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A Hu sheep genome with the first ovine Y chromosome reveal introgression history after sheep domestication

Science China(Life Sciences) 2021年第7期64卷 1116-1130页

作者： Ran Li Peng Yang Ming Li Wenwen Fang Xiangpeng Yue Hojjat Asadollahpour Nanaei shangquan gan Duo Du Yudong Cai Xuelei Dai Qimeng Yang Chunna Cao Weidong Deng Sangang He Wenrong Li Runlin Ma Mingjun Liu Yu Jiang Key Laboratory ofAnimal Genetics Breeding and Reproduction of Shaanxi ProvinceCollege of Animal Science and TechnologyNorthwest A&F UniversityYangling 712100China State Key Laboratory of Grassland Agro-ecosystems Key Laboratory of Grassland Livestock Industry InnovationMinistry of Agriculture and Rural AffairsEngineering Research Center of Grassland IndustryMinistry of EducationCollege of Pastoral Agriculture Science and TechnologyLanzhou UniversityLanzhou 730020China State Key Laboratory of Sheep Genetic Improvement and Healthy Production Xinjiang Academy of Agricultural and Reclamation SciencesShihezi 832000China Faculty of Animal Science and Technology Yunan Agricultural UniversityKunming 650201China Key Laboratory of Genetics Breeding and Reproduction of Grass feeding Livestock Ministry of AgricultureAnimal Biotechnology Research InstituteXinjiang Academy of Animal ScienceUrumqi 830026China State Key Laboratory of Molecular Developmental Biology Institute of Genetics and Developmental BiologyChinese Academy of SciencesBeijing 100101China

The Y chromosome plays key roles in male fertility and reflects the evolutionary history of paternal ***,we present a de novo genome assembly of the Hu sheep with the first draft assembly of ovine Y chromosome(o MSY),using nanopore sequencing and Hi-C *** o MSY that we generated spans 10.6 Mb from which 775 Y-SNPs were identified by applying a large panel of whole genome sequences from worldwide sheep and wild Iranian *** major paternal lineages(HY1a,HY1b and HY2)were defined across domestic sheep,of which HY2 was newly ***,HY2 forms a monophyletic clade with the Iranian mouflons and is highly divergent from both HY1a and *** analysis of Y chromosomes,mitochondrial and nuclear genomes confirmed that HY2 and the maternal counterpart of lineage C represented a distinct wild mouflon population in Iran that diverge from the direct ancestor of domestic sheep,the wild mouflons in Southeastern *** results suggest that wild Iranian mouflons had introgressed into domestic sheep and thereby introduced this Iranian mouflon specific lineage carrying HY2 to both East Asian and Africa sheep populations.

关键词： Y chromosome sheep paternal lineage introgression de novo assembly

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葡萄籽提取物的生物学功能及其在畜禽生产中的应用

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动物营养学报 2024年第9期36卷 5441-5450页

作者：马健李涛林露甘尚权广东海洋大学滨海农业学院湛江524088

作为一种天然活性物质,葡萄籽提取物具有丰富的多酚类物质,主要包括原花青素、表儿茶素以及没食子酸等成分,具有抗氧化、增强免疫力、预防炎症和抗肿瘤等生物学功能。近年来,研究发现葡萄籽提取物可缓解动物生理应激,在调控动物营养物... 详细信息

作为一种天然活性物质,葡萄籽提取物具有丰富的多酚类物质,主要包括原花青素、表儿茶素以及没食子酸等成分,具有抗氧化、增强免疫力、预防炎症和抗肿瘤等生物学功能。近年来,研究发现葡萄籽提取物可缓解动物生理应激,在调控动物营养物质消化、调节机体代谢以及提高生长性能方面发挥重要作用。在绿色健康养殖的背景下,葡萄籽提取物在畜禽生产中的应用受到广泛关注。本文介绍了葡萄籽提取物的营养价值和生物学功能,归纳了葡萄籽提取物在畜禽养殖中的应用。

关键词：葡萄籽提取物抗氧化免疫力动物健康

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岩藻多糖的理化性质、生物学功能及其在畜禽生产中的应用

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动物营养学报 2023年第10期35卷 6129-6136页

作者：马健郭广振尹福泉甘尚权广东海洋大学滨海农业学院湛江524088

岩藻多糖主要来源于褐藻,是一类含有岩藻糖和硫酸基团的多糖,具有抗氧化、抗炎、抑菌、增强免疫力等作用。近年来研究发现,岩藻多糖可调控动物消化道微生物群落结构,促进其发育,在提高营养物质消化率及动物生产性能方面发挥着重要作用... 详细信息

岩藻多糖主要来源于褐藻,是一类含有岩藻糖和硫酸基团的多糖,具有抗氧化、抗炎、抑菌、增强免疫力等作用。近年来研究发现,岩藻多糖可调控动物消化道微生物群落结构,促进其发育,在提高营养物质消化率及动物生产性能方面发挥着重要作用。作为一种绿色安全无害的添加剂,岩藻多糖在畜禽生产中应用的研究越来越多。在查阅相关文献并结合本团队前期研究的基础上,本综述介绍了岩藻多糖的理化性质,归纳了岩藻多糖的生物学功能,并重点总结了岩藻多糖在畜禽生产中的应用,以期为进一步开发利用岩藻多糖提供参考。

关键词：岩藻多糖提取工艺肠道发育抗氧化生产性能

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Kisspeptins/GPR54神经内分泌系统对哺乳动物生殖活动的调控

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中国细胞生物学学报 2014年第8期36卷 1200-1206页

作者：张伟王世银甘尚权石国庆新疆农业职业技术学院昌吉831100 新疆农垦科学院畜牧兽医研究所石河子832000 石河子大学动物科技学院石河子832003

哺乳动物的生殖活动受到神经内分泌系统的精确调控。近年来的研究表明,KISS-1基因的表达产物Kisspeptins及其G蛋白偶联受体(G protein coupled receptor 54,GPR54)在这一调控网络中发挥着重要作用,与哺乳动物青春期启动、发情排卵及季... 详细信息

哺乳动物的生殖活动受到神经内分泌系统的精确调控。近年来的研究表明,KISS-1基因的表达产物Kisspeptins及其G蛋白偶联受体(G protein coupled receptor 54,GPR54)在这一调控网络中发挥着重要作用,与哺乳动物青春期启动、发情排卵及季节性繁殖等过程密切相关。该文就近年来Kisspeptins/GPR54系统对哺乳动物生殖活动调控的研究进展进行简述。

关键词： Kisspeptins GPR54 KISS-1 生殖调控

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绵羊CCNG1基因克隆及表达分析

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遗传 2015年第4期37卷 374-381页

作者：高磊沈敏甘尚权杨井泉张译元新疆农垦科学院畜牧兽医研究所石河子832000 新疆兵团绵羊繁育生物技术重点实验室石河子832000

细胞周期蛋白cyclin G1(CCNG1)是一个重要的细胞周期调控因子,参与哺乳动物颗粒细胞增殖、卵母细胞成熟等繁殖生物学过程,但其在绵羊中鲜有报道。为了研究CCNG1基因对绵羊发情调控以及季节性繁殖的影响,文章对绵羊CCNG1基因进行了克隆... 详细信息

细胞周期蛋白cyclin G1(CCNG1)是一个重要的细胞周期调控因子,参与哺乳动物颗粒细胞增殖、卵母细胞成熟等繁殖生物学过程,但其在绵羊中鲜有报道。为了研究CCNG1基因对绵羊发情调控以及季节性繁殖的影响,文章对绵羊CCNG1基因进行了克隆和组织表达谱分析,利用Real-time PCR对该基因在多浪羊(常年发情)与中国美利奴羊(季节性繁殖)发情周期不同阶段性腺轴组织的表达变化进行了实时检测。获得了绵羊CCNG1基因部分c DNA序列,其中编码区全长885 bp,编码294个氨基酸。CCNG1蛋白结构经预测存在多个磷酸化位点和蛋白激酶C磷酸化位点。CCNG1基因在所检测绵羊各组织中均有表达,但在卵巢与肾脏中为高丰度表达;CCNG1在不同绵羊品种发情周期不同阶段性腺轴组织的表达变化规律基本一致,卵巢、子宫、松果体、垂体均是在发情期达到峰值。但是在发情期和发情后期卵巢CCNG1的表达量存在显著的品种间差异(P<0.01)。研究结果表明,CCNG1可能通过参与卵泡的生长发育继而达到对绵羊发情和季节性繁殖的调控。

关键词：绵羊 CCNG1基因克隆表达发情周期 CCNG1

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绵羊Fsp27基因组织表达、多态性及其与不同绵羊品种尾脂沉积能力的关联性分析

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畜牧兽医学报 2020年第5期51卷 952-964页

作者：张伟王世银高莉徐梦思王新华甘尚权新疆农垦科学院畜牧兽医研究所省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室石河子832000 新疆农业职业技术学院昌吉831100

旨在研究绵羊Fsp27基因的组织表达/多态性及其与不同绵羊品种尾脂沉积能力的关联性。本研究采用qRT-PCR检测了营养充足期阿勒泰羊不同组织中Fsp27基因的表达情况,同时对营养充足期和营养匮乏期阿勒泰羊尾脂组织中Fsp27基因的表达情况进... 详细信息

旨在研究绵羊Fsp27基因的组织表达/多态性及其与不同绵羊品种尾脂沉积能力的关联性。本研究采用qRT-PCR检测了营养充足期阿勒泰羊不同组织中Fsp27基因的表达情况,同时对营养充足期和营养匮乏期阿勒泰羊尾脂组织中Fsp27基因的表达情况进行了定量分析,采用PCR-SSCP结合测序技术检测了5个不同尾脂沉积能力绵羊品种Fsp27基因的突变情况,并分析了相关突变与绵羊尾脂沉积能力的关联性。结果表明,Fsp27基因在营养充足期阿勒泰羊尾脂中高表达,其表达量极显著高于其他组织(P0.05)。另外,营养充足期阿勒泰羊尾脂中Fsp27基因的表达量极显著高于营养匮乏期(P<0.01)。绵羊Fsp27基因在不同尾脂沉积能力品种群体中共检测到25个突变位点,其中位于第3外显子g. 16771741的G/A突变以及第5外显子g. 16774969的C/T突变均为错义突变,且与绵羊尾脂沉积能力高度相关。g. 16771741的G/A突变在尾脂沉积能力较强的阿勒泰羊、小尾寒羊和湖羊群体中以G等位基因为主,分别占到86.8%、83.7%和85.7%,而尾脂沉积能力较差的中国美利奴细毛羊和萨福克羊群体中G等位基因分别仅占30.3%和11.1%。g. 16774969的C/T突变在阿勒泰羊群体中以T等位基因为主,TT基因型占84.7%,CT基因型占15.3%,没有检测到CC基因型;在短脂尾型的小尾寒羊和湖羊群体中,TT和CT基因型也分别占到65.9%、50.4%和22.7%、41.1%,而在长瘦尾的中国美利奴细毛羊和萨福克羊群体中则以CC基因型为主,分别占到97.4%和69.4%,没有检测到TT基因型。以上研究结果表明,Fsp27基因在阿勒泰羊尾脂中高表达,且其在尾脂中的表达量与阿勒泰羊的营养状态密切相关,Fsp27基因第3外显子g. 16771741的G/A突变以及第5外显子g. 16774969的C/T突变与绵羊尾脂沉积能力高度相关,可以作为理想的分子标记用于低脂肪绵羊品种的选育。

关键词：绵羊 Fsp27 尾脂 SNP

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FABP4基因在阿勒泰羊尾脂沉积与代谢模型中的表达变化规律

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遗传 2015年第2期37卷 174-182页

作者：许瑞霞高磊赵伟利张伟宋广超甘尚权石国庆石河子大学动物科技学院石河子832000 新疆农垦科学院畜牧兽医研究所石河子832000

FABP4(Fatty acid binding protein 4)参与细胞内脂肪酸的转运和脂肪酸代谢,是当前研究动物脂肪沉积与代谢的热门候选基因。为了研究FABP4基因在绵羊尾脂沉积与代谢中的作用,文章采用生物信息学方法分析了FABP4氨基酸序列在各物种中的... 详细信息

FABP4(Fatty acid binding protein 4)参与细胞内脂肪酸的转运和脂肪酸代谢,是当前研究动物脂肪沉积与代谢的热门候选基因。为了研究FABP4基因在绵羊尾脂沉积与代谢中的作用,文章采用生物信息学方法分析了FABP4氨基酸序列在各物种中的保守性;利用半定量RT-PCR方法检测了该基因在阿勒泰羊主要组织中的表达;采用饥饿法成功建立了模拟阿勒泰羊尾脂沉积与代谢的动物模型,利用q PCR和i TRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)技术同时验证FABP4基因m RNA和蛋白在阿勒泰羊非饥饿组与饥饿组尾脂中的表达变化。序列分析结果表明,绵羊FABP4氨基酸序列在物种间高度保守,提示FABP4基因可能由于其重要的生物功能而在进化中表现出其物种的保守性。组织表达谱结果显示,FABP4 m RNA在阿勒泰羊肠脂与尾脂中均高丰度表达,暗示FABP4基因可能在脂肪中行驶着重要的生理生化功能。q PCR与i TRAQ结果显示,FABP4 m RNA与蛋白在两种极端条件下尾脂中的表达差异均不显著(P>0.05),表明FABP4基因可能不是绵羊尾脂沉积与代谢两种极端差异表型的决定基因。以上研究结果为进一步研究FABP4基因在绵羊尾脂中的生物功能奠定了基础。

关键词： FABP4 阿勒泰羊尾脂沉积与代谢表达变化

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阿勒泰羊Fsp27基因5'UTR区g.16767667位点G>A突变与其尾脂沉积能力关联性分析

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家畜生态学报 2021年第1期42卷 15-19页

作者：张伟王世银高莉徐梦思王新华甘尚权新疆农垦科学院省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室新疆石河子832000 新疆农业职业技术学院新疆昌吉831100

Fsp27基因在动物脂肪代谢过程中发挥着重要的调控作用。为了研究Fsp27基因5'UTR区g.16767667位点G>A突变与绵羊尾脂沉积能力的关联性,以尾脂沉积能力极强的脂尾(臀)型绵羊品种阿勒泰羊(Ovis aries)为研究对象,采用PCR-SSCP及测序技术研... 详细信息

Fsp27基因在动物脂肪代谢过程中发挥着重要的调控作用。为了研究Fsp27基因5'UTR区g.16767667位点G>A突变与绵羊尾脂沉积能力的关联性,以尾脂沉积能力极强的脂尾(臀)型绵羊品种阿勒泰羊(Ovis aries)为研究对象,采用PCR-SSCP及测序技术研究了该SNP位点不同基因型在阿勒泰羊群体中的分布,并通过比较不同基因型个体尾形数据的差异,评估其与阿勒泰羊尾脂沉积能力的关联性。结果表明,在阿勒泰羊群体中Fsp27基因5'UTR区g.16767667位点G>A突变可以检测到GG、AG和AA三种基因型,基因型频率分别47.2%、38.4%和14.4%;卡方检验结果表明该位点在阿勒泰羊群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。通过250只不同基因型阿勒泰羊尾形数据对比发现,GG和AG基因型个体脂尾(臀)的长、宽和厚3项数据均显著高于AA基因型个体(P0.05),推断G等位基因有利于阿勒泰羊尾脂沉积。

关键词：绵羊 Fsp27 尾脂 SNP

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巴什拜羊不同发育阶段骨骼肌中miR-486靶基因的研究

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中国农业科学 2021年第14期54卷 3134-3148页

作者：张伟王世银高莉杨力伟邓双义刘晓娜石国庆甘尚权新疆农业职业技术学院新疆农垦科学院畜牧兽医研究所/省部共建绵羊遗传改良与健康养殖重点实验室

【目的】为了深入挖掘巴什拜羊不同发育阶段骨骼肌中miR-486的靶基因,为最终阐明巴什拜羊优良肉质性状形成的分子调控机制奠定基础,同时为巴什拜羊的持续选育提供理论依据。【方法】分别采集了巴什拜羊胎儿期40,50,60,80,100和120 d,以... 详细信息

【目的】为了深入挖掘巴什拜羊不同发育阶段骨骼肌中miR-486的靶基因,为最终阐明巴什拜羊优良肉质性状形成的分子调控机制奠定基础,同时为巴什拜羊的持续选育提供理论依据。【方法】分别采集了巴什拜羊胎儿期40,50,60,80,100和120 d,以及出生当天,出生后30,60和90 d共计10个不同发育阶段的骨骼肌组织,分别利用胎儿期6个阶段的混合mRNA和出生后4个阶段的混合mRNA构建了胎儿期和出生后骨骼肌中miR-486调控靶基因的cDNA文库,并利用高通量测序技术对cDNA文库中的靶基因信息进行了深入挖掘。在对所得候选靶基因功能分析的基础上,选择10个候选靶基因,使用qRT-PCR检测其在巴什拜羊上述10个不同发育阶段骨骼肌中表达量的变化,结合课题组前期获得的miR-486在巴什拜羊不同发育阶段骨骼肌中的表达规律,对其靶向调控关系及生物学功能进行初步验证和分析。进而选择其中的4个候选靶基因使用荧光素酶报告载体试验和巴什拜羊骨骼肌卫星细胞中的靶向调控试验最终确认其靶向调控关系。【结果】通过对两个cDNA文库高通量测序数据的分析,胎儿期和出生后分别获得了123个和118个miR-486的靶基因,因其靶向调控关系未经实验验证,故暂称为候选靶基因。其中有96个为两个阶段共表达的候选靶基因,其余27个和22个分别为胎儿期和出生后骨骼肌中特异表达的候选靶基因。GO和KEGG分析结果表明所得候选靶基因显著富集于与肌肉分化和肌纤维发育相关的代谢和信号转导通路,诸如PI3k-Akt、MAPK、Wnt、Adherens junction和Regulation of actin cytoskeleton等。qRT-PCR检测结果表明所选10个候选靶基因在不同发育阶段巴什拜羊骨骼肌中均有表达,但其表达变化规律有所不同。PTEN、Foxo1、Dock3、PAX7、IGF1R、PIK3I1和FBN1在胎儿期巴什拜羊骨骼肌中呈高表达,出生后其表达量显著下调,而OLFM4的表达量则呈相反的变化趋势,ARHGAP5和PDCD4在胎儿期和出生后巴什拜羊骨骼肌中的表达量未见显著变化。对其中4个候选靶基因的进一步试验验证,双荧光素酶报告载体试验结果表明,miR-486可以高效结合在其候选靶基因PTEN、Foxo1、IGF1R和PIK3R1的靶位点上,进而极显著抑制其后萤火虫荧光素酶的活性;巴什拜羊骨骼肌卫星细胞中的靶向调控试验结果亦表明miR-486可以显著下调上述4个候选靶基因的mRNA水平,抑制其生物学功能。所以可以确证在巴什拜羊骨骼肌中miR-486可以靶向调控PTEN、Foxo1、IGF1R和PIK3R1的表达。【结论】对巴什拜羊不同发育阶段骨骼肌中miR-486的靶基因进行了深入挖掘,全面解析了miR-486及其靶基因在巴什拜羊骨骼肌发育过程中参与的生物学过程和信号通路,所得候选靶基因数据可靠性高,可为阐明巴什拜羊优良肉质性状的分子调控机制奠定基础。

关键词：巴什拜羊 miR-486 靶基因骨骼肌 cDNA文库

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案例式教学在动物科学专业《牛生产学》课程中的实践与探讨

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现代畜牧科技 2024年第2期 159-162页

作者：马健尹福泉周光现甘尚权广东海洋大学滨海农业学院广东湛江524088

案例式教学是以生产中的案例为授课内容,促使学生通过分析案例,实现学生间的讨论和团队合作,提高解决问题的能力。作为动物科学专业的核心课程,《牛生产学》是一门实践性较强的课程,在实际教学过程中通过引入牧场中的案例,提升学生兴趣... 详细信息

案例式教学是以生产中的案例为授课内容,促使学生通过分析案例,实现学生间的讨论和团队合作,提高解决问题的能力。作为动物科学专业的核心课程,《牛生产学》是一门实践性较强的课程,在实际教学过程中通过引入牧场中的案例,提升学生兴趣,实现真正的理论知识灌输,提高学生综合分析能力。该文先归纳案例式教学的特点,并以《牛生产学》课程为例,分析案例式教学的前期准备及实施过程,探索案例式教学在地方院校《牛生产学》课程中的应用,旨在改善教学质量,培养动物科学专业应用型人才。

关键词：案例式教学牛生产学动物科学专业

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