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Genome architecture and tetrasomic inheritance of autotetraploid potato

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Molecular Plant 2022年第7期15卷 1211-1226页

作者： Zhigui Bao Canhui Li Guangcun Li Pei Wang Zhen Peng Lin Cheng Hongbo Li Zhiyang Zhang Yuying Li Wu Huang mingwang ye Daofeng Dong Zhukuan Cheng Peter VanderZaag Evert Jacobsen Christian W.B.Bachem Suomeng Dong Chunzhi Zhang Sanwen Huang Qian Zhou Shenzhen Branch Guangdong Laboratory of Lingnan Modern AgricultureGenome Analysis Laboratory of the Ministry of Agriculture and Rural AffairsAgricultural Genomics Institute at ShenzhenChinese Academy of Agricultural SciencesShenzhen 518120China Key Laboratory for Potato Biology of Yunnan Province The CAAS-YNNU-YINMORE Joint Academy of Potato ScienceYunnan Normal UniversityKunming 650500China Institute of Vegetables and Flowers Chinese Academy of Agricultural SciencesKey Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Tuber and Root CropMinistry of Agriculture and Rural AffairsBeijing100081.China Plant Breeding Wageningen University and ResearchDroevendaalsesteeg 16708 PB Wageningenthe Netherlands Vegetable Research Institute Shandong Academy of Agricultural SciencesJinan 250100China State Key Lab of Plant Genomics Institute of Genetics and Developmental BiologyInnovation Academy for Seed DesignChinese Academy of SciencesBeijing 100101China Sunrise Potato Storage Ltd. AllistonON L9R1V3Canada Department of Plant Pathology and Key Laboratory of Plant Immunity Nanjing Agricultural UniversityNanjing 210095China Peng Cheng Laboratory Shenzhen 518055China

Potato(Solanum tuberosum)is the most consumed non-cereal food *** commercial potato cultivars are autotetraploids with highly heterozygous genomes,severely hampering genetic analyses and *** leveraging the state-of-the-art sequencing technologies and polyploid graph binning,we achieved a chromosome-scale,haplotype-resolved genome assembly of a cultivated potato,Cooperation-88(C88).lntra-haplotype comparative analyses revealed extensive sequence and expression differences in this tetraploid *** identified haplotype-specific pericentromeres on chromosomes,suggesting a distinct evolutionary trajectory of potato homologous ***,we detected double reduction events that are unevenly distributed on haplotypes in 1021 of 1034 selfing progeny,a feature of autopolyploid *** distinguishing maternal and paternal haplotype sets in C88,we simulated the origin of heterosis in cultivated tetraploid with a survey of 3110 tetra-allelic loci with deleterious mutations,which were masked in the heterozygous condition bytwo *** study provides insights into the genomic architecture of autopolyploids and will guide their breeding.

关键词： potato genome polyploid genome haplotype-resolved assembly haplotype diversity potato centromere

施加外源抗坏血酸促进马铃薯试管薯形成及其机制初步研究

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西北植物学报 2023年第6期43卷 956-967页

作者：雷春霞叶明旺李灿辉龚明云南师范大学生命科学学院云南省马铃薯生物学重点实验室生物能源持续开发利用教育部工程研究中心云南省生物质能与环境生物技术重点实验室昆明650500 云南师范大学马铃薯科学研究院云南省马铃薯生物学重点实验室昆明650500

为研究抗坏血酸(AsA)处理对马铃薯试管薯形成和结薯相关基因表达的影响及敲除结薯关键基因Solanum tuberosum self-prunning 6A(StSP6A)对AsA诱导马铃薯结薯的效应,利用不同浓度(0、1、5、10、20和50 mmol/L)外源AsA处理2个二倍体马铃薯... 详细信息

为研究抗坏血酸(AsA)处理对马铃薯试管薯形成和结薯相关基因表达的影响及敲除结薯关键基因Solanum tuberosum self-prunning 6A(StSP6A)对AsA诱导马铃薯结薯的效应,利用不同浓度(0、1、5、10、20和50 mmol/L)外源AsA处理2个二倍体马铃薯CIP-149(Solanum phureja)、CIP-178(***)和四倍体C-88(***)。结果表明,1~5 mmol/L外源AsA处理可显著诱导马铃薯块茎的形成。对10个块茎形成相关基因的表达分析结果表明,外源添加1 mmol/L AsA可显著影响块茎形成相关基因的表达,与对照相比,总体上呈正调控基因表达增强或负调控因子表达被抑制的趋势,特别是StSP6A在AsA处理过程中的块茎形成早期表达量极显著上调,敲除StSP6A可消除外源AsA对马铃薯块茎形成的诱导作用。这些结果表明,AsA诱导马铃薯块茎形成是通过调控与块茎形成相关的基因表达来实现的,而StSP6A在AsA诱导马铃薯块茎形成中起关键作用。

关键词：马铃薯块茎形成抗坏血酸(AsA) 结薯相关基因 StSP6A敲除

基于卷积神经网络的遥感影像建筑物提取方法综述

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地球信息科学学报 2024年第6期26卷 1500-1516页

作者：杨明旺赵丽科叶林峰蒋华伟杨震河南工业大学信息科学与工程学院郑州450001

建筑物提取作为遥感影像处理领域备受关注的研究方向之一,对于城市规划、灾害管理、智慧城市建设等方面具有重要意义。近年来,随着遥感技术的不断突破和深度学习算法的迅速发展,卷积神经网络凭借强大的特征提取能力成为从遥感影像中提... 详细信息

建筑物提取作为遥感影像处理领域备受关注的研究方向之一,对于城市规划、灾害管理、智慧城市建设等方面具有重要意义。近年来,随着遥感技术的不断突破和深度学习算法的迅速发展,卷积神经网络凭借强大的特征提取能力成为从遥感影像中提取建筑物的新兴解决方案。本文对基于卷积神经网络的建筑物提取方法进行系统总结,并将相关文献的方法针对模型结构、多尺度特征差异性、边界信息缺失以及模型复杂度的优化策略进行归纳分析。随后,我们阐述了典型的建筑物数据集以及当前数据集存在的问题,并根据数据集上的实验结果对相关方法的精度及参数量进行详细分析,旨在帮助读者更好地理解各种方法的性能和适用范围。最后,立足于领域的研究现状,面向人工智能高质量发展的新时代,从Transformer与CNN的结合、深度学习与强化学习的结合、跨模态数据融合、无监督或半监督学习方法、基于大规模遥感模型的实时提取、建筑物实例分割和建筑物轮廓矢量提取等方面对建筑物提取的未来研究方向进行了展望。

关键词：卷积神经网络遥感影像建筑物提取深度学习非对称网络结构多尺度特征融合边界优化轻量化网络结构

后入路无张力腹股沟疝修补术治疗复发性腹股沟疝20例报告

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现代医院 2010年第12期10卷 56-57页

作者：魏建彬丁俊理叶明旺连州市人民医院广东连州513400

目的探讨后入路无张力疝修补术治疗复发性腹股沟疝的优越性及临床应用价值。方法回顾性分析我院2009年1月～2010年6月收治20例腹股沟复发疝进行后入路无张力疝修补术的临床资料,其中直疝9例,斜疝11例。结果 20例手术全部成功,手术时间3... 详细信息

目的探讨后入路无张力疝修补术治疗复发性腹股沟疝的优越性及临床应用价值。方法回顾性分析我院2009年1月～2010年6月收治20例腹股沟复发疝进行后入路无张力疝修补术的临床资料,其中直疝9例,斜疝11例。结果 20例手术全部成功,手术时间30～50 min,平均42.0 min,术后住院4～7d,平均5.5 d,20例随访3～18个月,无一例复发。结论后入路无张力疝修补术创伤小,并发症少,是治疗复发性腹股沟疝安全、可靠的手术方法,值得在基层医院推广应用。

关键词：后入路无张力疝修补术复发腹股沟疝

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指背筋膜蒂皮瓣修复手指组织缺损的临床研究

临床医学工程 2014年第6期21卷 729-730页

作者：万富贵叶明旺庄华伟广东省连州市人民医院广东连州513400

目的探讨手指组织损伤应用指背筋膜蒂皮瓣修复的临床效果。方法入选我院2011年8月至2013年11月手指组织缺损94例94指，按治疗方式的不同分入两组，各47例，治疗组予以指背筋膜蒂皮瓣修复法治疗，对照组予以皮肤创面常规植皮术，术后... 详细信息

目的探讨手指组织损伤应用指背筋膜蒂皮瓣修复的临床效果。方法入选我院2011年8月至2013年11月手指组织缺损94例94指，按治疗方式的不同分入两组，各47例，治疗组予以指背筋膜蒂皮瓣修复法治疗，对照组予以皮肤创面常规植皮术，术后随访半年至1年半，观察术后临床效果、并发症及术后随访情况。结果治疗组的临床总有效率显著高于对照组（85.1%vs.57.4%， P〈0.05）；治疗术后皮瓣全部成活，切口均为I期愈合，未发生显著肿胀及静脉危象情况，全部供区植皮成活，术后随访，伤指皮肤与皮瓣质地、色泽相近，指腹饱满。两点辨别觉9~12 mm。患者指间关节可正常活动；治疗组的并发症、手指感觉、感染情况、手指外观等显著优于对照组（P〈0.05）。结论手指组织缺损应用指背筋膜蒂皮瓣修复术，可有效降低术后发生静脉危象，临床效果确切，值得临床推广。

关键词：临床效果修复术指背筋膜蒂皮瓣软组织缺损

探讨后外侧结构重建对后外侧入路全髋关节置换术后早期脱位的影响

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当代医学 2020年第14期26卷 30-31页

作者：郭亮亮叶明旺曾荣峰广东省连州市人民医院脊柱关节外科广东清远513400

目的探讨后外侧结构重建对后外侧入路全髋关节置换术后早期脱位的影响。方法选取2016年7月至2019年7月本院收治的需要进行后外侧入路全髋关节置换手术的患者70例作为研究对象,依据是否对后外侧结构进行重建分为研究组与对照组,每组35例... 详细信息

目的探讨后外侧结构重建对后外侧入路全髋关节置换术后早期脱位的影响。方法选取2016年7月至2019年7月本院收治的需要进行后外侧入路全髋关节置换手术的患者70例作为研究对象,依据是否对后外侧结构进行重建分为研究组与对照组,每组35例。研究组在后外侧入路全髋关节置换手术前对后外侧结构进行重建,对照组在后外侧入路全髋关节置换手术前不对后外侧结构进行重建。对比两组患者的髋关节早期脱位发生率。结果治疗后,对照组的髋关节早期脱位率明显高于研究组,差异具有统计学意义(P<0.05);研究组患者的术中失血量、手术时间、切口长度显著低于对照组,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论在后外侧入路全髋关节置换手术中,进行后外侧结构重建的患者较不进行后外侧结构重建的患者术后发生早期的脱位率显著降低,重建后外侧结构可减少后外侧入路全髋关节置换术后早期脱位的发生,对患者的手术效果、术后恢复及对髋关节软组织的平衡具有重要作用,值得临床推广应用。

关键词：后外侧入路早期脱位后外侧结构重建全髋关节置换术

传统正中入路椎弓根钉和经椎旁肌间隙入路椎弓根钉系统治疗单节段胸腰椎骨折的临床效果

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中外医学研究 2020年第4期18卷 140-142页

作者：郭亮亮叶明旺曾荣峰辛利军连州市人民医院

目的:对比传统正中入路椎弓根钉、经椎旁肌间隙入路椎弓根钉系统对单节段胸腰椎骨折的治疗效果。方法:选取2016年1月-2019年1月于笔者所在医院以椎弓根钉治疗单节段胸腰椎骨折患者60例,以入路方式作为分组依据,分为采用传统正中入路椎... 详细信息

目的:对比传统正中入路椎弓根钉、经椎旁肌间隙入路椎弓根钉系统对单节段胸腰椎骨折的治疗效果。方法:选取2016年1月-2019年1月于笔者所在医院以椎弓根钉治疗单节段胸腰椎骨折患者60例,以入路方式作为分组依据,分为采用传统正中入路椎弓根钉治疗的对照组及采用经椎旁肌间隙入路椎弓根钉系统的研究组,各30例。对比两组术中出血量、手术时间、术后疼痛评分、术后椎体前缘高度比、术后Cobb角、并发症发生率。结果:研究组手术时间短于对照组,术中出血量少于对照组,术后疼痛评分、并发症发生率均低于对照组,术后Cobb角小于对照组,术后椎体前缘高度比大于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论:经椎旁肌间隙入路椎弓根钉系统治疗单节段胸腰椎骨折效果更好,安全性更高。

关键词：椎弓根钉单节段胸腰椎骨折传统正中入路经椎旁肌间隙入路临床疗效

弹性髓内针固定治疗儿童前臂骨干骨折临床观察

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中国现代医生 2014年第16期52卷 23-25页

作者：万富贵房辉强庄华伟曾荣峰叶明旺广东省连州市人民医院外科二区广东连州513400

目的探讨弹性髓内针固定治疗儿童前臂骨干骨折的临床疗效。方法选取2011年1月～2014年2月我院骨科收治的前臂骨干骨折患儿80例，按随机排测法分为对照组和观察组，每组40例，对照组采用传统的皮克氏针、钢板和石膏固定，观察组采用弹性... 详细信息

目的探讨弹性髓内针固定治疗儿童前臂骨干骨折的临床疗效。方法选取2011年1月～2014年2月我院骨科收治的前臂骨干骨折患儿80例，按随机排测法分为对照组和观察组，每组40例，对照组采用传统的皮克氏针、钢板和石膏固定，观察组采用弹性髓内针进行固定，将两组术后患者前臂功能恢复情况和并发症进行分析和比较。结果观察组患者术后有1例（2．5％）出现前臂旋后功能受限，其余患儿患肢功能恢复良好，无并发症。对照组患者出现前臂旋后功能受限的有10例（25．0％），出现并发症15例（37．5％）。结论弹性髓内针治疗儿童前臂骨干骨折具有操作简单、风险低、效果明确、创伤小等优势，值得临床推广应用。

关键词：弹性髓内针固定儿童前臂骨干骨折

综合防控干预措施在多重耐药菌医院感染控制中的应用效果研究

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智慧健康 2023年第4期9卷 209-212页

作者：王伙群叶明旺谢慧君成桂丹谢稚梅广东省连州市人民医院广东清远513400

目的分析综合防控干预措施在多重耐药菌医院感染控制中的应用效果。方法以2019年7月-2021年7月检验科微生物室报告的新发多重耐药菌病例840例患者为研究对象,包括社区感染与医院感染(排除检验报告出来之前即出院或死亡),按入院先后顺... 详细信息

目的分析综合防控干预措施在多重耐药菌医院感染控制中的应用效果。方法以2019年7月-2021年7月检验科微生物室报告的新发多重耐药菌病例840例患者为研究对象,包括社区感染与医院感染(排除检验报告出来之前即出院或死亡),按入院先后顺序将前420例患者纳入对照组,后420例患者纳入实验组,为患者实施不同管理方式,对比医院感染控制、多重耐药菌检出率及医院感染率、感染防控措施落实情况。结果通过相关研究分析发现,实验组与对照组在目标监测菌株的检出率及医院感染率、感染防控措施落实情况的质控存在问题对比分析上具有明显差异,其中,实验组与对照组的相关差值对比有统计学意义(P<0.05)。结论经研究证实,综合防控干预措施在多重耐药菌医院感染率控制上具有一定指导意义,能够有效降低医院感染率,所以可推广到临床。

关键词：综合防控干预措施多重耐药菌医院感染控制应用效果