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cell2mol:encoding chemistry to interpret crystallographic data

npj Computational Materials 2022年第1期8卷 1787-1794页

作者： Sergi Vela ruben laplaza Yuri Cho Clémence Corminboeuf Laboratory for Computational Molecular Design(LCMD) Institute of Chemical Sciences and Engineering(ISIC)École Polytechnique Fédérale de Lausanne(EPFL)CH-1015LausanneSwitzerland National Centre for Computational Design and Discovery of Novel Materials(NCCR MARVEL) Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne1015LausanneSwitzerland National Centre for Competence in Research“Sustainable chemical processes through catalysis(NCCR Catalysis)” École Polytechnique Fédérale de Lausanne1015LausanneSwitzerland

The creation and maintenance of crystallographic data repositories is one of the greatest data-related achievements in *** such as the Cambridge Structural Database host what is likely the most diverse collection of synthesizable *** properly mined,they could be the basis for the large-scale exploration of new regions of the chemical space using quantum chemistry(QC).Yet,it is currently challenging to retrieve all the necessary information for QC codes based exclusively on the available structural data,especially for transition metal *** overcome this limitation,we present cell2mol,a software that interprets crystallographic data and retrieves the connectivity and total charge of molecules,including the oxidation state(OS)of metal *** demonstrate that cell2mol outperforms other popular methods at assigning the metal OS,while offering a comprehensive interpretation of the unit *** code is made available,as well as reliable QC-ready databases totaling 31k transition metal complexes and 13k ligands that contain incomparable chemical diversity.

关键词： offering overcome properly

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