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Identification of novel small-molecule inhibitors of SARS-CoV-2 by chemical genetics

Acta Pharmaceutica Sinica B 2024年第9期14卷 4028-4044页

作者： Chris Chun-Yiu Chan Qian Guo Jasper Fuk-Woo Chan Kaiming Tang Jian-Piao Cai Kenn Ka-Heng Chik Yixin Huang mei Dai Bo Qin Chon Phin Ong Allen Wing-Ho Chu Wan-Mui Chan Jonathan Daniel Ip Lei Wen Jessica Oi-Ling Tsang Tong-Yun Wang Yubin Xie Zhenzhi Qin Jianli Cao Zi-Wei Ye Hin Chu Kelvin Kai-Wang To Xing-Yi Ge tao Ni Dong-Yan Jin sheng Cui Kwok-Yung Yuen Shuofeng Yuan State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases Carol Yu Centre for InfectionDepartment of MicrobiologySchool of Clinical MedicineLi Ka Shing Faculty of Medicinethe University of Hong KongPokfulamHong Kong SAR 999077China Department of Infectious Diseases and Microbiology the University of Hong Kong-Shenzhen HospitalShenzhen 518000China Centre for Virology Vaccinology and TherapeuticsHong Kong Science and Technology ParkHong Kong SAR 999077China Academician Workstation of Hainan Province Hainan Medical University-the University of Hong Kong Joint Laboratory of Tropical Infectious DiseasesHaikou 571100China School of Biomedical Sciences Li Ka Shing Faculty of Medicinethe University of Hong KongPokfulamHong Kong SAR 999077China NHC Key Laboratory of Systems Biology of Pathogens Institute of Pathogen Biology Chinese Academy of Medical Sciences&Peking Union Medical CollegeBeijing 100730China College of Biology Hunan Provincial Key Laboratory of Medical VirologyHunan UniversityChangsha 410082China

There are only eight approved small molecule antiviral drugs for treating *** them,four are nucleotide analogues(remdesivir,JT001,molnupiravir,and azvudine),while the other four are protease inhibitors(nirmatrelvir,ensitrelvir,leritrelvir,and simnotrelvir-ritonavir).Antiviral resistance,unfavourable drug‒drug interaction,and toxicity have been reported in previous *** there is a dearth of new treatment options for *** this work,a three-tier cell-based screening was employed to identify novel compounds with anti-SARS-CoV-2 *** compound,designated 172,demonstrated broad-spectrum antiviral activity against multiple human pathogenic coronaviruses and different SARS-CoV-2 variants of *** studies validated by reverse genetics showed that compound 172 inhibits the 3-chymotrypsin-like protease(3CLpro)by binding to an allosteric site and reduces 3CLpro dimerization.A drug synergistic checkerboard assay demonstrated that compound 172 can achieve drug synergy with nirmatrelvir in *** vivo studies confirmed the antiviral activity of compound 172 in both Golden Syrian Hamsters and K18 humanized ACE2 ***,this study identified an alternative druggable site on the SARS-CoV-23CLpro,proposed a potential combination therapy with nirmatrelvir to reduce the risk of antiviral resistance and shed light on the development of allosteric protease inhibitors for treating a range of coronavirus diseases.

关键词： SARS-CoV-2 High throughput screening Broad-spectrum antiviral treatment 3CLpro inhibitor Allosteric-site inhibitor Animal models Chemical genetics Reverse genetics

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D^(+)→π^(+)v■decay process within the QCDSR approach

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Chinese Physics C 2024年第6期48卷 69-81页

作者：陈宇付海冰钟涛吴胜波黄冬 Department of Physics Guizhou Minzu UniversityGuiyang 550025China Center of Experimental Training Guiyang Institute of Information Science and TechnologyGuiyang 550025China

In this paper,we investigate the charmed meson rare decay process D^(+)→π^(+)v■using an approach based on QCD sum ***,the pion twist-2,3 distribution amplitude(DA)moments|μ,are calculated up to the tenth and fourth orders,respectively,in the QCD sum rules according to the background field *** constructing the light-cone harmonic oscillator model for the pion twist-2,3 D As,we obtain their behaviors by matching the calculatedξ-***,the D→πtransition form factors(TFFs)are calculated using an approach based on QCD light-cone sum *** vector form factor at the large recoil region is f_(+)^(D)→^(π)(0)=0.627_(-0.080)^(+0.120).Using the rapidly converging simplified series expansion of z(q^(2),t),we present the TFFs and corresponding angular coefficients in the whole squared momentum transfer physical *** on nonstandard neutrino interactions,the■^(0)→π^(+)e■_(e)decay can be related to the■^(0)→π^(+)e■_(e)decay ***,we first describe the semileptonic decay process■^(0)→π^(+)e■_(e),differential decay widths,and branching fraction with B(■^(0)→π^(+)e■_(e))=0.308_(-0.066)^(+0.155)×10^(2).The■^(0)→π^(+)e■_(e)differential/total predictions for forward-backward asymmetry,q^(2)-differential flat terms,and lepton polarization asymmetry are also *** prediction for the D^(+)→π^(+)v■branching fraction isB(D^(+)→π^(+)v■)=1.85_(-0.46)+^(0.93)×10^(-8).

关键词： transition form factors pion LCDAs flavour changing neutral current transition heavy meson semileptonic decays QCD sum rule

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强激光场对原子核α衰变的影响

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物理学报 2024年第6期73卷 159-165页

作者：张凯林韩胜贤岳生俊刘作业胡碧涛兰州大学核科学与技术学院兰州730000

为了探究强激光对原子核α衰变的影响,根据Gamow模型、双折叠模型、团簇模型理论,给出了一套求解原子核α衰变寿命的方法.计算了部分原子核α衰变的半衰期,与实验测量值符合较好,并进一步获取强激光作用下原子核α衰变半衰期的改变量.... 详细信息

为了探究强激光对原子核α衰变的影响,根据Gamow模型、双折叠模型、团簇模型理论,给出了一套求解原子核α衰变寿命的方法.计算了部分原子核α衰变的半衰期,与实验测量值符合较好,并进一步获取强激光作用下原子核α衰变半衰期的改变量.结果表明,当强激光的功率密度达到10^(26)W/cm^(2)时,超强激光可以减少部分原子核的半衰期约0.1%,有效地影响原子核的α衰变过程.同时,还理论计算了α衰变半衰期随着原子核自身参数与激光功率密度的变化关系,讨论相关参数对于原子核α衰变的影响.

关键词：超强激光 α衰变半衰期

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广东省智慧高速公路费用指标编制研究

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公路 2024年第6期69卷 221-227页

作者：肖梅峰石陶广东省交通运输工程造价事务中心广州市510101

根据《广东省智慧高速公路工程费用指标》编制与研究过程和成果,介绍智慧高速公路工程费用指标的编制特点、原则、技术路线、方法,为同行制定智慧高速公路计价标准及公路工程相关专业工程计价标准提供参考。

关键词：公路工程智慧高速公路造价分析费用指标编制研究

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混合动力汽车变速器噪声特性及优化控制研究

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机械设计与制造 2024年第10期 67-72,78页

作者：吴冬梅梁涛四川交通职业技术学院汽车工程系四川成都611000 西华大学汽车与交通学院四川成都610039

为了改善混合动力车辆加速过程中变速箱的噪声特性,研究了牵引力矩对混合动力变速器振动-声学响应的影响。首先建立了混合动力变速器系统动力学模型,通过数值计算研究了复合行星齿轮组的功率分流混合传动的振动声特性,估计了由行星齿轮... 详细信息

为了改善混合动力车辆加速过程中变速箱的噪声特性,研究了牵引力矩对混合动力变速器振动-声学响应的影响。首先建立了混合动力变速器系统动力学模型,通过数值计算研究了复合行星齿轮组的功率分流混合传动的振动声特性,估计了由行星齿轮、支承轴承、传动轴和齿轮箱壳体引起的声辐射功率的贡献率,通过系统模态振动方法分析了牵引电机的可控转矩对传动误差激励的影响。在此基础上提出了噪声优化控制策略,通过混合动力车辆的真实道路性能测试,行星齿轮的噪声显著降低,验证了所提噪声优化控制策略的有效性。

关键词：混合动力汽车功率分流振动噪声优化控制

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新时期大学生思想政治教育体系的构建路径探析

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湖北开放职业学院学报 2024年第19期37卷 111-112,115页

作者：陶梅江苏安全技术职业学院江苏徐州221004

本文分析了新时期做好大学生思想政治教育体系构建工作的重要性、原则,对高校思想政治教育工作中存在的问题进行了阐述。在此基础上,提出了充分发挥学生的主体地位,关注学生想法,在思政教育中渗透“责任”意识;深度改革思政教育内容及方... 详细信息

本文分析了新时期做好大学生思想政治教育体系构建工作的重要性、原则,对高校思想政治教育工作中存在的问题进行了阐述。在此基础上,提出了充分发挥学生的主体地位,关注学生想法,在思政教育中渗透“责任”意识;深度改革思政教育内容及方法,将教材案例与现实生活高度结合,增强感悟;系统化利用现代信息技术,结合社会热点新闻,正确解读思想政策;发扬民主精神,引导学生在“平等讨论”的过程中拓展思维格局等构建大学生思想政治教育体系的路径。

关键词：新时期大学生思想政治教育体系构建路径

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尊重黄河生命性提升黄河生命力:基于复杂系统管理思维

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环境科学研究 2024年第1期37卷 24-31页

作者：盛昭瀚陶莎曾恩钰常河南京大学工程管理学院江苏南京210008

黄河治理是一项复杂系统工程,深刻认识黄河流域的本质属性与形态特征,并依据其提出治理原则对于破解当前黄河治理新阶段治理目标与路径,实现黄河流域高水平治理与社会经济高质量发展具有重要意义.基于黄河生命性所引发的黄河治理的复杂... 详细信息

黄河治理是一项复杂系统工程,深刻认识黄河流域的本质属性与形态特征,并依据其提出治理原则对于破解当前黄河治理新阶段治理目标与路径,实现黄河流域高水平治理与社会经济高质量发展具有重要意义.基于黄河生命性所引发的黄河治理的复杂性认知,本文对有生命的黄河与受伤的黄河等黄河流域现象实体本质属性与形态特征进行了剖析,从有生命的黄河自然环境、有生命的黄河人类社会、有生命的黄河流域三方面阐述了黄河治理的生命性内涵,并进一步提出了黄河治理的尊重生命和平衡稳定思维原则以及共生治理实践原则.在所提原则的指导下,提出当前黄河治理的行动要点,主要包括三方面:遵循黄河生命性内在规律办事,重点发挥黄河自然恢复力,科学发掘黄河生命自然价值.本文强调黄河治理需尊重黄河生命性,提升黄河生命力的重要性,为黄河复杂系统治理提供决策参考.

关键词：有生命的黄河复杂系统管理思维原则治理原则

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Haplotype-resolved T2T genome assemblies and pangenome graph of pear reveal diverse patterns of allele-specific expression and the genomic basis of fruit quality traits

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Plant Communications 2024年第10期5卷 100-120页

作者： Qionghou Li Xin Qiao Lanqing Li Chao Gu Hao Yin Kaijie Qi Zhihua Xie sheng Yang Qifeng Zhao Zewen Wang Yuhang Yang Jiahui Pan Hongxiang Li Jie Wang Chao Wang Loren H.Rieseberg Shaoling Zhang Shutian tao National Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement and Utilization Sanya Institute of Nanjing Agricultural UniversityCollege of HorticultureNanjing Agricultural UniversityNanjingJiangsu 210095China Pomology Institute Shanxi Agricultural UniversityTaiguShanxi 030801China Department of Botany and Biodiversity Research Centre University of British ColumbiaVancouverBCCanada

Hybrid crops often exhibit increased yield and greater resilience,yet the genomic mechanism(s)underlying hybrid vigor or heterosis remain unclear,hindering our ability to predict the expression of phenotypic traits in hybrid ***,we generated haplotype-resolved T2T genome assemblies of two pear hybrid varieties,‘Yuluxiang’(YLX)and‘Hongxiangsu’(HXS),which share the same maternal parent but differ in their paternal *** then used these assemblies to explore the genome-scale landscape of allele-specific expression(ASE)and create a pangenome graph for *** was observed for close to 6000 genes in both hybrid cultivars.A subset of ASE genes related to aspects of fruit quality such as sugars,organic acids,and cuticular wax were identified,suggesting their important contributions to ***,Ma1,a gene regulating fruit acidity,is absent in the paternal haplotypes of HXS and YLX.A pangenome graph was built based on our assemblies and seven published pear *** data for 139 cultivated pear genotypes(including 97 genotypes sequenced here)were subsequently aligned to the pangenome graph,revealing numerous structural variant hotspots and selective sweeps during pear diversifica*** predicted,the Ma1 allele was found to be absent in varieties with low organic acid content,and this association was functionally validated by Ma1 overexpression in pear fruit and ***,these results reveal the contributions of ASE to fruit-quality heterosis and provide a robust pangenome reference for high-resolution allele discovery and association mapping.

关键词： pear haplotype-resolved assembly allele-specific expression fruit quality traits pangenome graph

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基于神经网络的绕射波速度分析方法

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煤田地质与勘探 2024年第9期52卷 166-175页

作者：陶俊宏赵惊涛盛同杰中国矿业大学(北京)地球科学与测绘工程学院北京100083

【背景】在地震成像领域,精确的速度模型对于细致地刻画地下空间结构至关重要。尤其在煤矿开采中,小尺度地质结构如断层和陷落柱与开采安全事故密切相关,这些结构在地震记录中通常以绕射波的形式出现。【目的和方法】为了有效成像这些... 详细信息

【背景】在地震成像领域,精确的速度模型对于细致地刻画地下空间结构至关重要。尤其在煤矿开采中,小尺度地质结构如断层和陷落柱与开采安全事故密切相关,这些结构在地震记录中通常以绕射波的形式出现。【目的和方法】为了有效成像这些小尺度地质体,充分利用绕射波信息进行精细化速度建模显得尤为重要。基于此,提出了一种基于神经网络的绕射场速度分析方法。首先在共虚震源域分离绕射波,利用分离的绕射波道集生成绕射速度谱;其次,在偏移倾角域利用绕射波的拟线性特征生成绕射速度比值γ谱。最终,将传统的反射速度谱与两类绕射速度谱作为输入,基于卷积注意力神经网络进行绕射场智能速度建模。【结果和结论】数值模拟数据测试验证了绕射场速度分析网络能够提高对地层尖灭、岩溶陷落柱等地质体精细化速度建模的准确性,在成像剖面上可有效聚焦绕射波,实现中小尺度构造的精细刻画。对煤矿实际数据的应用进一步证明了该方法在速度建模的效率以及成像精度上均优于传统方法,更适用于复杂地质条件下的小尺度构造成像。

关键词：绕射波深度学习速度分析智能建模地震成像

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资产价格泡沫与金融稳定——基于QVAR-DY的实证研究

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金融论坛 2024年第5期 26-37页

作者：郭文伟罗胜涛广东财经大学金融学院广州510320

本文采用BSADF方法测度中国股市和房市的泡沫水平,并通过TVP-FAVAR模型构建中国的金融稳定状况指数,进而通过QVAR-DY模型分析股市泡沫和房市泡沫对金融稳定的异质性溢出效应。研究发现:第一,资产泡沫对金融稳定存在显著的溢出效应,且沪... 详细信息

本文采用BSADF方法测度中国股市和房市的泡沫水平,并通过TVP-FAVAR模型构建中国的金融稳定状况指数,进而通过QVAR-DY模型分析股市泡沫和房市泡沫对金融稳定的异质性溢出效应。研究发现:第一,资产泡沫对金融稳定存在显著的溢出效应,且沪市泡沫、深市泡沫和房市泡沫之间存在泡沫传染;第二,在低分位数下,股市泡沫对金融稳定的溢出效应要大于房市泡沫,其中沪市泡沫的负向冲击比深市泡沫更大;第三,在高分位数下,房市泡沫对金融稳定的溢出效应要大于股市泡沫。

关键词：资产泡沫金融稳定 BSADF TVP-FAVAR QVAR-DY

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