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The mRNA–miRNA–lncRNA Regulatory Network and Factors Associated with Prognosis Prediction of Hepatocellular Carcinoma

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Genomics, Proteomics & Bioinformatics 2021年第6期19卷 913-925页

作者： Bo Hu Xiaolu Ma Peiyao Fu qiman sun Weiguo Tang Haixiang sun Zhangfu Yang Mincheng Yu Jian Zhou Jia Fan Yang Xu Department of Liver Surgery and Transplantation Liver Cancer InstituteZhongshan Hospitaland Key Laboratory of Carcinogenesis and Cancer Invasion(MOE)Fudan UniversityShanghai 200032China State Key Laboratory of Genetic Engineering Fudan UniversityShanghai 200032China Institute of Biomedical Sciences Fudan UniversityShanghai 200032China Laboratory Medicine Department Zhongshan Hospitaland Key Laboratory of Carcinogenesis and Cancer Invasion(MOE)Fudan UniversityShanghai 200032China Institute of Fudan-Minhang Academic Health System Minhang HospitalFudan UniversityShanghai 201199China Endoscopy Centre Zhongshan HospitalFudan UniversityShanghai 200032China

The aim of this study was to identify novel prognostic mRNA and microRNA(miRNA)biomarkers for hepatocellular carcinoma(HCC)using methods in systems *** expressed mRNAs,miRNAs,and long non-coding RNAs(lncRNAs)were compared between HCC tumor tissues and normal liver tissues in The Cancer Genome Atlas(TCGA)***,a prognosis-associated mRNA co-expression network,an mRNA–miRNA reg-ulatory network,and an mRNA–miRNA–lncRNA regulatory network were constructed to identify prognostic biomarkers for HCC through Cox survival *** prognosis-associated mRNA co-expression modules were obtained by analyzing these differentially expressed *** expression module including 120 mRNAs was significantly corre-lated with HCC patient *** with patient survival data,several mRNAs and miRNAs,including CHST4,SLC22A8,STC2,hsa-miR-326,and hsa-miR-21 were identified from the network to predict HCC patient *** significance was investigated using tissue microarray analysis of samples from 258 patients with *** annotation of hsa-miR-326 and hsa-miR-21-5p indicated specific associations with several cancer-related *** present study provides a bioinformatics method for biomarker screening,leading to the identification of an integrated mRNA–miRNA–lncRNA regulatory network and their co-expression patterns in relation to predicting HCC patient survival.

关键词： TCGA database mRNA-miRNA-lncRNA regulatory network Hepatocellular carcinoma Prognostic factor Systems biology

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复发肝细胞癌的处理

中华肝脏外科手术学电子杂志 2019年第2期8卷 83-86页

作者：孙绮蛮付佩尧周俭复旦大学附属中山医院肝外科复旦大学肝癌研究所

肝细胞癌(肝癌)是目前世界第六大常见肿瘤,同时也是第三位的肿瘤致死病因,其发病率在世界范围内呈逐年上升趋势。肝切除术是肝癌患者的首选治疗方法。然而,尽管随着医疗技术的进步,肝脏手术禁区的不断突破,越来越多患者获得了进一步治... 详细信息

肝细胞癌(肝癌)是目前世界第六大常见肿瘤,同时也是第三位的肿瘤致死病因,其发病率在世界范围内呈逐年上升趋势。肝切除术是肝癌患者的首选治疗方法。然而,尽管随着医疗技术的进步,肝脏手术禁区的不断突破,越来越多患者获得了进一步治疗的机会,但肝癌具有高复发率的特性,术后5年复发率可达70%,严重影响患者远

关键词：癌,肝细胞肿瘤复发,局部治疗应用消融技术

白细胞介素2受体拮抗剂对肝移植后新发糖尿病发病及其转归的影响

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中华内分泌代谢杂志 2018年第2期34卷 121-128页

作者：梁璟薛孟娟陈显英黄晓武孙绮蛮王婷高键周俭樊嘉于明香上海复旦大学附属中山医院内分泌科 200032 上海复旦大学附属中山医院肝癌研究所、教育部癌变与侵袭原理重点实验室、上海市器官移植重点实验室 200032 上海复旦大学附属中山医院重症医学科 200032 上海复旦大学附属中山医院临床流行病与循证医学中心 200032

目的探讨白细胞介素2受体拮抗剂（interleukin-2 receptor antagonists, IL-2Ra）在肝移植受者中对移植后新发糖尿病（newly-onset diabetes after transplantation, NODAT）发病及其转归的影响。方法回顾性调查2001年4月至2016年12月在我院肝外科接受同种异体肝移植术的879例患者的术前及术后临床资料，按照术后是否应用IL-2Ra将其分为IL-2Ra使用组和未使用组；按照NODAT是否发生逆转将其分为暂时性NODAT（Transient-NODAT，T-NODAT）和持续性NODAT（Persistent-NODAT，P-NODAT）；并分析IL-2Ra对NODAT、T-NODAT累计发病率及其发病风险的影响，进一步探讨IL-2Ra对肝移植NDOAT患者远期生存的影响。结果共入组879例肝移植受者，IL-2Ra使用组（549人）共计177人（32.24%）发生NODAT，其中29.38%（52人）发生逆转；未使用组（330人）共计131人（39.70%）发生NODAT，其中26.72%（35人）发生逆转。校正18项相关混杂因素后分析发现，IL-2Ra使用组的NODAT累计发病率显著低于未使用组（校正后P＝0.028），且IL-2Ra是肝移植NODAT发病的独立保护因素（HR＝0.774, 95%CI 0.616～0.973, P＝0.028）；而使用IL-2Ra与否与肝移植NODAT患者的逆转情况并无显著联系。IL-2Ra使用组NODAT患者的生存情况显著优于未使用组（校正后P＝0.001）。结论使用IL-2Ra可显著降低肝移植受者发生NODAT的风险，并且显著改善肝移植NODAT患者的远期生存。

关键词：移植后新发糖尿病肝移植白细胞介素2受体拮抗剂

基于DCF协议的基本服务集互听的系统性能分析

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中国科技论文在线精品论文

中国科技论文在线精品论文 2024年第2期17卷 183-195页

作者：高绮蔓雷羽孙浩王诗辽宁工程技术大学电子与信息工程学院辽宁葫芦岛125105

本文首先介绍了在分布式协调机制(distributed coordination function,DCF)下数据传输流程和蒙特卡洛仿真流程。其次,为分析在复杂条件下的系统性能,本文对二维马尔科夫模型进行改进并建立了一个以吞吐量期望为系统评价指标的信道接入... 详细信息

本文首先介绍了在分布式协调机制(distributed coordination function,DCF)下数据传输流程和蒙特卡洛仿真流程。其次,为分析在复杂条件下的系统性能,本文对二维马尔科夫模型进行改进并建立了一个以吞吐量期望为系统评价指标的信道接入机制性能分析框架。最后,为了评估所建立的框架的有效性和准确性,本文将两组实际参数作为框架输入,进行吞吐量的求解,并进行了两组仿真实验得出物理层速率对系统单节点吞吐量的影响。仿真结果表明,本文所建立的信道接入机制性能分析框架在推导吞吐量方面具有较高的精度,与仿真器模拟结果相比误差较小,对指导实际网络信道接入具有科学的参考意义。

关键词：通信技术分布式协调机制马尔科夫模型蒙特卡洛仿真

符合"复旦标准"的肝癌肝移植受者复发后生存状况及诊治策略

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中华器官移植杂志 2021年第2期42卷 82-86页

作者：贺轶锋宋康杨国欢孙琦蛮孙健肖永胜王征施国明史颖弘黄晓武樊嘉周俭复旦大学附属中山医院肝外科癌变与侵袭原理教育部重点实验室上海市器官移植重点实验室上海200032

目的分析影响肝癌肝移植术后复发受者生存状况的临床病理因素,总结诊治经验。方法对102例符合"复旦标准"移植后肿瘤复发受者的临床病理特征及诊治方案进行比较(单因素分析),通过Cox多因素分析得到有独立意义的预后指标。结果本组受者1、... 详细信息

目的分析影响肝癌肝移植术后复发受者生存状况的临床病理因素,总结诊治经验。方法对102例符合"复旦标准"移植后肿瘤复发受者的临床病理特征及诊治方案进行比较(单因素分析),通过Cox多因素分析得到有独立意义的预后指标。结果本组受者1、3、5年的总体存活率分别为92.2%、48.6%、34.6%,复发后1、3、5年的带瘤存活率分别为63.2%、31.0%、16.7%,Cox多因素分析示患者年龄、肿瘤可否切除、能否采取以靶向治疗为主的个体化诊治方案是影响总体存活率和带瘤生存率的独立预后因素。结论肝移植术后肿瘤的复发转移严重影响受者生存,通过积极有效地精准诊治,部分受者仍可获得较满意的预后。

关键词：肝移植肝细胞癌复发

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二氮嗪预处理对大鼠部分肝移植的保护作用

中国临床医学 2012年第3期19卷 222-224页

作者：宋康孙绮蛮周俭黄晓武史颖弘肖永胜谭长军高强何义舟成剑文杨柳晓樊嘉复旦大学附属中山医院肝外科上海200032

目的:探讨二氮嗪(diazoxide,DA)预处理对大鼠部分肝移植的保护作用,寻找减轻临床部分肝移植中缺血再灌注损伤的途径。方法:将150只SD(Sprague-Dawley)大鼠,随机配对成75对,分为3组:对照组(C组)、DA预处理组(DA组)和5-羟基癸酸盐(5-hydro... 详细信息

目的:探讨二氮嗪(diazoxide,DA)预处理对大鼠部分肝移植的保护作用,寻找减轻临床部分肝移植中缺血再灌注损伤的途径。方法:将150只SD(Sprague-Dawley)大鼠,随机配对成75对,分为3组:对照组(C组)、DA预处理组(DA组)和5-羟基癸酸盐(5-hydroxydecanoate sodium salt,5-HD)+DA预处理组(HD-DA组),每组25对。在进行60%比例部分肝移植术前,C组供体不进行药物预处理;DA组供体在术前30min腹腔注射DA(5mg/kg);HD-DA组供体在术前45min腹腔注射5-HD(5mg/kg),并在其后15min腹腔注射DA(5mg/kg)。各组分别在术后2h、1d、3d、5d和7d各处死5只受体大鼠,测定谷酸丙氨酸转移酶(alanine aminotransferase,ALT)和门冬氨酸氨基转移酶(aspartate aminotransferase,AST),并在光镜下进行病理检查,电镜下进行超微结构检查。结果:DA组与C组相比,肝细胞肿胀、变性、坏死和空泡样变性以及肝小叶结构排列紊乱和汇管区炎症都较轻,而HD-DA组则跟与C组相近。DA组术后2h、1d、3d的ALT值和AST值均显著低于C组(P0.05)。结论:二氮嗪预处理对大鼠部分肝移植具有保护作用,但这种保护作用可以被5-羟基癸酸盐特异性阻断。

关键词：部分肝移植二氮嗪预处理缺血再灌注损伤大鼠

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大鼠小体积肝移植模型的建立及技术改进

中国临床医学 2012年第1期19卷 1-3页

作者：宋康高强周俭贺轶锋孙琦蛮杨国欢史颖弘肖永胜谭长军丁振斌吴志全樊嘉复旦大学附属中山医院肝外科上海200032

目的:建立稳定的大鼠30%比例小体积肝移植模型。方法:采用SD大鼠,"二袖套法"行30%比例原位肝移植25例。经腹主动脉插管原位快速灌注获取供肝,冷缺血时间设定为1 h。结果:术后2 d存活率和1周存活率分别为72%(18/25)和64%(16/25)。结论:... 详细信息

目的:建立稳定的大鼠30%比例小体积肝移植模型。方法:采用SD大鼠,"二袖套法"行30%比例原位肝移植25例。经腹主动脉插管原位快速灌注获取供肝,冷缺血时间设定为1 h。结果:术后2 d存活率和1周存活率分别为72%(18/25)和64%(16/25)。结论:成功建立了大鼠30%比例的小体积肝移植模型,该模型手术成功率较高、便于操作,与临床部分肝移植(如活体肝移植)的手术十分相似,是研究肝移植缺血再灌注损伤的理想途径。

关键词：肝移植小体积供肝大鼠动物模型

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肝内胆管癌肝移植患者的预后影响因素分析

实用器官移植电子杂志 2022年第6期10卷 521-526页

作者：肖永胜张博李辉郭磊杨国欢徐永锋沈早卓孙绮蛮宋康贺轶锋丁振斌孙健王征史颖弘杨欣荣施国明黄晓武樊嘉周俭复旦大学附属中山医院肝外科复旦大学肝癌研究所上海200032

目的总结肝内胆管癌患者进行肝移植的疗效和分析预后相关危险因素。方法回顾性分析2001年4月至2022年2月复旦大学附属中山医院46例病理诊断为肝内胆管癌的患者进行肝移植的临床病理资料,随访患者的生存、复发状况。采用Kaplan-Meier分... 详细信息

目的总结肝内胆管癌患者进行肝移植的疗效和分析预后相关危险因素。方法回顾性分析2001年4月至2022年2月复旦大学附属中山医院46例病理诊断为肝内胆管癌的患者进行肝移植的临床病理资料,随访患者的生存、复发状况。采用Kaplan-Meier分析患者的总体生存率及无复发生存率,Cox回归模型分析影响预后的危险因素。结果肝内胆管癌患者肝移植术后中位总生存时间为19个月,1、3、5年总生存率分别为64.4%、30.2%、20.7%。中位无复发生存时间为10个月,1、3、5年无复发生存率分别为45.8%、20.8%、10.4%。多因素分析结果显示,术前糖类抗原19-9(carbohydrate antigen19-9,CA19-9)水平(P=0.026)是患者总生存时间的独立危险因素,肿瘤直接侵犯肝外组织(P=0.019)是肿瘤复发转移的独立危险因素。结论肝内胆管癌肝移植预后欠佳,术前CA19-9高水平是术后生存期短、肿瘤直接侵犯肝外组织是术后复发率高的独立危险因素。

关键词：肝内胆管癌肝移植预后

反季节移栽圆冠榆越冬期间保护物质及水分动态变化

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新疆农业科学 2014年第11期51卷 1996-2002页

作者：宋雨蓬齐曼.尤努斯邵扬孙卫新疆农业大学林学与园艺学院乌鲁木齐830052 乌鲁木齐市林业局(园林管理局) 乌鲁木齐830000

【目的】通过对比反季节移栽和非移栽圆冠榆在自然越冬下的保护物质含量和树体水分状态,研究反季节移栽圆冠榆对越冬期间温度变化的适应性,为干旱寒冷地区反季节移栽提供理论依据。【方法】选用移栽后第一年(2011年)、第二年(2012年)圆... 详细信息

【目的】通过对比反季节移栽和非移栽圆冠榆在自然越冬下的保护物质含量和树体水分状态,研究反季节移栽圆冠榆对越冬期间温度变化的适应性,为干旱寒冷地区反季节移栽提供理论依据。【方法】选用移栽后第一年(2011年)、第二年(2012年)圆冠榆以及非移栽本地圆冠榆为材料,随冬季温度自然下降(0℃至-23℃)和上升(0℃至15℃)采样并测定其枝条中可溶性糖含量、可溶性蛋白含量、淀粉含量、样品总含水量、束缚水/自由水比值等抗寒指标。【结果】圆冠榆树体中可溶性糖含量、可溶性蛋白含量和束缚水/自由水随着越冬期气温的下降而上升,随着气温的回升而降低,其淀粉含量和总含水量在越冬期间呈现出下降趋势。2011年度,反季节移栽圆冠榆树体中可溶性糖含量、可溶性蛋白含量显著高于非移栽圆冠榆,束缚水/自由水无显著差异,而其淀粉含量极显著低于非移栽圆冠榆;移栽后第一年与第二年相比,移栽后第二年的圆冠榆树体中可溶性糖含量、可溶性蛋白含量显著降低,淀粉含量显著升高,而束缚水/自由水无显著差异。【结论】反季节移栽后的第一年冬季,圆冠榆通过枝条中可溶性糖含量、可溶性蛋白含量提高,束缚水/自由水保持稳定,降低组织冰点温度,提高反季节移栽后圆冠榆的抗寒能力,使其安全越冬,而这些生理指标在移栽后第二年冬季相应减少,表明圆冠榆具有较强的反季节移栽交叉适应能力。

关键词：圆冠榆反季节移栽抗寒能力交叉适应