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Analysis of Single Nucleotide Polymorphism in Human Paraoxonase 1 Gene(Q192R) with Matrix-assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-flight Mass Spectrometry

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Chemical Research in Chinese Universities 2006年第3期22卷 394-396页

作者： sun ya-dong sun Shu-chen WANG Zhi yaNG yang ZHANG Jin Key Laboratory for Molecular Enzymology and Engineering of Educational Ministry Jilin University Changchtm 130021 P. R. China People＇s Hospital of Jilin Province Changchun 130021 P. R. China

Introduction Single nucleotide polymorphisms （SNPs） are the most abundant DNA markers in the human genome occurring at a frequency of one in every 500--1000 nucleotides. A variety of methods have been used for the analysis of single nucleotide polymorphisms, including restriction fragment length polymorphism （RFLP）, direct sequencing by using laser-induced fluorescence detectionTM, fluorescence energy transfer, MALDI-TOF MS combined with primer extension or invasive cleavage, and fluorescence polarization. During the past two decades, mass spectrometry has become a very popular tool in the analysis of biomolecules and is perfectly suited to the analysis of single nucleotide polymorphisms （SNPs） due to its speed, low cost, and accuracy. In this work, we used MALDI TOF mass spectrometry to detect the fragments of restriction endonuclease hydrolysis of PCR products flanking a SNP located at paraoxonase 1（Q192R）. Compared with electrophoresis, this method requires less time of analysis and possess a higher accuracy.

关键词： Single nucleotide polymorphism Human paraoxonase 1 gene Matrix-assisted laser desorption/ionizationtime-of-flight mass spectrometry

Transcriptome analysis for understanding the mechanism of dark septate endophyte S16 in promoting the growth and nitrate uptake of sweet cherry

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Journal of Integrative Agriculture 2021年第7期20卷 1819-1831页

作者： WU Fan-lin QU De-hui TIAN Wei WANG Meng-yun CHEN Fei-yan LI Ke-ke sun ya-dong SU Ying-hua yaNG Li-na SU Hong-yan WANG Lei Key Laboratory of Molecular Module-Based Breeding of High Yield and Abiotic Resistant Plants in Universities of Shandong School of AgricultureLudong UniversityYantai 264025P.R.China College of Life Sciences Ludong UniversityYantai 264025P.R.China State Key Laboratory of Microbial Metabolism and School of Life Sciences&Biotechnology Shanghai Jiao Tong UniversityShanghai 200240P.R.China State Key Laboratory of Crop Biology College of Life SciencesShandong Agricultural UniversityTai'an 271018P.R.China Department of Genetics and Cell Biology Basic Medical CollegeQingdao UniversityQingdao 266071P.R.China

Sweet cherry is one of the most popular fresh fruits in the ***,we isolated a soilborne dark septate endophyte(DSE)strain,S16,which promoted the growth of Gisela 5 sweet cherry ***,little is known about the molecular mechanism of the effect of S16 on the growth of sweet *** this study,the physiological parameters and transcript profiles of sweet cherry roots were analyzed under S16 treatment compared with a control to elucidate the molecular mechanisms of the effect of this strain on sweet cherry *** inoculation with S16,sweet cherry seedlings exhibited more vigorous ***,we identified 4249 differentially expressed genes(DEGs)between S16-treated plants and the *** of the DEGs are involved in pathways related to plant growth,such as cellular metabolic and plant hormone ***,some genes involved in nitrate regulation were also enriched;and these genes may be involved in the regulation of nitrate uptake in *** index detection demonstrated that S16 could improve the nitrate assimilation of sweet cherry via NO3–*** RNA-seq dataset provides comprehensive insight into the transcriptomic landscape to reveal the molecular mechanisms whereby the DSE influences the growth of sweet cherry.

关键词： sweet cherry dark septate endophyte RNA-seq growth NO3–transporters

抵抗素-420C/G基因多态性与中国东北地区汉族人群2型糖尿病大血管病变相关性分析

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吉林大学学报（医学版） 2011年第2期37卷 300-303页

作者：孙亚东马彦吉林省人民医院内分泌科吉林长春130021

目的:研究中国东北地区汉族人群抵抗素(RETN)-420C/G基因单核苷酸多态性(SNPs)的等位基因、基因型频率分布及其与2型糖尿病(T2DM)大血管病变之间的关系。方法:应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法对180例样本[T2DM并... 详细信息

目的:研究中国东北地区汉族人群抵抗素(RETN)-420C/G基因单核苷酸多态性(SNPs)的等位基因、基因型频率分布及其与2型糖尿病(T2DM)大血管病变之间的关系。方法:应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法对180例样本[T2DM并发大血管病变组60例,单纯T2DM组60例,正常对照(ND)组60例],进行基因分型及频率测定。结果:T2DM并发大血管病变组及单纯T2DM组等位基因频率及CC/GC+GG基因型分布与ND组比较差异均有统计学意义(P<0.01);T2DM并发大血管病变组等位基因频率及CC/GC+GG基因型分布与单纯T2DM组比较差异亦有统计学意义(P<0.05),T2DM并发大血管病变组GC+GG基因型频率明显高于单纯T2DM组。结论:RETN-420C/G基因多态性与中国东北地区汉族人群T2DM及其大血管病变的发生有相关性。

关键词： 2型糖尿病抵抗素基因多态性大血管病变聚合酶链反应

基于指标参数依赖关系动态响应的研发流程模型

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计算机集成制造系统 2013年第7期19卷 1509-1519页

作者：孙亚东张旭宁汝新王恺北京理工大学数字化设计与制造研究所北京100081 北京机械设备研究所北京100094

针对复杂产品多层次、多冲突、多迭代的协同开发特点,提出一种基于指标参数依赖关系网络动态响应的复杂产品研发流程模型。探讨了指标参数之间依赖关系的分析方法,并将其分为兄弟组件之间的依赖关系和父子组件之间的依赖关系两种类型。... 详细信息

针对复杂产品多层次、多冲突、多迭代的协同开发特点,提出一种基于指标参数依赖关系网络动态响应的复杂产品研发流程模型。探讨了指标参数之间依赖关系的分析方法,并将其分为兄弟组件之间的依赖关系和父子组件之间的依赖关系两种类型。针对两种类型分别提出基于设计结构矩阵的兄弟组件之间的指标参数依赖关系分析方法和基于关联矩阵的自顶向下的父子组件之间的指标参数依赖关系分析方法,并建立指标参数依赖关系网络;面向多学科协同设计提出基于数据和消息驱动的研发流程执行机制,以T/R研发流程为例说明了动态响应的研发流程模型。

关键词：指标参数依赖关系研发流程多学科协同设计产品开发

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河流生态系统结构功能整体性概念模型

水科学进展 2010年第4期21卷 550-559页

作者：董哲仁孙东亚赵进勇张晶中国水利水电科学研究院北京100038

在完善与整合现有河流生态系统结构功能概念及模型的基础上,提出河流生态系统结构功能整体性概念模型。水文情势、水力条件和地貌景观格局是对河流生态系统结构与功能具有关键影响的3大生境要素,结构功能模型的核心是建立以3大生境要素... 详细信息

在完善与整合现有河流生态系统结构功能概念及模型的基础上,提出河流生态系统结构功能整体性概念模型。水文情势、水力条件和地貌景观格局是对河流生态系统结构与功能具有关键影响的3大生境要素,结构功能模型的核心是建立以3大生境要素为构架的生命支持系统与河流生命系统之间的相互作用和相互制约关系,同时考虑由于人类活动引起生境要素变化对于河流生态系统的影响。河流生态系统结构功能整体性概念模型由以下4种模型组成:河流四维连续体模型、水文情势-河流生态过程耦合模型、水力条件-生物生活史特征适宜模型以及地貌景观空间异质性-生物群落多样性关联模型,这4种模型的一体化整合,基本概括了河流生态系统结构功能的整体特征。

关键词：河流生态系统结构功能连续体水力条件水文情势洪水脉冲景观格局概念模型

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生态水工学进展与展望

水利学报 2014年第12期45卷 1419-1426页

作者：董哲仁孙东亚赵进勇张晶中国水利水电科学研究院北京100038

生态水工学是在生态保护的大背景下产生和发展起来的新兴交叉学科,是对传统水利工程学的补充和完善。文章系统总结了十多年来生态水工学的主要进展,包括水利水电工程生态影响机理;河流生态修复规划方法;河流健康评估;兼顾生态保护的水... 详细信息

生态水工学是在生态保护的大背景下产生和发展起来的新兴交叉学科,是对传统水利工程学的补充和完善。文章系统总结了十多年来生态水工学的主要进展,包括水利水电工程生态影响机理;河流生态修复规划方法;河流健康评估;兼顾生态保护的水库调度方法以及河流生态状况定量评价方法等。文章对生态水工学发展进行了展望,列举了包括水电资源开发程度战略研究,建立多种压力-响应生态模型,洄游鱼类保护技术,改善水库调度方法以及技术整合研发等若干学科发展前沿问题。

关键词：生态水工学生态修复河流健康水库调度洄游鱼类

基于主导生态功能分区的河流健康评价全指标体系

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水利学报 2010年第8期40卷 883-892页

作者：张晶董哲仁孙东亚王俊娜中国水利水电科学研究院北京100038

为建立全国河流健康评价标准的方法框架,从影响河流生态系统的生物、生境要素和人类活动要素出发,构建了包括水文特性、水质特性、河流地貌特性、生物特性和社会经济特性5方面、含36项指标的全国河流健康评价全指标体系;提出了基于主导... 详细信息

为建立全国河流健康评价标准的方法框架,从影响河流生态系统的生物、生境要素和人类活动要素出发,构建了包括水文特性、水质特性、河流地貌特性、生物特性和社会经济特性5方面、含36项指标的全国河流健康评价全指标体系;提出了基于主导生态功能和纬度、集水面积、距离河源的位置、河流所处地区等空间因子的两级水生态区划方法,根据河流所属水生态区构建了基于一级分区的特定河流健康评价指标体系,确定河流健康评价重点以及不同指标的权重;选择了5条河流作为示例划分水生态区,并明确了建立其河流健康评价指标体系需考虑的重点。

关键词：河流健康评价水生态区划全指标体系主导生态功能

氨基末端脑钠素前体与2型糖尿病自主神经病变的相关性分析

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吉林大学学报（医学版） 2010年第6期36卷 1139-1142页

作者：周煦孙亚东马彦吉林省人民医院内分泌科吉林长春130021 延边大学临床医学院吉林延吉133000

目的:探讨2型糖尿病(T2DM)伴自主神经病变(AN)(T2DAN)患者氨基末端脑钠素前体(NT-ProBNP)的变化情况,阐明NT-ProBNP与T2DAN的相关关系。方法:单纯T2DM组患者40例,T2DAN组患者35例,另选取本院体检中心健康体检者21例作为对照组,应用酶联... 详细信息

目的:探讨2型糖尿病(T2DM)伴自主神经病变(AN)(T2DAN)患者氨基末端脑钠素前体(NT-ProBNP)的变化情况,阐明NT-ProBNP与T2DAN的相关关系。方法:单纯T2DM组患者40例,T2DAN组患者35例,另选取本院体检中心健康体检者21例作为对照组,应用酶联免疫吸附实验(ELISA)检测各组患者血浆中NT-ProBNP水平。结果:T2DAN组NT-ProBNP水平明显高于T2DM组及对照组(均P<0.01)。NT-ProBNP与病程、空腹血糖(FPG)、糖化血红蛋白(HbA1c)、平卧位心率(HR)及立卧位收缩压(SBP)变化呈正相关关系,相关系数(r)分别为0.957、0.932、0.912、0.876及0.924(P<0.01),与空腹血清C-肽(FC-P)、深呼吸心率变化(HRV)、立卧位HRV、30∶15比值及乏氏指数呈负相关关系,相关系数(r)分别为-0.755、-0.766、-0.698、-0.732及-0.812(P<0.01)。结论:在T2DAN患者中,血浆NT-ProBNP过度表达与T2DAN有明确相关性。

关键词： 2型糖尿病自主神经病变氨基末端脑钠素前体

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关于堤防工程规范中增加生态技术内容的建议

水利水电技术 2005年第3期36卷 4-8页

作者：孙东亚董哲仁中国水利水电科学研究院北京100038

在防洪工程建设中,需要兼顾生态需求,合理引入生态工程技术,减轻水利工程对河流生态系统的负面影响,避免自然河流的人工渠道化和非连续化.很多发达国家的堤防工程规范中已明确提出了这方面的要求,并发布了有关的技术导则或手册.参考国... 详细信息

在防洪工程建设中,需要兼顾生态需求,合理引入生态工程技术,减轻水利工程对河流生态系统的负面影响,避免自然河流的人工渠道化和非连续化.很多发达国家的堤防工程规范中已明确提出了这方面的要求,并发布了有关的技术导则或手册.参考国外的经验和最新技术进展,从我国堤防工程建设的需求出发,提出我国堤防工程规范中应增加生态技术内容,并就防洪工程规划的原则、堤线布置及堤型选择、河流断面设计、岸坡防护、景观建设、工程施工和工程管理等几个方面相应条款的修订提出了具体建议.

关键词：堤防生态工程规范导则