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中国化学会第28届学术年会

作者： John D.Holliday peter willett Information School University of Sheffield

Any similarity measure that is to be used for similarity-based virtual screening （SBVS） has three principal components:the structure representation,the weighting scheme,and the similarity coefficient [1].The many previous studies of SBVS that have been carried out have demonstrated that effective screening can be achieved using binary fingerprints and the Tanimoto *** studies [2,3] discussed the interactions between representation,weighting scheme and similarity coefficient when a chemical similarity measure is *** their study,it was shown that the Tanimoto coefficient is effective for binary （unweighted） similarity searching,but it has been suggested that other coefficients may be superior to the Tanimoto coefficient when applied to non-binary representations [4].In this study,we consider of different similarity coefficients when used with weighted fingerprints and different datasets,*** class,heterogeneous class or high diversity datasets,to evaluate the effectiveness the similarity measure for SBVS.

关键词： chemical databases chemoinformatics similarity coefficient similarity search virtual screening

来源： cnki会议评论

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