检索结果-南通市图书馆

The advancements,challenges,and future implications of the CRISPR/Cas9 system in swine research

维普期刊数据库评论

在线全文

维普期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

Journal of Genetics and Genomics 2021年第5期48卷 347-360页

作者： Jinfu Zhang Emmanuel M.Khazalwa Hussein M.Abkallo Yuan Zhou Xiongwei Nie Jinxue Ruan Changzhi Zhao Jieru Wang Jing Xu Xinyun Li Shuhong Zhao Erwei Zuo Lucilla Steinaa shengsong xie Key Laboratory of Agricultural Animal Genetics Breeding and Reproduction of Ministry of Education&Key Lab of Swine Genetics and Breeding of Ministry of Agriculture and Rural AffairsHuazhong Agricultural UniversityWuhan 430070PR China Animal and Human Health Program BiosciencesInternational Livestock Research Institute(ILRI)P.O.Box 30709Nairobi 00100Kenya Key Laboratory of Pig Molecular Quantitative Genetics of Anhui Academy of Agricultural Sciences Livestock and Poultry Epidemic Diseases Research Center of Anhui ProvinceAnhui Provincial Key Laboratory of Livestock and Poultry Product Safety EngineeringInstitute of Animal Husbandry and Veterinary MedicineAnhui Academy of Agricultural SciencesHefei 230031PR China The Cooperative Innovation Center for Sustainable Pig Production Huazhong Agricultural UniversityWuhan 430070PR China sLingnan Guangdong Laboratory of Modern Agriculture Genome Analysis Laboratory of the Ministry of AgricultureAgricultural Genomics Institute at ShenzhenChinese Academy of Agricultural SciencesShenzhen 518124PR China

Clustered regularly interspaced short palindromic repeats(CRISPR)/CRISPR-associated protein 9(CRISPR/Cas9)genome editing technology has dramatically influenced swine research by enabling the production of high-quality disease-resistant pig breeds,thus improving *** addition,CRISPR/Cas9 has been used extensively in pigs as one of the tools in biomedical *** this review,we present the advancements of the CRISPR/Cas9 system in swine research,such as animal breeding,vaccine development,xenotransplantation,and disease *** also highlight the current challenges and some potential applications of the CRISPR/Cas9 technologies.

关键词： CRISPR/Cas9 Swine Genome editing CRISPR screening Base editing

The functional study of non-coding elements by integrating of 3D and 1D genome information

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

The functional study of non-coding elements by integrating o...

乌克兰危机背景下美国缓和委内瑞拉石油工业制裁研判

2019中国化学会第十五届全国计算（机）化学学术会议

作者： Yunlong Wang Ruimin Wang 方亚平 shengsong xie Hubei Key Laboratory of Agricultural Bioinformatics College of Informatics Huazhong Agricultural University 华中农业大学 Key Laboratory of Agricultural Animal Genetics Huazhong Agricultural University

＜正＞Non-coding elements are important to the study of biology, Over 98% of the human genome are non-coding DNA including intros, noncoding RNA cis- and trans-regulatory elements, pseudo genes, repeats and transposons, et al. In history these non-coding DNA were termed as ‘junk-DNA’ and now they are known as genome’s‘dark matter’.

关键词：

来源： cnki会议评论

在线全文

cnki会议

学校读者我要写书评

暂无评论

当代石油石化 2023年第9期31卷 11-15页

作者：谢盛松中国石油化工集团有限公司综合管理部北京100728

近20年来,美国不断升级加码对委内瑞拉石油工业制裁,以长臂管辖方式干扰其国内政局、破坏国民经济。乌克兰危机发生以来,全球能源市场供给侧遭受剧烈冲击,国际油气价格高位震荡,美西方国家通货膨胀高企。受此影响,美国低调地放松了对委... 详细信息

近20年来,美国不断升级加码对委内瑞拉石油工业制裁,以长臂管辖方式干扰其国内政局、破坏国民经济。乌克兰危机发生以来,全球能源市场供给侧遭受剧烈冲击,国际油气价格高位震荡,美西方国家通货膨胀高企。受此影响,美国低调地放松了对委内瑞拉等产油国的制裁,考虑到美国内政阻力和委内瑞拉政局不确定性、短期内资源上产空间有限等因素,预计缓和制裁不会对国际原油供给侧带来实质性影响。宜对美国缓和制裁委内瑞拉情况保持跟踪,前瞻性研判全球原油供给侧格局重塑形势,提前部署应对措施,加强与相关各方的战略互动,多元化提升我国能源安全保障能力。

关键词：乌克兰危机委内瑞拉原油供给侧石油制裁

浙江省水上项目运动员心理坚韧性与教练员支持行为研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

体育成人教育学刊 2019年第2期35卷 82-86页

作者：谢圣松樊荣宁波市水上运动学校浙江宁波315020 中国地质大学(武汉)体育部湖北武汉430074 华中师范大学体育学院湖北武汉430079

分析了浙江省水上项目运动员心理坚韧性、教练员支持行为现状,以及两者之间的相关关系。采用心理坚韧性量表(MTI)以及人际行为问卷(IBQ)对87名水上项目运动员进行调查,结果发现:运动员心理坚韧性与教练员支持行为在性别、年龄、学历、... 详细信息

分析了浙江省水上项目运动员心理坚韧性、教练员支持行为现状,以及两者之间的相关关系。采用心理坚韧性量表(MTI)以及人际行为问卷(IBQ)对87名水上项目运动员进行调查,结果发现:运动员心理坚韧性与教练员支持行为在性别、年龄、学历、运动等级上存在差异,教练员支持行为各维度与运动员心理坚韧性显著相关。提出了提高运动员心理坚韧性的策略:就教练员而言,应建立有效的教练员-运动员关系模式;给予运动员选择的权利与自由;创设有挑战性的训练环境;实施有针对性的执教行为。就运动员而言,需从容应对训练和比赛中的逆境和挫折,总结经验,提高自身的心理坚韧性。

关键词：运动员水上项目心理坚韧性教练员支持行为

CRISPR/Cas9系统中sgRNA设计与脱靶效应评估

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

遗传 2015年第11期37卷 1125-1136页

作者：谢胜松张懿张利生李广磊赵长志倪攀赵书红华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室武汉430070 中国人民解放军第161医院妇产科武汉430010

基于CRISPR/Cas9系统介导的第三代基因组编辑技术,已成功应用于动物、植物和微生物等诸多物种的基因组改造。如何提高CRISPR/Cas9技术的基因组编辑效率和最大限度降低脱靶风险一直是本领域的研究热点,而使用高效且特异的sg RNA(Small gu... 详细信息

基于CRISPR/Cas9系统介导的第三代基因组编辑技术,已成功应用于动物、植物和微生物等诸多物种的基因组改造。如何提高CRISPR/Cas9技术的基因组编辑效率和最大限度降低脱靶风险一直是本领域的研究热点,而使用高效且特异的sg RNA(Small guide RNA)是基因组改造成功的关键性因素之一。目前,已有多款针对CRISPR/Cas9技术的sg RNA设计和/或脱靶效应评估软件,但不同的软件各有优缺点。本文重点对16款sg RNA设计和脱靶效应评估在线和单机版软件的特点进行了阐述,通过制定38项评估指标对不同软件进行了比较分析,最后对11种用于检测基因组编辑效率和脱靶的实验方法,以及如何筛选高效且特异的sg RNA进行了归纳总结。

关键词： CRISPR/Cas9系统基因组编辑 sgRNA 脱靶效应

sgRNAcas9软件图形用户界面开发及应用

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

遗传 2015年第10期37卷 1061-1072页

作者：赵长志张懿李广磊陈济良李京津任瑞敏倪攀赵书红谢胜松华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室武汉430070 华中农业大学动物医学院动物生理生化教研室武汉430070 中国人民解放军第161医院妇产科武汉430010

CRISPR/Cas9系统介导的基因组编辑技术是新一代功能强大的基因修饰技术。然而，脱靶效应（Off-target effects）是目前CRISPR/Cas9技术面临的最大问题。因此，设计脱靶风险低的sgRNA（single guide RNA）就成为关键。sgRNAcas9是一款专... 详细信息

CRISPR/Cas9系统介导的基因组编辑技术是新一代功能强大的基因修饰技术。然而，脱靶效应（Off-target effects）是目前CRISPR/Cas9技术面临的最大问题。因此，设计脱靶风险低的sgRNA（single guide RNA）就成为关键。sgRNAcas9是一款专门用于sgRNA设计和评估脱靶效应的软件包。针对其核心运行程序，我们利用Java程序语言开发了其图形用户界面。此外，依据脱靶位点碱基数和 sgRNA 种子序列（seed sequences）的特异性，通过设置不同的风险等级对sgRNA的脱靶效应进行评估。随后，利用此软件设计了34124条靶向人、小鼠、大鼠、猪和鸡中共4691个microRNA（miRNA）前体的sgRNAs。此外，随机挑选了一个靶向人miR-206前体的sgRNA进行脱靶效应评估和验证。结果发现，sgRNAcas9软件人机交互界面友好，大多数miRNA前体可通过该软件寻找到 sgRNA，且他们的 GC%含量范围集中于40%~-60%。利用 sgRNAcas9软件设计的靶向 miR-206的 sgRNA，其基因组编辑活性和脱靶位点可被实验验证。本研究表明 sgRNAcas9图形用户界面软件能针对任意物种设计特异性的sgRNA，其可在BiooTools（http：//***/）网站下载。

关键词： CRISPR/Cas9 sgRNAcas9软件基因组编辑计算机辅助设计

恩施黑猪基因组群体遗传学参数的估计与选择信号研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

畜牧兽医学报 2019年第3期50卷 485-494页

作者：吴林慧孙琦王荔茹张凯丽谢胜松李新云赵书红马云龙华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室武汉430070

旨在调查恩施黑猪基因组群体遗传学参数与选择信号。本研究利用Porcine 80K SNP芯片,通过计算亲缘系数、近交系数、连锁不平衡程度与有效群体大小等群体遗传学层面的参数评估恩施黑猪种群结构关系,运用CLR和iHS方法检测恩施黑猪基因组... 详细信息

旨在调查恩施黑猪基因组群体遗传学参数与选择信号。本研究利用Porcine 80K SNP芯片,通过计算亲缘系数、近交系数、连锁不平衡程度与有效群体大小等群体遗传学层面的参数评估恩施黑猪种群结构关系,运用CLR和iHS方法检测恩施黑猪基因组选择信号,并通过生物信息学分析揭示其潜在受选择基因。亲缘系数计算发现,咸丰县恩施黑猪个体间平均亲缘系数为0.12;近交系数计算表明, 16%的样本近交系数大于0.125,存在明显近交累积。此外,本研究构建了恩施黑猪全基因组连锁不平衡图谱;利用连锁不平衡信息,恩施黑猪估计历史有效群体大小呈现逐代下降趋势,其中5世代前有效群体大小约为25头。基于CLR方法共检测到126个显著选择信号候选区域,总长约为51.6 Mb,占基因组总长的2.1%。利用iHS方法,共发现248个显著选择信号候选区域,长度约为78.78 Mb,约占基因组总长的3.2%。富集分析表明,与选择信号区域重叠的LPAR2、NDUFA13、MEF2B、AHR基因分别与胴体长度(滴水损失)、精子形成、骨骼肌分化和总产仔数相关。研究表明,现存恩施黑猪群体血统较窄,近交累积严重,有效群体大小较小,并呈现继续缩小的趋势。选择信号分析揭示的一系列潜在受选择基因能够为未来恩施黑猪的遗传改良提供一定的参考依据。

关键词：恩施黑猪亲缘系数近交系数连锁不平衡有效群体大小选择信号

靶向miRNA前体不同类型sgRNA的丰度及特异性评估

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

遗传 2018年第7期40卷 567-577页

作者：刘海龙谌阳高杨周玲韩晓松赵长志杨高娟陈毅龙杨慧谢胜松华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室武汉430070 华中农业大学动物医学院基础兽医系武汉430070 华中农业大学生猪健康养殖协同创新中心武汉430070

CRISPR/Cas技术能高效进行基因组定点编辑,但不同细菌来源或人工改造的Cas9以及Cpf1等核酸酶识别的PAM(protospacer adjacent motif)有差异,因此不同的基因编辑核酸酶可能采用不同类型的sgRNAs(small guide RNAs)。Micro RNAs(miRNAs)... 详细信息

CRISPR/Cas技术能高效进行基因组定点编辑,但不同细菌来源或人工改造的Cas9以及Cpf1等核酸酶识别的PAM(protospacer adjacent motif)有差异,因此不同的基因编辑核酸酶可能采用不同类型的sgRNAs(small guide RNAs)。Micro RNAs(miRNAs)是一类调控性的小分子非编码RNAs,为了研究miRNA前体中是否可能存在特异性高的sgRNAs靶点,本文利用本课题组前期开发的生物信息学软件CRISPR-offinder,对靶向28 645条miRNA前体的11种不同类型sgRNA的丰度及特异性进行了分析,并利用CRISPR/Cas9慢病毒技术构建了猪miR-302/367基因簇敲除细胞系,对构建的猪miRNA敲除细胞系的效率进行了检测。结果表明,每个miRNA前体中平均存在约8种不同类型sgRNA的靶点;通过评估靶向猪miRNA前体sgRNA的脱靶效应,发现其中特异性高的sgRNA仅占18.2%;通过CRISPR/Cas9慢病毒技术成功构建了猪miR-302/367基因簇敲除细胞系,发现通过该技术构建miRNA敲除细胞系的效率为40%。本研究为利用CRISPR/Cas技术靶向敲除miRNA提供了重要资源。

关键词：猪 miRNA CRISPR/Cas9 sgRNA 敲除

CRISPR/Cas9技术在分子生物学创新性实验教学中的应用

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

生命的化学 2016年第1期36卷 117-125页

作者：谢胜松刘向东曾翠平马云龙王海燕华中农业大学动物医学院动物生理生化教研室武汉430070 华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室武汉430070 华中农业大学信息学院武汉430070

实验教学是高校分子生物学专业人才培养过程中不可或缺的关键环节,开发综合性和设计性实验项目可提高分子生物学实验教学的质量。CRISPR/Cas9是近年快速发展起来的基因组编辑技术,目前已成功应用于诸多物种,包括猪、兔和农作物等。以CRI... 详细信息

实验教学是高校分子生物学专业人才培养过程中不可或缺的关键环节,开发综合性和设计性实验项目可提高分子生物学实验教学的质量。CRISPR/Cas9是近年快速发展起来的基因组编辑技术,目前已成功应用于诸多物种,包括猪、兔和农作物等。以CRISPR/Cas9基因组编辑技术为核心,本实验室开设了一门名为"基因组定点编辑技术在动植物中的应用"创新性实验教学课程。本文详细阐述了实施该课程的教学目标、重点与难点、实验原理、实验步骤及结果等。实践表明,此实验教学项目可巧妙地将生物化学、分子细胞生物学、基因工程技术、生物信息学等多学科知识点有机整合。采用此策略,不仅可巩固与加强学生从分子生物学理论课所学的基础知识,同时有利于提高其综合实验设计能力与培养创新精神。该创新性实验课程内容难度适中,包含有验证性和探索性实验,可在开设分子生物学专业的高校推广与试行。

关键词：教学改革 CRISPR/Cas9技术分子生物学创新性实验教学