential for CNTNAP2 processing and its function.Our study indicates that inhibition of the cleavage by pathogenic mutations underlies ASD pathogenesis,and upregulation of its C-terminal fragments could have therapeutical potentials for ASD treatment.

关键词： NAP2 cleavage subsequent

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战时机场道面抢修机械配置与抢修策略研究

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兵器装备工程学报 2022年第S2期43卷 105-109页

作者：侯永乐李建阳宋世鹏宁宁卢振宇航天工程大学士官学校北京102249

针对弹坑和坑槽的特点,估算修复工程量,提出一种抢修机械选型配置的方法,以施工机械工作效率和抢修工序特点为基础,分别对弹坑和坑槽的毁伤进行抢修机械配置。根据反跑道炸弹和子母弹的攻击特点,分析了弹坑与坑槽的分布情况,研究了弹坑... 详细信息

针对弹坑和坑槽的特点,估算修复工程量,提出一种抢修机械选型配置的方法,以施工机械工作效率和抢修工序特点为基础,分别对弹坑和坑槽的毁伤进行抢修机械配置。根据反跑道炸弹和子母弹的攻击特点,分析了弹坑与坑槽的分布情况,研究了弹坑与坑槽的优先抢修策略,可为应急抢修提供参考。

关键词：机场道面工作效率机械选型最小起降带抢修策略

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气囊排气口开启控制方式试验研究

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振动与冲击 2019年第13期38卷 202-207,230页

作者：李建阳王红岩宋世鹏洪煌杰航天工程大学士官学校北京102249 装甲兵工程学院机械工程系北京100072 工程兵科研一所江苏无锡214035

排气式气囊的排气口开启控制方式一般可以分为压力控制和加速度控制等两种。为研究排气口开启控制方式对气囊缓冲特性的影响,设计了两种排气控制式气囊,建立了回收载荷-气囊系统室内跌落试验平台,并对两种排气控制方式气囊进行跌落试验... 详细信息

排气式气囊的排气口开启控制方式一般可以分为压力控制和加速度控制等两种。为研究排气口开启控制方式对气囊缓冲特性的影响,设计了两种排气控制式气囊,建立了回收载荷-气囊系统室内跌落试验平台,并对两种排气控制方式气囊进行跌落试验。试验结果表明,设计的加速度开关工作可靠,加速度控制式气囊实现了两侧排气口同时打开;在带倾角跌落时,加速度控制式气囊的着陆稳定性较好;随着加速度控制式气囊加速度开关阈值的增大,气囊排气口开启时机越晚,排气口开启之前气囊吸收更多的能量,导致气囊内压和冲击加速度增大。

关键词：排气式气囊排气口开启控制试验研究

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四川盆地开江—梁平海槽周缘长兴组—飞仙关组气源差异及龙潭组煤成气有利勘探方向

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天然气地球科学 2024年第5期35卷 799-809页

作者：黄士鹏赵振宇艾悦姜华田兴旺江青春马德波宋微宋海敬中国石油勘探开发研究院北京100083 中国石油西南油气田分公司四川成都610041

基于天然气组分、碳氢同位素、储层沥青、烃源岩条件和源储组合分析,明确了四川盆地开江—梁平海槽两侧长兴组—飞仙关组天然气的来源及其差异,并指出了龙潭组煤成气的有利勘探方向,取得如下认识:(1)长兴组—飞仙关组天然气主体上以烷... 详细信息

基于天然气组分、碳氢同位素、储层沥青、烃源岩条件和源储组合分析,明确了四川盆地开江—梁平海槽两侧长兴组—飞仙关组天然气的来源及其差异,并指出了龙潭组煤成气的有利勘探方向,取得如下认识:(1)长兴组—飞仙关组天然气主体上以烷烃气为主,均为典型干气;(2)海槽东侧长兴组—飞仙关组甲、乙烷碳同位素组成明显轻于海槽西侧,西侧的龙岗气田乙烷碳同位素组成要重于元坝气田,而甲烷氢同位素组成则要比元坝气田偏轻;(3)东岳寨气田、普光气田和元坝气田天然气主要来源于吴家坪组II_(1)—I型腐泥型有机质;龙岗气田则是煤成气和油型气的混合气,煤成气的比例稍高,来源于吴家坪组II_(1)—II_(2)型混合型有机质;(4)龙潭组内部可形成煤岩气、致密砂岩气和页岩气等多类型气藏。遂宁—泸州、阆中—广安—涪陵一带分别是煤岩气和海—陆过渡相页岩气勘探的有利区带;遂宁—合川、广安—南充一带长兴组礁滩发育区也是煤成气勘探的有利勘探区带。

关键词：长兴组—飞仙关组天然气成因来源吴家坪组龙潭组煤成气有利勘探方向

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基于集成学习方法的中国近地面臭氧浓度时空分布

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遥感学报 2023年第8期27卷 1792-1806页

作者：宋世鹏范萌陶金花陈三明顾坚斌韩宗甫梁晓霞陆晓艳王甜甜张莹无桂林理工大学地球科学学院桂林541000 中国科学院空天信息创新研究院遥感科学国家重点实验室北京100101 中国科学院大学北京100049 首都师范大学资源环境与旅游学院北京100089 广西壮族自治区生态环境监测中心南宁530028 江苏省环境监测中心南京210019

自2013年大气污染防治行动以来,PM_(2.5)、PM_(10)、SO_(2)、NO_(2)等空气污染物浓度都有不同程度下降,但臭氧污染仍有上升趋势,臭氧污染已成为制约中国空气质量持续改善的关键问题。地基站点可以提供空间上特定点的臭氧浓度,但无法获... 详细信息

自2013年大气污染防治行动以来,PM_(2.5)、PM_(10)、SO_(2)、NO_(2)等空气污染物浓度都有不同程度下降,但臭氧污染仍有上升趋势,臭氧污染已成为制约中国空气质量持续改善的关键问题。地基站点可以提供空间上特定点的臭氧浓度,但无法获得近地面臭氧连续的空间分布。由于臭氧大量分布于平流层,遥感卫星反演的臭氧柱浓度产品仅能反映整层臭氧柱浓度,但整层臭氧柱浓度与近地面浓度无明显相关性,因而无法体现近地面臭氧浓度。本文综合地基监测数据、再分析资料、卫星产品,采用不同的模型方法,得到近地面臭氧浓度的时空分布,结果表明集成学习方法可以准确估算近地面臭氧在空间上的分布状况和在时间上的变化趋势。本文对比了梯度提升回归树(GBRT)、极端随机树(ERT)、极端梯度提升器(XGBoost)3种不同的集成学习方法在近地面臭氧污染估算的效果表现,3种集成学习方法在2019年—2020两年的十折交叉验证R^(2)都在0.89以上,极端梯度提升器(XGBoost)方法在RMSE、MAE指标上有最好的表现,2019年—2020年两年的平均RMSE、MAE分别为15.77μg/m^(3)、10.53μg/m^(3),但基于极端随机树(ERT)方法获得的近地面臭氧空间分布更加连续自然。因此最终选择极端随机树(ERT)方法估算得到中国近地面臭氧浓度数据集,并在此基础上进行时空分析。由于中国政府实施积极的减排措施的及疫情影响,臭氧浓度多年来的上升趋势得到了逆转,2020年臭氧年均值为107.41±18.6μg/m^(3),较去年平均值109.26±19.71μg/m^(3),有所减少。时间上,每年的5—9月气温较高,光化学反应剧烈,因而臭氧高污染事件频繁发生。空间上,京津冀地区、长三角地区、珠三角地区、成渝地区等城市群显著高于周围其他区域,是臭氧污染防治的重点区域。

关键词：遥感近地面臭氧集成学习极端随机树梯度回归提升树极端梯度提升器 TROPOMI 新冠疫情

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新工科内涵范式下的ESP课程体系构建

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宿州教育学院学报 2021年第4期24卷 81-84页

作者：宋仕鹏杨成湖北汽车工业学院外国语学院湖北十堰442002

为满足"新工科"背景下工程人才培养需求,首先明确了"新"素养、"新"结构和"新"方法等新工科内涵,以及ESP课程培养学生语言能力、人文价值、学科素养和工具理性的定位。在校本实践的基础上提出了ESP课程体系构建思路:通过模块搭建实现"工... 详细信息

为满足"新工科"背景下工程人才培养需求,首先明确了"新"素养、"新"结构和"新"方法等新工科内涵,以及ESP课程培养学生语言能力、人文价值、学科素养和工具理性的定位。在校本实践的基础上提出了ESP课程体系构建思路:通过模块搭建实现"工具性"与"人文性"统一;通过阶梯循序课程体系实现其与核心素养的统一;通过评估方式和主体的更替实现其与多维教学目标的统一。

关键词：新工科 ESP课程素养理工院校

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液压挖掘机功率损失分析及节能控制技术研究

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机床与液压 2008年第11期36卷 80-81页

作者：宋世鹏朱新云赵磊装备指挥技术学院士官系北京102249

分析了液压挖掘机功率损失的五种主要形式,并根据功率损失的形式,提出了相应的节能控制技术,为提高挖掘机液压系统的工作效率提供了参考依据。

关键词：液压功率损失节能技术压力流量

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