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The role of genomic structural variation in the genetic improvement of polyploid crops

The Crop Journal 2019年第2期7卷 127-140页

作者： sarah-veronica schiessl Elvis Katche Elizabeth Ihien Harmeet Singh Chawla Annaliese S.Mason Department of Plant Breeding Justus Liebig University

Many of our major crop species are polyploids, containing more than one genome or set of chromosomes. Polyploid crops present unique challenges, including difficulties in genome assembly, in discriminating between multiple gene and sequence copies, and in genetic mapping, hindering use of genomic data for genetics and breeding. Polyploid genomes may also be more prone to containing structural variation, such as loss of gene copies or sequences(presence–absence variation) and the presence of genes or sequences in multiple copies(copynumber variation). Although the two main types of genomic structural variation commonly identified are presence–absence variation and copy-number variation, we propose that homeologous exchanges constitute a third major form of genomic structural variation in polyploids. Homeologous exchanges involve the replacement of one genomic segment by a similar copy from another genome or ancestrally duplicated region, and are known to be extremely common in polyploids. Detecting all kinds of genomic structural variation is challenging, but recent advances such as optical mapping and long-read sequencing offer potential strategies to help identify structural variants even in complex polyploid genomes. All three major types of genomic structural variation(presence–absence, copy-number, and homeologous exchange) are now known to influence phenotypes in crop plants, with examples of flowering time, frost tolerance, and adaptive and agronomic traits. In this review,we summarize the challenges of genome analysis in polyploid crops, describe the various types of genomic structural variation and the genomics technologies and data that can be used to detect them, and collate information produced to date related to the impact of genomic structural variation on crop phenotypes. We highlight the importance of genomic structural variation for the future genetic improvement of polyploid crops.

关键词： Presence–absence variation Copy-number variation Homeologous exchanges Genome structure Pan-genome

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luminating Crop Adaptation Using Population Genomics

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Molecular Plant 2019年第1期12卷 27-29页

作者： Rod J.Snowdon sarah schiessl Department of Plant Breeding IFZ Research Centre for BiosystemsLand Use and Nutrition Justus Liebig University GiessenNeinrich-Buff-Ring 26-3235392 GiessenGermany

In this issue,Wu et al.(2019)describe the largest whole-genome resequencing dataset published to date for rapeseed (Brassica napus),an allopolyploid crop species that originated just a few thousand years ago under anthropogenic influence and rapidly evolved into one of the world's most important oilseed crops. In almost 1000 *** spanning species-wid.e germplasm for oilseed rape,a comprehensive analysis of sequence diversity related to flowering-related traits uncovered selective sweeps associated with eco-geographic adaptation and human selection,attributable particularly to divergence among homoeologs of key flowering-time regulation and ethylene synthesis/signaling genes.

关键词： issue Brassica napus

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H2O2干法灭菌与高架仓库

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酒．饮料技术装备 2010年第3期 74-76页

作者： Hans-Peter schiessl 克朗斯股份公司

德国riha集团在西班牙的子公司Agrozumos采用克朗斯最新科技扩大生产。不仅是灌装技术，还有内部物流。riha集团的灭菌经验来自第一次在西班牙安装一条PET生产线，当时首款实施项目即为克朗斯气态H2O2（过氧化氢）干法灭菌的PET—Asept... 详细信息

德国riha集团在西班牙的子公司Agrozumos采用克朗斯最新科技扩大生产。不仅是灌装技术，还有内部物流。riha集团的灭菌经验来自第一次在西班牙安装一条PET生产线，当时首款实施项目即为克朗斯气态H2O2（过氧化氢）干法灭菌的PET—AseptD设备。

关键词： H2O2 高架仓库灭菌干法扩大生产灌装技术过氧化氢西班牙

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H2O2干法灭菌与高架仓库——Agrozumos果汁生产企业采用克朗斯最新科技扩大生产

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现代包装 2010年第7期 34-34,36,38页

作者： Hans-Peter schiessl 德国克朗斯股份公司

德国Riha集团在西班牙的子公司Agrozumos采用最新科技扩大生产。新科技不仅包括了先进的灌装技术，还包括了创新的内部物流技术。Riha集团的灭菌经验源于其第一次在西班牙安装一条PET生产线。当时，首款灭菌实施项目即采用了克朗斯气态H... 详细信息

德国Riha集团在西班牙的子公司Agrozumos采用最新科技扩大生产。新科技不仅包括了先进的灌装技术，还包括了创新的内部物流技术。Riha集团的灭菌经验源于其第一次在西班牙安装一条PET生产线。当时，首款灭菌实施项目即采用了克朗斯气态H2O2（过氧化氢）干法灭菌的PET-Asept D设备。在仓储领域，Agrozumo也同样选择了由克朗斯公司提供的全自动化高架仓库。Agrozumos公司于1981年成立，从事果汁和蜜汁的灌装生产。该企业位于西班牙北部Navarra的Lekunberri市，距离PamPlona西北部有30公里，距离法国边境不到100公里。Agrozumos是业界第一个应用软包装的果汁灌装公司，当时该公司的创新举动曾在果汁市场掀起了一场革命。现在，Agrozumos公司又以创新的PET无菌灌装饮品而再度出名。

关键词：扩大生产生产企业高架仓库 H2O2 新科技果汁灭菌干法

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克朗斯最新科技帮助Agrozumos扩大生产

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中国包装工业 2010年第5期 59-60页

作者： Hans-Peter schiessl 克朗斯股份公司

德国Riha集团在西班牙的子公司——Agrozumos果汁生产企业采用克朗斯的最新科技不仅对灌装技术,还对内部物流进行了扩大生产。

关键词：高架仓库立体仓库朗斯垛板 Agrozumos 无菌灌装周边设备灌装设备 PET 灭菌设备

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