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A recombineering system for Bacillus subtilis based on the native phage recombinase pair YqaJ/YqaK

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Engineering Microbiology 2023年第3期3卷 21-29页

作者： qingshu liu Ruijuan Li Hongbo Shi Runyu Yang Qiyao Shen Qingwen Cui Xiuling Wang Aiying Li Youming Zhang Jun Fu State Key Laboratory of Microbial Technology Shandong UniversityQingdao 266237China Hunan Institute of Microbiology Xinkaipu Lu 18Tianxin DistrictChangsha 410009China

Bacillus subtilis plays an important role in fundamental and applied research,and it has been widely used as a cell factory for the production of enzymes,antimicrobial materials,and chemicals for agriculture,medicine,and ***,genetic manipulation tools for *** have low *** this work,our goal was to develop a simple recombineering system for *** showed that genome editing can be achieved in *** 1A751 through co-expression of YqaJ/YqaK,a native phage recombinase pair found in ***-tilis 168,and the competence master regulator ComK using a double-stranded DNA substrate with short ho-mology arms(100 bp)and a phosphorothioate modification at the 5′-*** gene knockouts and large DNA insertions were achieved using this new recombineering system in *** *** far as we know,this is the first recombineering system using the native phage recombinase pair YqaJ/YqaK in *** conclusion,this new recombineering system provides a simple and fast tool for genetic manipulation of ***-tilis,and it will promote studies of genome function,construction of production strains,and genome mining in ***.

关键词： Bacillus subtilis Recombineering YqaJK system Genome editing

THE CO-RELATIONSHIP BETWEEN NEIGUAN POINT AND THE HEART AND REGULATION OF AMYGDALOID NUCLEI

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World Journal of Acupuncture-Moxibustion 1995年第2期5卷 57-62页

作者： Cao qingshu, Wen Shen, liu Junling, Han Zhenjing, Chen ShupingInstitute of Acupuncture and Moxibustion , China Academy of TCM, Beijing 100700 , China

In this present study, the ruodel of the rabbit with acute myocardial ischemia（AMI） was used to explore mechanisms of interrelation hetween Neiguan acupoint （PC 6） of the Peri-cardium Meridian and the heart hy employing physiological and morphologicaI methods. It wasdemonstrated that electroacupuncture （EA） at Neiguan （PC 6 ） couId raise the eIectrical excitahility ofischemic myocardium, lessen the dispersity of recovery excitability, correct the disorder of electricalactivity; protect myocardiac glycogen and phosphorylase and alleviate their depletion, increase contentof ribonuclei acid （RNA ）, etc., indicating that EA could help oxidative rnetaholism carry out normal-Iy and irnProve nutritional state of the ischemic myocardiurn. The key point of EA action is probablyregulates the coronary microclrculation of heart and reclistributes myocardial blood flow. Studies withalkaline phosphatase （ALP ）, Mg2--ATPase and ABS casting of the Ieft coronary artery showed thatafter EA the number and the Iength

关键词： Electroacupuncture Rabbit Acute myocardial ischemia Pericardium Meridian Amygdaloid nuclei

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浅析TBM隧道管片排版BIM软件开发

水电站设计 2020年第1期36卷 59-62,66页

作者：刘庆舒陈改霞中国电建集团成都勘测设计研究院有限公司四川成都610072 首辅工程设计有限公司四川成都610041

本文介绍了笔者开发的TBM隧道管片排版BIM软件的技术路线,从公路隧道路线、管片的数学模型出发,基于几何关系,对管片预排版方法进行研究;基于施工过程,研究了管片动态排版;最后对BIM模型进行了讨论。本文对使用TBM隧道管片排版软件及理... 详细信息

本文介绍了笔者开发的TBM隧道管片排版BIM软件的技术路线,从公路隧道路线、管片的数学模型出发,基于几何关系,对管片预排版方法进行研究;基于施工过程,研究了管片动态排版;最后对BIM模型进行了讨论。本文对使用TBM隧道管片排版软件及理解软件的原理有较大的帮助,对开发类似BIM软件有一定的参考价值。

关键词： TBM隧道管片路线排版 BIM CATIA

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网架组拼、吊装过程中的施工测量

土木工程与管理学报 1989年第1期27卷 64-67页

作者：刘庆恕武汉城市建设学院城市规划系

本文就一体育馆的网架组拼、吊装过程中的施工测量作了分析,指出网架吊装就位产生偏心位移是客观存在,偏心量的大小取决于施工过程中的温差变化,且超过了 JGJ7—80规范的要求.对此笔者提出了相应的建议.

关键词：网架结构组拚和吊装测量偏心位移

基于3DE平台的某水电站场内交通工程建模适应性分析

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水电站设计 2021年第3期37卷 22-24页

作者：冯亮刘庆舒中国电建集团成都勘测设计研究院有限公司四川成都610072

本文介绍了西南地区某水电站场内交通工程三维建模的技术路线,展示了基于3DE软件进行公路工程路线、路基路面、桥梁、隧道、交安、机电附属设施建模的方法和成果。本文对各种道路工程三维建模工作具有一定的参考价值。

关键词： 3DE 路线结构物三维建模

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一株李维斯链霉菌的鉴定及其抗病促生性能

微生物学报 2024年第12期64卷 4859-4868页

作者：黄军唐滢黄彬彬李晔张翠央郭照辉刘清术湖南省微生物研究院湖南长沙410009 湖南省农用微生物应用工程技术研究中心湖南长沙410009 国家植保微生物种质资源库(湖南) 湖南长沙410009

【目的】探究一株李维斯链霉菌的抗病促生性能,鉴定其抑菌活性成分。【方法】从耐旱稗草根际分离到一株能抑制多种病原真菌及细菌的链霉菌,采用形态学观察及16SrRNA基因序列分析的方法对菌株进行鉴定;运用液相色谱和高分辨质谱技术鉴定... 详细信息

【目的】探究一株李维斯链霉菌的抗病促生性能,鉴定其抑菌活性成分。【方法】从耐旱稗草根际分离到一株能抑制多种病原真菌及细菌的链霉菌,采用形态学观察及16SrRNA基因序列分析的方法对菌株进行鉴定;运用液相色谱和高分辨质谱技术鉴定活性物质成分;利用二代Illumina与三代Nanopore测序技术进行全基因组测序;antiSMASH分析该菌株中活性成分的生物合成基因簇。【结果】李维斯链霉菌L2的菌体及发酵液能高效抑制革兰氏阳性菌及多种植物病原真菌的生长,能在铬天青平板(chrome azurol sulphonate,CAS)上产生较大的噬铁圈,还具有较好的产吲哚乙酸(indole-3-acetic acid,IAA)的能力。其抑菌活性成分的m/z为537.1020[M+H]^(+)(calcd for C_(27)H_(20)O_(12),537.1035,2.2×10^(-6)),523.0863[M+H]^(+)(calcd for C_(26)H_(18)O_(12),523.0878,2.9×10^(-6)),分别与α-鲁霉素、β-鲁霉素、γ-鲁霉素的精确分子量相符,误差小于1/5000000,其高效液相色谱保留时间与鲁霉素标准品一致。该菌基因组总长8.8 Mb,预测编码有鲁霉素等32个次级代谢产物生物合成基因簇。【结论】李维斯链霉菌L2具有较好的抗病促生性能,适宜进一步开发为生防菌剂,其抑菌活性成分为鲁霉素。

关键词：李维斯链霉菌植物根际促生菌鲁霉素抗病促生

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基于3DE的桩基工程三维建模程序开发研究

水电站设计 2023年第4期39卷 53-56页

作者：刘庆舒谢昔奎陈改霞中国电建集团成都勘测设计研究院有限公司四川成都610072 首辅工程设计有限公司四川成都610000

采用UDF功能实现单桩建模,通过对桩基工程应用情况抽象出基于表格布置、线性布置、平面网状布置三种基本的布置方式,运用EKL语言调用UDF实现了桩基工程的快速建模;采用相同的技术实现承台、冠梁等构件的快速建模,对土木工程三维建模工... 详细信息

采用UDF功能实现单桩建模,通过对桩基工程应用情况抽象出基于表格布置、线性布置、平面网状布置三种基本的布置方式,运用EKL语言调用UDF实现了桩基工程的快速建模;采用相同的技术实现承台、冠梁等构件的快速建模,对土木工程三维建模工作具有较大的参考价值。

关键词： 3DE 桩基工程 UDF 工程模板 EKL 三维建模

双组分因子LiaRS调控短短芽胞杆菌X23伊短菌素生物合成的研究

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中国生物防治学报 2024年第5期40卷 1036-1044页

作者：邱丽婷张亮刘天波巢进蔡海林易克刘清术陈武湖南农业大学植物保护学院长沙410128 湖南农业大学农学院长沙410128 湖南省烟草科学研究所长沙410004 湖南省湘西自治州烟草公司技术中心湘西416000 湖南省长沙市烟草公司技术中心长沙410019 湖南中烟工业有限责任公司原料采购中心长沙410007 湖南省微生物研究院长沙410009

双组分系统(two-component system,TCS)参与多种芽胞杆菌次级代谢产物生物合成的调控,但调控伊短菌素生物合成的TCS鲜见报道。前期转录组测序分析发现,在短短芽胞杆菌X23中,双组分因子LiaRS与伊短菌素生物合成基因簇(edeBGC)的表达趋势... 详细信息

双组分系统(two-component system,TCS)参与多种芽胞杆菌次级代谢产物生物合成的调控,但调控伊短菌素生物合成的TCS鲜见报道。前期转录组测序分析发现,在短短芽胞杆菌X23中,双组分因子LiaRS与伊短菌素生物合成基因簇(edeBGC)的表达趋势一致,推测其可能参与伊短菌素生物合成的调控,通过Red/ET同源重组法敲除野生型X23的liaS和liaR基因,构建了突变体菌株,平皿对峙培养、qRT-PCR定量分析和HPLC-MS靶向代谢分析等结果表明,在相同培养条件下,突变菌株的抑菌圈直径较野生型显著增加,伊短菌素生物合成基因簇的表达量显著上调,且伊短菌素的峰面积是野生型的1.3倍。本研究发现LiaRS是伊短菌素生物合成的负调控因子,为伊短菌素的代谢工程改造提供了候选基因元件。

关键词：短短芽胞杆菌伊短菌素双组分系统 LiaRS Red/ET同源重组

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辣椒果实胎座中生防细菌对白绢病的防效

湖南农业大学学报（自然科学版） 2020年第3期46卷 331-335页

作者：吕翠张亮黄军刘清术郑井元王运生戴良英陈武湖南农业大学植物保护学院湖南长沙410128 湖南农业大学农学院湖南长沙410128 湖南省微生物研究院湖南长沙410009 湖南省蔬菜研究所湖南长沙410125

从辣椒果实胎座中分离出60株内生细菌,平皿对峙培养发现13株细菌对辣椒白绢病菌(Sclerotium rolfsii Sacc.)有拮抗作用,其中6株对白绢病抑制率较高的生防菌对辣椒疫病(Phytophthora capsici)和辣椒炭疽病(Colletotrichum capsici)病原... 详细信息

从辣椒果实胎座中分离出60株内生细菌,平皿对峙培养发现13株细菌对辣椒白绢病菌(Sclerotium rolfsii Sacc.)有拮抗作用,其中6株对白绢病抑制率较高的生防菌对辣椒疫病(Phytophthora capsici)和辣椒炭疽病(Colletotrichum capsici)病原菌也有抑菌活性。16Sr RNA鉴定结果表明,菌株G242和T443为贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis),菌株YZ12、G241、T151、T442为解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)。以单一菌株或菌株复配进行盆栽试验,结果 G241和T443复配后对辣椒白绢病的防效达到88.41%,高于单一菌株G241(29.14%)和T443(38.16%)的防效。

关键词：辣椒果实胎座生防菌辣椒白绢病防效