检索结果-南通市图书馆

Characterization and validation of somatic mutation spectrum to reveal heterogeneity in gastric cancer by single cell sequencing

引用

Science Bulletin 2019年第4期64卷 236-244页

作者： Lihua Peng Rui Xing Dongbing Liu Li Bao Wenxiang Cheng Hongyi Wang Yuan Yu Xiaofeng Liu Lu Jiang Yan Wu Zhongxue An qiaoyi Liang Ryong Nam Kim Young Kee Shin Huanming Yang Jian Wang Jun Yu Xiuqing Zhang xun xu Jiaan Yang Kui Wu Shida Zhu Youyong Lu BGI-Shenzhen China National GeneBank-Shenzhen BGI-Shenzhen Laboratory of Molecular Oncology Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research (Ministry of Education) Peking University Cancer Hospital & Institute Department of Drug Design and Pharmacology University of Copenhagen Shenzhen Institute of Advanced Technology Chinese Academy of Sciences Department of Histology and Embryology Inner Mongolia Medical University Department of Medicine and Therapeutics State Key Laboratory of Digestive Disease Institute of Digestive Disease and Li Ka Shing Institute of Health Sciences The Chinese University of Hong Kong Department of Pharmacy College of Pharmacy Seoul National University James D. Watson Institute of Genome Sciences Micro Pharmatech Ltd Department of Biology University of Copenhagen

Gastric cancer(GC) is a highly heterogeneous disease with multiple cellular types and poor ***, the cellular evolution and molecular basis of GC at the individual intra-tumor level has not been well demonstrated. We performed single-cell whole exome sequencing to detect somatic singlenucleotide variants(SNVs) and significantly mutated genes(SMGs) among 34 tumor cells and 9 normal cells from a patient with GC. The Complete Prediction for Protein Conformation(CPPC) approach directly predicting the folding conformation of the protein 3D structure with Protein Folding Shape Code, combined with functional experiments were used to confirm the characterization of mutated SMGs in GC cells. We identified 201 somatic SNVs, including 117 non-synonymous mutations in GC cells. Further analysis identified 24 significant mutated genes(SMGs) in single cells, for which a single amino acid change might affect protein conformation. Among them, two genes(CDC27 and FLG) that were mutated only in single cells but not in the corresponding tumor tissue, were recurrently present in another GC tissue cohort, and may play a potential role to promote carcinogenesis, as confirmed by functional characterization. Our findings showed a mutational landscape of GC at intra-tumor level for the first time and provided opportunities for understanding the heterogeneity and individualized target therapy for this disease.

关键词： Gastric cancer Single-cell whole exome sequencing SNV Signi-cell mutated gene Heterogeneity

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

配施中微肥对荔枝产量、品质及养分吸收累积的影响

引用

果树学报 2022年第9期39卷 1649-1658页

作者：易琼李国良黄旭向旭唐拴虎黄巧义张木广东省农业科学院农业资源与环境研究所·农业农村部南方地区植物营养与肥料重点实验室·广东省养分循环与农田保护重点实验室广州510640 广东省农业科学院果树研究所广州510640

【目的】探讨在氮磷钾营养供应相对合理的范围内,连续多年配施中微肥对荔枝产量、品质、土壤与树体各部位营养积累与平衡特征的影响,以期为荔枝生产中中微肥施用提供科学依据。【方法】以妃子笑荔枝为试材,设计中微肥配施与不配施处理,... 详细信息

【目的】探讨在氮磷钾营养供应相对合理的范围内,连续多年配施中微肥对荔枝产量、品质、土壤与树体各部位营养积累与平衡特征的影响,以期为荔枝生产中中微肥施用提供科学依据。【方法】以妃子笑荔枝为试材,设计中微肥配施与不配施处理,连续开展4 a(年)田间试验,通过破坏性取样方式获取不同施肥措施下荔枝农艺性状、产量、营养积累、品质及土壤性质等指标。【结果】与常规氮磷钾优化用量(OPT)处理相比,配施中微肥(OPT+MN)处理不仅在一定程度上促进了枝梢的快速生长,提高了荔枝果实中维生素C含量,而且有效提高了荔枝产量,4 a平均产量增加16.7%,差异达显著水平。中微肥的添加还促进了树体对氮和锌营养的吸收积累,使钙、镁、锌、硼等营养元素主要积累在枝干中,并促使更多的镁、锌转移累积至叶片中。【结论】鉴于荔枝年际间树体中中微量营养元素含量差异较大且养分失衡症状存在一定的滞后性,提倡各荔枝园结合土壤测试结果,对土壤中缺乏的中微肥(尤其是钙、镁、锌、硼营养元素)进行相应的补充。同时,针对荔枝园土壤酸化现象,施用适量的土壤改良剂或石灰以期改良土壤产地条件,进而使土壤-荔枝树体营养平衡,实现荔枝提质增产增效。

关键词：荔枝产量中微肥营养积累营养平衡

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

缓释尿素在双季稻上的养分供应特征

引用

土壤 2018年第4期50卷 656-663页

作者：张木唐拴虎黄巧义易琼黄旭广东省农业科学院农业资源与环境研究所/广东省养分资源循环利用与耕地保育重点实验室广州510640

采用双季早晚稻的田间试验,研究了养分释放期为60 d和90 d的两种不同缓释尿素对整个生育期内水稻养分吸收的影响。结果表明:60 d型缓释尿素一次性施用在早、晚稻上均达到了普通尿素分次施肥时的产量水平,而90 d型缓释尿素一次性施用在... 详细信息

采用双季早晚稻的田间试验,研究了养分释放期为60 d和90 d的两种不同缓释尿素对整个生育期内水稻养分吸收的影响。结果表明:60 d型缓释尿素一次性施用在早、晚稻上均达到了普通尿素分次施肥时的产量水平,而90 d型缓释尿素一次性施用在早稻上效果好晚稻上效果欠佳。60 d和90 d型缓释尿素一次性施用的优势在于能使水稻有较高的有效穗数及穗粒数,整个生育期地上植株氮(灌浆期不含籽粒)含量也显著高于普通尿素分次施肥、普通尿素一次施用及不施氮处理,而灌浆过程中籽粒、剑叶、倒二位及倒三位叶的氮含量及剑叶SPAD值(叶绿素相对含量)也均高于其他3个处理。两种缓释尿素均使水稻出现了不同程度的贪青状况,其中以90 d型缓释尿素贪青最为严重,60 d型缓释尿素的养分释放期对水稻较为适中而90天型缓释尿素较长。

关键词：水稻缓释尿素养分吸收动态养分累积产量

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

Combining methylated SEPTIN9 and RNF180 plasma markers for diagnosis and early detection of gastric cancer

引用

Cancer Communications 2023年第11期43卷 1275-1279页

作者： Yongzhan Nie Xianchun Gao Xiqiang Cai Zhen Wu qiaoyi Liang Guobing xu Na Liu Peng Gao Jingyu Deng Hongzhi xu Zhanlong Shen Changqi Cao Fenrong Chen Nannan Zhang Yongxi Song Mingjun Sun Chengyin Liu Guangpeng Zhou Weili Han Jianhua Dou Huahong Xie Liping Yao Zhiguo Liu Gang Ji Xin Wang Qingchuan Zhao Lei Shang Daiming Fan Xiaoliang Han Jianlin Ren Han Liang Zhenning Wang Jinhai Wang Qi Wu Jun Yu Kaichun Wu the MAGIS Study Group State Key Laboratory of Holistic Integrative Management of Gastrointestinal Cancers and National Clinical Research Center for Digestive Diseases Xijing Hospital of Digestive DiseasesFourth Military Medical UniversityXi'anShaanxiP. R. China Department of Gastroenterology Tangdu HospitalFourth Military Medical UniversityXi'anShaanxiP. R. China BioChain (Beijing) Science & Technology Inc. BeijingP. R. China Department of Medicine and Therapeutics Institute of Digestive DiseasePrince of Wales HospitalThe Chinese University of Hong KongHong KongP. R. China Department of Endoscopy Center Peking University Cancer Hospital & InstituteKey Laboratory of Carcinogenesis and Translational ResearchMinistry of EducationBeijingP. R. China Department of Gastroenterology the Second Affiliated HospitalXi'an Jiaotong UniversityXi'anShaanxiP. R. China Department of Surgical Oncology and General Surgery Key Laboratory of Precision Diagnosis and Treatment of Gastrointestinal TumorsThe First Affiliated Hospital of China Medical UniversityShenyangLiaoningP. R. China Department of Gastric Surgery Tianjin Medical University Cancer Institute and HospitalNational Clinical Research Center for CancerKey Laboratory of Cancer Prevention and TherapyTianjin's Clinical Research Center for CancerTianjinP. R. China Department of Gastroenterology Zhongshan HospitalXiamen UniversityXiamenFujianP. R. China Department of Gastrointestinal Surgery Peking University People's HospitalBeijingP. R. China Department of Endoscope The First Hospital Affiliated to China Medical UniversityShenyangLiaoningP. R. China Department of Health Statistics School of Preventive MedicineFourth Military Medical UniversityXi'anShaanxiP. R. China 不详

Dear Editor,Early diagnosis is critical for successful treatment of gastric adenocarcinoma(GA).However,the sensitivities of tumor markers carcinoembryonic antigen(CEA),cancer antigen 19-9(CA19-9)and CA72-4 for GA detection are approximately 20%[1],and the sensitivities of all markers combined for early gastric cancer detection is still very low[2].DNA methylation plays a major role in tumorigenesis and therefore has obvious potential as a non-invasive biomarker for cancer detection[3].Through genome-wide methylation analysis and histological verification,we previously identified ring finger protein 180(RNF180)as a novel preferentially methylated gene in GA[4,5].

关键词： RNF180 diagnosis gastric

来源：

维普期刊数据库评论

在线全文

维普期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

脑机接口中高频稳态视觉诱发电位的识别研究

引用

生物医学工程学杂志 2023年第4期40卷 683-691页

作者：罗睿心豆心怡肖晓琳吴乔逸许敏鹏明东天津大学精密仪器与光电子工程学院天津300072 天津大学医学工程与转化医学研究院天津300072

利用高频刺激进行编码能够缓解基于稳态视觉诱发电位(SSVEP)的脑-机接口(BCI)产生的用户视觉疲劳,提升系统的舒适度和安全性,具有广阔的应用前景。然而,当前先进的SSVEP解码算法大多在低频数据集上进行对比验证,在高频SSVEP信号上的识... 详细信息

利用高频刺激进行编码能够缓解基于稳态视觉诱发电位(SSVEP)的脑-机接口(BCI)产生的用户视觉疲劳,提升系统的舒适度和安全性,具有广阔的应用前景。然而,当前先进的SSVEP解码算法大多在低频数据集上进行对比验证,在高频SSVEP信号上的识别性能仍然未知。针对此问题,本文采集了20名受试者在高频SSVEP范式下的脑电(EEG)数据,对目前主流的2种典型相关分析算法、3种集成任务相关成分分析算法和1种任务判别成分分析算法展开对比。结果表明,它们均能有效解码高频SSVEP信号,且在不同条件下算法的分类性能指标和速度存在差异。本研究为高频SSVEP-BCI系统的算法选择提供了依据,在构建舒适友好型BCI系统方面具有潜在的应用价值。

关键词：脑-机接口稳态视觉诱发电位高频解码算法

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

浅谈一种基于ATmega48段式液晶显示器的驱动方法

引用

太原科技 2007年第11期 91-92,94页

作者：薛旭乔毅吴化柱大连交通大学辽宁大连116028

介绍了段式液晶显示器驱动知识和利用ATmega48单片机驱动液晶显示器DG03532的硬件原理。提出此种方法较为简单,所需元器件较少,在单片机I/O引脚充裕的情况下,是一种理想的人机界面实现方式。

关键词： ATmega48 单片机 DG03532 液晶驱动

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

水稻冠层图像分割方法对比研究

引用

中国生态农业学报 2018年第5期26卷 710-718页

作者：黄巧义樊小林张木黄旭李苹付弘婷唐拴虎广东省农业科学院农业资源与环境研究所/农业部南方植物营养与肥料重点实验室/广东省养分资源循环利用与耕地保育重点实验室广州510640 华南农业大学/广东高校环境友好型肥料工程技术研究中心广州510642

水稻冠层信息在自动化管理上具有重要指导意义,但田间多变光照强度环境显著降低了水稻冠层图像分割和信息提取的精度。为降低光照强度的干扰,本文基于RGB、CIEL~*a~*b~*、HSV色彩空间和多色彩空间(包括RGB、CIEL~*a~*b~*和HSV色彩空间)... 详细信息

水稻冠层信息在自动化管理上具有重要指导意义,但田间多变光照强度环境显著降低了水稻冠层图像分割和信息提取的精度。为降低光照强度的干扰,本文基于RGB、CIEL~*a~*b~*、HSV色彩空间和多色彩空间(包括RGB、CIEL~*a~*b~*和HSV色彩空间)构建水稻冠层图像的色彩特征组合,然后通过支持向量机(SVM)的线性核函数对水稻冠层图像进行分类识别,其分割方法分别定义为rgb-SVM、lab-SVM、hsv-SVM和Multi-SVM。同时,利用此方法对不同光照强度下的水稻冠层图像进行分割,并与常用的Ex G&Otsu分割方法进行对比,比较不同方法的分割效果和光强稳健性。结果表明,rgb-SVM的分割效果优于Ex G&Otsu方法,但对晴天条件下获取的水稻冠层图像的分割误差仍较大,光强稳健性低;lab-SVM和hsv-SVM分割方法的分割精确度较低,存在一定的欠分割现象;基于多色彩空间和支持向量机的Multi-SVM分割方法的分割效果最佳,该方法对不同光强下获取的水稻冠层图像的分割误差均控制在4.00%以内,具有较好的光强稳健性。因此,基于多色彩空间和支持向量机的Multi-SVM分割方法能够相对准确地将水稻像元从水稻冠层图像中分割出来,且对田间多变光强条件具有一定的稳健性,可为田间水稻生长发育监测和自动化管理提供一定的技术支持。

关键词：水稻冠层图像光照强度图像分割色彩空间支持向量机

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

缓释尿素配施普通尿素对双季稻养分的供应特征

引用

中国农业科学 2018年第20期51卷 3985-3995页

作者：张木唐拴虎黄巧义逄玉万易琼黄旭李苹付弘婷广东省农业科学院农业资源与环境研究所/广东省养分资源循环利用与耕地保育重点实验室

【目的】缓释尿素作为轻简施肥及减量施肥的新型肥料产品,其养分释放特性与作物养分需求规律的匹配度是作物高产的保证。论文主要探讨缓释尿素与普通尿素配合一次施用对整个生育期内水稻养分吸收特征的影响,为新型肥料产品的研发提供理... 详细信息

【目的】缓释尿素作为轻简施肥及减量施肥的新型肥料产品,其养分释放特性与作物养分需求规律的匹配度是作物高产的保证。论文主要探讨缓释尿素与普通尿素配合一次施用对整个生育期内水稻养分吸收特征的影响,为新型肥料产品的研发提供理论指导和技术支撑。【方法】采用早稻及晚稻的田间试验,设置6个施肥处理:(1)不施氮(CK);(2)100%缓释尿素(100%SRU);(3)75%缓释尿素+25%普通尿素(75%SRU+25%CU);(4)50%缓释尿素+50%普通尿素(50%SRU+50%CU);(5)25%缓释尿素+75%普通尿素(25%SRU+75%CU);(6)100%普通尿素(100%CU)。氮肥用量为150 kg N·hm,磷、钾肥的用量分别为55 kg P2O5·hm、130 kg K2O·hm,采用过磷酸钙及氯化钾。在早稻生育期内多次采集植株样品进行氮、磷、钾分析。在灌浆期采集不同部位叶片及籽粒样品进行氮、磷、钾分析,并测定灌浆期剑叶SPAD值的变化,在水稻采收后测算产量和产量构成。【结果】75%缓释尿素+25%普通尿素的处理早稻和晚稻的产量均最高,100%缓释尿素、50%缓释尿素+50%普通尿素以及25%缓释尿素+75%普通尿素3个处理间在早、晚稻产量上均无显著性差异,但在不同程度上均优于100%普通尿素的处理。相对于100%普通尿素处理,添加缓释尿素的处理水稻有效穗数和穗粒数占相对优势,特别是在早稻上更为明显。在整个生育期内,100%缓释尿素处理水稻植株地上部干物重及氮累积量高于其他处理,并随着普通尿素添加比例的增加而递减。植株地上部(灌浆期不含籽粒)氮含量以100%缓释尿素处理最高,随着普通尿素添加比例的增加而逐渐降低。灌浆过程中籽粒、剑叶、倒二位叶及倒三位叶氮含量,以及剑叶SPAD均以100%缓释尿素处理最高,同样随着普通尿素添加比例的增加而不断降低。【结论】100%缓释尿素的处理水稻氮素供应过旺,水稻出现贪青且在晚稻上更为严重,导致产量的降低。75%缓释尿素+25%普通尿素的处理效果较好可用于水稻一次性施肥。所有添加缓释尿素的处理均不同程度的好于100%普通尿素的处理,出于成本考虑可适当下调缓释尿素的添加比例。

关键词：水稻缓释尿素养分吸收动态养分累积产量

来源：

同方期刊数据库评论

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

支持向量机和最大类间方差法结合的水稻冠层图像分割方法

引用

中国农业科技导报 2019年第4期21卷 52-60页

作者：黄巧义张木李苹付弘婷黄旭唐拴虎广东省农业科学院农业资源与环境研究所农业农村部南方植物营养与肥料重点实验室广东省养分资源循环利用与耕地保育重点实验室广州510640 华南农业大学资源环境学院广州510642

针对田间多变光照强度给水稻冠层图像分割带来的难题,探讨了一种基于支持向量机(SVM)和最大类间方差法(OTSU法)相结合的水稻冠层图像分割算法。首先,从不同光强条件下的水稻冠层图像中采集代表性水稻和背景像元构建训练图像S1和S2,通过... 详细信息

针对田间多变光照强度给水稻冠层图像分割带来的难题,探讨了一种基于支持向量机(SVM)和最大类间方差法(OTSU法)相结合的水稻冠层图像分割算法。首先,从不同光强条件下的水稻冠层图像中采集代表性水稻和背景像元构建训练图像S1和S2,通过分析水稻S1和背景S2两类图像在RGB色彩空间中R、G、B色彩特征值的分布频率,rgb(标准化RGB)色彩空间中r、g、b色彩特征值的分布频率,CIE L*a*b*色彩空间中L*、a*、b*色彩特征值的分布频率,以及HSV色彩空间中H、S、V色彩特征值的分布频率,筛选出具有明显双峰特征的g、a*、b*和S作为关键色彩特征;然后,在由g、a*、b*和S色彩特征构成的多维色彩空间中采用支持向量机学习算法获得分隔水稻和背景像元的优化超平面Z(Z=0.421g+0.753 a*+0.152 b*+0.051S+0.085);最后,计算水稻冠层图像中每一像元的Z值,并用最大类间方差法计算分割阈值Z_t,从而实现水稻冠层图像分割。为了评价该分割方法,以90幅不同光强(阴天、多云和晴天)条件下采集到的田间水稻冠层图像作为测试图像,并以常用的ExG&OTSU分割方法作为对比,分析该分割方法的分割精度和光强稳健性。结果表明,Ex G&OTSU方法的精确度显著受光强条件影响,随着光强强度的提高而显著降低,光强稳健性差;该研究所提分割方法对阴天、多云和晴天条件下水稻冠层图像的分割误差为7.30%、8.72%和8.98%,分割精确度较高,且具有良好的光强稳健性。因此,该基于支持向量机和最大类间方差法相结合的水稻冠层图像分割方法具有较高的分割精度和光强稳健性,可为田间多变光照条件下水稻冠层图像精准分割提供技术参考。

关键词：支持向量机最大类间方差法色彩空间水稻光照强度图像分割

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

不同固含量PAN浆液制备的抗起球腈纶的性能研究

引用

合成纤维工业 2020年第1期43卷 23-26页

作者：徐静刘乔伊张磊东华大学材料科学与工程学院高性能纤维及制品教育部重点实验室

采用固含量分别为9%,13%的聚丙烯腈(PAN)浆液,通过湿法转向纺丝工艺制备常规腈纶及抗起球腈纶,研究了两种不同固含量PAN浆液的流变性能,以及PAN浆液固含量对抗起球腈纶截面形貌、饱和吸水倍率、力学性能的影响。结果表明:在相同温度下,... 详细信息

采用固含量分别为9%,13%的聚丙烯腈(PAN)浆液,通过湿法转向纺丝工艺制备常规腈纶及抗起球腈纶,研究了两种不同固含量PAN浆液的流变性能,以及PAN浆液固含量对抗起球腈纶截面形貌、饱和吸水倍率、力学性能的影响。结果表明:在相同温度下,固含量为9%的PAN浆液的表观黏度更低,高频区的弹性效应更小;相较于固含量为13%的PAN浆液制备的1.67 dtex抗起球腈纶,以固含量为9%的PAN浆液制备的0.89 dtex抗起球腈纶内部结构更松散,微孔更多,且饱和吸水倍率提高了约39%,力学性能明显下降,结强结伸乘积为18.92,经马丁代尔法测试抗起球级数达到4级。

关键词：抗起球腈纶固含量力学性能饱和吸水倍率打结强度打结伸长

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

欢迎您,

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

欢迎您,

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：