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Association mapping of lignin response to Verticillium wilt through an eight-way MAGIC population in Upland cotton

Journal of Integrative Agriculture 2023年第5期22卷 1324-1337页

作者： TIAN xiao-min HAN Peng WANG Jing shao pan-xia AN Qiu-shuang Nurimanguli AINI YANG Qing-yong YOU Chun-yuan LIN Hai-rong ZHU Long-fu pan Zhen-yuan NIE Xin-hui Key Laboratory of Oasis Eco-agricultural Xinjiang Production and Construction Corps/Agricultural CollegeShihezi UniversityShihezi 832003P.R.China College of Informatics Huazhong Agricultural UniversityWuhan 430070P.R.China Cotton Research Institute Shihezi Academy of Agricultural SciencesShihezi 832011P.R.China National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement/College of Plant Sciences&Technology Huazhong Agricultural UniversityWuhan 430070P.R.China

Lignin metabolism plays a pivotal role in plant defense against pathogens and is always positively correlated as a response to pathogen infection. Thus, understanding resistance genes against plant pathogens depends on a genetic analysis of the lignin response. This study used eight Upland cotton lines to construct a multi-parent advanced generation intercross(MAGIC) population(n=280), which exhibited peculiar characteristics from the convergence of various alleles coding for advantageous traits. In order to measure the lignin response to Verticillium wilt(LRVW), the artificial disease nursery(ADN) and rotation nursery(RN) were prepared for MAGIC population planting in four environments. The stem lignin contents were collected, and the LRVW was measured with the lignin value of ADN/RN in each environment, which showed significant variations. We employed 9 323 high-quality single-nucleotide polymorphism(SNP) markers obtained from the Cotton-SNP63K array for genotyping the MAGIC population. The SNPs were distributed through the whole genome with 4.78 SNP/Mb density, ranging from 1.14(ChrA06) to 10.08(ChrD08). In addition, a genome-wide association study was performed using a Mixed Linear Model(MLM) for LRVW. Three stable quantitative trait loci(QTLs), qLRVW-A04, qLRVW-A10, and qLRVW-D05, were identified in more than two environments. Two key candidate genes, Ghi_D05G01046 and Ghi_D05G01221, were selected within the QTLs through the combination of variations in the coding sequence, induced expression patterns, and function annotations. Both genes presented nonsynonymous mutations in coding regions and were strongly induced by Verticillium dahliae. Ghi_D05G01046 encodes a leucine-rich extensin(LRx) protein involved in Arabidopsis cell wall biosynthesis and organization. Ghi_D05G01221 encodes a transcriptional co-repressor novel interactor of novel interactor of jasmonic acid ZIM-domain(JAZ–NINJA), which functions in the jasmonic acid(JA) signaling pathway. In summary, t

关键词： genome-wide association study lignin response MAGIC population Upland cotton Verticillium wilt

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转化生长因子-β1和血管内皮生长因子在浓缩生长因子各层中的分布及含量特点

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北京大学学报（医学版） 2016年第5期48卷 860-865页

作者：陈飞潘韶霞冯海兰北京大学口腔医学院·口腔医院修复科口腔数字化医疗技术和材料国家工程实验室口腔数字医学北京市重点实验室北京100081 中国人民解放军总医院口腔科北京100853

目的:测定浓缩生长因子(concentrated growth factors,CGF)凝胶层与红细胞(red blood cells,RBC)层中转化生长因子-β1(transforming growth factor-β1,TGF-β1)、血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)分布及含量,探究TGF-β1、VEGF在CGF凝胶层内的分布及含量与其促成骨效应的相关性并指导临床应用。方法:招募6名健康志愿者,采集静脉血制备CGF样品。免疫组织化学法观察CGF凝胶层与RBC层中TGF-β1、VEGF的分布并测定制备即刻的累积光密度值(integrated optical density,IOD)和平均光密度值(average optical density,AOD)。酶联免疫吸附(enzyme-linked immunosorbent assays,ELISA)测定制备即刻上清层与制备1 d后CGF凝胶层析出液中TGF-β1、VEGF的浓度。结果:TGF-β1与VEGF大量聚集于CGF凝胶层中,在RBC层中仅位于多核细胞胞浆和散在的血小板内;CGF凝胶层与RBC层的交界区域有大量血小板与白细胞聚集,并有较高的TGF-β1表达;CGF凝胶层析出液中TGF-β1和VEGF的浓度分别为(55 236.78±3 686.34)ng/L和(610.99±148.81)ng/L,均显著高于上清层(20 710.20±4 523.14)ng/L和(335.20±51.69)ng/L(P<0.001)。结论:CGF凝胶层内含有大量TGF-β1、VEGF,可发挥促进成骨与加速组织愈合的作用。在临床应用中建议应用时间宜早为佳,除整个CGF层外,可将上清层、CGF层与RBC层交界区域一并使用。

关键词：浓缩生长因子转化生长因子β1 血管内皮生长因子骨生成

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对无牙颌患者ACP分类方法临床应用的评价

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北京大学学报（医学版） 2009年第1期41卷 86-89页

作者：潘韶霞 Jocelyne Sheila FEINE 冯海兰北京大学口腔医学院.口腔医院修复科北京100081 Mcgill University Faculty of Dentistry Montreal

目的：评价美国修复学院（American College of Prosthodontics，ACP）分类方法对临床无牙颌患者修复工作的指导意义，并分析医师对无牙颌患者修复预后的预期与患者自身评价间的关系。方法：采用ACP分类法，对107例老年无牙颌患者进行... 详细信息

目的：评价美国修复学院（American College of Prosthodontics，ACP）分类方法对临床无牙颌患者修复工作的指导意义，并分析医师对无牙颌患者修复预后的预期与患者自身评价间的关系。方法：采用ACP分类法，对107例老年无牙颌患者进行临床检查，用全口曲面断层片测量下颌骨最小垂直高度并分类，由医师评价患者全口义齿修复难度。全口义齿修复后半年，采用麦吉尔大学义齿满意度Visual Analog Scale（VAS）评价系统评估患者对下颌修复体的满意度。采用相关分析和多元线性回归法分析临床医师对无牙颌患者修复难易程度的评价，以及医师评价与患者报告满意度间的关系。结果：约80％（83／105）老年无牙颌患者可见重度剩余牙槽骨吸收。不同医师采用ACP分类法对下颌骨高度分类，测量者复测信度为0．96，测量者之间信度为0．90°对于下颌牙槽嵴高度低，形态较差（如刃状，不规则或低平）的患者，以及下颌牙槽嵴黏膜松软活动、末次义齿戴用年限长的患者，医师评估其下颌义齿修复难度大，在VAS评估法中体现为下颌骨最低高度小于11mm的患者较之大于11mm的患者，医师评估其难度高8．8％～16．1％（P〈0．05）。医师评估修复难度与修复后患者义齿满意度间相关系数r〈0．1。结论：由McGarry等医师于1999年提出的ACP无牙颌分类法具有较好的信度，为评价临床患者口腔条件，及医患交流提供了有力工具。然而，尽管医师能够较为准确地评价无牙颌患者的口腔解剖条件，但医师对病例修复难度的预测与患者修复后义齿满意度间并无相关性。

关键词：颌无牙牙槽突义齿全口病人满意度

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锥形束CT分析下颌无牙颌患者前部颌弓形态对“All-on-4”种植设计的影响

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北京大学学报（医学版） 2017年第4期49卷 699-703页

作者：李世赢李刚冯海兰潘韶霞北京大学口腔医学院·口腔医院修复科北京100081 北京大学口腔医学院·口腔医院放射科口腔数字化医疗技术和材料国家工程实验室口腔数字医学北京市重点实验室北京100081

目的:通过测量分析下颌无牙颌患者的锥形束CT(conebeam computed tomography,CBCT)图像,测量可能植入种植体的A-P距离(anterior-posterior distance),分类前部颌弓形态,探究颌弓形态对"All-on-4"远中倾斜种植体临床设计的影响。方法:收... 详细信息

目的:通过测量分析下颌无牙颌患者的锥形束CT(conebeam computed tomography,CBCT)图像,测量可能植入种植体的A-P距离(anterior-posterior distance),分类前部颌弓形态,探究颌弓形态对"All-on-4"远中倾斜种植体临床设计的影响。方法:收集下颌无牙颌患者的CBCT图像共74例,其中男性35例,女性39例,拟行"All-on-4"种植固定义齿修复。在经颏孔并平行于牙合平面的平面上测量可能植入种植体的A-P距离,分类前部颌弓形态,测量由颏孔往近中方向7.5 mm的颌骨段所跨过的颌弓弧度,探究A-P距离与该弧度的相关性。结果:74例患者测得可植入的颏孔间区种植体的A-P距离为(8.5±1.5)mm(最小为4.5 mm,最大为11.8 mm),其中≤7 mm者占12.2%(男性3例,女性6例),颌弓为方圆形;>7 mm、≤9 mm者占54.0%(男性20例,女性20例),颌弓为卵圆形;>9 mm者占33.8%(男性12例,女性13例),颌弓为尖圆形。测量患者颏孔前方7.5 mm颌弓段转角弧度,左、右两侧共测得148个数据,平均为15.9°±5.5°(最小为5.6°,最大为35.2°)。统计分析发现,A-P距离与转角弧度呈显著负相关。结论:本研究中下颌无牙颌患者的前部颌弓形态中,卵圆形所占百分比最多,尖圆形次之,方圆形最少。女性方圆形颌弓者多于男性,卵圆形和尖圆形颌弓与性别无明显相关。颌弓越方,A-P距离越小,颏孔前区颌弓弧度就越大,远中斜行种植体所需要的骨宽度就越大。下颌无牙颌患者的"All-on-4"种植固定修复采用远中斜行种植体,术前应评估颌弓形态,设计远中种植体的合理倾角,远中种植位点的骨宽度应在常规要求外留有余量。方圆形颌弓是"All-on-4"种植固定修复的不利因素。

关键词：下颌骨颌,无牙牙种植牙弓

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戴用义齿对无牙颌患者睡眠呼吸的影响

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北京大学学报（医学版） 2014年第2期46卷 299-301页

作者：邹东董霄松韩芳潘韶霞冯海兰北京大学口腔医学院.口腔医院修复科北京100081 北京大学人民医院呼吸科北京100044

目的:探讨戴用义齿对无牙颌患者睡眠呼吸的影响。方法:对9位无牙颌受试者进行多导睡眠仪(polysomnogram,PSG)监测自身对照睡眠研究,一夜不戴义齿,另一夜戴用义齿,比较患者呼吸暂停低通气指数(apnea and hypopnea index,AHI)、最低血氧... 详细信息

目的:探讨戴用义齿对无牙颌患者睡眠呼吸的影响。方法:对9位无牙颌受试者进行多导睡眠仪(polysomnogram,PSG)监测自身对照睡眠研究,一夜不戴义齿,另一夜戴用义齿,比较患者呼吸暂停低通气指数(apnea and hypopnea index,AHI)、最低血氧饱和度(L-SpO2)、晨起血压等指标。结果:9位无牙颌受试者中,佩戴义齿较不戴义齿AHI增加的有8人,减少的有1人;不戴义齿睡眠时,9位受试者的平均AHI为8.82,戴用义齿后AHI增加至11.72,差异有统计学意义(P0.05)。结论:无牙颌人群在睡眠时戴用义齿可能会增加睡眠呼吸暂停低通气发生的频次。

关键词：睡眠呼吸暂停综合征颌无牙义齿

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液基薄层细胞检查与高危型人乳头瘤病毒检测在宫颈癌筛查中的应用价值

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中国当代医药 2020年第11期27卷 92-94页

作者：潘少霞舒晴广东省清远市中医院检验科广东清远511500

目的分析液基薄层细胞(TCT)检查与高危型人乳头瘤病毒(HPV)检测在宫颈癌筛查中的应用价值。方法选取2018年1月~2019年3月于我院行宫颈癌疾病筛查的260例患者作为研究对象,所有患者均接受TCT、HPV检查与病理活检。以病理活检结果作为疾... 详细信息

目的分析液基薄层细胞(TCT)检查与高危型人乳头瘤病毒(HPV)检测在宫颈癌筛查中的应用价值。方法选取2018年1月~2019年3月于我院行宫颈癌疾病筛查的260例患者作为研究对象,所有患者均接受TCT、HPV检查与病理活检。以病理活检结果作为疾病诊断金标准,评估TCT及HPV行单一或联合疾病检查的灵敏度、特异度与诊断符合率。结果病理活检诊断炎症133例,宫颈上皮内瘤样变(CIN)119例,宫颈癌8例。高危型HPV检查的诊断符合率为79.23%,灵敏度为75.59%,特异度为82.71%;TCT检查的诊断符合率为83.46%,灵敏度为80.31%,特异度为86.47%;联合检查的诊断符合率为96.92%,灵敏度为96.85%,特异度为96.99%。联合检查的诊断符合率、灵敏度及特异度均高于HPV、TCT单一检测,差异有统计学意义(P<0.05)。结论推荐疑似宫颈癌患者行高危型HPV及TCT联合检查,临床诊断符合率高,灵敏度、特异度佳,可为临床疾病的诊断提供较精准的参考依据,值得推广。

关键词：高危型液基薄层细胞检查高危型人乳头瘤病毒检测宫颈癌筛查

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一种数字化全口义齿的临床疗效评价

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北京大学学报（医学版） 2020年第4期52卷 762-770页

作者：魏菱邹东陈虎潘韶霞孙玉春周永胜北京大学口腔医学院·口腔医院修复科国家口腔疾病临床医学研究中心口腔数字化医疗技术和材料国家工程实验室口腔数字医学北京市重点实验室北京100081 中日友好医院口腔医学中心北京100029

目的:比较计算机辅助设计与制造(computer aided design/computer aided manufacturing,CAD/CAM)技术制作的数字化全口义齿与传统方法制作的全口义齿的临床疗效。方法:纳入20例无牙颌患者,通过前瞻性、单盲、自身对照临床实验,每人分别... 详细信息

目的:比较计算机辅助设计与制造(computer aided design/computer aided manufacturing,CAD/CAM)技术制作的数字化全口义齿与传统方法制作的全口义齿的临床疗效。方法:纳入20例无牙颌患者,通过前瞻性、单盲、自身对照临床实验,每人分别采用功能易适性数字化义齿(functional suitable denture,FSD)制作系统及传统方法制作全口义齿。义齿完成后,首先戴用传统全口义齿,3个月后交换戴用数字化全口义齿。患者于修复前、修复后第2周、第1个月、第2个月、第3个月填写无牙颌口腔健康影响量表-20(oral health impact profile edentulous,OHIP-20E)和义齿满意度视觉模拟评分量表(visual analogue scale,VAS)。于两副义齿戴用后的第3个月,分别进行咀嚼效率测试。结果:20例患者在戴牙后第3个月,FSD全口义齿VAS评分在总体满意度、易清洁性、发音、美观、稳定、口腔状况这6个方面均值均高于传统全口义齿,而在舒适、咀嚼能力、嚼碎功能这3个方面VAS评分的均值与传统全口义齿基本持平,但差异无统计学意义(P>0.05);FSD全口义齿OHIP-20E评分在各个方面的均值均高于传统全口义齿,其中功能受限、心理不适、总评分这3个方面评分差异有统计学意义(P<0.05);咀嚼效率测量结果为,FSD全口义齿平均咀嚼效率(1.20±0.54)高于传统全口义齿的平均咀嚼效率(1.16±0.53),差异无统计学意义(P=0.691)。结论:本研究评价的数字化全口义齿的疗效与传统全口义齿相同,在患者满意度及口腔相关生活质量评价方面都展现出相同的治疗效果。

关键词：计算机辅助设计与制造功能易适性数字化义齿系统全口义齿临床疗效

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矿化胶原复合物引导组织再生膜体外性能测试

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口腔颌面修复学杂志 2005年第4期6卷 249-252页

作者：潘韶霞冯海兰北京大学口腔医学院修复科博士生北京100081

目的:研究一种新型可吸收性引导组织再生(GuidedTissueRegeneration,GTR)膜的机械力学性能,以及其体外降解过程。方法:通过在聚乳酸(Polylactide,PLA)中加入矿化胶原复合物(nano-hydroxyapatite/collagen,nHAC)获得复合GTR膜,矿化胶原中的无机物为纳米相的羟基磷灰石。测量不同nHAC含量的复合膜的弹性模量和最大拉伸强度,通过热失重分析评估模拟体液浸泡后样本无机相的变化,并通过扫描电镜观察样本表面形态的变化。结果:当nHAC/PLA比例为0.4:1,各项力学性能指标达到最高值。复合膜表面可以观察到比较活跃的晶体溶解和再沉积过程。结论:在本实验条件下,复合GTR膜nHAC/PLA比例为0.4:1力学性能最佳。体外情况下复合膜表面有较活跃的晶体溶解和再沉积过程。

关键词：引导组织再生纳米相羟基磷灰石聚乳酸扫描电镜

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选择性激光熔化种植体对早期骨矿化沉积率的影响

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北京大学学报（医学版） 2018年第1期50卷 117-122页

作者：刘婧寅陈飞葛严军魏菱潘韶霞冯海兰北京大学口腔医学院.口腔医院第一门诊部修复科口腔数字化医疗技术和材料国家工程实验室口腔数字医学北京市重点实验室北京100034 北京大学口腔医学院.口腔医院修复科北京100081 中国人民解放军总医院口腔科

目的:研究由选择性激光熔化(selective laser melting,SLM)技术制备的钛种植体的粗糙表面对种植体周围早期骨矿化沉积率的影响。方法:在两只成年雄性比格犬下颌骨愈合拔牙窝分别植入SLM种植体和大颗粒喷砂酸蚀(sandblasted,large-grit,a... 详细信息

目的:研究由选择性激光熔化(selective laser melting,SLM)技术制备的钛种植体的粗糙表面对种植体周围早期骨矿化沉积率的影响。方法:在两只成年雄性比格犬下颌骨愈合拔牙窝分别植入SLM种植体和大颗粒喷砂酸蚀(sandblasted,large-grit,acid-etched,SLA)种植体共16颗,分为埋入愈合和穿龈愈合即刻负重,在植入后2、4、8周分别注射3种四环素类荧光标记物,用以标记和观察新骨。植入12周时处死两只比格犬,制作硬组织切片共16张,经甲苯胺蓝染色后在光学显微镜和激光扫描共聚焦荧光显微镜下观察标本,对比各组种植体周围的新骨形成情况并计算平均骨矿化沉积率。结果:SLM种植体在植入术后12周与骨组织之间形成了良好的骨结合,新生骨在其粗糙表面爬行生长并渗透于孔隙之间,SLM种植体的平均骨矿化沉积率明显高于SLA种植体(P<0.01)。结论:SLM法制备的钛种植体可以促进种植体周围早期骨整合,提高早期骨矿化速率。

关键词：牙种植体选择性激光熔化骨生成矿化沉积率荧光染料

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早期负重小直径种植体下颌覆盖义齿对咀嚼功能的影响

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北京大学学报（医学版） 2013年第5期45卷 798-802页

作者：廖晓玲潘韶霞冯海兰康艳凤彭东北京大学口腔医学院.口腔医院修复科北京100081 天津市口腔医院北京大学口腔医学院.口腔医院临床口腔生理实验室北京100081

目的：评价应用早期负重小直径种植体下颌覆盖义齿对老年无牙颌患者咀嚼功能、嚼碎能力及咀嚼效率的影响.方法：选取8名下无牙颌患者行下颌前部颏孔间区两颗小直径种植体（种植体直径3.25 mm或2.2 mm,ERA Mini Dental,Zimmer Dental Inc... 详细信息

目的：评价应用早期负重小直径种植体下颌覆盖义齿对老年无牙颌患者咀嚼功能、嚼碎能力及咀嚼效率的影响.方法：选取8名下无牙颌患者行下颌前部颏孔间区两颗小直径种植体（种植体直径3.25 mm或2.2 mm,ERA Mini Dental,Zimmer Dental Inc.）植入手术及下颌覆盖义齿修复术.种植体于术后2~4周早期负重.在术前、负重后2周、3个月及6个月行义齿满意度视觉模拟评分（visual analogue scale,VAS）问卷调查,以评价义齿满意度及咀嚼不同种类食物能力的变化情况.在术前及负重后6个月行光密度法测定咀嚼效率,以评价种植体固位对咀嚼效率的改善程度.结果：在6个月的观察期内,临床检查种植体周围牙龈健康,全部16颗种植体无松动或叩痛.经SPSS 18.0统计学软件进行前后自身对照配对t检验,种植体早期负重后2周、3个月及6个月分别与术前相比,义齿满意度VAS评分在总体满意度、稳定性、咀嚼能力及嚼碎功能等方面改变量大于30,差异均有统计学意义（P〈0.01）,其中针对不同种类的食物咀嚼能力及嚼碎功能均有显著改善,尤其是进食脆硬及硬韧食物改变量大于40,差异有统计学意义（P〈0.01）.光密度法测定术后6个月咀嚼效率,与术前相比提高约3倍,差异有统计学意义（P〈0.01）.结论：两颗小直径种植体固位的下颌覆盖义齿能够显著提高患者的咀嚼效率及义齿满意度,使患者日常饮食从高热低营养转向较为健康的饮食,改善了日常所进食物的种类.

关键词：牙种植体负重义齿,覆盖

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