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Screening antimicrobial peptides and probiotics using multiple deep learning and directed evolution strategies

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Acta Pharmaceutica Sinica B 2024年第8期14卷 3476-3492页

作者： Yu Zhang Li-Hua Liu Bo Xu Zhiqian Zhang Min Yang yiyang He Jingjing Chen Yang Zhang Yucheng Hu Xipeng Chen Zitong Sun qijun Ge Song Wu Wei Lei Kaizheng Li Hua Cui Gangzhu Yang Xuemei Zhao Man Wang Jiaqi Xia Zhen Cao Ao Jiang yi-Rui Wu Tidetron Bioworks Technology(Guangzhou)Co. Ltd.Guangzhou Qianxiang Bioworks Co.Ltd.Guangzhou 510000China Biology Department and Institute of Marine Sciences College of ScienceShantou UniversityShantou 515063China School of Basic Medical Sciences Hubei University of Science and TechnologyXianning 437100China School of Education Jianghan UniversityWuhan 430056China Yeasen Biotechnology(Shanghai)Co. Ltd.Shanghai 200000China School of Basic Medicine Jiamusi UniversityJiamusi 154000China

Owing to their limited accuracy and narrow applicability,current antimicrobial peptide(AMP)prediction models face obstacles in industrial *** address these limitations,we developed and improved an AMP prediction model using Comparing and Optimizing Multiple DEep Learning(COMDEL)algorithms,coupled with high-throughput AMP screening method,finally reaching an accuracy of 94.8%in test and 88%in experiment verification,surpassing other state-of-the-art *** conjunction with COMDEL,we employed the phage-assisted evolution method to screen Sortase in vivo and developed a cell-free AMP synthesis system in vitro,ultimately increasing AMPs yields to a range of 0.5-2.1 g/L within ***,by multi-omics analysis using COMDEL,we identified Lactobacillus plantarum as the most promising candidate for AMP generation among 35 edible *** this,we developed a microdroplet sorting approach and successfully screened three *** mutants,each showing a twofold increase in antimicrobial ability,underscoring their substantial industrial application values.

关键词： Antimicrobial peptide Deep learning Cell-free synthesis Probiotics L.plantarum

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阳离子两亲性共聚物在有机鞣革复鞣中的应用

皮革科学与工程 2024年第3期34卷 1-8页

作者：易玉丹李奇军王亚楠四川大学制革清洁技术国家工程实验室四川成都610065 四川大学皮革化学与工程教育部重点实验室四川成都610065

通过自由基聚合反应制备了阳离子两亲性共聚物(PSD),并将其用于TWS有机鞣革的复鞣。动态光散射和扩散波谱结果表明,PSD在水中的聚集程度随着pH提高、温度降低及浓度提高而增大。故选择pH 4、温度40℃的工艺条件用PSD对有机鞣革复鞣。PS... 详细信息

通过自由基聚合反应制备了阳离子两亲性共聚物(PSD),并将其用于TWS有机鞣革的复鞣。动态光散射和扩散波谱结果表明,PSD在水中的聚集程度随着pH提高、温度降低及浓度提高而增大。故选择pH 4、温度40℃的工艺条件用PSD对有机鞣革复鞣。PSD可渗透至有机鞣革的原纤维层级并形成疏水薄膜,从而显著提高坯革整体的疏水性,动态防水透水时间从0.14 min提高至10~20 min。此外,PSD促进了有机鞣革对阴离子加脂剂的吸收,吸收率从88.5%提高至93.7%。PSD用量越大,坯革的疏水性和增厚率提高而柔软度下降。综上,将阳离子两亲性共聚物应用于有机鞣革的复鞣能够提高成革的综合性能,这有助于发展完善无铬有机鞣制体系,制造高性能无金属生态皮革。

关键词：阳离子聚合物两亲性聚集行为复鞣有机鞣革疏水性

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阿帕替尼连续给药或隔日给药联合SOX方案一线治疗晚期胃癌效果观察

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肿瘤研究与临床 2022年第8期34卷 601-605页

作者：孔颖赵丹婷李明燕缪玉娥衣启君马莉李琨刘海燕山东第一医科大学第二附属医院肿瘤科泰安271000 山东第一医科大学第二附属医院呼吸内科泰安271000

目的比较阿帕替尼连续给药或隔日给药联合SOX方案一线治疗晚期胃癌患者的临床效果及安全性。方法收集山东第一医科大学第二附属医院2018年1月至2021年1月经病理确诊的52例人表皮生长因子受体2(HER2)阴性不能手术的局部晚期或晚期胃癌患... 详细信息

目的比较阿帕替尼连续给药或隔日给药联合SOX方案一线治疗晚期胃癌患者的临床效果及安全性。方法收集山东第一医科大学第二附属医院2018年1月至2021年1月经病理确诊的52例人表皮生长因子受体2(HER2)阴性不能手术的局部晚期或晚期胃癌患者, 按照随机数字表法分为连续给药组和隔日给药组。连续给药组接受阿帕替尼(250 mg, 每日1次)联合SOX(替吉奥+奥沙利铂)方案;隔日给药组接受阿帕替尼(250 mg, 隔日1次)联合SOX方案。21 d为1个周期, 治疗2个周期后评价疗效, 4~6个周期后疾病稳定者接受阿帕替尼+替吉奥维持治疗。比较两组的治疗效果及不良反应。结果 51例患者可评价疗效, 其中连续给药组26例, 隔日给药组25例。连续给药组和隔日给药组疾病控制率分别为84.6%(22/26)、76.0%(19/25)(χ^(2)=0.60, P=0.499), 中位无进展生存时间分别为7.50个月(95%CI 6.17~8.83个月)、8.30个月(95%CI 6.99~9.61个月)(χ^(2)=0.71, P=0.401), 中位总生存时间分别为15.50个月(95%CI 11.30~19.69个月)、15.60个月(95%CI 13.63~17.57个月)(χ^(2)=1.82, P=0.177)。两组患者的不良反应主要为白细胞减少、血小板减少、高血压、恶心、呕吐、疲乏、手足综合征、蛋白尿、肝肾损害。连续给药组与隔日给药组≥3级不良反应发生率分别为42.3%(11/26)、12.0% (3/25), 差异有统计学意义(χ^(2)=4.46, P=0.035)。结论采用阿帕替尼连续给药或隔日给药联合SOX方案一线治疗晚期胃癌的疗效相似, 但隔日给药方案≥3级不良反应发生率较低, 提高了患者的依从性和耐受性。

关键词：胃肿瘤药物疗法联合奥沙利铂替吉奥阿帕替尼连续给药隔日给药

A general quantum minimum searching algorithm with high success rate and its implementation

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Science China(Physics,Mechanics & Astronomy) 2023年第4期66卷 49-60页

作者： yi Zeng Ziming Dong Hao Wang Jin He qijun Huang Sheng Chang School of Physics and Technology Wuhan UniversityWuhan 430072China Key Laboratory of Artificial Micro-and Nano-Structures of Ministry of Education Wuhan UniversityWuhan 430072China

Finding a minimum is a fundamental calculation in many quantum ***,challenges are faced in demonstrating it effectively in real quantum *** practice,the number of solutions is unknown,and there is no universal encoding *** that,current quantum computers have limited *** alleviate these problems,this paper proposes a general quantum minimum searching *** adaptive estimation method is adopted to calculate the number of solutions,and a quantum encoding circuit for arbitrary databases is presented for the first time,which improves the universality of the algorithm and helps it achieve a nearly 100%success rate in a series of random ***,gate complexity is reduced by our simplified Oracle,and the realizability of the algorithm is verified on a superconducting quantum *** algorithm can serve as a subroutine for various quantum algorithms to promote their implementation in the Noisy IntermediateScale Quantum era.

关键词： quantum minimum searching algorithm quantum circuit superconducting quantum computer quantum encoding

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企业社会责任实践影响因素的差异分析

大连理工大学学报（社会科学版） 2016年第3期37卷 84-89页

作者：买生伊其俊李腾飞齐丽云石河子大学经济与管理学院新疆石河子832003 大连理工大学管理与经济学部辽宁大连116024

文章以东北地区企业为样本,采用单因素方差分析和Tamhane/LSD方法深入分析了企业性质、规模、上市与否等特征对企业社会责任实践的影响差异以及影响机制。结果表明,企业的性质、规模、是否上市对企业社会责任实践具有显著影响,在促进企... 详细信息

文章以东北地区企业为样本,采用单因素方差分析和Tamhane/LSD方法深入分析了企业性质、规模、上市与否等特征对企业社会责任实践的影响差异以及影响机制。结果表明,企业的性质、规模、是否上市对企业社会责任实践具有显著影响,在促进企业社会责任实践发展方面,政府应当优先推进国有企业、大型企业、上市企业的社会责任实践,减小实施阻力,同时逐步完善社会责任实践相关制度和加强监管力度,形成帮带机制。

关键词：企业社会责任影响因素差异分析实证研究

基于Android智能手机平台的AMT监测系统的设计

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电子技术应用 2014年第3期40卷 68-70页

作者：万晓凤雷继棠易其军南昌大学信息工程学院江西南昌330031

针对机械式自动变速器(简称AMT)在研究开发阶段需要观测系统参数和车辆状态信息的情况,设计了基于Android智能手机平台并采用无线蓝牙通信技术的AMT监测系统。阐述了系统的基本工作原理,详细介绍了系统的下位机的软、硬件设计,着重介绍... 详细信息

针对机械式自动变速器(简称AMT)在研究开发阶段需要观测系统参数和车辆状态信息的情况,设计了基于Android智能手机平台并采用无线蓝牙通信技术的AMT监测系统。阐述了系统的基本工作原理,详细介绍了系统的下位机的软、硬件设计,着重介绍了Android平台上的上位机设计。实验表明,基于Android智能手机平台构建的AMT监测系统实现了AMT系统的数据采集、分析、显示,使开发人员能够实时掌握AMT系统的动态参数。

关键词： Android 蓝牙 AMT 监测系统

Effect of cationic monomer structure on the aggregation behavior of amphoteric acrylic polymer around isoelectric point

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Journal of Leather Science and Engineering 2022年第1期4卷 52-60页

作者： qijun Li Yudan yi Ya-nan Wang Jing Li Bi Shi Key Laboratory of Leather Chemistry and Engineering(Sichuan University) Ministry of EducationChengdu 610065China National Engineering Laboratory for Clean Technology of Leather Manufacture Sichuan UniversityChengdu 610065China Sichuan Tingjiang New Material Inc.Shifang 618412China.

Amphoteric polymer can be used as retanning agent in leather manufacture. It is particularly useful in chrome-free tanning systems since it can regulate the charge properties of chrome-free leather and enhance the fixation of anionic post-tanning chemicals in leather. However, the aggregation and precipitation of amphoteric polymer retanning agents around the isoelectric point (pI) hinder their wide application. Herein, we synthesized five amphoteric acrylic polymers (AAPs) by free radical copolymerization with acrylic acid and five different cationic acrylic monomers. The effect of cationic monomer structure on the aggregation behavior of AAPs was investigated. The aggregation of AAPs in aqueous solution showed pH and concentration dependence. Light scattering analysis showed that Poly (AA-co-MAPTAC) and Poly (AA-co-DMAPMA) were in the shape of coiled linear flexible chains with small particle size (Rg 7.6 nm and 14.8 nm, respectively) near the pI. However, Poly (AA-co-DAC), Poly (AA-co-DMC) and Poly (AA-co- DMAEMA) were in the shape of hollow spheres and exhibited serious aggregation. Quantum chemical calculations suggested that the amide groups in the cationic monomers MAPTAC and DMAPMA enhanced the nucleophilicity of AAPs. Thus the corresponding AAPs could carry a large number of cationic charges to slow their aggregation when the pH just climbed over the pI. The results are expected to provide theoretical reference for the synthesis and widespread application of AAPs.

关键词： Amphoteric acrylic polymer Isoelectric point Aggregation behavior Cationic monomer Retanning

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基于车速反馈的AMT离合器起步接合控制

工程设计学报 2013年第5期20卷 441-445页

作者：万晓凤雷继棠易其军贾进学张燕飞丁卯南昌大学信息工程学院江西南昌330031 南昌市正道科技实业有限公司江西南昌330031

针对AMT系统离合器起步接合控制由于离合器磨损、工作温度变化、车辆载荷变化以及路况条件变化等造成的鲁棒性差问题,提出了基于车速反馈的AMT离合器起步接合控制方法,以车速作为离合器起步接合控制的目标.根据加速踏板的输入产生起步... 详细信息

针对AMT系统离合器起步接合控制由于离合器磨损、工作温度变化、车辆载荷变化以及路况条件变化等造成的鲁棒性差问题,提出了基于车速反馈的AMT离合器起步接合控制方法,以车速作为离合器起步接合控制的目标.根据加速踏板的输入产生起步过程中的目标车速,实时检测车速的变化,采用模糊控制方法,根据实际车速与目标车速的偏差,动态调整离合器的接合速度和接合量,使实际车速跟踪目标车速平稳变化,提高了AMT离合器起步接合控制的鲁棒性.

关键词： AMT 离合器接合控制模糊控制车速反馈

内科电子胸腔镜术在二例儿童胸腔积液诊治中的应用

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中国小儿急救医学 2024年第4期31卷 314-317页

作者：王永军李环赵启君王舒颖王文媛李万怡易彬甘肃省妇幼保健院小儿呼吸二科兰州730070 甘肃省康复中心医院兰州730000

目的探讨内科电子胸腔镜术在儿童难治性胸腔积液中的诊疗价值。方法选取2022年甘肃省妇幼保健院小儿呼吸二科收治的2例难治性胸腔积液患儿,行内科电子胸腔镜术及胸膜活检术,并松解粘连带、清除包裹性积液、行胸膜腔冲洗。结果2例患儿,1... 详细信息

目的探讨内科电子胸腔镜术在儿童难治性胸腔积液中的诊疗价值。方法选取2022年甘肃省妇幼保健院小儿呼吸二科收治的2例难治性胸腔积液患儿,行内科电子胸腔镜术及胸膜活检术,并松解粘连带、清除包裹性积液、行胸膜腔冲洗。结果2例患儿,1例胸膜活检病理确诊为结核性胸膜炎;1例化脓性胸膜炎,胸腔镜下行脓苔剥离清除、胸膜腔冲洗术,联合抗感染、胸腔闭式引流治疗后胸膜粘连消失,临床症状控制;2例患儿均在喉罩全麻下进行,先行电子支气管镜术,后行内科电子胸腔镜术,术中、术后未发生严重并发症。结论内科电子胸腔镜术作为儿科呼吸介入技术,对儿童难治性胸腔积液的诊治有重要临床价值,在充分掌握临床操作技术,严格把握适应证、禁忌证的情况下,其安全、有效,值得在儿科应用。

关键词：胸腔积液内科胸腔镜儿童