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DIA-based proteome profiling with PRM verification reveals the involvement of ER-associated protein processing in pollen abortion in Ogura CMS cabbage

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Horticultural Plant Journal 2024年第3期10卷 755-770页

作者： Peiwen Wang Lin Zhu Ziheng Li mozhen cheng Xiuling Chen Aoxue Wang Chao Wang Xiaoxuan Zhang Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops(Northeast Region) Ministry of Agriculture and Rural AffairsNortheast Agricultural UniversityHarbinHeilongjiang 150030China College of Horticulture and Landscape Architecture Northeast Agricultural UniversityHarbinHeilongjiang 150030China

Ogura cytoplasmic male sterility(Ogura CMS)is extensively applied in hybrid seed production in cruciferous ***,the posttranscriptional molecular basis of Ogura CMS in cruciferous crops remains ***,a data-independent acquisition-based proteomic approach coupled with a parallel reaction monitoring-based targeted proteomic assay was used to analyze the proteome dynamics of Ogura CMS cabbage line RM and its maintainer line RF during floral bud development to obtain insights into the mechanism underlying Ogura CMS in cruciferous crops.A total of 9162 proteins corresponding to 61464 peptides were identified in RM and RF floral *** proteomic fluctuation of RM was weaker than that of *** in protein expression between RM and RF gradually enlarged with floral bud *** continually up-regulated and eight continually down-regulated proteins were found in RM relative to RF throughout floral bud *** expressed proteins between RM and RF during floral bud development were implicated in the endoplasmic reticulum(ER)-associated protein processing pathway,in which most of them exhibited down-regulated expression in *** data suggest that ER-associated protein processing may be involved in pollen abortion in Ogura CMS cabbage by inhibiting the expression of critical *** findings not only deepen the understanding of the molecular mechanisms of Ogura CMS in cruciferous crops but also provide better guidance for applying Ogura CMS in the hybrid breeding of cruciferous crops.

关键词： Ogura cytoplasmic male sterility(Ogura CMS) Cabbage Data-independent acquisition(DIA) Parallel reaction monitoring(PRM) Pollen development

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番茄AS2基因家族的系统进化分析

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基因组学与应用生物学 2018年第9期37卷 3958-3965页

作者：刘洋郑洋洋宫超程谟桢黄海峰张瑶陈秀玲王傲雪东北农业大学生命科学学院哈尔滨150030 东北农业大学园艺学院哈尔滨150030

AS2基因家族是一类直接参与转录调控并广泛存在于植物中的转录因子家族,能够调控植物生长发育和抗逆境胁迫过程。本研究通过分析番茄基因组,鉴定了番茄中具有特定结构域的AS2基因,并利用生物信息学手段对番茄AS2基因的系统进化、染色体... 详细信息

AS2基因家族是一类直接参与转录调控并广泛存在于植物中的转录因子家族,能够调控植物生长发育和抗逆境胁迫过程。本研究通过分析番茄基因组,鉴定了番茄中具有特定结构域的AS2基因,并利用生物信息学手段对番茄AS2基因的系统进化、染色体定位以及基因结构等信息进行了分析。系统进化分析共鉴定了45个番茄AS2基因家族成员,分成5个亚类。亚细胞定位分析表明,该家族基因主要分布在细胞核上。染色体定位揭示了AS2基因分布于10条染色体上,基因主要以片段复制的方式进行扩增。本研究为进一步探究番茄和其他物种中AS2基因功能奠定了基础。

关键词：番茄 AS2基因家族生物信息学系统进化基因复制

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无创及有创正压通气治疗光气中毒致急性呼吸窘迫综合征的疗效比较

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临床医学 2011年第11期31卷 1-3页

作者：尉玉杰王磊井慎成维鹏李莫振皖北煤电集团总医院SICU 安徽宿州234000

目的观察无创正压通气(NPPV)及有创正压通气(IPPV)治疗光气中毒致急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的临床疗效。方法对皖北煤电集团总医院重症监护病房收治的9例光气中毒致ARDS患者,随机分别采用NPPV及IPPV治疗,比较两组患者的呼吸机使用时间... 详细信息

目的观察无创正压通气(NPPV)及有创正压通气(IPPV)治疗光气中毒致急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的临床疗效。方法对皖北煤电集团总医院重症监护病房收治的9例光气中毒致ARDS患者,随机分别采用NPPV及IPPV治疗,比较两组患者的呼吸机使用时间、住院时间、镇静剂使用及并发症发生情况。结果 9例患者均康复出院。NPPV治疗组5例患者中,平均使用呼吸机时间76.5 h,平均住院时间13.8 d,均未使用镇静剂,均未发生机械通气相关并发症。IPPV治疗组4例患者中,平均使用呼吸机时间82.5 h,平均住院时间22.2 d,均需要使用镇静剂,有2例患者出现机械通气相关并发症。NPPV治疗组患者的住院时间及并发症明显短或少于IPPV治疗组。结论对光气中毒致ARDS早期患者,选择NPPV与IPPV治疗,都是有效可行的;两者相比,NPPV具有无创性,不需要使用镇静剂,能缩短住院时间,减少并发症的发生,疗效优于IPPV。

关键词：光气,中毒急性呼吸窘迫综合征无创正压通气有创正压通气

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