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Discovering Candidate Chromosomal Regions Linked to Kernel Size-Related Traits via QTL Mapping and Bulked Sample Analysis in Maize

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Phyton-International Journal of Experimental Botany 2022年第7期91卷 1429-1443页

作者： Hameed Gul Mengya Qian Mohammad GArabzai Tianhui Huang Qiannan Ma Fangyu Xing Wan Cao Tingting Liu Hong Duan qianlin xiao Zhizhai Liu College of Agronomy and Biotechnology Southwest UniversityChongqing400715China Department of Agronomy Faculty of AgriculturePaktia UniversityGardiz2201Afghanistan

Kernel size-related traits,including kernel length,kernel width,and kernel thickness,are critical components in determining yield and kernel quality in maize(Zea mays L.).Dissecting the phenotypic characteristics of these traits,and discovering the candidate chromosomal regions for these traits,are of potential importance for maize yield and quality improvement.In this study,a total of 139 F2:3 family lines derived from EHel and B73,a distinct line with extremely low ear height(EHel),was used for phenotyping and QTL mapping of three kernel sizerelated traits,including 10-kernel length(KL),10-kernel width(KWid),and 10-kernel thickness(KT).The results showed that only one QTL for KWid,i.e.,qKWid9 on Chr9,with a phenotypic variation explained(PVE)of 13.4%was detected between SNPs of AX-86298371 and AX-86298372,while no QTLs were detected for KL and KT across all 10 chromosomes.Four bulked groups of family lines,i.e.,Groups I to IV,were constructed with F2:3 family lines according to the phenotypic comparisons of KWid between EHel and B73.Among these four groups,Group I possessed a significantly lower KWid than EHel(P=0.0455),Group II was similar to EHel(P=0.34),while both Group III and Group IV were statistically higher than EHel(P<0.05).Besides,except Group IV exhibited a similar KWid to B73(P=0.11),KWid of Groups I to III were statistically lower than B73(P<0.00).By comparing the bulked genotypes of the four groups to EHel and B73,a stable chromosomal region on Chr9 between SNPs of AX-86298372 to AX-86263154,entirely covered by qKWid9,was identified to link KWid with the positive allele of increasing phenotypic effect to KWid from B73,similar to that of qKWid9.A large amount of enzyme activity and macromolecule binding-related genes were annotated within this chromosomal region,suggesting qKWid9 as a potential QTL for KWid in maize.

关键词： Maize(Zea mays L.) kernel size-related traits QTL mapping bulked sample analysis(BSA)

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融合均值榜样的反向互学习水母搜索算法

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河南师范大学学报（自然科学版） 2024年第4期52卷 111-119,I0015,I0016页

作者：段艳明肖辉辉谭黔林河池学院大数据与计算机学院广西河池546300 河池学院广西蚕桑生态学与智能化技术应用重点实验室广西河池546300

为解决水母搜索算法(jellyfish search algorithm,JS)的洋流运动缺乏多样性、群内运动缺乏引导性、种群间信息无交流,造成搜索速度慢、稳定性差及易早熟的问题,构建了一种融合均值榜样的反向互学习水母搜索算法(oppositional-mutual lea... 详细信息

为解决水母搜索算法(jellyfish search algorithm,JS)的洋流运动缺乏多样性、群内运动缺乏引导性、种群间信息无交流,造成搜索速度慢、稳定性差及易早熟的问题,构建了一种融合均值榜样的反向互学习水母搜索算法(oppositional-mutual learning jellyfish search algorithm based on mean-value example,OMLJS).首先在水母跟随洋流运动(全局搜索)部分,利用前两代水母的平均位置代替只考虑上一代水母的平均位置来引导水母个体的位置更新,提高算法的全局搜索能力;其次在水母的群内主动运动(局部搜索)部分,利用最优个体代替随机个体来引导水母进行更有效的搜索,加快算法的收敛速度;然后在水母进入下一次迭代前增加对水母种群进行动态反向互学习步骤,增加种群多样性及增强种群间的信息交流,达到互补另外两个策略,提高算法的整体优化性能.选用12个经典的基准测试优化函数,将OMLJS与5个对比算法从解的平均值、最优值及方差进行对比分析,并用于求解最小生成树问题,OMLJS能够更快地找到最小生成树.实验结果表明,OMLJS的收敛速度、求解精度明显提高.

关键词：水母搜索算法均值榜样学习反向互学习时间控制机制最小生成树问题

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机器人辅助腹腔镜与传统腹腔镜关于全子宫切除术在不同体质指数患者中的对比研究

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重庆医科大学学报 2024年第1期49卷 70-74页

作者：朱梦秋易倩琳武加林陈万丽肖琳重庆医科大学附属第一医院妇科重庆400016

目的:比较机器人辅助腹腔镜与传统腹腔镜关于全子宫切除术在不同体质指数患者中的安全性及可行性。方法:回顾性收集2016年2月至2021年4月于重庆医科大学附属第一医院接受了机器人辅助腹腔镜全子宫切除术(n=416)和传统腹腔镜全子宫切除术... 详细信息

目的:比较机器人辅助腹腔镜与传统腹腔镜关于全子宫切除术在不同体质指数患者中的安全性及可行性。方法:回顾性收集2016年2月至2021年4月于重庆医科大学附属第一医院接受了机器人辅助腹腔镜全子宫切除术(n=416)和传统腹腔镜全子宫切除术(n=725)患者的病例资料。按照不同等级体质指数(body mass index,BMI)对患者进行分层(非超重、超重和肥胖),比较2组中各BMI亚组间患者的围术期情况、术中及术后并发症。结果:机器人组中超重亚组的手术时间短于传统腹腔镜组[(125.37±50.92) min vs.(135.68±44.55) min],机器人组中3个BMI亚组的术中出血量均少于传统腹腔镜组[(60.46±45.20) mL vs.(92.88±105.13) mL、(72.01±62.03) mL vs.(115.02±123.38) mL及(65.59±37.92) mL vs.(125.16±96.07) mL],机器人组中超重亚组和肥胖亚组的首次排气时间均短于传统腹腔镜组[(2.04±0.83) d vs.(2.19±0.63) d和(1.97±0.54) d vs.(2.19±0.54) d],差异均有统计学意义(P0.05)。结论:超重和肥胖患者的全子宫切除术,机器人辅助腹腔镜相较于传统腹腔镜在围术期降低并发症等方面有一定优势。

关键词：机器人辅助腹腔镜传统腹腔镜全子宫切除术体质指数围术期

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Transcription factor ZmNAC126 plays an important role in transcriptional regulation of maize starch synthesis-related genes

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The Crop Journal 2021年第1期9卷 192-203页

作者： qianlin xiao Yayun Wang Hui Li Chunxia Zhang Bin Wei Yongbin Wang Huanhuan Huang Yangping Li Guowu Yu Hanmei Liu Junjie Zhang Yinghong Liu Yufeng Hu Yubi Huang State Key Laboratory of Crop Gene Exploration and Utilization in Southwest China Sichuan Agricultural UniversityChengdu 611130SichuanChina College of Agronomy and Biotechnology Southwest UniversityChongqing 400716China College of Agronomy Sichuan Agricultural UniversityChengdu 611130SichuanChina College of Life Science Sichuan Agricultural UniversityYa'an 625014SichuanChina Maize Research Institute Sichuan Agricultural UniversityChengdu 611130SichuanChina Sichuan Seed Station Chengdu 610041SichuanChina

Maize(Zea mays L.)is one of the most important food crops in the world,and starch is the main component of its endosperm.Transcriptional regulation plays a vital role in starch biosynthesis.However,it is not well understood in maize.We report the identification of the transcription factor ZmNAC126 and its role in regulation of starch synthesis in maize.Transcriptional expression of ZmNAC126 was higher in maize endosperm and kernels than in roots or stems.ZmNAC126 shared a similar expression pattern with starch synthesis genes during seed development,and its expression pattern was also consistent with the accumulation of starch.ZmNAC126 is a typical transcription factor with a transactivation domain between positions 201 and 227 of the amino acid sequence,is located in the nucleus,and binds to CACG repeats in vitro.Yeast one-hybrid assay revealed that ZmNAC126 bound the promoters of ZmGBSSI,ZmSSIIa,ZmSSIV,ZmISA1,and ZmISA2.Transient overexpression of ZmNAC126 in maize endosperm increased the activities of promoters pZmSh2,pZmBt2,pZmGBSSI,pZmSSIIIa,and pZmBT1 but inhibited the activities of pZmISA1 and pZmISA2.ZmNAC126 thus acts in starch synthesis by transcriptionally regulating targeted starch synthesis-related genes in maize kernels.

关键词： Maize Starch synthesis ZmNAC126 Co-expression Transcription regulation

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Maize (Zea maysL.) Productivity in Response to Nitrogen Management in Pakistan

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American Journal of Plant Sciences 2021年第8期12卷 1173-1179页

作者： Hameed Gul Saeedur Rahman Ali Shahzad Shareef Gul Mengya Qian qianlin xiao Zhizhai Liu College of Agronomy and Biotechnology Southwest University Chongqing China Department of Agronomy The University of Agriculture Peshawar Pakistan Department of Agronomy University of Swabi Anbar (KPK) Pakistan

Nitrogen (N) plays a vital role in the productivity of maize (Zea mays L). To investigate the fertilizer effects of N on the yield and growth of maize hybrid variety (Gorilla), the experiment was carried out at the research farm of University of Swabi, Pakistan, during summer 2017-18. Four levels of N (Urea, Urea + Farm Yard Manure (FYM), Urea + Compost, Urea + Poultry Manure (PM)) were set in the present study. Randomized complete block design (RCBD) was used with split-plot arrangement with N administering to main plot. Results showed that yield and other traits, i.e. plant height, ear length, ear weight, kernel yield, kernels ear-1 and harvest index (HI) were significantly affected by Nitrogen. In current study, the maximum performances of plant height (231.46 cm), ear length (12.17 cm), kernels ear-1 (434.83), kernel yield (2095.7 kg·ha-1), total kernel weight (350.75 kg·ha-1), biomass yield (4015.3 kg·ha-1) and HI (37.31) were recorded under the treatment of UREA + PM, and followed by UREA + FYM. Besides, the applications of organic manure in combination with nitrogen significantly increased yield and its components. Application of 50% of N and 50% of poultry manure produced higher performance for the traits of plant height, ear length, kernels ear-1, total kernels weight ear-1, kernel yield, and biomass yield.

关键词： Maize (Zea mays L.) Nitrogen Yield Yield Components Pakistan

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多孔镁基镁铁铝复合尖晶石耐火骨料的合成机理

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硅酸盐学报 2023年第3期51卷 571-578页

作者：陈茜琳鄢文王晓武汉科技大学省部共建耐火材料与冶金国家重点实验室武汉430081 青海大学化工学院西宁810016

多孔骨料是对耐火材料进行轻量化设计的关键。以轻烧菱镁矿、氢氧化铝和铁红为原料,采用原位分解合成法,成功制备了多孔镁基镁铁铝复合尖晶石耐火骨料,在分析烧成温度(1000~1600℃)对显微结构与强度影响的基础上,研究了多孔骨料的合成... 详细信息

多孔骨料是对耐火材料进行轻量化设计的关键。以轻烧菱镁矿、氢氧化铝和铁红为原料,采用原位分解合成法,成功制备了多孔镁基镁铁铝复合尖晶石耐火骨料,在分析烧成温度(1000~1600℃)对显微结构与强度影响的基础上,研究了多孔骨料的合成机理。研究表明:当烧成温度为1000~1300℃时,试样内气孔来自微颗粒内和微颗粒之间,基本没有颈部连接;当烧成温度升高到1400~1600℃时,微颗粒内气孔合并长大、迁出,颈部显著长大,强度提高;镁铁铝复合尖晶石的形成过程分为2步,一是在氢氧化铝假象表面生成MgAl_(2)O_(4)后,再与Fe^(3+)反应生成环状镁铁铝复合尖晶石,二是在MgO位置生成MgFe_(2)O_(4),再与Al^(3+)反应生成粒状和条状镁铁铝复合尖晶石;当烧成温度为1550℃时,试样具有优异的综合性能,其显气孔率为24.4%,中位孔径为25.89μm,导热系数为2.79 W/(m·K)(1000℃),耐压强度为74.4 MPa,与市售烧结镁砂相比,导热系数降低了64.7%。

关键词：多孔耐火骨料镁基镁铁铝复合尖晶石原位分解合成法显微结构强度

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猪细环病毒1型间接ELISA抗体检测方法的建立

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北京农学院学报 2024年第1期39卷 43-46页

作者：杨敩校刘芊麟陈丙生蒋小玲王建舫董虹肖兴周双海北京农学院动物科学技术学院北京102206 衡阳市畜牧水产事务中心湖南衡阳421001

【目的】建立一种检测猪细环病毒1型抗体的血清学方法。【方法】以猪细环病毒1型衣壳蛋白为包被抗原,筛选和优化抗体检测反应条件来建立一种检测猪细环病毒1型衣壳蛋白抗体的间接ELISA方法,之后进行特异性和重复性试验,并进行初步临床... 详细信息

【目的】建立一种检测猪细环病毒1型抗体的血清学方法。【方法】以猪细环病毒1型衣壳蛋白为包被抗原,筛选和优化抗体检测反应条件来建立一种检测猪细环病毒1型衣壳蛋白抗体的间接ELISA方法,之后进行特异性和重复性试验,并进行初步临床应用检测。【结果】确定了检测猪细环病毒1型衣壳蛋白抗体的间接ELISA方法的各项最佳反应条件;对8种猪源病毒阳性血清的检测结果显示只有猪细环病毒1型阳性血清为阳性,显示出良好的特异性;批内变异系数均小于5%,批间变异系数均小于10%,显示出良好的重复性。对来源于北京和湖南地区的400份猪血清样品的检测结果显示,猪细环病毒1型衣壳蛋白抗体阳性率为75.25%,PCR阳性率为71.00%,二者之间没有显著差异(P>0.05),表明这两个地区存在较多的的猪细环病毒1型感染。【结论】建立了一种特异性和重复性都良好的检测猪细环病毒1型衣壳蛋白抗体的间接ELISA,可用于猪细环病毒1型抗体的临床检测。

关键词：猪细环病毒1型衣壳蛋白间接ELISA 抗体检测

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Preliminary Phenotypic and SNP-Based Molecular Characterization of Maize (Zea maysL.)-Mexicana (Zea maysSSP. Mexicana) Introgression Lines under Inbred Background of 48-2

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American Journal of Plant Sciences 2021年第7期12卷 1073-1089页

作者： Abdoul Raouf Sayadi Maazou Ju Qiu Ling Ai Mohammad G. Arabzai Mengya Qian Hameed Gul Xuemei Du Fangyu Xing Jiarui Yan Keyi Zhang Ziqi Zhang Qiannan Ma Tianhui Huang Hong Duan qianlin xiao Zhizhai Liu College of Agronomy and Biotechnology Southwest University Chongqing China Pan African University Life and Earth Sciences Institute (Including Health and Agriculture) University of Ibadan Ibadan Nigeria International Institute of Tropical Agriculture (IITA) Ibadan Nigeria Paktia University Gardiz Afghanistan

Wild relatives possess potential genetic diversity for maize (Zea mays L.) improvement. Characterization of maize-mexicana introgression lines (ILs) is of great value to diversify the genetic base and improve the maize germplasm. Four maize-mexicana IL generations, i.e. BC1, BC2, BC3, and RIL, were constructed under the elite inbred background of 48-2, elite inbred line that is widely used in maize breeding in Southwestern China, and were phenotyped in different years and genotyped with 56110 SNPs. The results indicated that 48-2 had higher phenotypic performances than all the characterized ILs on most of the agronomic traits. Compared with other ILs, BC2 individuals exhibited more similar performance to 48-2 on most traits and possessed the highest kernel ratio (66.5%). Population structure and principal component analysis indicated that BC3 individuals gathered closer to 48-2 and exhibited the lowest mexicana-introgression frequency (0.50%), while BC2 (29.06%) and RIL (18.52%) showed higher introgression frequency. The high level of genetic diversity observed in the maize-mexicana ILs demonstrated that Z. mays ssp. mexicana can serve as a potential source for the enrichment of maize germplasm.

关键词： Maize (Zea mays L.) Mexicana (Zea mays SSP. Mexicana) Introgression Lines Phenotypic Characterization Molecular Characterization

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缓释双生长因子三层支架体内长期促骨软骨缺损再生的研究

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天津大学学报（自然科学与工程技术版） 2023年第6期56卷 588-594页

作者：董云生黄佳星肖慧王雅菁王茜霖王淑芳南开大学生命科学学院天津300071 南开大学生物活性材料教育部重点实验室天津300071

外伤或关节使用过度或重度关节炎都会导致关节表面的软骨以及软骨下骨形成难以恢复的损伤.尽管目前临床上的治疗技术在某些方面取得成功,但仍存在治疗的局限性,如自体移植存在供区并发症、移植的组织不完全整合和易降解、骨髓刺激会产... 详细信息

外伤或关节使用过度或重度关节炎都会导致关节表面的软骨以及软骨下骨形成难以恢复的损伤.尽管目前临床上的治疗技术在某些方面取得成功,但仍存在治疗的局限性,如自体移植存在供区并发症、移植的组织不完全整合和易降解、骨髓刺激会产生纤维软骨、质量不佳等.为提高骨软骨缺损的治疗效果,前期研究制备了局部缓释生长因子rhBMP-2和rhTGF-β3的丝素蛋白/脱软骨细胞外基质/纳米羟基磷灰石复合三层支架,并在兔子体内短期植入后获得良好的骨软骨修复效果,但并未进行长期体内研究.本研究在兔子双膝滑车沟处建立直径5mm、深度3mm的缺损,并将具有局部缓释生长因子rhBMP-2和rhTGF-β3的复合三层支架进行缺损区植入,且以天然膝关节滑车沟处骨软骨为对照组,修复34周后通过大体观察、组织学染色、免疫组织化学染色、Micro-CT扫描以及力学测定,评价支架对骨软骨缺损长期的修复情况.大体观察、组织学染色、免疫组织学染色扫描结果表明,支架组再生软骨具有与天然组相似的表面平整度和完整度、细胞排列形态以及黏多糖含量;但Ⅱ型胶原染色和软骨纳米压痕结果表明,支架组再生软骨Ⅱ型胶原含量以及力学性能明显低于天然软骨.Micro-CT扫描以及力学结果表明,支架组再生软骨下骨具有与天然软骨下骨相似的结构以及力学强度((48.98±12.7091)MPa).因此,具有局部缓释生长因子rhBMP-2和rhTGF-β3的丝素蛋白复合三层支架在体内长期促进骨软骨再生方面具有显著的优势.

关键词：缓释支架生长因子骨软骨修复体内研究组织工程

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红外光谱法测定压缩空气中悬浮油检测方法的解析

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山西化工 2023年第10期43卷 43-44页

作者：刘前林肖宏艳何丽广东普标技术研究有限公司广东广州510700 广州市微生物研究所集团股份有限公司广东广州510663

压缩空气是工业生产重要的动力源,压缩空气质量的好坏关系到工业生产的安全、产品质量和运营成本的控制等方面,本文解析了压缩空气悬浮油测试的仲裁方法傅立叶红外光谱法,对此方法从准备、采样到分析,严格按照ISO8573-2的标准方法,来保... 详细信息

压缩空气是工业生产重要的动力源,压缩空气质量的好坏关系到工业生产的安全、产品质量和运营成本的控制等方面,本文解析了压缩空气悬浮油测试的仲裁方法傅立叶红外光谱法,对此方法从准备、采样到分析,严格按照ISO8573-2的标准方法,来保证整个检测结果的准确可靠,同时大大提升了采样效率。

关键词：压缩空气悬浮油红外光谱法

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