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Chinese Journal of Integrative Medicine 2022年第1期28卷 88-95页

作者： Muhammad Atif Farrah Naz Junaid Akhtar muhammad Imran Sidrah Saleem Javed Akram muhammad Imran muhammad Ikram Ullah Department of Clinical Laboratory Sciences College of Applied Medical SciencesJouf UniversitySakaka(75471)Saudi Arabia Department of Microbiology Government College UniversityFaisalabad(38000)Pakistan Department of Microbiology University of Health SciencesLahore(54600)Pakistan Department of Allied Health Sciences Sargodha Medical CollegeUniversity of SargodhaSargodha(40100)Pakistan University of Health Sciences Lahore(54600)Pakistan University Institute of Diet and Nutritional Sciences Faculty of Allied Health SciencesThe University of LahoreLahore(54590)Pakistan

COVID-19 virus is a causative agent of viral pandemic in human beings which specifically targets respiratory system of humans and causes viral pneumonia.This unusual viral pneumonia is rapidly spreading to all parts of the world,currently affecting about 105 million people with 2.3 million deaths.Current review described history,genomic characteristics,replication,and pathogenesis of COVID-19 with special emphasis on Nigella sativum(N.sativum)as a treatment option.N.sativum seeds are historically and religiously used over the centuries,both for prevention and treatment of different diseases.This review summarizes the potential role of N.sativum seeds against COVID-19 infection at levels of in silico,cell lines and animal models.

关键词： coronavirus nCoV-19 COVID-19 Nigella sativum review

聚（2-甲基-2-噁唑啉）/聚（4-乙烯基吡啶）二元聚合物刷对蛋白质的可控吸附研究

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聚（2-甲基-2-噁唑啉）/聚（4-乙烯基吡啶）二元聚合物刷对蛋白质...

作者： Muhammad Atif 中国科学技术大学

学位级别：硕士

控制蛋白质在材料表面的吸附和脱附在生物材料或医学等方面十分重要。在不同的情况下,对蛋白质的吸附和脱附有不同的要求。例如,对于细胞和组织在材料表面的增殖以及蛋白质的富集和分离需要蛋白质的吸附,而在生物技术和生物医学材料领... 详细信息

控制蛋白质在材料表面的吸附和脱附在生物材料或医学等方面十分重要。在不同的情况下,对蛋白质的吸附和脱附有不同的要求。例如,对于细胞和组织在材料表面的增殖以及蛋白质的富集和分离需要蛋白质的吸附,而在生物技术和生物医学材料领域如生物传感器、含血的材料如人工血管、人造心脏等则需要抑制蛋白质的吸附。因此需要设计一种能够根据需求调控蛋白质在其上的吸附和脱附的表面,这一点可以通过同时具有刺激响应性和抗蛋白质吸附性能的表面实现。本论文发展了一种可以实现蛋白质可控吸附的新方法:在材料表面接枝上抗蛋白吸附聚合物刷(聚(2-甲基-2-噁唑啉)(PMOXA))和刺激响应性聚合物刷(聚(4-乙烯基吡啶)(P4VP))。论文分为两个部分。(1)分别通过2-甲基-2-噁唑啉(MOXA)的阳离子开环聚合(CROP)和4-乙烯基吡啶(4VP)的可逆加成-断裂链转移(RAFT)聚合,和随后与甲基丙烯酸缩水甘油酯的无规和嵌段共聚制备了聚(2-甲基-2-噁唑啉-r-甲基丙烯酸缩水甘油酯)(PMOXA-r-GMA)刷状共聚物和聚(4-乙烯基吡啶)-b-聚甲基丙烯酸缩水甘油酯)(P4VP-b-PGMA)。最后,将PMOXA-r-GMA和P4VP-b-PGMA溶于氯仿得到的混合溶液旋涂到基底表面(硅片和玻璃片),在110℃条件下交联得到PMOXA/P4VP的二元混合刷涂层。通过水接触角(WCA),X射线光电子能谱(XPS),可变角度椭圆偏正光谱仪(VASE)和原子力显微镜(AFM)等对涂层进行了表征。研究结果表明,通过简单调整混合溶液组成就可以得到具有特定表面组成的涂层。混合刷的溶胀和塌缩可以随着环境pH 2～10进行调节。最后,通过异硫氰酸荧光素标记的牛血清白蛋白(FITC-BSA)吸附实验研究了 PMOXA/P4VP混合刷对牛血清白蛋白(BSA)的可调控行为。实验表明,通过调节混合刷涂层中PMOXA-r-GMA和P4VP-b-PGMA的组成和环境pH值2-10的变化,可以控制PMOXA/P4VP混合刷由低到高的吸附量和脱附率,在特定条件下89%被吸附的蛋白质可以脱附下来。(2)通过加热制备了 PMOXA链长固定而不同链长的P4VP的基于PMOXA/P4VP的涂层。通过WCA和VASE研究了PMOXA/P4VP混合刷的调控性能和P4VP链长、pH值以及离子强度(I)之间的关系。结果表明,当P4VP链长是PMOXA链长的三倍时,改变环境条件由pH 3(I=10-3 M)到pH 9(I=10-1 M),水接触角和厚度变化值最大。最后,分别通过FITC-BSA吸附实验、石英晶体微天平(QCM-D)和VASE研究了 P4VP链长对蛋白质吸附/脱附的影响。结果表明,在pH 3及低离子强度(I=10-3 M)的条件下,BSA吸附量增多,同时随P4VP链长增加BSA吸附也增多。当外界条件变为pH 9且离子强度较强(I=10-1 M)时,吸附的蛋白质可有效脱附,此时PMOXA/P4VP涂层脱附率大于92%。

关键词：基于PMOXA/P4VP的涂层蛋白质吸附行为表面修饰石英晶体微天平

Adaptive Event-Triggered Filter Design for Cyber Physical Systems Under Non-Periodic Denial-of-Service Attacks

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Adaptive Event-Triggered Filter Design for Cyber Physical S...

作者： Muhammad Atif 华南理工大学

学位级别：硕士

In the last few decades,cyber-physical systems（CPSs）have become new-generation engineering systems formed by the networks environment.Due to the involvement of networks,security against cyber-attacks and resource optimization are the primary performance indicator of CPSs,which have excellent research prospects.In this paper,we study the adaptive event triggering scheme（AETS）based H

关键词：

聚多巴胺固定的聚(2-甲基-2-噁唑啉)/聚(4-乙烯吡啶)混合刷对胃蛋白酶的可控吸附

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Chinese Journal of Chemical Physics 2023年第3期36卷 339-348,I0100,I0101页

作者：何康胡飞陈朝奭 Muhammad Atif 王延梅中国科学技术大学高分子科学与工程系合肥230026

在聚多巴胺修饰的基底表面同时接枝端基为氨基的聚(2-甲基-2-噁唑啉)和端基为巯基的聚(4-乙烯吡啶),制备了聚(2-甲基-2-噁唑啉)/聚(4-乙烯吡啶)混合刷.通过X射线光电子能谱、可变角光谱型椭偏仪、zeta电位仪和静态水接触角对涂层进行表... 详细信息

在聚多巴胺修饰的基底表面同时接枝端基为氨基的聚(2-甲基-2-噁唑啉)和端基为巯基的聚(4-乙烯吡啶),制备了聚(2-甲基-2-噁唑啉)/聚(4-乙烯吡啶)混合刷.通过X射线光电子能谱、可变角光谱型椭偏仪、zeta电位仪和静态水接触角对涂层进行表征.结果表明,混合刷的组成可以通过改变聚(2-甲基-2-噁唑啉)和聚(4-乙烯吡啶)的投料比控制.此外,改变环境pH值和混合刷组成比例可以调节混合刷涂层表面的zeta电位和水接触角.采用异硫氰酸荧光素标记胃蛋白酶.和表面等离子体共振研究了胃蛋白酶在聚(2-甲基-2-噁唑啉)/聚(4-乙烯吡啶)混合刷表面的响应性吸附/脱附能力结果表明,通过调整聚(2-甲基-2-噁唑啉)或聚(4-乙烯吡啶)的组分比,在pH=3时,聚(2-甲基-2-噁唑啉)/聚(4-乙烯吡啶)混合刷表面可以吸附大量的胃蛋白酶;在pH=7时,脱附效率达到92%以上.

关键词：二元混合刷 zeta电位蛋白质的可控吸附胃蛋白酶表面等离子体共振

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Frontiers of Information Technology & Electronic Engineering 2019年第7期20卷 946-964页

作者： muhammad IMRANz Bruce AHARVEY Muhammad Atif Adnan Ali MEMON Department of Electrical&Computer Engineering Florida State UniversityTallahassee32306USA Faculty of Information and Communication Technology Balochistan University of Information TechnologyEngineering and Management SciencesQuetta87100Pakistan

提出一种基于多分辨率分解和去相关的模块化安全性与鲁棒性彩色图像水印方案。该方案主要目标是同时满足良好水印的4个要求(鲁棒性、安全性、不可察觉性和容量)。本研究的贡献在于实现一个基本满足这4个矛盾需求的水印方案。为此,结合... 详细信息

提出一种基于多分辨率分解和去相关的模块化安全性与鲁棒性彩色图像水印方案。该方案主要目标是同时满足良好水印的4个要求(鲁棒性、安全性、不可察觉性和容量)。本研究的贡献在于实现一个基本满足这4个矛盾需求的水印方案。为此,结合不同方法以实现这个目的。例如,为获得不可察觉性,通过主成分分析去相关3个颜色(红绿蓝)通道,并选择第一个主成分(去相关红色通道)嵌入水印。为取得鲁棒性,采用离散小波变换(DWT)分解去相关信道,将近似带(其余3个带保持不变以保留边缘信息)进一步分解为不同区块。根据随机生成键选择随机区块。随机选取的区块进一步被分解为奇异值和向量。基于奇异值和向量矩阵的相互依赖性,并依据水印位,对数值进行修改,并保存这些数值的位置,将数值位置作为提取水印所需的另一个密钥。两级认证级别确保了安全性,同时使用奇异值和向量可提高该方案的容量。此外,在水印嵌入过程中,左右奇异向量与奇异值的结合增强了该方案的鲁棒性。最后,使用Gonzalez和Kodak数据集,从不可察觉性(峰值信噪比和结构相似性指数)、安全性(带多个伪密钥)、鲁棒性(归一化相关和误码率)和容量方面将该方案与已有方案作比。结果显示本文方案与现有方案相比有明显改进。

关键词：版权保护数据隐藏多分辨率分解去相关安全性

磁流体动力压缩黏性流体在多孔介质中的流动分析

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Journal of Central South University 2023年第3期30卷 844-854页

作者： HUSSAIN Shafqat atif Shahzada M. SAGHEER muhammad JAHANGEER Ibraheem Department of Mathematics Statistics and PhysicsCollege of Arts and SciencesQatar UniversityP.O.Box 2713DohaQatar Department of Mathematics Capital University of Science and TechnologyIslamabadPakistan

本文通过数值分析,讨论了倾斜磁场效应下压缩黏性流体流动特征的意义。对于高效传热现象,温度方程中还考虑了黏性耗散和焦耳热效应。利用打靶法求解了无量纲守恒方程。对模型中所考虑的特定参数对流体运动、传热能量分配率和表面阻力系... 详细信息

本文通过数值分析,讨论了倾斜磁场效应下压缩黏性流体流动特征的意义。对于高效传热现象,温度方程中还考虑了黏性耗散和焦耳热效应。利用打靶法求解了无量纲守恒方程。对模型中所考虑的特定参数对流体运动、传热能量分配率和表面阻力系数的行为进行了图解和详细讨论。倾斜磁场效应对流体速度和换热速率的影响非常重要。从模拟结果可知,当普朗特常数从1增加到5时,热传导率增加了56%,而当倾斜磁参数γ从π/8增加到π/2时,热传导率下降了9.7%。实验还发现,随着挤压参数的增大,换热速率减小,而下板拉伸参数的增大则趋势相反。

关键词：挤压流黏性流体磁流体动力流吸/注射

基于聚(2-甲基-2-[口恶]唑啉)和聚丙烯酸的混合刷在毛细管电泳在线富集溶菌酶中的应用

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色谱 2020年第9期38卷 1085-1094页

作者：张淼王雨晨 Muhammad Atif 陈丽娟王延梅中国科学技术大学高分子科学与工程系安徽合肥230026 皖西学院材料与化工学院安徽六安237012

制备了一种对溶菌酶具有可控吸附性能的混合刷涂层毛细管,用于毛细管电泳在线富集溶菌酶以提高其检测灵敏度。首先,分别通过阳离子开环聚合和可逆加成-断裂链转移(RAFT)聚合合成聚(2-甲基-2-[口恶]唑啉)(PMOXA)和聚丙烯酸(PAA),然后将... 详细信息

制备了一种对溶菌酶具有可控吸附性能的混合刷涂层毛细管,用于毛细管电泳在线富集溶菌酶以提高其检测灵敏度。首先,分别通过阳离子开环聚合和可逆加成-断裂链转移(RAFT)聚合合成聚(2-甲基-2-[口恶]唑啉)(PMOXA)和聚丙烯酸(PAA),然后将甲基丙烯酸缩水甘油酯(GMA)分别与PMOXA和PAA通过自由基共聚和RAFT聚合合成出聚(2-甲基-2-[口恶]唑啉)-r-甲基丙烯酸缩水甘油酯(PMOXA-r-GMA)和聚丙烯酸-b-聚甲基丙烯酸缩水甘油酯(PAA-b-PGMA)。将PMOXA-r-GMA和PAA-b-PGMA的混合溶液以一定比例加入到毛细管内,通过加热即可制备出基于PMOXA和PAA的混合刷涂层毛细管。X射线光电子能谱(XPS)对毛细管原材料的表面组成研究结果表明,当混合溶液质量浓度为20 g/L、PMOXA-r-GMA和PAA-b-PGMA质量比为1∶1时,所得涂层中羧基的含量随着PAA链长的增加而增加;异硫氰酸荧光素标记溶菌酶(FITC-溶菌酶)吸附实验结果显示,通过改变环境的pH和离子强度(I)可以调控涂层毛细管对溶菌酶的吸附和释放,在pH 7(I=10^-5mol/L)条件下,毛细管可以吸附大量的溶菌酶,当条件变为pH 3(I=10^-1mol/L)时,吸附的溶菌酶可以被释放出来。将这种具有溶菌酶可控吸附性能的涂层毛细管用于毛细管电泳在线富集溶菌酶,当PAA链长是PMOXA链长的2.2倍时,溶菌酶的灵敏度增强因子为17.69,检出限为8.7×10^-5g/L;同一天内对溶菌酶连续测定5次以及连续测定5天,峰面积的日内、日间相对标准偏差(RSD)分别为2.9%和4.1%,迁移时间的日内、日间RSD分别为0.9%和2.1%。涂层的制备只需一步,简单易行,而且涂层具有很好的稳定性。本研究为毛细管电泳分析痕量蛋白质提供了一种简单有效的方法。

关键词：毛细管电泳在线富集混合刷聚(2-甲基-2-[口恶]唑啉) 聚丙烯酸

A Novel Approach to Energy Optimization:Efficient Path Selection in Wireless Sensor Networks with Hybrid ANN

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Computers, Materials & Continua 2024年第5期79卷 2945-2970页

作者： muhammad Salman Qamar Ihsan ulHaq Amil Daraz atif MAlamri Salman A.AlQahtani muhammad Fahad Munir Department of Electrical and Computer Engineering International Islamic UniversityIslamabad44000Pakistan School of Information Science and Engineering NingboTech UniversityNingbo315100China Software Engineering Department College of Computer and Information SciencesKing Saud UniversityRiyadh11495Saudi Arabia Computer Engineering Department College of Computer and Information SciencesKing Saud UniversityRiyadh11495Saudi Arabia

In pursuit of enhancing the Wireless Sensor Networks(WSNs)energy efficiency and operational lifespan,this paper delves into the domain of energy-efficient routing protocols.InWSNs,the limited energy resources of Sensor Nodes(SNs)are a big challenge for ensuring their efficient and reliable operation.WSN data gathering involves the utilization of a mobile sink(MS)to mitigate the energy consumption problem through periodic network traversal.The mobile sink(MS)strategy minimizes energy consumption and latency by visiting the fewest nodes or predetermined locations called rendezvous points(RPs)instead of all cluster heads(CHs).CHs subsequently transmit packets to neighboring RPs.The unique determination of this study is the shortest path to reach RPs.As the mobile sink(MS)concept has emerged as a promising solution to the energy consumption problem in WSNs,caused by multi-hop data collection with static sinks.In this study,we proposed two novel hybrid algorithms,namely“ Reduced k-means based on Artificial Neural Network”(RkM-ANN)and“Delay Bound Reduced kmeans with ANN”(DBRkM-ANN)for designing a fast,efficient,and most proficient MS path depending upon rendezvous points(RPs).The first algorithm optimizes the MS’s latency,while the second considers the designing of delay-bound paths,also defined as the number of paths with delay over bound for the MS.Both methods use a weight function and k-means clustering to choose RPs in a way that maximizes efficiency and guarantees network-wide coverage.In addition,a method of using MS scheduling for efficient data collection is provided.Extensive simulations and comparisons to several existing algorithms have shown the effectiveness of the suggested methodologies over a wide range of performance indicators.

关键词： Wireless Sensor Networks(WSNs) mobile sink(MS) rendezvous point(RP) machine learning Artificial Neural Networks(ANNs)

聚合物涂层在毛细管电泳分离蛋白中的研究进展

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分析测试学报 2019年第8期38卷 1020-1028页

作者：陈丽娟闫叶寒朱海锟 Muhammad Atif 皖西学院材料与化工学院安徽六安237012 中国科学技术大学化学与材料科学学院安徽合肥230026

毛细管电泳具有分析时间短,分离效率高,样品消耗量少等优点,在生物样品分离,特别是蛋白质分析领域有重要应用。然而,毛细管内壁硅羟基的解离给分离结果带来诸多不良影响。聚合物涂层能够抑制蛋白质在毛细管内壁的吸附以及调控电渗流,故... 详细信息

毛细管电泳具有分析时间短,分离效率高,样品消耗量少等优点,在生物样品分离,特别是蛋白质分析领域有重要应用。然而,毛细管内壁硅羟基的解离给分离结果带来诸多不良影响。聚合物涂层能够抑制蛋白质在毛细管内壁的吸附以及调控电渗流,故对毛细管内壁进行有效修饰能够提高其对蛋白质的分离效率及分离稳定性。该文主要综述了动态及静态聚合物涂层毛细管的最新研究进展,并概述了近些年基于多巴胺/聚多巴胺发展起来的涂层毛细管的研究进展,最后展望了聚合物涂层毛细管的发展趋势。

关键词：毛细管电泳聚合物涂层蛋白质分离电渗流

Comparative analysis of SIMILAR to RCD ONE(SRO)family from tetraploid cotton species and their diploid progenitors depict their significance in cotton growth and development

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Journal of Cotton Research 2024年第1期7卷 45-57页

作者： SHABAN muhammad TABASSUM Riaz RANA Iqrar Ahmad atif Rana muhammad AZMAT muhammad Abubakkar IQBAL Zubair MAJEED Sajid AZHAR muhammad Tehseen Department of Plant Breeding and Genetics University of Agriculture FaisalabadSub-Campus BurewalaVehari 61010Pakistan Department of Chemistry and Biochemistry University of AgricultureFaisalabad 38400Pakistan Centre of Agricultural Biochemistry and Biotechnology University of AgricultureFaisalabad 38400Pakistan Department of Plant Breeding and Genetics University of AgricultureFaisalabad 38400Pakistan Precision Agriculture and Analytics Lab National Centre in Big Data and Cloud ComputingCentre for Advanced Studies in Agriculture and Food SecurityUniversity of Agriculture FaisalabadFaisalabad 38400Pakistan Department of Plant Pathology University of CaliforniaDavisCA 95616USA State Key Laboratory of Cotton Biology Institute of Cotton ResearchChinese Academy of Agricultural SciencesAnyangHenan 455000China Federal Seed Certification and Registration Department Ministry of National Food Security and ResearchIslamabad 44090Pakistan School of Agriculture Sciences Zhengzhou UniversityZhengzhou 450000China

Background SRO(Similar to RCD1)genes family is largely recognized for their importance in the growth,develop-ment,and in responding to environmental stresses.However,genome-wide identification and functional characteri-zation of SRO genes from cotton species have not been reported so far.Results A total of 36 SRO genes were identified from four cotton species.Phylogenetic analysis divided these genes into three groups with distinct structure.Syntenic and chromosomal distribution analysis indicated uneven distribu-tion of GaSRO,GrSRO,GhSRO,and GbSRO genes on A2,D5 genomes,Gh-At,Gh-Dt,Gb-At,and Gb-Dt subgenomes,respectively.Gene duplication analysis revealed the presence of six duplicated gene pairs among GhSRO genes.In promoter analysis,several elements responsive to the growth,development and hormones were found in GhSRO genes,implying gene induction during cotton growth and development.Several miRNAs responsive to plant growth and abiotic stress were predicted to target 12 GhSRO genes.Organ-specific expression profiling demonstrated the roles of GhSRO genes in one or more tissues.In addition,specific expression pattern of some GhSRO genes dur-ing ovule development depicted their involvement in these developmental processes.Conclusion The data presented in this report laid a foundation for understanding the classification and functions of SRO genes in cotton.

关键词： Cotton SRO miRNAs Gene duplications Gene expression Ovule development