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第二届全国病毒性肝炎慢性化重症化基础与临床研究进展学术会议

作者： Dengming He Qinghua Shang Yong An Wei Bai Qingqiang Yi Yuqi Zhang Wei Zhang mingquan ding Jianguo Yu Liver disease diagnosis and treatment center of Chinese PLA the 88th Hospital of Chinese PLA

Background and aim:In about 80%of chronic hepatitis B virus(HBV) infected patients, aminotransferase(ALT) levels are persistently *** deciding a treatment strategy,a liver biopsy is ***,liver biopsy is not generally accepted by the majority of patients because of possible ***,it is important to evaluate liver histological activity according to related factors,such as age,gender,hepatitis B surface antigen(HBeAg),and ALT levels in patients with normal ALT *** observing the relationship between histological activity and related factors in chronic HBV patients with a persistently normal ALT level,the aim of this study was to provide

关键词：

Comparative mapping and association analysis revealed the differentiation in genetic basis governing stem trichome/seed fiber development between cultivated tetraploid cottons

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Comparative mapping and association analysis revealed the di...

2019年中国作物学会学术年会

作者：袁蓉 Tengyu Li Feng Yang Yuan Qin Yuefen Cao mingquan ding Yurong Jiang Chengdong Sun Hua Zhang Junkang Rong Zhejiang A&F University

Cotton stem trichome and seed fibers belong to the single-cell structure formed by the protrusion of epidermal cells. Compared with fibers, the cotton stem trichome are easier to observe and study, but its genetic basis and molecular mechanism are still poorly understood. After long term of observation, we found that both cultivated tetraploid cottons(Gossypium hirsutum and ***) differed greatly in stem trichome phenotype. Most *** have little or no trichome, whereas all of the cultivated G. hirsutum varieties have trichome on stem. In addition, two species have significantly difference in trichome density, length and trichome number, according to which, stem trichome of cultivated tetraploid cottons can be roughly divided into four types(Ⅰ-Ⅳ). Upland cottons normally have the long single and cluster stem trichome(type Ⅰ and Ⅱ), while Sea island cottons only have short cluster trichome(type Ⅲ and Ⅳ). Genetic mapping using the F2 populations between varieties with different type of trichome and without stem trichome revealed that the type Ⅰ trichome of upland cotton were mainly controlled by genes on chromosomes A06 and D08, the type Ⅱ were mainly controlled by genes on A06, whereas the type Ⅲ and Ⅳ stem trichome of Sea Island cotton were mainly controlled by genes on D08. When more cross combinations were observed, it was found that the resultant F1 consistently showed the obvious different trihome phenotype among crosses with different type of tichome, while those from varieties with the same type of trichome showed the same trichome phenotype, suggesting that different types of trichome in tetraploid cotton were controlled by different genetic foundation. More ratio of wild upland cotton do not have trichome on their stem than modern varieties, whereas in Sea island cotton less ratio of wild accessions having the glabrous stem than modern varieties. In both Upland and Island cottons, a very close relationship between fuzzy fiber number/fiber leng

关键词： cotton stem trichome genetic mapping QTL DNA marker

转录组测序技术在鉴定小麦染色体臂置换系染色体组成上的应用

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麦类作物学报 2019年第10期39卷 1146-1153页

作者：缪娜娜丁明全杨思晴戎均康浙江农林大学林业与生物技术学院浙江临安311300 浙江农林大学农业与食品科学学院浙江临安311300

为给染色体片段置换系的快速鉴定提供新的技术手段,用3个以普通小麦品种中国春(Chinese Spring,CS)为背景的野生二粒小麦(TTD140)染色体臂置换系(chromosome arm substitution line,CASL)进行转录组测序,并结合SNP分析,获得纯合的SNP,... 详细信息

为给染色体片段置换系的快速鉴定提供新的技术手段,用3个以普通小麦品种中国春(Chinese Spring,CS)为背景的野生二粒小麦(TTD140)染色体臂置换系(chromosome arm substitution line,CASL)进行转录组测序,并结合SNP分析,获得纯合的SNP,用于鉴定CASL材料中TTD140的置换区段。结果发现,CASL3AL的SNP主要分布在染色体3A的108~750 Mb区段;CASL7BS的SNP分布于染色体7B的0~536 Mb和5A的22~482 Mb区段;CASL4AL的SNP分布比较复杂,除集中在4A的40~745 Mb、7B的0~570 Mb以及5B的410~675 Mb外,还在1A、2A、3A、7A、2B、2D、5D、6D和7D染色体上成簇分布,表明该材料除在预期的染色体4A上保留TTD140的大片段外,还在其他染色体上残留许多TTD140小片段。通过97对多态性SSR标记验证CASL3AL的染色体组成,发现84对标记能检测到TTD带型,其分布范围与转录组数据鉴定结果基本一致。对SNP富集区域的320 bp PCR产物直接测序,发现CASL3AL与CS之间存在7个SNP位点,但与TTD140以及Zavitan参考序列一致。因此,本研究利用转录组测序技术能够有效鉴定小麦染色体片段置换系材料的染色体组成,且比传统的分子标记技术准确、方便、快捷。

关键词：小麦 RNA-seq 染色体臂置换系 SNP 染色体组成

Polymorphisms of TLR-IFN pathway genes and the risk for persistently chronic hepatitis B virus infection in Chinese Southwest Han population

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Polymorphisms of TLR-IFN pathway genes and the risk for pers...

第四届全国病毒性肝炎慢性化、重症化基础与临床研究进展学术会议

作者： Dengming Shiqi Tao Shimin Guo Maoshi Li Junqiu Wu Hongfei Huang Xinwu Guo Guohua Yan Peng Zhu Cheng Xu Yuming Wang mingquan ding Institute of Infectious Disease Southwest HospitalThird Military Medical University Liver Disease Diagnoses and Treatment Center of Chinese PLA the 88th Hospital of Chinese PLA The Chongqing Key Laboratory for Research of Infectious Diseases Sansure Biotech Inc

Background and aims The innate immunity represented by TLR-IFN signal pathway play a crucial role in HBV *** HLA polymorphisms is associated with chronic HBV infection,no further mechanism was *** to linkage disequilibrium of genetics and the role of innate immune in the control of HBV,we assumed that there may be some linkage between polymorphic of HLA and TLR-IFN pathway *** design this case-control study to seek the

关键词： IFN HBV TLR Polymorphisms of TLR-IFN pathway genes and the risk for persistently chronic hepatitis B virus infection in Chinese Southwest Han population

Polymorphisms of TLR-IFN pathway genes and the risk for persistently chronic hepatitis B virus infection in Chinese Southwest Han population

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中华医学会第四届全国病毒性肝炎慢性化、重症化基础与临床研究进展学术会议

Background and aims The innate immunity represented by TLR-IFN signal pathway play a crucial role in HBV *** HLA polymorphisms is associated with chronic HBV infection,no further mecha

关键词：

雷蒙德氏棉HSP70基因家族的进化分析及其同源基因在陆地棉中的表达分析

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遗传 2014年第9期36卷 921-933页

作者：张毓婷王敏华陈家栋戎均康丁明全浙江农林大学、亚热带森林培育国家重点实验室培育基地临安311300 浙江农林大学农业与食品科学学院、浙江省农产品品质改良技术研究重点实验室临安311300 中国农业科学院棉花研究所、棉花生物学国家重点实验室安阳455000

热激蛋白70家族(HSP70)是一类在植物中高度保守的分子伴侣蛋白,在细胞中协助蛋白质正确折叠。文章利用隐马可链夫模型(HMM)在雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii L.)全基因组范围内进行HSP70基因家族成员进化分析,共得到30个HSP70家族成员... 详细信息

热激蛋白70家族(HSP70)是一类在植物中高度保守的分子伴侣蛋白,在细胞中协助蛋白质正确折叠。文章利用隐马可链夫模型(HMM)在雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii L.)全基因组范围内进行HSP70基因家族成员进化分析,共得到30个HSP70家族成员。利用生物信息学对雷蒙德氏棉HSP70基因的结构、染色体分布、基因倍增模式以及系统进化进行分析,结果表明,HSP70基因家族根据亚细胞定位结果可分为不同的基因亚家族,各亚家族中HSP70基因具有相对保守的基因结构;染色体片段重复和串联重复是雷蒙德氏棉HSP70基因家族扩增的主要方式。通过对不同物种的HSP70基因家族进行系统进化分析可知,HSP70亚组的分化发生在单细胞植物形成前,且细胞质型HSP70成员大量扩增。比较陆地棉棉纤维发育不同时期的深度测序表达谱,发现HSP70基因可能参与棉纤维的生长发育。本研究结果有助于了解棉属植物HSP70基因家族的功能,以期为深入研究棉纤维发育过程中的分子调控机理提供基础。

关键词：棉纤维 HSP70家族深度测序基因结构系统进化分析

泥沙直径和浓度对水斗式水轮机转轮的磨损特性

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中国电机工程学报 2021年第14期41卷 5025-5033页

作者：葛新峰孙洁李阳张雷邓朝钟王金亮高飞丁铭泉郑源河海大学能源与电气学院江苏省南京市210098 江苏理工学院江苏省常州市213001 黄河水利科学研究院河南省郑州市450003 黄河万家寨水利枢纽有限公司山西省忻州市036412

含沙水流会对高水头水斗式水轮机转轮造成磨损,影响机组检修和高效安全运行。文采用流体体积模型(volume of fluid,VOF)、SST k-w湍流模型和离散相模型(discrete phase model,DPM)对含沙水流进行了固–液–气三相非定常数值模拟,研究了... 详细信息

含沙水流会对高水头水斗式水轮机转轮造成磨损,影响机组检修和高效安全运行。文采用流体体积模型(volume of fluid,VOF)、SST k-w湍流模型和离散相模型(discrete phase model,DPM)对含沙水流进行了固–液–气三相非定常数值模拟,研究了泥沙颗粒的直径、浓度与斗叶内表面磨损量、磨损位置的关系。研究表明:随着射流能量的传递,水膜的高压力区逐渐从缺口后移到斗叶根部;分水刃和缺口位置是最容易受到泥沙磨损的部位,与现场电站转轮水斗磨损位置一致;泥沙直径、浓度的增加与磨损率呈正相关;小颗粒泥沙更易对靠近斗叶根部的出水边造成磨损,而大颗粒泥沙更易对靠近分水刃的进水边造成磨损。本文研究的目的是为水斗式水轮机的制造加工、维护检修提供一定的理论基础。

关键词：水斗式水轮机泥沙磨损 SST k-w湍流模型固-液–气三相流非定常数值模拟

普通小麦(浙农林12×CASL7AS)DH系株高的分析

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麦类作物学报 2023年第12期43卷 1524-1533页

作者：陈玉翠胡鑫赵燕昊彭星木丁明全戎均康浙江农林大学现代农学院浙江省农产品品质改良技术研究重点实验室浙江临安311300 桐庐县农业技术推广中心浙江桐庐311500 桐庐县瑶琳镇人民政府浙江桐庐311500

小麦株高与植株倒伏密切相关,影响小麦产量。为挖掘小麦株高QTL位点和候选基因,从遗传和分子水平上解释株高分子机理,本研究将野生二粒小麦染色体臂置换系CASL7AS为母本,课题组自选株系浙农林12(简称ZNL12)为父本,杂交F 1经过花培得到17... 详细信息

小麦株高与植株倒伏密切相关,影响小麦产量。为挖掘小麦株高QTL位点和候选基因,从遗传和分子水平上解释株高分子机理,本研究将野生二粒小麦染色体臂置换系CASL7AS为母本,课题组自选株系浙农林12(简称ZNL12)为父本,杂交F 1经过花培得到178个DH群体。通过4年2个种植点株高数据,利用55K SNP芯片构建高密度遗传图谱,对小麦株高性状进行QTL分析。该遗传连锁图谱包含3655个SNP标记,长度为4738.45 cM,标记间平均遗传距离为1.30 cM,覆盖了小麦21条染色体。其中,A、B、D染色体组分别含有标记1466、1492和697个。QTL分析共检测出53个QTL位点,分布于1A、3A、5A、7A、1B、3B、4B、5B、7B、2D、4D、6D和7D染色体上,可解释2.80%~38.50%表型变异。其中,稳定主效QTL有2个,分别为***.4B-1和***.4D-1,其贡献率分别为25.18%~38.50%和20.67%。经细胞生物学分析,基因型为(0,2)矮秆植株胚芽鞘的表皮细胞长度显著短于基因型为(2,0)的高秆植株,基因型为(0,0)、(2,2)中间型的植株胚芽鞘表皮细胞长度无显著差异,由此推测小麦株高的变异由细胞长度因素决定。***.4B-1候选基因Rht-B1b基因编码区矮秆株系,第904核苷酸处发生碱基“C-T”的突变,形成终止密码子(CAG-TAG);而***.4D-1候选基因Rht-D1b基因编码区矮秆株系,第781核苷酸处碱基突变“G-T”,编码氨基酸中缬氨酸变为天冬氨酸。结果为小麦株高候选基因的筛选和QTL定位提供了优异的遗传位点和候选基因,未来可用于小麦抗倒伏相关的分子标记辅助育种。

关键词：六倍体小麦株高 QTL定位双单倍体

胡杨果糖-1,6-二磷酸醛羧酶基因PeALD的克隆及耐盐性分析

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基因组学与应用生物学 2011年第3期30卷 257-267页

作者：张帆常李伟丁明全侯佩臣沈昕陈少良北京林业大学生物科学与技术学院北京100083

胡杨(Populus euphratica Oliv)是优良的抗逆树种,有很强的耐盐碱性。前期胡杨转录组研究结果显示盐胁迫可诱导果糖-1,6-二磷酸醛羧酶基因(PeALD)转录上调,提示该基因可能对胡杨耐盐性方面有某种贡献。为分析PeALD基因在胡杨耐盐性中的... 详细信息

胡杨(Populus euphratica Oliv)是优良的抗逆树种,有很强的耐盐碱性。前期胡杨转录组研究结果显示盐胁迫可诱导果糖-1,6-二磷酸醛羧酶基因(PeALD)转录上调,提示该基因可能对胡杨耐盐性方面有某种贡献。为分析PeALD基因在胡杨耐盐性中的作用,本研究以胡杨为材料,利用RT-PCR方法克隆了胡杨果糖-1,6-二磷酸醛羧酶基因的全长cDNA,通过基因转化法尝试在烟草中过量表达该基因,并对转基因株系的耐盐性进行初步分析。研究结果显示,克隆的cDNA编码果糖-1,6-二磷酸醛羧酶,ORF为1177bp,是由247个氨基酸编码的疏水性蛋白,理论等电点为6.84,分子量为26.79kD。PCR与RT-PCR检测结果表明,外源的PeALD基因通过转化已经整合到烟草的染色体中,并在4个株系中得到较强的表达。转化株系表型筛选实验表明,在200mmol/L NaCl的MS培养基中培养15d后,野生型烟草植株无明显高生长,叶片全部黄化并萎缩;而转基因烟草高生长基本没有受到抑制,植株生长良好。说明在烟草中过表达PeALD使转化植株的耐盐性显著提高。光合数据结果显示,ALD基因能够降低盐胁迫对烟草叶片净光合速率的影响,可能是PeALD过表达加速了卡尔文循环的运转,提高了CO2的固定速率,进而促进了光合活性,通过光合作用促进碳的积累,利于呼吸作用和氧化磷酸化产生ATP,为维持跨膜质子浓度梯度提供能量,从而有可能促进质膜上的Na+/H+逆向转运,利于细胞质膜保持拒盐性。这些结果初步验证了PeALD基因的耐盐性功能,为进一步深入研究该基因在耐盐机制中的作用奠定了良好基础。

关键词：胡杨果糖-1,6-二磷酸醛羧酶基因转基因烟草碳流向抗盐性

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小麦粒重形成的分子调控机制研究综述

浙江农林大学学报 2016年第2期33卷 348-356页

作者：魏玮郭嘉莲万琳涛徐林峰丁明全周伟浙江农林大学农业与食品科学学院/浙江省农产品品质改良技术研究重点实验室浙江临安311300 浙江省开化县农作物技术推广站浙江开化324300 浙江勿忘农种业科学研究院有限公司浙江杭州310020

粒重是小麦Triticum aestivum产量构成的三大要素之一,是由多基因控制的数量性状,极易受环境因素的影响。国内外学者围绕粒重形成的遗传特征和分子调控机制进行了大量研究,也取得了一些研究进展。如何高效地利用前人的研究成果进行不断... 详细信息

粒重是小麦Triticum aestivum产量构成的三大要素之一,是由多基因控制的数量性状,极易受环境因素的影响。国内外学者围绕粒重形成的遗传特征和分子调控机制进行了大量研究,也取得了一些研究进展。如何高效地利用前人的研究成果进行不断创新以提高小麦单产是育种工作者重要的研究课题。围绕小麦粒重形成的构成要素、遗传特征、QTLs(quantitative trait loci,QTLs)遗传定位、籽粒质量形成候选基因的克隆与分子调控机制解析等方面的最新研究展开综述;同时总结了以往研究过程中存在的问题,并结合自身研究对研究前景进行分析后指出:为了从分子水平上全面阐明小麦粒重形成的调控机制,后续研究首先应在小麦粒重形成的关键时期对籽粒激素的变化特征进行全面分析;其次要利用全基因组关联分析和高通量测序技术进一步开发与性状密切相关联的SNP标记(single nucleotide polymorphism,SNP);最后结合作图群体进行表型与SNP分析技术为基础的基因型关联性分析,对粒重形成候选主效基因进行精细定位、图位克隆和功能解析。

关键词：作物遗传育种小麦粒重产量分子调控综述