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HCSGD：An integrated database of human cellular senescence genes

Journal of Genetics and Genomics 2017年第5期44卷 227-234页

作者： qiongye dong Hongqing Han Xuehui Liu Lei Wei Wei Zhang Zhen Zhao Michael Q.Zhang Xiaowo Wang Ministry of Education Key Laboratory of Bioinformatics Center for Synthetic and Systems Biology Department of Automation Tsinghua University Beijing100084 China Bioinformatics Division Tsinghua National Laboratory for Information Science and Technology Beijing 100084 China Department of Basic Medical Sciences School of Medicine Tsinghua University Beijing 100084 China

Cellular senescence is an irreversible cell cycle arrest program in response to various exogenous and endogenous stimuli like telomere dysfunction and DNA *** has been widely accepted as an antitumor program and is also found closely related to embryo development,tissue repair,organismal aging and age-related degenerative *** the past decades,numerous efforts have been made to uncover the gene regulatory mechanisms of cellular *** is a strong demand to integrate these data from various resources into one open *** facilitate researchers on cellular senescence,we have developed Human Cellular Senescence Gene Database（HCSGD） by integrating multiple online published data sources into a comprehensive senescence gene annotation platform（http：//***/member/xwwang/HCSGD）.Potential Human Cellular Senescence Genes（HCSGS）were collected by combining information from published literatures,gene expression profiling data and Protein-Protein Interaction ***,genes are annotated with gene ontology annotation and microRNA/drug/compound target *** provides a valuable resource to visualize cellular senescence gene networks,browse annotated functional information,and retrieve senescenceassociated genes with a user-friendly web interface.

关键词： Cellular senescence Meta-analysis Text-mining

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抗衰老药物对线虫生存曲线影响的荟萃分析

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中国科学：生命科学 2015年第5期45卷 479-487页

作者：梁亚茹刘畅王卓然董琼叶汪小我王钊清华大学医学院蛋白质科学教育部重点实验室北京100084 清华大学自动化系清华信息科学与技术国家实验室(筹)生物信息学研究部合成与系统生物学研究中心生物信息学教育部重点实验室北京100084

随着世界人口老龄化步伐的加快,衰老机制及抗衰老药物的研究日益成为生物医学领域的热点前沿之一.国内外已有大量研究报道抗衰老药物能够延长多种模式生物包括线虫、果蝇、小鼠、大鼠及灵长类等的寿命,然而,这些药物延缓衰老方式的差异... 详细信息

随着世界人口老龄化步伐的加快,衰老机制及抗衰老药物的研究日益成为生物医学领域的热点前沿之一.国内外已有大量研究报道抗衰老药物能够延长多种模式生物包括线虫、果蝇、小鼠、大鼠及灵长类等的寿命,然而,这些药物延缓衰老方式的差异仍缺乏系统研究.因此,本研究以衰老研究的热点模式生物线虫为对象,搜集1990年以来国内外刊物上正式发表的有关抗衰老药物寿命试验的研究文献及其涉及的生存曲线,利用荟萃分析比较了不同抗衰老药物与生存曲线变化类型间的关系,并结合药物的药理作用探讨其延寿机制.生存曲线特征聚类结果与药物生物学分类交叉分析结果表明,药理作用类型与增益类型具有很强相关性,提示这2种分类方法的结果是匹配的.抗氧化剂类药物和控制血糖类药物对生存曲线的改善总体增益虽然不是最高,但相对于正常组生存曲线其增益部分呈平移形,表明该类药物可以通过改善年龄结构对整个群体产生显著增益,且其衰老曲线的特征与自然衰老相似.抗癫痫药物及胃肠道菌群相关药物总体增益较大,其曲线增益形状呈梯形,提示该类药物(尤其是胃肠道菌群相关药物)尽管显著延长了少数个体的最大寿命,但是从整个群体来看,大多数个体寿命延长程度并不明显,受益的少数个体可能需要较长的外界资源支持方能保持较长时间的存活状态,这种模式既不大众化也不经济.综上所述,清除自由基和控制血糖类药物对健康老年有着更为积极合理的作用与效应.

关键词：衰老抗衰老生存曲线线虫药物荟萃分析

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