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Genetic diversity of subgenotype 2.1 isolates of classical swine fever virus

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Genetic diversity of subgenotype 2.1 isolates of classical s...

中国畜牧兽医学会兽医公共卫生学分会第五次学术研讨会

作者： Wenjie Gong Jianmin Wu Zongji Lu Li Zhang shaomin qin Fenglian Chen Zhicheng Peng qin Wang Ling Ma Anbin Bai Huancheng Guo Jishu Shi Changchun Tu Military Veterinary Institute Academy of Military Medical Sciences Department of Anatomy and Physiology College of Veterinary MedicineKansas State University Guangxi Veterinary Research Institute College of Life Science Foshan University College of Animal Science and Technology Jilin Agricultural University China Institute of Veterinary Drug Control National Classical Swine Fever Reference Laboratory Jiangsu Co-innovation Center for Prevention and Control of Important Animal Infectious Diseases and Zoonoses

As the causative agent of classical swine fever,the economically devastating swine disease worldwide,classical swine fever virus（CSFV） is currently classified into the 11 subgenotypes,of which subgenotype 2.1 is distributed worldwide and showing more genetic diversity than other *** to this report,subgenotype 2.1 was divided into three sub-subgenotypes（2.1a-2.1c）.To further analyze the genetic diversity of CSFV isolates in China,39 CSFV isolates collected between 2004-2012 in two Chinese provinces Guangxi and Guangdong were sequenced and subjected to phylogenetic analysis together with reference sequences retrieved from Gen *** analyses based on the 190-nt and/or 1119-nt full length E2 gene fragments showed that current CSFV subgenotype 2.1 virus isolates in the world could be divided into 10 sub-subgenotypes（2.1a-2.1j） and the 39 isolates collected in this study were grouped into 7 of them（2.1a-2.1c and 2.1g-2.1j）.Among the 10 sub-subgenotypes,2.1d-2.1j were newly ***-subgenotypes 2.1d isolates were circulated only in India,however the rest 9 sub-subgenotypes were from China with some of them closely related to isolates from European and neighboring Asian *** to the temporal and spatial distribution of CSFV subgenotype 2.1 isolates,the newly classified 10 sub-subgenotypes were further categorized into three groups:dominant sub-subgenotype,minor sub-subgenotype and silent sub-subgenotype,and each sub-subgenotype can be found only in certain geographical *** together,this study reveals the complex genetic diversity of CSFV subgenotype 2.1 and improves our understanding about the epidemiological trends of CSFV subgenotype 2.1 in the world,particularly in China.

关键词：

Full genome sequence of the first bluetongue virus serotype 21（BTV-21） isolated from China:evidence for genetic reassortment between BTV-21 and bluetongue virus serotype 16（BTV-16）

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Full genome sequence of the first bluetongue virus serotype ...

中国畜牧兽医学会兽医公共卫生学分会第六次学术研讨会

作者： shaomin qin Heng Yang Yixuan Zhang Zhanhong Li Jun Lin Lin Gao Defang Liao Yingying Cao Pengfei Ren Huachun Li Jianmin Wu Guangxi Key Laboratory of Veterinary Biotechnology Guangxi Veterinary Research Institute

蓝舌病（Bluetongue,BT）是由蓝舌病毒（bluetongue virus,BTV）引起反刍动物的一种非接触性虫媒病毒病。该病主要侵害绵羊,能导致绵羊出现严重的临床症状和死亡。蓝舌病毒是一种分节段的双链RNA病毒,其基因组由10个不同大小的片段组成...

蓝舌病（Bluetongue,BT）是由蓝舌病毒（bluetongue virus,BTV）引起反刍动物的一种非接触性虫媒病毒病。该病主要侵害绵羊,能导致绵羊出现严重的临床症状和死亡。蓝舌病毒是一种分节段的双链RNA病毒,其基因组由10个不同大小的片段组成,这种基因组结构使不同血清型的BTV野毒株和疫苗株在同时感染同一动物时容易发生基因重组现象。本研究于2015年,在广西的监控牛群中分离到一株BTV-21型（命名为5149E）,并进行了全基因组测序,这是在我国第一次分离并全基因测序了BTV-21型。序列分析显示,BTV分离株5149E的基因组片段6可能来源于一株日本的BTV-16型毒株,说明该分离株已经发生了基因重组。本研究结果为更进一步了解BTV的起源和流行病学提供了重要的数据支撑。

关键词：

Characterization of Akabane Virus from domestic bamboo rat,Southern China

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Characterization of Akabane Virus from domestic bamboo rat,S...

中国畜牧兽医学会动物传染病学分会第九次全国会员代表大会暨第十七次全国学术研讨会

作者：唐海波 Fenglian Chen Guibo Rao Anbin Bai Jiajia Jiang Yichao Du Pengfei Ren Jinfeng Liu shaomin qin Lei Yang Jianmin Wu Guangxi Veterinary Research Institute

To identify the causative agents in 3 large-scale outbreaks of encephalitis and death among fa rmed bamboo rats(Rhizomys pruinosus).The routine bacterial culture and identification were perfo *** were no significant pathogenic bacteria isolated from the brain,heart,liver,spleen,lu ng,or kidney of diseased bamboo *** PCR-based methods,we excluded the following as causative agent:pox virus,herpesvirus,adenovirus,lymphocytic choriomeningitis virus,rabies virus,and sendai ***,the homogenate from the diseased bamboo rats was subjected to v iral metagenomic analysis which revealed 48506 filtered viral reads annotated to Akabane virus(A KAV) with >75%nucleotide identity,suggesting the presence of AKAVs in bamboo *** nov el AKAV isolates were successfully isolated and *** the newly isolated AK AV isolate was used to demonstrate that it can reproduce the severe encephalitic and pneumonic d isease in bamboo rats and *** findings add to the better understanding of AKAV epidemiol ogy and to the prevention and control of Akabane diseases in China.

关键词： Akabane virus Bamboo rat

抗人红细胞单链抗体(ScFv)-伪狂犬病毒(PRV)gE蛋白双功能融合蛋白的构建及生物学活性检测

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农业生物技术学报 2010年第3期18卷 562-566页

作者：廖文军覃绍敏吴健敏王仰杰白安斌覃建飞广西大学动物科学技术学院广西兽医研究所

利用特异性引物从重组质粒pMD-2E8ScFv和pMD-gE中PCR扩增出2E8基因(抗人红细胞H抗原单链抗体基因)和kgE基因(PRVgE主要抗原编码区),采用重叠延伸(SOE)PCR法拼接成融合的双功能分子2E8kgE,经BamHⅠ和EcoRⅠ双酶切,纯化后,克隆至BamHⅠ和E... 详细信息

利用特异性引物从重组质粒pMD-2E8ScFv和pMD-gE中PCR扩增出2E8基因(抗人红细胞H抗原单链抗体基因)和kgE基因(PRVgE主要抗原编码区),采用重叠延伸(SOE)PCR法拼接成融合的双功能分子2E8kgE,经BamHⅠ和EcoRⅠ双酶切,纯化后,克隆至BamHⅠ和EcoRⅠ双酶切的表达载体pET-Trx中,构建了原核表达载体pET-Trx-2E8kgE;将pET-Trx-2E8kgE转化至BL21plysS中,在IPTG诱导下表达具有双功能的融合蛋白,经过SDS-PAGE和Western-blot检测;结果表明,重组菌BL21plysS表达出约60.1kD的目的蛋白,与猪伪狂犬标准阳性血清发生特异性反应。红细胞凝集试验证实,2E8kgE融合蛋白既能够与人红细胞结合,又能够与PRV抗体反应,具有双功能特性。

关键词：猪伪狂犬病毒 gE基因抗人红细胞单链抗体原核表达

竹鼠肠道纤维素降解菌的分离鉴定及其产酶特性研究

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动物营养学报 2021年第7期33卷 4142-4152页

作者：曾文婷覃绍敏吴健敏梁小莉白安斌刘金凤陈凤莲秦树英马玲广西大学动物科学技术学院南宁530004 广西壮族自治区兽医研究所广西兽医生物技术重点实验室南宁530001 广西农业职业技术学院动物科学技术学院南宁530007

本试验旨在从竹鼠肠道内容物中分离筛选易培养、具有高纤维素酶活性的菌株。称取竹鼠肠道内容物1.0 g,以刚果红平板进行纤维素降解菌的初筛,再分别以羧甲基纤维素钠(CMC⁃Na)、微晶纤维素、D-水杨苷和滤纸为碳源,采用3,5-二硝基水杨酸(D... 详细信息

本试验旨在从竹鼠肠道内容物中分离筛选易培养、具有高纤维素酶活性的菌株。称取竹鼠肠道内容物1.0 g,以刚果红平板进行纤维素降解菌的初筛,再分别以羧甲基纤维素钠(CMC⁃Na)、微晶纤维素、D-水杨苷和滤纸为碳源,采用3,5-二硝基水杨酸(DNS)法测定菌株内切葡聚糖酶(Cen)、外切葡聚糖酶(Cex)、β-葡萄糖苷酶(BG)和滤纸酶(FPA)活性。采用生理生化试验和16S rDNA PCR方法进行菌株种属鉴定。结果显示:从竹鼠肠道内容物中分离获得4株产纤维素酶的需氧菌(GL⁃4、GL⁃5、GL⁃6和GL⁃8),其中GL⁃4的Cen和FPA活性最高,分别为49.32和25.13 U/mL;GL⁃8的Cex活性最高,为30.59 U/mL;GL⁃5的BG活性最高,为35.08 U/mL。对纤维素酶总活性最高的GL⁃4进行了培养条件优化,其在37℃、pH 8.0条件下培养24 h时,FPA活性最高。对产纤维素酶活性较高的3株菌(GL⁃4、GL⁃5和GL⁃8)进行种属鉴定,显示3株菌均为枯草芽孢杆菌。综上可知,本试验从竹鼠肠道内容物中分离到3株需氧枯草芽孢杆菌,这3株菌均具有较高的产酶能力;对菌株GL⁃4进行培养条件优化,得出其产酶最适条件为发酵时间24 h、发酵培养基pH 8和发酵温度37℃,可作为高粗纤维含量非粮型饲料开发利用的候选菌株。

关键词：竹鼠肠道产纤维素酶需氧鉴定

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混行交通流下单交叉口车道布设和信号配时

交通科学与工程 2023年第5期39卷 139-148页

作者：蒋林锡吴伟秦少敏长沙理工大学交通运输工程学院湖南长沙410114 常德市路网监测与应急事务中心湖南常德415000

为提高道路交叉口在自动驾驶车辆和常规驾驶车辆混行交通流环境下的通行能力,在交叉口设置自动驾驶专用车道、常规驾驶专用车道以及混合驾驶车道,基于车道布设和信号配时,以交叉口通行能力最大化为目标,建立优化模型,并对其进行求解。... 详细信息

为提高道路交叉口在自动驾驶车辆和常规驾驶车辆混行交通流环境下的通行能力,在交叉口设置自动驾驶专用车道、常规驾驶专用车道以及混合驾驶车道,基于车道布设和信号配时,以交叉口通行能力最大化为目标,建立优化模型,并对其进行求解。研究结果表明:该模型通过设置相应的车道及信号配时,能有效地提高交叉口的通行能力。该研究还对交通流量中自动驾驶车辆所占比例、自动驾驶专用道的车头时距及常规驾驶专用道的车头时距进行了敏感度分析,这些结果也表明该模型能适用于多种不同的交通状况。该研究可为类似混行交通流下单交叉口的车道布设与信号配时提供参考。

关键词：自动驾驶车辆车道布设通行能力信号配时

通过抑制caspase-8活性提高PRRSV体外培养滴度的初步研究

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中国动物传染病学报 2024年第2期32卷 27-34页

作者：钟华刘金凤陈冰覃绍敏陈凤莲马玲林俊毛燕秦树英白安斌广西民族大学海洋与生物技术学院南宁530006 广西壮族自治区兽医研究所广西兽医生物技术重点实验室南宁530001

探讨通过凋亡抑制剂阻断PRRSV诱导的细胞凋亡来促进PRRSV体外复制,从而提高PRRSV体外培养滴度的可行性。本研究以PRRSV高致病毒株(HP-PRRSV)感染Marc-145细胞,并用三种凋亡抑制剂(Z-VAD-FMK、Z-IETD-FMK、Z-LEHDFMK)分别处理PRRSV感染细... 详细信息

探讨通过凋亡抑制剂阻断PRRSV诱导的细胞凋亡来促进PRRSV体外复制,从而提高PRRSV体外培养滴度的可行性。本研究以PRRSV高致病毒株(HP-PRRSV)感染Marc-145细胞,并用三种凋亡抑制剂(Z-VAD-FMK、Z-IETD-FMK、Z-LEHDFMK)分别处理PRRSV感染细胞,通过比较在不同的浓度、不同的作用时间处理下PRRSV培养滴度(TCID50)来筛选最佳抑制剂及其最佳使用浓度和作用时间。同时采用caspase-8活性蛋白酶检测试剂盒、实时荧光定量PCR(qRT-PCR)、流式细胞术等检测在最佳抑制剂作用下caspase-8活性、细胞凋亡及其通路相关因子表达情况。结果显示:z-IETD-FMK(caspases-8特异性抑制剂)为最佳抑制剂,10μmol/L为最佳使用浓度,PRRSV感染细胞48 h后加入10μmol/L Z-IETD-FMK能最大限度提高PRRSV体外培养滴度。此外,PRRSV感染Marc-145细胞后,细胞caspase-8活性显著增加,且随着感染时间的延长,细胞凋亡率及促凋亡因子Bax均呈上升趋势,而抑凋亡因子Bcl-2表达水平却呈下降趋势;用抑制剂z-IETD-FMK处理后,细胞caspases-8活性下调,细胞凋亡率也下降,Bax表达量显著低于不加抑制处理的病毒感染组(P<0.01),与此相反Bcl-2的表达水平为升高趋势,显著高于不加抑制处理的病毒感染组(P<0.01)。说明,caspase-8特异性抑制剂能有效抑制PRRSV诱导的细胞凋亡。结果提示HPPRRSV感染可通过caspase-8途径诱导Marc-145细胞凋亡,从而抑制病毒的复制。使用caspase-8特异性抑制剂可有效抑制细胞凋亡,进而提高病毒体外培养滴度。

关键词： HP-PRRSV caspase 细胞凋亡活性检测

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发酵酸鱼中乳酸菌的鉴定及特性分析

中国酿造 2023年第3期42卷 95-100页

作者：韦珏刘金凤覃绍敏秦树英许力士林俊陈凤莲韦珊珊马玲陈童锦悦吴健敏广西壮族自治区兽医研究所广西兽医生物技术重点实验室广西南宁530001

该研究以分离自酸鱼发酵后期的乳酸菌菌株LP224为研究对象,采用形态学观察、生理生化试验和分子生物学技术对其进行菌种鉴定,采用K-B药敏纸片扩散法和聚合酶链式反应(PCR)法对其耐药性和抗性基因进行检测,并研究其生长特性及耐受性。结... 详细信息

该研究以分离自酸鱼发酵后期的乳酸菌菌株LP224为研究对象,采用形态学观察、生理生化试验和分子生物学技术对其进行菌种鉴定,采用K-B药敏纸片扩散法和聚合酶链式反应(PCR)法对其耐药性和抗性基因进行检测,并研究其生长特性及耐受性。结果表明,菌株LP224被鉴定为植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum),其对头孢曲松、链霉素、环丙沙星、磺胺异噁唑、万古霉素、林可霉素等6类15种抗生素耐药,基因组DNA检测出ermC和tetG2种抗性基因,而细菌质粒未检测到抗性基因,说明该菌株相对安全。菌株LP224经55℃水浴处理30 min后存活率为35.06%;p H2.5环境下存活率为52.60%;0.3%胆盐浓度下存活率为31.67%,说明该菌株具有较强的耐热、耐酸、耐胆盐能力。

关键词：植物乳杆菌分离鉴定耐药性耐酸耐胆盐酸鱼

产AmpC酶的猪源奇异变形杆菌分离鉴定及生物学特性分析

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畜牧与兽医 2023年第7期55卷 46-52页

作者：陈赫威马玲秦树英陈樱宋瑞鹏孙倩覃绍敏刘金凤陈凤莲吴健敏广西大学动物科学技术学院广西南宁530004 广西壮族自治区兽医研究所广西兽医生物技术重点实验室广西南宁530001 农业农村部中国(广西)-东盟跨境动物疫病防控重点实验室广西南宁530001

奇异变形杆菌(Proteus mirabilis)是一种可导致多种动物感染的条件致病菌,目前有关产AmpC酶的动物源奇异变形杆菌研究较少。为探究广西某猪场母猪流产、死胎的原因,从流产猪胎肝脏中分离到病原菌,对分离株进行纯化培养、染色镜检、生化... 详细信息

奇异变形杆菌(Proteus mirabilis)是一种可导致多种动物感染的条件致病菌,目前有关产AmpC酶的动物源奇异变形杆菌研究较少。为探究广西某猪场母猪流产、死胎的原因,从流产猪胎肝脏中分离到病原菌,对分离株进行纯化培养、染色镜检、生化试验和16S rRNA测序确定为奇异变形杆菌,命名为GX-Y9251株。对GX-Y9251株进行药敏试验、耐药基因检测、AmpC酶基因检测、毒力基因检测、小鼠致病性试验和生物膜半定量检测。药敏试验结果显示,该菌株对8种药物敏感,对17种抗生素耐药。GX-Y9251株存在多种耐药基因,且产AmpC酶,为blaDHA基因。GX-Y9251株存在6个毒力基因,其对小鼠的半数致死量(LD50)为5.4×107CFU;具有生物被膜形成能力,为中等黏附型(++)。研究结果为奇异变形杆菌感染的防治提供了理论依据。

关键词：奇异变形杆菌毒力基因耐药性 AmpC酶生物被膜