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Gene expression profiles in early leaf of rice(Oryza sativa)and foxtail millet(Setaria italica)

The Crop Journal 2024年第3期12卷 776-787页

作者： Jing Sun Chen Deng Xiuru Dai Haoshu Li Liying Zhang Jingke Wang Hang Zhao Yirong Yang nghivan phung Zhiguo Zhang Pinghua Li Xuehui Sun Tiegang Lu Biotechnology Research Institute Chinese Academy of Agricultural SciencesBeijing 100081China College of Agronomy Shandong Agricultural UniversityTai’an 271018ShandongChina Qingdao Institute of Bioenergy and Bioprocess Technology Chinese Academy of SciencesQingdao 266101ShandongChina

Plant anatomy is patterned early during leaf development which suggests studying the spatial–temporal transcriptomes of primordia will help identify critical regulative and functional *** successfully isolated the leaf primordia tissues from the C3grass rice and the C4grass foxtail millet by laser capture microdissection(LCM)and studied the gene expression throughout leaf developmental *** data analysis uncovered the conserved expression patterns of certain gene clusters both in rice and foxtail millet during leaf *** revealed genes and transcription factors involved in vein formation,stomatal development,and suberin *** identified 79 candidate genes associated with functional regulation of C4anatomy *** phenotype of the candidate genes revealed that knock-out of a putative polar auxin transport related gene NAL1 resulted significantly reduced veinal space in rice *** present work provides a foundation for future analyses of genes with novel functions in grasses and their role in leaf development,in particular the role in leaves with a contrasting C3vs.C4biosynthetic pathway.

关键词： Rice Foxtail millet Leaf development RNA-seq LCM

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