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A toolbox for genetic manipulation in intestinal Clostridium symbiosum

Synthetic and Systems Biotechnology 2024年第1期9卷 43-54页

作者： pengjie yang Jinzhong Tian Lu Zhang Hui Zhang Gaohua yang Yimeng Ren Jingyuan Fang yang Gu Weihong Jiang CAS-Key Laboratory of Synthetic Biology CAS Center for Excellence in Molecular Plant SciencesShanghai Institute of Plant Physiology and EcologyChinese Academy of SciencesShanghai200032China University of Chinese Academy of Sciences Beijing100049China Xianghu Laboratory Hangzhou311231China NHC Key Laboratory of Digestive Diseases Division of Gastroenterology and HepatologyShanghai Institute of Digestive DiseaseRenji HospitalSchool of MedicineShanghai Jiao Tong University145 Middle Shandong RoadShanghai200001China Shenzhen Branch Guangdong Laboratory for Lingnan Modern AgricultureGenome Analysis Laboratory of the Ministry of AgricultureAgricultural Genomics Institute at ShenzhenChinese Academy of Agricultural SciencesShenzhen518120China The Wallenberg Laboratory Department of Molecular and Clinical MedicineSahlgrenska AcademyUniversity of GothenburgBruna Straket 16Gothenburg41345Sweden

Gut microbes are closely related with human health,but remain much to *** symbiosum is a conditionally pathogenic human gut bacterium and regarded as a potential biomarker for early diagnosis of intestinal ***,the absence of an efficient toolbox that allows diverse genetic manipulations of this bacterium limits its in-depth ***,we obtained the complete genome sequence of *** ATCC 14940,a representative strain of *** this basis,we further developed a series of genetic manipulation methods for this ***,following the identification of a functional replicon pBP1 in *** ATCC 14940,a highly efficient conjugative DNA transfer method was established,enabling the rapid introduction of exogenous plasmids into ***,we constructed a dual-plasmid CRISPR/Cas12a system for genome editing in this bacterium,reaching over 60% repression for most of the chosen genes as well as efficient deletion(>90%)of three target ***,this toolbox was used for the identification of crucial functional genes,involving growth,synthesis of important metabolites,and virulence of *** ATCC *** work has effectively established and optimized genome editing methods in intestinal ***,thereby providing strong support for further basic and application research in this bacterium.

关键词： Gut Clostridium symbiosum Toolbox Gene overexpression Gene deletion Gene regulation

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细胞自噬在心肌肥厚中的研究进展

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中华实验外科杂志 2017年第9期34卷 1613-1616页

作者：杨鹏杰邓勇志山西医科大学附属心血管病医院山西省心血管病医院(研究所)心血管外科太原030024

心肌肥厚作为心力衰竭的独立危险因素，主要表现为细胞体积增大、蛋白合成增多。近年来部分研究结果表明细胞自噬是引起心肌细胞肥大的分子机制，因此我们将从细胞自噬的产生过程、不同水平的自噬与心肌细胞肥大的关系、影响心肌细胞自... 详细信息

心肌肥厚作为心力衰竭的独立危险因素，主要表现为细胞体积增大、蛋白合成增多。近年来部分研究结果表明细胞自噬是引起心肌细胞肥大的分子机制，因此我们将从细胞自噬的产生过程、不同水平的自噬与心肌细胞肥大的关系、影响心肌细胞自噬的上游分子信号机制等方面进行综述，以阐明细胞自噬对心肌肥厚的作用，拟为今后心衰的治疗提供理论基础。

关键词：心肌肥厚自噬分子机制

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基于多尺度自适应残差卷积神经网络的新能源配电网故障定位技术

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水利水电技术（中英文） 2023年第S2期54卷 439-446页

作者：杨鹏杰徐宇郑晨一云南电网有限责任公司昆明供电局云南昆明650011 东南大学电气工程学院江苏南京210092

随着新型电力系统建设的推进,分布式新能源接入配电网的比例不断提升,使得电网潮流分布更加复杂,对配电网的故障定位要求越来越高,导致现有的故障定位方法准确率低、稳定性差。对此提出一种基于多尺度自适应残差卷积神经网络的新能源配... 详细信息

随着新型电力系统建设的推进,分布式新能源接入配电网的比例不断提升,使得电网潮流分布更加复杂,对配电网的故障定位要求越来越高,导致现有的故障定位方法准确率低、稳定性差。对此提出一种基于多尺度自适应残差卷积神经网络的新能源配电网故障定位方法。首先,对故障电流使用变分模态分解,得到一系列征模态函数;然后,使用多尺度自适应卷积动态调整卷积核尺寸、残差卷积提升网络学习能力的方式构建多尺度自适应残差卷积神经网络模型,特征学习输入的故障电流本征模态函数;最后,经过Softmax分类器实现故障区段分类,完成故障定位。仿真结果表明,所提方法面对新能源接入的配电网能够实现不同故障的准确定位,并且对高阻接地故障仍然具有较高的准确率。和常见的卷积神经网络、支持向量机相比,配电网故障定位准确率分别提升了5.63%、9.31%,验证了该方法的有效性。

关键词：新型电力系统新能源配电网故障定位多尺度自适应残差卷积神经网络

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SYNTAX及EuroSCORE评分对左主干和／或三支病变血运重建策略选择的指导意义

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中华胸心血管外科杂志 2016年第5期32卷 309-312页

作者：杨鹏杰邓勇志山西医科大学附属心血管病医院山西省心血管病医院研究所心外科太原030024

近年来冠心病的治疗取得了较大的进展，极大地改善了冠心病患者的预后。但导致急性心肌梗死和心源性猝死的冠状动脉左主干病变和／或三支病变的治疗决策，目前尚无统一意见，Eu—mSCORE和SYNTAXScore是两种国际上广为接受的探讨冠心病... 详细信息

近年来冠心病的治疗取得了较大的进展，极大地改善了冠心病患者的预后。但导致急性心肌梗死和心源性猝死的冠状动脉左主干病变和／或三支病变的治疗决策，目前尚无统一意见，Eu—mSCORE和SYNTAXScore是两种国际上广为接受的探讨冠心病治疗策略的评分，我们就两种评分系统对左主干和／或三支病变患者血运重建策略选择的指导意义进行综述。

关键词：冠状动脉左主干病变三支病变评分系统血运重建冠心病患者急性心肌梗死心源性猝死治疗

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蓄电池放电设备故障自动化测试方法优化

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自动化与仪器仪表 2019年第7期 62-65页

作者：孙西杨鹏杰云南电网有限责任公司昆明供电局

蓄电池在输电配电过程中受到电磁场干扰以及蓄电池电源组件之间的串扰影响,容易产生蓄电池漏电故障,为了提高蓄电池的漏电故障诊断效率,提出一种基于属性约简的蓄电池漏电故障自动检测方法。采用电源传感信息特征采样方法进行蓄电池的... 详细信息

蓄电池在输电配电过程中受到电磁场干扰以及蓄电池电源组件之间的串扰影响,容易产生蓄电池漏电故障,为了提高蓄电池的漏电故障诊断效率,提出一种基于属性约简的蓄电池漏电故障自动检测方法。采用电源传感信息特征采样方法进行蓄电池的属性信息采集,提取蓄电池电源分布式组件中的漏电信号,对蓄电池的漏电信号进行高阶谱特征分解和属性约简挖掘,采用谱分析模型进行蓄电池传输信号的特征提取,根据提取的属性约简特征量的异常性进行蓄电池的漏电故障分析,采用自适应学习算法进行蓄电池漏电的模式识别和自动诊断,提高蓄电池漏电故障检测的自适应性和全局收敛性。仿真结果表明,采用该方法进行蓄电池漏电故障检测的智能性较好,检测准确性较高,提高了故障诊断的自适应性和自动化水平。

关键词：属性约简蓄电池漏电故障检测特征提取

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基于深度卷积门控神经网络的高比例新能源接入配电网故障分类研究

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电气应用 2023年第12期42卷 68-76页

作者：徐宇杨鹏杰李磊云南电网有限责任公司昆明供电局云南昆明650011

提出一种基于深度卷积门控神经网络的高比例新能源接入配电网故障分类方法。首先,通过小波包变换特征提取配电网零序电流形成时频能量谱,将序列归一化后作为模型的输入数据;其次,将深度卷积门控神经网络应用于配电网故障分类中,融合卷... 详细信息

提出一种基于深度卷积门控神经网络的高比例新能源接入配电网故障分类方法。首先,通过小波包变换特征提取配电网零序电流形成时频能量谱,将序列归一化后作为模型的输入数据;其次,将深度卷积门控神经网络应用于配电网故障分类中,融合卷积神经网络和门控循环网络提取新能源配电网故障特征数据,引入注意力机制提升网络训练效率和准确度,通过Softmax分类器进行故障分类,形成高比例新能源接入配电网故障分类模型,映射输入零序电流和输出故障类别之间的关系;最后,经过仿真结果表明,所提方法对不同故障位置和不同过渡电阻具有分类速度快、准确率高的优点,在高比例新能源接入的配电网中应用前景良好。

关键词：新能源配电网故障分类深度卷积门控神经网络小波包变换

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基于优化核极限学习机的新能源配电网继电保护故障检测技术

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自动化应用 2023年第23期64卷 64-69页

作者：徐宇杨鹏杰李磊云南电网有限责任公司昆明供电局云南昆明650011

随着分布式新能源接入电网容量的不断增加,配电网潮流分布更加复杂,传统的故障检测方法无法满足现有新能源配电网的需求,进一步降低了继电保护装置的可靠性、灵敏性。针对该问题,本文提出了一种基于优化核极限学习机的新能源配电网继电... 详细信息

随着分布式新能源接入电网容量的不断增加,配电网潮流分布更加复杂,传统的故障检测方法无法满足现有新能源配电网的需求,进一步降低了继电保护装置的可靠性、灵敏性。针对该问题,本文提出了一种基于优化核极限学习机的新能源配电网继电保护故障检测方法。首先,通过小波包变换特征提取配电网三相电流形成时频能量谱;然后,利用鲸鱼优化算法寻优速度快、收敛精度高的优点,优化核极限学习机参数,构建基于鲸鱼优化核极限学习机的新能源配电网继电保护故障检测模型,以准确获取新能源配电网的故障位置、类型、相序;最后,搭建IEEE33节点的新能源配电网模型并进行仿真验证。结果表明,该方法对不同故障位置、类型、相序均具有较高精度,提升了新能源配电网继电保护的故障检测水平。

关键词：新能源配电网故障检测继电保护核极限学习机

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紫杉醇在内蒙地区肿瘤患者中群体药代动力学模型的建立及验证

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肿瘤药学 2020年第6期10卷 691-697页

作者：侯坤王飞杨鹏杰内蒙古自治区肿瘤医院药学部内蒙古呼和浩特010020

目的建立紫杉醇在内蒙地区肿瘤患者中的群体药代动力学模型,为患者制定精准的个体化给药方案提供参考。方法收集59例接受紫杉醇治疗的肿瘤患者的121个血样,利用免疫比浊法测定紫杉醇血药浓度,采用非线性混合效应模型法(NONMEM)考察年龄... 详细信息

目的建立紫杉醇在内蒙地区肿瘤患者中的群体药代动力学模型,为患者制定精准的个体化给药方案提供参考。方法收集59例接受紫杉醇治疗的肿瘤患者的121个血样,利用免疫比浊法测定紫杉醇血药浓度,采用非线性混合效应模型法(NONMEM)考察年龄、种族、白蛋白等病理生理因素对紫杉醇药动学参数的影响,并建立紫杉醇群体药代动力学模型。对模型进行拟合优度诊断、自举法(Bootstrap)内部验证。结果紫杉醇在内蒙地区肿瘤患者体内的药代动力学符合一室模型,模型的药代动力学参数估计值:清除率0.14 L·h^-1,表观分布容积3.62 L。种族对内蒙地区肿瘤患者的紫杉醇清除率和表观分布容积均有显著影响。结论所建立的群体药代动力学模型稳定,可以较好地反映紫杉醇在内蒙地区肿瘤患者中的群体药代动力学特征,可为临床优化给药方案的制定提供一定的科学依据。

关键词：紫杉醇内蒙地区群体药物代谢动力学非线性混合效应模型

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雌二醇对小鼠颈部移植心脏免疫耐受影响的初步研究

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中国药物与临床 2022年第1期22卷 5-8,I0001页

作者：徐一君杨鹏杰山西省心血管病医院心外科太原030024 内蒙古医科大学附属人民医院胸外科呼和浩特010110

目的探讨雌二醇对小鼠颈部移植心脏免疫耐受的影响。方法建立小鼠颈部心脏异位移植模型,供、受体均为近交系健康雄性BALB/c和C57BL/6小鼠,分别在受体小鼠心脏移植术后1 d,3 d,7 d腹腔注射不同剂量外源性雌二醇实现干预。实验分为4组:A组... 详细信息

目的探讨雌二醇对小鼠颈部移植心脏免疫耐受的影响。方法建立小鼠颈部心脏异位移植模型,供、受体均为近交系健康雄性BALB/c和C57BL/6小鼠,分别在受体小鼠心脏移植术后1 d,3 d,7 d腹腔注射不同剂量外源性雌二醇实现干预。实验分为4组:A组:对照组,供、受体均无特殊处理;B组:2 mg/kg;C组:4 mg/kg;D组:6 mg/kg。术后观察比较各组受体小鼠供心存活时间、排斥反应程度及冠状动脉内膜增生程度。结果B、C、D组受体小鼠比A组存活天数明显延长[(13.7±1.6)d、(15.3±1.9)d、(16.7±2.2)d与(8.8±1.3)d,P<0.05],B、C、D组之间相比,随着外源性雌二醇注射剂量的增加存活天数有所延长,但差异无统计学意义。切取移植后供心进行苏木精-伊红染色病理检查发现:术后第7天B、C、D组心肌组织间存在多灶型炎症细胞浸润并伴有部分心肌坏死,但是移植心发生排斥反应的程度轻于A组,术后第7天排斥分级显示D组移植小鼠明显较A组小鼠排斥反应轻。通过弹力纤维染色图像分析测定发现各组移植心脏冠状动脉内膜增厚程度随着存活天数的延长而加重,术后7 d给予B、C、D组冠状动脉内膜增生慢,且随着外源性雌二醇注射剂量的增加,冠状动脉内膜增生更慢。结论雌二醇干预能够抑制免疫排斥反应,减轻冠状动脉内膜增生,延长移植心脏存活时间,在诱导小鼠移植心脏产生免疫耐受方面具有一定作用。

关键词：雌二醇心脏移植免疫耐受

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复合动脉桥在冠状动脉三支病变患者全动脉化血运重建中的应用

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中华临床医师杂志（电子版） 2016年第19期10卷 2907-2912页

作者：杨鹏杰邓勇志山西医科大学附属心血管病医院山西省心血管病医院(研究所)心外科太原030024

冠状动脉旁路移植术是冠状动脉三支病变患者首选的治疗方式。全动脉化冠状动脉血运重建(TACR)是近年来冠状动脉外科临床的主要进展。由于动脉桥血管可用移植血管长度的限制等原因,传统的血管吻合方式难以满足三支病变患者TACR的需求。... 详细信息

冠状动脉旁路移植术是冠状动脉三支病变患者首选的治疗方式。全动脉化冠状动脉血运重建(TACR)是近年来冠状动脉外科临床的主要进展。由于动脉桥血管可用移植血管长度的限制等原因,传统的血管吻合方式难以满足三支病变患者TACR的需求。合理的复合动脉桥设计可以解决这一难题。常用的复合动脉桥有人字桥、丁字桥、兀字桥、吊索型桥、乂字桥、飞字桥、众字桥等。本文针对以上复合动脉桥TACR的临床研究进展进行综述。

关键词：冠心病三支病变冠状动脉旁路移植术复合动脉桥全动脉化冠状动脉血运重建

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