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Mapping of de novo mutations in primary biliary cholangitis to a disease-specific co-expression network underlying homeostasis and metabolism

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Journal of Genetics and Genomics 2022年第2期49卷 145-154页

作者： Lu Wang Jinchen Li Chan Wang Ruqi Tang Jialong Liang Yuhua Gong Yaping Dai ningling ding Jian Wu Na Dai Lei Liu Yi Zhao Youlin Shao Weifeng Zhao Peng Jiang Xingjuan Shi Weichang Chen Ye Tian Xiangdong Liu Xiong Ma Zhongsheng Sun Key Laboratory of Developmental Genes and Human Diseases Institute of Life SciencesSoutheast University2 Sipailou RoadNanjingJiangsu 210096China Beijing Institutes of Life Science Chinese Academy of SciencesNo.1 West Beichen RoadChaoyang DistrictBeijing 100101China Department of Gastroenterology and Hepatology Shanghai Institute of Digestive DiseasesShanghai Jiao Tong University School of Medicine Afﬁliated Renji Hospital145 Shandong Middle RoadShanghai 200001China Department of Laboratory Medicine The Third People’s Hospital of Zhenjiang300 DaijiamenZhenjiangJiangsu 212021China Department of Laboratory Medicine The Fifth People’s Hospital of Wuxi1215 Guangrui RoadWuxiJiangsu 214000China Department of Hepatology The Fifth People’s Hospital of SuzhouSoochow University10 Guangqian RoadSuzhouJiangsu 215131China Department of Rheumatology First Afﬁliated Hospital of Soochow University188 Shizi RoadSuzhouJiangsu 215006China Department of Gastroenterology Jiangsu University Afﬁliated Kunshan Hospital91 Qianjin West RoadKunshanJiangsu 215300China Department of Gastroenterology Yixing People’s Hospital75 Tongzhenguan RoadYixinJiangsu 214200China Department of Gastrointestinal Endoscopy Eastern Hepatobiliary Surgery Hospital700 Moyu North RoadShanghai 201800China Department of Hepatology The Third People’s Hospital of Changzhou300 Lanling North RoadChangzhouJiangsu 213001China Department of Infectious Diseases First Afﬁliated Hospital of Soochow University188 Shizi RoadSuzhouJiangsu 215006China Department of Gastroenterology First Afﬁliated Hospital of Soochow University188 Shizi RoadSuzhouJiangsu 215006China Department of Radiology Second Afﬁliated Hospital of Soochow University1055 Sanxiang RoadSuzhouJiangsu 215004China Institute of Genomic Medicine Wenzhou Medical UniversityUniversity TownChashanWenzhouZhejiang 325035China

Primary biliary cholangitis(PBC) is an autoimmune disease involving dysregulation of a broad array of homeostatic and metabolic processes. Although considerable single-nucleotide polymorphisms have been unveiled, a large fraction of risk factors remains enigmatic. Candidate genes with rare mutations that tend to confer more deleterious effects need to be identified. To help pinpoint cellular and developmental mechanisms beyond common noncoding variants, we integrate whole exome sequencing with integrative network analysis to investigate genes harboring de novo mutations. Prominent convergence has been revealed on a network of disease-specific co-expression comprised of 55 genes associated with homeostasis and metabolism. The transcription factor gene MEF2 D and the DNA repair gene PARP2 are highlighted as hub genes and identified to be up-and down-regulated, respectively, in peripheral blood data set. Enrichment analysis demonstrates that altered expression of MEF2 D and PARP2 may trigger a series of molecular and cellular processes with pivotal roles in PBC pathophysiology. Our study identifies genes with de novo mutations in PBC and suggests that a subset of genes in homeostasis and metabolism tend to act in synergy through converging on co-expression network, providing novel insights into the etiology of PBC and expanding the pool of molecular candidates for discovering clinically actionable biomarkers.

关键词： Primary biliary cholangitis de novo mutations Whole exome sequencing Transcriptional networks Co-expression

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血浆置换对慢性乙型重型肝炎患者血清细胞因子影响的研究

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中国医药导报 2010年第32期7卷 33-34页

作者：丁宁玲朱翔王勇平苏州市第五人民医院传染科江苏苏州215007

目的:研究血浆置换对慢性乙型重型肝炎患者血清白介素-12(IL-12)、白介素-18(IL-18)和白介素-10(IL-10)的影响。方法:40例慢性乙型重型肝炎患者,分别在血浆置换治疗前后检测血清IL-12、IL-18和IL-10的水平,同时检测肝功能、凝血酶原活动... 详细信息

目的:研究血浆置换对慢性乙型重型肝炎患者血清白介素-12(IL-12)、白介素-18(IL-18)和白介素-10(IL-10)的影响。方法:40例慢性乙型重型肝炎患者,分别在血浆置换治疗前后检测血清IL-12、IL-18和IL-10的水平,同时检测肝功能、凝血酶原活动度(PTA),并与健康对照组比较。结果:慢性乙型重型肝炎患者治疗前血清IL-12、IL-18水平明显升高,IL-10水平下降(均P<0.01);血浆置换治疗后血清IL-12、IL-18水平较前显著下降,IL-10水平较前显著升高(均P<0.01)。血浆置换治疗对肝功能的恢复及PTA的升高有明显疗效。结论:血浆置换可降低慢性乙型重型肝炎患者血清IL-12、IL-18的水平,提升IL-10的水平,保护肝细胞,促进病情的恢复。

关键词：血浆置换慢性乙型重型肝炎白细胞介素

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替诺福韦酯治疗40例恩替卡韦疗效不佳慢性乙型肝炎患者临床分析

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中国现代医生 2017年第35期55卷 102-104,107页

作者：丁宁玲龚婵聪路文明朱翔江苏省苏州市第五人民医院感染科江苏苏州215007

目的探讨替诺福韦酯(TDF)对恩替卡韦(ETV)效果不佳的慢性乙型肝炎(CHB)患者的临床疗效。方法采用TDF对40例ETV效果不佳的CHB患者进行挽救治疗,每天300 mg口服,连续48周。分析第12、24、48周时HBV DNA转阴率、病毒学突破率、ALT复常率、H... 详细信息

目的探讨替诺福韦酯(TDF)对恩替卡韦(ETV)效果不佳的慢性乙型肝炎(CHB)患者的临床疗效。方法采用TDF对40例ETV效果不佳的CHB患者进行挽救治疗,每天300 mg口服,连续48周。分析第12、24、48周时HBV DNA转阴率、病毒学突破率、ALT复常率、HBeAg血清学转换率及不良反应发生率。结果基线时点、第12、24、48周HBV DNA转阴率分别为0%、40.0%、72.5%、92.5%(各时间点病毒学突破率均为0),ALT复常率分别为10.0%、37.5%、62.5%、90.0%,两指标各时间点前后比较,差异均有统计学意义(P0.05)。结论 TDF挽救治疗ETV效果不佳的CHB患者是一种有效、安全的优化治疗方案。

关键词：替诺福韦酯挽救治疗恩替卡韦治疗失败慢性乙型肝炎

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替诺福韦对HBeAg阳性慢性乙型肝炎初治患者病毒载量影响及疗效观察

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国际流行病学传染病学杂志 2019年第3期46卷 200-203页

作者：龚婵聪丁宁玲李扬沙莉路文明苏州市第五人民医院传染科江苏苏州215000

目的探究替诺福韦(TDF)对HBeAg阳性初治慢性乙型肝炎患者的治疗效果。方法选择苏州市第五人民医院2016年10月至2017年12月收治的174例HBeAg阳性初治慢性乙型肝炎患者,随机分为TDF组(90例)和恩替卡韦(ETV)组(84例),比较两组患者的HBeAg... 详细信息

目的探究替诺福韦(TDF)对HBeAg阳性初治慢性乙型肝炎患者的治疗效果。方法选择苏州市第五人民医院2016年10月至2017年12月收治的174例HBeAg阳性初治慢性乙型肝炎患者,随机分为TDF组(90例)和恩替卡韦(ETV)组(84例),比较两组患者的HBeAg血清学转换情况、HBV DNA水平和转阴情况及ALT水平和复常情况。结果TDF组患者在治疗4、12、24和48周的HBeAg转阴略高于ETV组,差异无统计学意义(P>0.05)。TDF组患者在治疗后各时间点的HBV DNA水平、HBV DNA转阴率、ALT水平和ALT复常率与ETV组比较差异均无统计学意义(P>0.05)。结论TDF在抑制HBV活性、HBeAg转阴方面的作用与ETV相似,在治疗HBeAg阳性初治慢性乙型肝炎上效果显著,值得在临床上积极推广。

关键词：肝炎,乙型,慢性替诺福韦恩替卡韦 HBV DNA 谷丙转氨酶

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Differential regulation of JAK1 expression by ETS1 associated with predisposition to primary biliary cholangitis

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Journal of Genetics and Genomics 2023年第10期50卷 807-812页

作者： Peng Jiang Chan Wang Mingming Zhang Ye Tian Weifeng Zhao Junyi Xin Yexi Huang Zhibin Zhao Wenjuan Sun Jie Long Ruqi Tang Fang Qiu Xingjuan Shi Yi Zhao Li Zhu Na Dai Lei Liu Xudong Wu Jinshan Nie Bo Jiang Youlin Shao Yueqiu Gao Jianjiang Yu Zhigang Hu Zhidong Zang Yuhua Gong Yaping Dai Lan Wang ningling ding Ping Xu Sufang Chen Lu Wang Jing Xu Luyao Zhang Junyan Hong Ruonan Qian Hu Li Xuan Jiang Congwei Chen Wenyan Tian Jian Wu Yuzhang Jiang Chongxu Han Kui Zhang Hong Qiu Li Li Hong Fan Liming Chen Jianqiong Zhang Zhongsheng Sun Xiao Han Zhenhua Dai Erguang Li M.Eric Gershwin Zhexiong Lian Xiong Ma Michael F.Seldin Weichang Chen Meilin Wang Xiangdong Liu Key Laboratory of Developmental Genes and Human Diseases School of Life Science and TechnologySoutheast UniversityNanjingJiangsu 210096China Institute of Translational Medicine Yangzhou University Medical CollegeYangzhouJiangsu 225009China Department of Radiology&Oncology The Second Affiliated Hospital of Soochow UniversitySuzhouJiangsu 215004China The First Affiliated Hospital of Soochow University SuzhouJiangsu 215006China Department of Bioinformatics School of Biomedical Engineering and InformaticsNanjing Medical UniversityNanjingJiangsu 210029China Author links open overlay panelYexi Huang Guangdong Provincial People's Hospital Guangdong Academy of Medical SciencesGuangzhouGuangdong 510080China Department of Gastroenterology and Hepatology Shanghai Institute of Digestive DiseasesShanghai Jiao Tong University School of Medicine Affiliated Renji HospitalShanghai 200001China Department of Laboratory Medicine The Fourth Affiliated Hospital of Nanjing Medical UniversityNanjingJiangsu 210031China Department of Gastrointestinal Endoscopy Eastern Hepatobiliary Surgery HospitalShanghai 201800China The Fifth People's Hospital Soochow UniversitySuzhouJiangsu 215007China Department of Gastroenterology Jiangsu University Affiliated Kunshan HospitalKunshanJiangsu 215300China Department of Gastroenterology Yixing People's HospitalYixinJiangsu 214200China Department of Gastroenterology Yancheng First People's HospitalYanchengJiangsu 224005China Department of Gastroenterology Taicang First People's HospitalSoochow UniversityTaicangJiangsu 215400China Department of Hepatology Jingjiang Second People's HospitalJingjiangJiangsu 214500China Department of Hepatology The Third People's Hospital of ChangzhouChangzhouJiangsu 213001China Department of Liver Diseases Shuguang HospitalShanghai University of Traditional Chinese MedicineShanghai 201203China Department of Laboratory Medicine Jiangyin People's HospitalSoutheast UniversityJiangyinJiangsu 214400China Department of Labora

Primary biliary cholangitis(PBC)is an autoimmune liver disease characterized by the destruction of intrahepatic small bile ducts and progressive cholestasis,eventually leading to liver cirrhosis and hepatic failure wi... 详细信息

关键词： cholangitis biliary

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肝癌干细胞外泌体miR-196a增强肝癌细胞对多柔比星的耐药性

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国际肿瘤学杂志 2020年第10期47卷 585-592页

作者：宋全丁宁玲许英曹凯悦周素芳赵爱琴潘韵芝马赛苏州大学附属传染病医院药剂科 215131 苏州大学附属传染病医院传染科 215131 天津市第一中心医院病理科 300100 苏州市高新区人民医院妇产科 215129 南京医科大学附属苏州医院中心实验室苏州215002

目的筛选肝癌干细胞来源外泌体中差异表达的miRNA并分析其对肝癌细胞恶性生物学特征的影响。方法采用miRNA表达谱芯片分析肝癌干细胞来源外泌体中差异表达的miRNA并鉴定miRNA对肝癌干细胞恶性表型的作用。采用不同浓度(0、150、300μmol... 详细信息

目的筛选肝癌干细胞来源外泌体中差异表达的miRNA并分析其对肝癌细胞恶性生物学特征的影响。方法采用miRNA表达谱芯片分析肝癌干细胞来源外泌体中差异表达的miRNA并鉴定miRNA对肝癌干细胞恶性表型的作用。采用不同浓度(0、150、300μmol/L)多柔比星处理细胞,采用实时定量PCR(qRT-PCR)检测miR-196a表达水平的变化;分别采用肝癌干细胞来源外泌体(Exo-NC组)、转染miR-196a抑制剂处理后的外泌体(Exo-Inhibitor组)培养肝癌细胞,检测肝癌细胞的凋亡情况以及caspase3/7的活性。按照随机数字表法将裸鼠分为Do-PBS组、Do-Exo-Inhibitor组、Do-Exo-NC组,每组各5只,采用裸鼠移植瘤实验分析miR-196a对肝癌细胞裸鼠移植瘤模型的作用。结果本研究分离纯化了CD133^+Huh7干细胞培养上清中的外泌体,发现miR-7162-3p、miR-1910-5p、miR-3613-3p、miR-196a、miR-155-5p表达上调,miR-1246和miR-3613-5p表达下调。外泌体中miR-7162-3p、miR-196a和miR-155-5p对肝癌干细胞的自我更新能力具有重要影响;miR-1910-5p、miR-196a和miR-155-5p对肝癌干细胞的侵袭能力具有重要影响,其中miR-196a的抑制效果最显著。在反应24 h时,多柔比星浓度在0、150、300μmol/L时miR-196a的表达量分别为0.96±0.05、1.23±0.05和2.33±0.03,差异具有统计学意义(F=996.90,P<0.001);48 h时,多柔比星浓度在0、150、300μmol/L时miR-196a的表达量分别为1.02±0.07、2.35±0.05和2.89±0.55,差异具有统计学意义(F=303.00,P<0.001)。Exo-NC组肝癌细胞在多柔比星浓度为0和300μmol/L时的细胞凋亡率分别为9.37%±0.19%和11.64%±0.27%,Exo-Inhibitor组分别为18.80%±1.91%和22.79%±1.57%,差异均具有统计学意义(t=4.41,P=0.048;t=4.96,P=0.038)。未使用多柔比星处理时,Exo-NC组在24 h和48 h的caspase3/7比值分别为0.94±0.08和0.97±0.09,Exo-Inhibitor组分别为1.56±0.01和1.58±0.01,差异均具有统计学意义(t=11.41,P=0.008;t=6.07,P=0.026)。使用300μmol/L多柔比星处理细胞后,Exo-NC组在24 h和48 h的caspase3/7比值分别为0.95±0.07、1.36±0.08,Exo-Inhibitor组分别为2.84±0.08、3.20±0.14,差异均具有统计学意义(t=24.20,P=0.002;t=15.78,P=0.004)。Do-PBS组、Do-Exo-Inhibitor组和Do-Exo-NC组3组裸鼠的移植瘤体积依次增大,分别为(1051.86±89.90)mm^3、(1310.91±86.66)mm^3和(2185.14±352.34)mm^3,差异具有统计学意义(F=30.28,P<0.001);3组移植瘤重量依次增加,分别为(0.36±0.10)g、(0.39±0.12)g和(0.76±0.16)g,差异具有统计学意义(F=11.81,P=0.002);转染miR-196a抑制剂后裸鼠移植瘤肿瘤内miR-196a的表达显著降低,3组表达量分别为1.05±0.16、0.38±0.08和2.17±0.26,差异具有统计学意义(F=48.93,P<0.001)。结论肝癌干细胞分泌的外泌体可通过其中的miR-196a增强肝癌细胞对多柔比星的耐药性。

关键词：肝肿瘤干细胞外泌体 miR-196a 耐药

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330MW高背压热电联产机组运行优化分析

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华北电力大学学报（自然科学版） 2023年第4期50卷 101-111页

作者：李健丁维栋杨志平王宁玲戈志华华北电力大学国家火力发电工程技术研究中心北京102206 内蒙古京宁热电有限公司内蒙古乌兰察布012000

大型汽轮机组采用高背压方式供热可以充分利用乏汽余热,提高燃料利用效率,已经有越来越多火电厂进行高背压供热改造。为确保高背压机组运行经济性,针对某电厂330 MW高背压热电联产机组建立Ebsilon模型并进行全工况模拟,根据低压缸最小... 详细信息

大型汽轮机组采用高背压方式供热可以充分利用乏汽余热,提高燃料利用效率,已经有越来越多火电厂进行高背压供热改造。为确保高背压机组运行经济性,针对某电厂330 MW高背压热电联产机组建立Ebsilon模型并进行全工况模拟,根据低压缸最小冷却流量确定了机组的理论负荷区间,针对其实际热负荷条件建立了热网数学模型,结合热网供回水温度分析其在不同环境温度条件下的背压运行方式和电负荷范围,确定了优化背压后机组的实际运行边界;并针对热网回水偏离理想值时的经济性进行分析,确定了机组高背压投运策略。结果表明:机组采用高背压乏汽余热供热方式可以有效提高供热能力约80 MW,但是其环境温度适应性较差,环境温度较高时,采用抽背方式供热的经济性要明显优于抽凝方式,采用优化后的背压运行方式最高可降低标准发电煤耗约34 g/kW·h;另外,热网回水温度严重影响高背压机组的经济性,在不同的供水温度下,其高背压投运的边界回水温度也相应改变。

关键词：热电联产高背压供热供回水温度经济性分析运行策略

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目标导向液体治疗在腹部肿瘤切除术中的应用

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中国卫生标准管理 2021年第5期12卷 34-37页

作者：丁济飞赵强赵宁玲程微王勇六盘水市人民医院麻醉科贵州六盘水553001

目的探讨以每搏量变异度(stroke volume variation,SVV)指导的目标导向液体治疗与中心静脉压(central venous pressure,CVP)指导的传统补液方法在行腹部肿瘤切除术中的应用价值。方法择期行腹部肿瘤切除术的患者67例,ASAⅠ-Ⅲ级,随机分... 详细信息

目的探讨以每搏量变异度(stroke volume variation,SVV)指导的目标导向液体治疗与中心静脉压(central venous pressure,CVP)指导的传统补液方法在行腹部肿瘤切除术中的应用价值。方法择期行腹部肿瘤切除术的患者67例,ASAⅠ-Ⅲ级,随机分成2组:GDFT组(G组,n=32)和传统补液组(C组,n=35)。局麻下行桡动脉穿刺及右侧颈内静脉穿刺。G组桡动脉连接Flotrac/Vigileo,以SVV、CI等指标行目标导向液体治疗;C组监测CVP、MAP,根据CVP行传统补液。记录术中晶体量、胶体量、尿量、输血量;记录入室监测后的MAP、HR、Lac等指标。结果总输液量C组高于G组,差异有统计学意义(P0.05)。结论以SVV指导的目标导向治疗在择期行腹部肿瘤切除术的患者中,能明显减少术中液体的输入,保证微循环灌注,较传统的补液方法提供更加优化的容量治疗。

关键词：目标导向液体治疗 Flotrac/Vigileo 每搏量变异度中心静脉压腹部肿瘤切除术血流动力学

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商丘市宁陵县鱼类资源调查

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河南水产 2023年第3期 29-32页

作者：张艺蕊刘如垚丁琪琪陈守东杨胜军郝亚飞武国兆汤永涛周传江聂国兴河南师范大学水产学院河南省水产动物养殖工程技术研究中心河南新乡453007 宁陵县农业农村局河南商丘476700 河南省乡村产业发展服务中心郑州450008

2020年12月4日至12月5日,河南鱼类资源调查队在宁陵县农业农村局的配合下完成了商丘市宁陵县鱼类资源调查工作。宁陵县境内所有河流均属于淮河水系,根据境内河流的分布特点,此次调查共设置15个采样点,覆盖古宋河、大沙河等河流的干流及... 详细信息

2020年12月4日至12月5日,河南鱼类资源调查队在宁陵县农业农村局的配合下完成了商丘市宁陵县鱼类资源调查工作。宁陵县境内所有河流均属于淮河水系,根据境内河流的分布特点,此次调查共设置15个采样点,覆盖古宋河、大沙河等河流的干流及主要支流。本次渔获物共包括25种鱼类,隶属于4目9科24属,其中以鲤形目鱼类为主,共17种鱼类,占比68.00%。本研究从物种组成、生态类型(如栖息水层、产卵类型、摄食方式)和区系划分等方面对宁陵县鱼类资源情况进行论述,并根据调查结果对宁陵县水体治理和鱼类保护提出相关建议。

关键词：宁陵县鱼类资源调查生态类型区系划分

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