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Genealogy and phylogeography of Cyprinid fish Labeo rohita （Hamilton, 1822） inferred from ATPase 6 and 8 mitochondrial DNA gene analysis

引用

Current Zoology 2014年第4期60卷 460-471页

作者： Rupesh K. LUHARIYA Kuldeep K. LAL Rajeev K. SINGH Vindhya MOHINDRA Arti GUPTA prachi masih Arvind K. DWIVEDI Rakhi DAS U. K. CHAUHAN J. K. JENA National Bureau ofFish Genetic Resources (ICAR) Lucknow- 226 002 UP India School of Environmental Sciences APS University Rewa- 486 003 MP India

ATPase 6/8 gene (842 bp) of mitochondrial DNA was sequenced inLabeo rohitasamples (n= 253) collected from nine rivers belonging to four river basins; Indus, Ganges, Brahmaputra and Mahanadi. Analysis revealed 44 haplotypes with high haplotype diversity (Hd) 0.694 and low nucleotide diversity (π) 0.001. The within population variation was larger (83.44%) than among population differences (16.56%). The mean FSTvalue (0.166;P< 0.05) for overall populations revealed moderate level of genetic structuring in the wildL. rohitapopulations. The haplotype network presented a single clade for wildL. rohitapopulation, from different rivers. Negative values for Fu’s index (FS), mismatch distribution analysis indicated period of expansion inL. rohitapopulation. The time after recent expansion was estimated for each population, between 0.042 to 0.167 mya. The pattern of Isolation by Distance (IBD) was not significant (r= -0.113,P< 0.287), when all the sampling locations were compared (Mantel test), however, when an outlier (Indus, Brahmaputra and Mahanadi) was removed from the whole population set, a clear positive correlation between pairwise FSTand geographic distance (Km) was seen. The analysis of data demonstrated that ATPase6/8 gene polymorphism is a potential marker to understand genetic population structure of wildL. rohitaexisting in different rivers. The study identified population substructure in wildL. rohitawith common ancestral origin [Current Zoology60 (4): 460–471, 2014].

关键词：线粒体DNA 系统地理学基因分析 ATP酶野鲮鲤科鱼类南亚家谱

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