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Genomic analysis of a novel strain of Bacillus nealsonii, isolated from Surti buffalo rumen

Advances in Bioscience and Biotechnology 2014年第3期5卷 235-245页

作者： neelam M. Nathani Srinivas M. Duggirala Vaibhav D. Bhatt Jay KaPatel Chaitanya G. Joshi Department of Animal Biotechnology College of Veterinary Science & Animal Husbandry Anand Agricultural University Anand India Department of Microbiology Gujarat Vidyapith Sa-dra India

Aim: Whole genome sequencing and functional annotation of Bacillus nealsonii strain AAU1, an amylolytic anaerobic spore forming isolate from ruminal contents of buffalo. Methods and Results: Morphologically, the strain was observed as slender Grampositive rods, occurring in pairs. Optimal growth was observed at 40°C (range: 30°C to 45°C) and pH 6.5 (range: 5.5 to 7.5) when cultivated in Hungate’s medium supplemented with starch. The microorganism showed extracellular constitutive amylolytic activity, proving to be capable of utilizing glucose, maltose, mannose, trehalose, dextrin and starch under anaerobic conditions. Sequence analysis revealed a GC content of 35.1 mol%. Comparison of housekeeping gene sequences for RNA polymerase subunit B (rpoB) and gyrase A (gyrA) identified sequence similarity within the Bacillus genus, confirmed by 16S rRNA gene sequence similarity which identified Bacillus nealsonii DSM 15077 as the closest publically available relative. Chemotaxonomic analysis provided conflicting results with straight-chain saturated C16: 0/C16:0 aldehyde, C16:0 DMA, C14:0 and monounsaturated 16:1w7c and 16:1w9c the major fatty acids in contrast to those reported for B. nealsonii DSM15077. Further characterization using AN-Bilog and physiological parameters provided genotypic and phenotypic support for taxonomic classification of isolate AAU1 with published Bacillus species including B. licheniformis, B. subtilis, B. circulans and B. nealsonii. Conclusion: Based on the data presented, isolate is likely to represent a new strain/subspecies, for which the identifier B. nealsonii AAU1 is proposed. Significance and Impact of Study: The strict anaerobic conditions prevailing in the bovine rumen from where AAU1 was isolated may have resulted in genetic polymorphism influencing its metabolic characteristics.

关键词： Bacillus nealsonii AAU1 Anaerobic Phenotypic Characterization Genomic Analysis

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Fas配体对NIH3T3增殖和胶原表达的信号机制研究

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中国职业医学 2010年第2期37卷 91-94页

作者：姚三巧 LU Yongju WANG Liying Rojanasakul Anand Iyer neelam Azad Yon Rojanasakul 华北煤炭医学院劳动卫生与环境卫生学科河北唐山063000 美国西弗吉尼亚大学基础药学院 MorgantownWV26505 USA 美国国立职业安全与卫生研究所 MorgantownWV26505USA 河北省煤矿卫生与安全实验室唐山063000

目的探讨Fas配体(FasL)对小鼠成纤维细胞NIH3T3增殖和胶原表达的影响及其信号调控机制。方法采用鼠成纤维细胞系HIN3T3,以FasL为诱导剂,采用抑制剂技术和Western blot技术观察NIH3T3的增殖及胶原表达情况,同时探讨磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K... 详细信息

目的探讨Fas配体(FasL)对小鼠成纤维细胞NIH3T3增殖和胶原表达的影响及其信号调控机制。方法采用鼠成纤维细胞系HIN3T3,以FasL为诱导剂,采用抑制剂技术和Western blot技术观察NIH3T3的增殖及胶原表达情况,同时探讨磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/Akt、有丝分裂原活化蛋白(MAPK)/P38、MAPK/ERK信号通路在NIH3T3增殖和胶原表达中的作用。结果研究发现低剂量的FasL可调节3T3的生长,表现为细胞数量和胶原表达水平均随FasL剂量的增加而增加,且存在剂量-效应和时间-效应;MAPK/P38及PI3K/Akt信号通路对NIH3T3的增殖具有调控作用,MAPK/P38及MAPK/ERK信号通路可调控NIH3T3胶原表达。结论Fas/FasL系统对成纤维细胞增殖和胶原表达起促进作用;FasL主要通过PI3K/Akt、MAPK/P38信号通路对成纤维细胞增殖起调控作用;通过MAPK/P38及MAPK/ERK信号通路调节成纤维细胞的胶原表达。

关键词： Fas配体 NIH3T3 增殖 Ⅰ、Ⅲ型胶原信号转导

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Colon mucosal neoplasia referred for endoscopic mucosal resection:Recurrence of adenomas and prediction of submucosal invasion

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World Journal of Gastrointestinal Endoscopy 2020年第7期12卷 198-211页

作者： Mamoon Ur Rashid neelam Khetpal Hammad Zafar Saeed Ali Evgeny Idrisov Yuan Du Assaf Stein Deepanshu Jain Muhammad Khalid Hasan Department of Internal Medicine Advent Health Graduate Medical EducationOrlandoFL 32804United States Department of Internal Medicine Univerity of Iowa hospitalIowa CityIA 52242United States Department of Gastroenterology University of Oklahoma Health SciencesOklahomaOK 73104United States Center for Interventional Endoscopy AdventHealthOrlandoFL 32803United States

BACKGROUND Endoscopic mucosal resection(EMR)is an effective and minimally invasive alternative to surgery for large polyps and laterally spreading *** morphology and surface characteristics may help predict submucosal invasion of the lesion(SMIL)during endoscopic *** is one of the largest singlecenter studies reporting endoscopic mucosal resection for larger(≥20 mm)colorectal lesions in the United *** To determine the recurrence rate of adenomas and endoscopic features that may predict submucosal invasion of colonic mucosal *** This is a retrospective cohort study of all the patients referred for endoscopic mucosal resection for lesions≥20 mm,spanning a period from January 2013 to February *** main outcome measure was identifying features that may predict submucosal invasion of mucosal lesions and predict recurrence of adenomas on follow-up surveillance colonoscopy performed at 4-6 *** A total of 480 patients with 500 lesions were included in the *** median age was 68(Inter quantile range:14)with 52%*** most common lesion location was ascending colon(161;32%).Paris classification 0-IIa(Flat elevation of mucosa-316;63.2%);Kudo Pit Pattern IIIs(192;38%)and Granular surface morphology(260;52%)were most *** invasion was present in 23(4.6%)out of 500 *** independent risk factors for SMIL were Kudo Pit Pattern IIIL+IV and V(Odds ratio:4.5;P value40 mm).Almost all recurrences(98.8%)were treated endoscopically.

关键词： Endoscopy Polyp Endoscopic mucosal resection Recurrence Submucosal invasion

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Rock1 Inhibitor Abrogates Chronic Rejection in Rat Cardiac Model System

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Open Journal of Organ Transplant Surgery 2012年第4期2卷 46-51页

作者： Li Zhang Malgorzata Kloc neelam Tejpal Junping You Andrea M. Cordero-Reyes Keith A. Youker Rafik M. Ghobrial Department of Surgery The Methodist Hospital The Methodist DeBakey Heart & Vascular Center Houston TX USA

Background: We have shown previously that the abrogation of acute and chronic rejection of rat cardiac allografts occurs through the down-regulation of RhoA pathway and involves the changes in RhoA kinase (ROCK)-dependent actin cytoskeleton and T cell motility. Here we studied the ability of the Y-27632, a highly selective inhibitor of Rho-associated protein kinase p160ROCK (ROCK1), to abrogate chronic rejection of the allograft and influence T cell infiltration. Methods: Heterotopic cardiac transplants were performed between donor Wistar Furth (WF) and ACI recipient rats. Controls received sub-therapeutic dose of cyclosporine (CsA, 10 mg/kg) for 3 days or 7 days therapeutic dose of cyclosporine. The experimental groups of ACI recipient received one preoperative dose of the Y-27632 inhibitor (2 mg/kg, gavage feed) in conjunction with the sub-therapeutic dose of CsA for 3 days or inhibitor alone for 7 days. The cardiac grafts were harvested at 100 days of post-transplantation for histological and immunohistochemical assessment of chronic rejection, vascular sclerosis, and infiltration by different T cell subtypes. Results: Cardiac allografts from recipients exposed to Y-27632 inhibitor in conjunction with sub-therapeutic dose of CsA showed drastically reduced vascular sclerosis, minimal myocardial total cellular infiltration, and were selectively infiltrated with Foxp3+ T regulatory (Treg) cells. Conclusions: Our novel finding that a single dose of the ROCK1 inhibitor Y-27632 attenuates chronic rejection in rat cardiac model system by promoting development of Treg cells warrants its potential as a novel therapeutic agent specific for the inhibition of chronic rejection.

关键词： Chronic Rejection Transplantation ROCK1 RhoA T Cell

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宫颈脱落细胞miR-125b与宫颈病变关系及其在HR-HPV阳性患者分层筛查中的作用研究

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医学信息 2018年第23期31卷 76-78+82页

作者： neelam SAH 聂小凤张琴张素仙杨丽华昆明医科大学第二附属医院妇科

目的比较正常宫颈、宫颈上皮内瘤变及宫颈癌患者宫颈脱落细胞中miR-125b表达水平差异,探讨宫颈脱落细胞miR-125b表达水平检测在HR-HPV阳性患者分层筛查中的作用及其与宫颈病变的关系。方法采用第二代杂交捕获技术进行HR-HPV初筛,HR-HPV... 详细信息

目的比较正常宫颈、宫颈上皮内瘤变及宫颈癌患者宫颈脱落细胞中miR-125b表达水平差异,探讨宫颈脱落细胞miR-125b表达水平检测在HR-HPV阳性患者分层筛查中的作用及其与宫颈病变的关系。方法采用第二代杂交捕获技术进行HR-HPV初筛,HR-HPV阳性患者行宫颈液基薄层细胞学检查及miR-125b检测。液基细胞学检查结果异常者直接阴道镜下活检行病理学检查,液基细胞学检查正常者行阴道镜检查,阴道镜检查下发现异常者行阴道镜下活检取材,余视作宫颈组织学正常,不做宫颈活检。RT-qPCR检测正常宫颈及不同级别宫颈病变中miR-125b表达水平,比较不同组织学分组之间的宫颈脱落细胞miR-125b表达水平,绘制ROC曲线,探讨miR-125b、液基细胞学检查在宫颈病变中的诊断作用。结果宫颈脱落细胞miR-125b水平随着宫颈病变程度加重逐渐升高(P<0.05);在HR-HPV阳性患者分层筛查中,宫颈液基细胞学诊断宫颈高级别上皮内病变的敏感性、特异性分别为64.90%、80.70%,AUC为0.728(95%CI:0.657～0.779,P<0.001)。与液基细胞学检查相比,宫颈脱落细胞miR-125b检测诊断宫颈高级别上皮内病变的灵敏性、特异性更高(87.30%vs 64.90%;69.20%vs80.70%),AUC为0.864(95%CI:0.800～0.928,P<0.001)。结论 miR-125b水平随着宫颈病变加重逐渐升高,检测宫颈脱落细胞miR-125b水平可有效分流HR-HPV阳性患者,敏感性高于细胞学检查,可能成为一种有效的分层筛查方法。

关键词：宫颈病变 miR-125b HR-HPV 宫颈癌筛查

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Effect of Oxalate Precursor Formation Temperature on Magnetic Properties of Nicuzn Ferrites

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Materials Sciences and Applications 2011年第8期2卷 1097-1108页

作者： neelam S. Shinde Sujata S. Khot Bhimrao P. Ladgaonkar Bharat B. Kale Sanjay Apte Prasad M. Tamhankar Shrikant C. Watawe 不详

Ni-Cu-Zn ferrites with general formula Ni0.5Zn0.5-x/2Cux/2Fe2O4 (with x = 0.3, 0.4, 0.5 and 0.6) have been synthesized using oxalate precursor method with different precursor reaction temperatures in the range 10℃ to 70℃. The Curie temperatures obtained using AC susceptibility measurements are found to be in the range 150℃ to 350℃, the measurements also show single domain structure for all the samples except few compositions obtained at 35℃ precursor reaction temperature, show a multi-domain behaviour. The saturation magnetization is found to be in the range 20 to 51 emu/gm, while the magnetic moment is found to be in the range 0.63 to 1.5 μB. The hysteresis losses were found to be maximum for the samples obtained at precursor reaction temperature of 35℃. The grain size is found to be in the range 0.4 to 2.0 μm.

关键词： Magnetic Materials Temperature Of Chemical Reaction Magnetic Susceptibility Curie Temperature

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在化妆品中使用黑色素降解酶

在化妆品中使用黑色素降解酶

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2006年中国化妆品学术研讨会

作者： Thomas Mammone Ken Marenus neelam Muizzuddin Daniel Maes 雅诗兰黛生物研究发展实验室

我们对于人类黑色素的生物合成已有一定的了解,然而对于黑色素的降解及其代谢却知之甚少。我们猜测在人类皮肤中含有一些可以降解黑色素的酶,这些酶可以淡化皮肤的颜色。为了验证这个猜测,我们用经同位素标记的合成黑色素脉冲标记体外... 详细信息

我们对于人类黑色素的生物合成已有一定的了解,然而对于黑色素的降解及其代谢却知之甚少。我们猜测在人类皮肤中含有一些可以降解黑色素的酶,这些酶可以淡化皮肤的颜色。为了验证这个猜测,我们用经同位素标记的合成黑色素脉冲标记体外培养基中的HaCaT角化细胞和正常人类角化细胞一小时。实验所用黑色素是由体外合成,该过程包括以同位素[14C]标记的3,4-二羟苯丙氨酸(DOPA)作为底物,从蘑菇中提取的酪氨酸酶催化完成。经过分次标记后,我们分别在2,4, 6,18小时取出细胞样品及其培养基样品。在经过这些时间段后,留在培养基及细胞碎片中的黑色素的量显著减少,这说明黑色素的降解需要新的蛋白质的合成及溶酶体的参与。从烟曲霉菌和酿酒酵母中分离得到可以降解黑色素的提取物,并将它们用于人类皮肤。这些提取物可显著减少由UVB引起的色素沉着。这类提取物可能对于开发可以调节皮肤颜色、色调等的美白产品非常有用。

关键词：化妆品黑色素酪氨酸酶美白产品

来源： cnki会议评论

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Performance of chick pea under the influence of gibberellic acid and oxygenated peptone during germination

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Advances in Bioscience and Biotechnology（生命科学与技术进展） 2011年第1期

作者： Utkarsha Thakare neelam Patil Nutan Malpathak

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幽门螺杆菌cagⅡ对胃上皮细胞IL-8基因转录的影响机制

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现代消化及介入诊疗 1999年第2期4卷 49-51页

作者：李淑德许国铭李兆申 J.E Crabtree B.neelam 第二军医大学长海医院上海市200433 英国Leeds

[目的]探讨Hp cagⅡ对胃上皮细胞IL-8基因转录的影响及信号传导机制。[方法]构建cagⅡ基因位点缺失Hp突变以及带有IL-8报告基因的人胃癌细胞系L5F11，用液体闪烁计数仪测定荧光素酶(IL-8转录)活性．川ELISA法测定IL-8蛋白浓度。[结果]所... 详细信息

[目的]探讨Hp cagⅡ对胃上皮细胞IL-8基因转录的影响及信号传导机制。[方法]构建cagⅡ基因位点缺失Hp突变以及带有IL-8报告基因的人胃癌细胞系L5F11，用液体闪烁计数仪测定荧光素酶(IL-8转录)活性．川ELISA法测定IL-8蛋白浓度。[结果]所有HP突变株诱导荧光素酶活性与IL-8蛋白浓度较亲代菌株26695均降低(0.13±0.01vs 0.59±0.05×10^4epm．P0.05)。[结论]Hp cag Ⅱ中的多个基因能够调节胃上皮细胞IL-8基因转录，且这一作用主要经蛋白酯氨酸激酶途径。

关键词： IL-8 agⅡ 胃上皮细胞荧光素酶诱导基因转录蛋白表达幽门螺杆菌抑制蛋白浓度

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Structural and electrical characterization of Bi2VO5.5/Bi4Ti3O12 bilayer thin films deposited by pulsed laser ablation technique

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Natural Science（自然科学期刊） 2010年第10期

作者： neelam Kumari Saluru Baba Krupanidhi Kalidhindi Balakrishna Raju Varma

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