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上海市食源性单核细胞增生李斯特菌MLST分析及毒力基因分布

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中国食品学报 2019年第2期19卷 223-229页

作者：成梦雅王文凯史贤明施春雷上海交通大学农业与生物学院中美食品安全联合研究中心陆伯勋食品安全研究中心上海200240

为了解上海市食源性单核细胞增生李斯特菌亚型和毒力基因的分布情况,于2013年6月至2014年6月在上海市采集各类食品样品,从中分离到86株单核细胞增生李斯特菌,并对其进行多位点序列分型(MLST)及毒力基因检测。MLST分析结果显示:86株单核... 详细信息

为了解上海市食源性单核细胞增生李斯特菌亚型和毒力基因的分布情况,于2013年6月至2014年6月在上海市采集各类食品样品,从中分离到86株单核细胞增生李斯特菌,并对其进行多位点序列分型(MLST)及毒力基因检测。MLST分析结果显示:86株单核细胞增生李斯特菌可以分为15个ST型,其中,80.2%(69/86)属于谱系II,其余属于谱系I,未发现谱系III和IV菌株。同时检测了10个毒力基因(prfA,hly,plcA,plcB,actA,clpE,mpl,inlA,inlB和iap),结果发现,这些分离株中10个毒力基因的携带率均为100%。以上结果提示:上海市市售食品中单核细胞增生李斯特菌存在较大的食品安全风险,需加强监测和防控。

关键词：单核细胞增生李斯特菌 MLST 毒力基因

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全自动食品制售机的食品安全评估

中国食品学报 2020年第8期20卷 321-327页

作者：吴酉芝施春雷倪根华李坚上海交通大学农业与生物学院食品科学与工程系上海200240 上海金禾实业发展有限公司上海201906

全自动食品制售机的运营模式兼有餐饮、流通、生产的特点,属于食品新业态。由于没有相应的监管法规与标准,因此其获得食品经营许可证非常困难。研究发现食品安全评估是比较可行的途径。本文首先阐述了全自动食品制售机食品安全评估的必... 详细信息

全自动食品制售机的运营模式兼有餐饮、流通、生产的特点,属于食品新业态。由于没有相应的监管法规与标准,因此其获得食品经营许可证非常困难。研究发现食品安全评估是比较可行的途径。本文首先阐述了全自动食品制售机食品安全评估的必要性及现状,重点归纳总结了国内外全自动食品制售机食品安全评估的方法和相关的法律法规,为正确开展食品安全评估提供较全面的理论参考。

关键词：全自动食品制售机食品安全评估风险评估

Expression switching of three genes encoding light-independent protochlorophyllide oxidoreductase in Chlorella protothecoides

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Expression switching of three genes encoding light-independe...

基于GB 4789.10-2016的银白色葡萄球菌鉴定方法的改进

中国食品科学技术学会第五届年会暨第四届东西方食品业高层...

作者： chunlei shi Xianming shi* (Department of Food Science and Technology,Shanghai Jiao Tong University,Shanghai 201101,China)

＜正＞Expression of three chloroplast genes,chlL,chlN and chlB,encoding the light-independent protochlorophyllide oxidoreductase（LIPOR）in Chlorella protothecoides CS-41 growing either photoautotrophically,mixotrophically or heterotrophically was *** three genes were all transcribed constitutively independent of illumination and presence of glucose, but the steady-state amounts of all three transcripts in the light-grown cells were approximately two-to three fold greater than those in the dark-grown *** addition,Western blotting demonstrated that an approximately same amount of protein was present in cultures grown mixtrophically or heterotrophically both containing ***,much less protein was shown in photoautotrophic *** results suggest that LIPOR activity depends on post-transcriptional and post-translational ***,the fact that LIPOR accumulates in the light-grown cells indicates that LIPOR,which was thought to work only in darkness,may partially account for the protochlorophyllide photoredution in ***,LIPOR switches on both in light and in darkness.

关键词： Chlorella protothecoides chlorophyll glucose light light-independent protochlorophyllide oxidoreductase

来源： cnki会议评论

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cnki会议

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中国食品学报 2020年第10期20卷 240-246页

作者：金方宁张道锋区楚君史贤明施春雷上海交通大学农业与生物学院中美食品安全联合研究中心上海200240

探讨基于食品安全国家标准GB 4789.10-2016鉴定银白色葡萄球菌(Staphylococcus argenteus)的适用性,并提出相应的改进方法。采用GB 4789.10-2016第一法与PCR鉴定方法(目的基因为nuc1或NRPS)同时对193株金黄色葡萄球菌分离株和6株银白色... 详细信息

探讨基于食品安全国家标准GB 4789.10-2016鉴定银白色葡萄球菌(Staphylococcus argenteus)的适用性,并提出相应的改进方法。采用GB 4789.10-2016第一法与PCR鉴定方法(目的基因为nuc1或NRPS)同时对193株金黄色葡萄球菌分离株和6株银白色葡萄球菌分离株进行鉴定,比较两者结果。结果表明,GB 4789.10-2016和nuc1-PCR方法将银白色葡萄球菌错误鉴定为金黄色葡萄球菌,而NRPS-PCR方法可以区分两者。研究表明:在GB 4789.10-2016的基础上,结合NRPS-PCR建立一套检验流程,可鉴定并区分金黄色葡萄菌和银白色葡萄菌。

关键词：银白色葡萄球菌金黄色葡萄球菌 GB 4789.10-2016 耐热核酸酶基因nuc1 非核糖体多肽合成酶基因NRPS

原壳小球藻番茄红素ε环化酶基因的克隆和分析

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微生物学报 2009年第9期49卷 1180-1189页

作者：李婷施春雷淦志兵史贤明上海交通大学农业与生物学院食品科学系陆伯勋食品安全研究中心上海200240

【目的】番茄红素ε环化酶(lycopene epsilon cyclase)是叶黄素代谢途径中处于分支位点的关键酶。它催化线性的番茄红素选择性环化,形成胡萝卜素,再进一步合成叶黄素(lutein)。本研究的目标是克隆原壳小球藻(Chlorella protothecoides C... 详细信息

【目的】番茄红素ε环化酶(lycopene epsilon cyclase)是叶黄素代谢途径中处于分支位点的关键酶。它催化线性的番茄红素选择性环化,形成胡萝卜素,再进一步合成叶黄素(lutein)。本研究的目标是克隆原壳小球藻(Chlorella protothecoides CS-41)LCYE基因的全长cDNA,通过该基因的生物学信息分析预测其表达产物的空间结构与功能位点,并验证该表达产物的生物学活性。【方法】采用cDNA末端快速扩增(rapid-amplification of cDNA ends)和RT-PCR技术克隆原壳小球藻LCYE基因的全长cDNA序列。分别采用PredictProtein、Pfam HMMs和Swiss-Model等在线分析软件分析LCYE的基本生物学信息,预测蛋白质功能位点和空间结构。利用pET28-a(+)构建LCYE基因的原核表达质粒pET-LCYE,并转入大肠杆菌BL21(DE3),再利用IPTG诱导LCYE基因超量表达。此外,携带pAC-LYC质粒的大肠杆菌工程菌能够积累番茄红素,可用于验证LCYE基因编码蛋白的酶活。【结果】获得了原壳小球藻的LCYE基因的cDNA序列,长2107bp,GenBank登录号为FJ752528。序列分析表明:它含有1731bp的完整开放阅读框(ORF),编码576个氨基酸,与高等植物和其他藻类的LCYE有很高的相似性,其中相似性最高的是莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii XM001696477.1),达到67%。第48～459个氨基酸残基为一个典型的番茄红素环化酶蛋白(Lycopene cyclase protein)结构域(pfam05834),第261～284个氨基酸残基为一个典型的环化酶保守的模体。SDS-PAGE检测表明,LCYE基因在大肠杆菌BL21(DE3)中得到了超量表达。携带pAC-LYC质粒的大肠杆菌工程菌在获得LCYE基因后,其颜色从粉红色变为黄色。【结论】原壳小球藻LCYE基因的全长cDNA为2107bp,预测出番茄红素ε环化酶所特有的保守功能区域,构建了它的三维结构模型。同时,阐明了小球藻和衣藻的亲缘关系。最后,证实了本研究克隆到的LCYE基因编码的蛋白具有番茄红素ε环化酶的功能与活性。

关键词：原壳小球藻叶黄素番茄红素ε环化酶

DBSCAN算法优化及在村镇管理决策中的应用

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农业机械学报 2016年第10期47卷 346-350页

作者：彭波史春雷高万林中国农业大学信息与电气工程学院北京100083

作为空间数据挖掘技术中的一种,带有噪声的空间聚类应用算法(DBSCAN算法)是基于密度的聚类算法,其可以从空间数据库中发现任意形状的聚类。本文研究了基于密度的空间聚类算法优化原理及实现过程,分析了原始DBSCAN算法存在的问题,通过避... 详细信息

作为空间数据挖掘技术中的一种,带有噪声的空间聚类应用算法(DBSCAN算法)是基于密度的聚类算法,其可以从空间数据库中发现任意形状的聚类。本文研究了基于密度的空间聚类算法优化原理及实现过程,分析了原始DBSCAN算法存在的问题,通过避免公共领域对象的重复查询,减少对核心对象邻域查询的计算,优化后算法的时间效率提高了33.73%。将优化后的DBSCAN算法应用于村镇网格化管理,可对网格化管理系统中的数据记录进行有效挖掘,为村镇管理工作提供信息和辅助决策。

关键词：数据挖掘空间聚类村镇管理 DBSCAN算法

消除食品背景杂菌干扰的金黄色葡萄球菌分离方法的改进

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中国食品学报 2021年第5期21卷 317-322页

作者：区楚君尚岱麒吴酉芝施春雷上海交通大学农业与生物学院上海200240 上海中侨职业技术大学上海201319

采用国家标准GB4789.10-2016《食品安全国家标准食品微生物学检验金黄色葡萄球菌检验》对冷冻肉及肉制品进行金黄色葡萄球菌分离鉴定,受背景杂菌干扰严重,产生大量假阴性结果,金黄色葡萄球菌的分离率偏低。为了解决这一问题,本研究通过... 详细信息

采用国家标准GB4789.10-2016《食品安全国家标准食品微生物学检验金黄色葡萄球菌检验》对冷冻肉及肉制品进行金黄色葡萄球菌分离鉴定,受背景杂菌干扰严重,产生大量假阴性结果,金黄色葡萄球菌的分离率偏低。为了解决这一问题,本研究通过改进国标方法,使用质量分数10%氯化钠肉汤进行增菌,增菌后划线于Baird-Parker琼脂平板上,挑取疑似菌落在含有质量分数4%琼脂和体积分数2%乙醇的胰蛋白酶大豆琼脂上进行分离纯化,再进行验证,食品中金黄色葡萄球菌的分离率由2.61%提至19.98%。通过该改进方法可有效避免假阴性结果。

关键词：食品金黄色葡萄球菌背景杂菌假阴性

沙门菌属特异性检测靶点碱基差异位点的识别及其血清型决定力

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食品科学 2017年第24期38卷 47-52页

作者：石秀清周秀娟施春雷张芬史贤明上海交通大学农业与生物学院中美食品安全联合研究中心微生物代谢国家重点实验室上海200240

以美国国家生物技术信息中心(NCBI)已公布的28株沙门菌(14个血清型)全基因组序列为研究对象,对前期研究获得的7个沙门菌属特异性检测靶点在不同血清型间的单核苷酸多态性进行比较分析,结果表明,S9和S69为碱基差异位点最多的两个靶点,具... 详细信息

以美国国家生物技术信息中心(NCBI)已公布的28株沙门菌(14个血清型)全基因组序列为研究对象,对前期研究获得的7个沙门菌属特异性检测靶点在不同血清型间的单核苷酸多态性进行比较分析,结果表明,S9和S69为碱基差异位点最多的两个靶点,具有沙门菌分子血清分型的潜在能力。随后,通过分析S9和S69在沙门菌不同血清型菌株中的差异位点,分别绘制两个血清分型靶点的差异位点表,从而获得了这两个靶点同时用于14个沙门菌血清型的快速分子血清分型的差异位点组合。在这些组合中,同一血清型具有相同的差异位点,不同血清型可以通过差异位点得以区分。最后,采集食品样品192份,用国标方法获得疑似沙门菌21株;利用血清分子分型靶点S9和S69进行快速分型,并同时用传统玻片凝集反应鉴定方法进行验证,两种方法鉴定结果的符合率为100%。鉴定结果为:21株沙门菌共包括4个不同血清型,其中肠炎沙门菌10株、鼠伤寒沙门菌7株、鸡沙门菌2株、纽波特沙门菌2株。基因组序列分析结果和分离株分型结果均表明,沙门菌特异分子检测靶点S9和S69相结合具备沙门菌的分子血清分型能力,以差异位点表为基础建立的血清分型方法有望替代传统的玻片凝集血清分型这一繁杂步骤,从而降低沙门菌血清鉴定的时间与成本,为聚合酶链式反应技术应用于沙门菌分子血清分型提供新思路。

关键词：沙门菌分子血清分型特异性检测靶点食品样品血清鉴定

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应用于北斗L、S频点的新型双频滤波器设计

固体电子学研究与进展 2023年第1期43卷 46-50页

作者：马振洋史超翰史春蕾中国民航大学安全科学与工程学院天津300300

提出了一种应用于北斗短报文波段(即L和S频点)的背靠背E形双频滤波器设计。该滤波器由两对公共馈电的背靠背E形谐振器并联组成,上方为背靠背E形的微带阶跃阻抗谐振器,下方为背靠背E形的缺陷阶跃阻抗谐振器。通过等效阻抗分析、表面电流... 详细信息

提出了一种应用于北斗短报文波段(即L和S频点)的背靠背E形双频滤波器设计。该滤波器由两对公共馈电的背靠背E形谐振器并联组成,上方为背靠背E形的微带阶跃阻抗谐振器,下方为背靠背E形的缺陷阶跃阻抗谐振器。通过等效阻抗分析、表面电流仿真、参数优化得到滤波器的结构,滤波器尺寸为34 mm×21 mm×0.762 mm。实测结果表明,该滤波器的两个中心频点分别为1.62 GHz和2.53 GHz,相对带宽分别为8%和3%,带内插入损耗均小于2.2 dB,回波损耗均大于11.8 dB,相邻通带间的隔离度大于15 dB。测试结果与仿真结果基本吻合。

关键词：枝节加载双频北斗导航系统带通滤波器阶跃阻抗谐振器