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A genome-wide association study uncovers a critical role of the RsPAP2 gene in red-skinned Raphanus sativus L.

Horticulture Research 2020年第1期7卷 793-805页

作者： Lianxue Fan YanWang Liang Xu mingjia tang Xiaoli Zhang Jiali Ying Cui Li Junhui Dong Liwang Liu National Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement Key Laboratory of Horticultural Crop Biology and Genetic Improvement(East China)of MOARCollege of HorticultureNanjing Agricultural University210095 NanjingPR China

Radish(Raphanus sativus L.)taproot contains high concentrations of flavonoids,including anthocyanins(ATCs),in redskinned genotypes.However,little information on the genetic regulation of ATC biosynthesis in radish is available.A genome-wide association study of radish red skin color was conducted using whole-genome sequencing data derived from 179 radish genotypes.The R2R3-MYB transcription factor production of anthocyanin pigment 2(PAP2)gene was found in the region associated with a leading SNP located on chromosome 2.The amino acid sequence encoded by the RsPAP2 gene was different from those of the other published RsMYB genes responsible for the red skin color of radish.The overexpression of the RsPAP2 gene resulted in ATC accumulation in Arabidopsis and radish,which was accompanied by the upregulation of several ATC-related structural genes.RsPAP2 was found to bind the RsUFGT and RsTT8 promoters,as shown by a dual-luciferase reporter system and a yeast one-hybrid assay.The promoter activities of the RsANS,RsCHI,RsPAL,and RsUFGT genes could be strongly activated by coinfiltration with RsPAP2 and RsTT8.These findings showed the effectiveness of GWAS in identifying candidate genes in radish and demonstrated that RsPAP2 could(either directly or together with its cofactor RsTT8)regulate the transcript levels of ATC-related genes to promote ATC biosynthesis,facilitating the genetic enhancement of ATC contents and other related traits in radish.

关键词： Raphanus critical finding

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Comparative proteomic analysis provides insight into a complex regulatory network of taproot formation in radish (Raphanus sativus L.)

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Horticulture Research 2018年第1期5卷 249-262页

作者： Yang Xie Liang Xu Yan Wang Lianxue Fan Yinglong Chen mingjia tang Xiaobo Luo Liwang Liu National Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement Key Laboratory of Horticultural Crop Biology and Genetic Improvement(East China)of MOACollege of HorticultureNanjing Agricultural UniversityNanjing210095PR China The UWA Institute of Agriculture UWA School of Agriculture and EnvironmentThe University of Western AustraliaPerthWA6001Australia

The fleshy taproot of radish is an important storage organ determining its yield and quality.Taproot thickening is a complex developmental process in radish.However,the molecular mechanisms governing this process remain unclear at the proteome level.In this study,a comparative proteomic analysis was performed to analyze the proteome changes at three developmental stages of taproot thickening using iTRAQ approach.In total,1862 differentially expressed proteins(DEPs)were identified from 6342 high-confidence proteins,among which 256 up-regulated proteins displayed overlapped accumulation in S1(pre-cortex splitting stage)vs.S2(cortex splitting stage)and S1 vs.S3(expanding stage)pairs,whereas 122 up-regulated proteins displayed overlapped accumulation in S1 vs.S3 and S2 vs.S3 pairs.Gene Ontology(GO)and pathway enrichment analysis showed that these DEPs were mainly involved in several processes such as“starch and sucrose metabolism”,“plant hormone signal transduction”,and“biosynthesis of secondary metabolites”.A high concordance existed between iTRAQ and RT-qPCR at the mRNA expression levels.Furthermore,association analysis showed that 187,181,and 96 DEPs were matched with their corresponding differentially expressed genes(DEGs)in S1 vs.S2,S1 vs.S3,and S2 vs.S3 comparison,respectively.Notably,several functional proteins including cell division cycle 5-like protein(CDC5),expansin B1(EXPB1),and xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 24(XTH24)were responsible for cell division and expansion during radish taproot thickening process.These results could facilitate a better understanding of the molecular mechanism underlying taproot thickening,and provide valuable information for the identification of critical genes/proteins responsible for taproot thickening in root vegetable crops.

关键词： metabolism analysis Raphanus

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Melatonin-induced DNA demethylation of metal transporters and antioxidant genes alleviates lead stress in radish plants

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Horticulture Research 2021年第1期8卷 1887-1900页

作者： mingjia tang Liang Xu Yan Wang Junhui Dong Xiaoli Zhang Kai Wang Jiali Ying Cui Li Liwang Liu National Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement Key Laboratory of Horticultural Crop Biology and Genetic Improvement(East China)of MOARCollege of HorticultureNanjing Agricultural UniversityNanjing 210095P.R.China

Melatonin(MT)is a tryptophan-derived natural product that plays a vital role in plant response to abiotic stresses,including heavy metals(HMs).However,it remains elusive how exogenous MT mediates lead(Pb)accumulation and detoxification at the methylation and transcriptional levels in radish.In this study,decreased Pb accumulation and increased antioxidant enzyme activity were detected under MT treatment in radish.Single-base resolution maps of DNA methylation under Pb stress(Pb200)and Pb plus MT treatment(Pb_50MT)were first generated.The genome-wide methylation level was increased under Pb stress,while an overall loss of DNA methylation was observed under MT treatment.The differentially methylated region(DMR)-associated genes between Pb_50MT and Pb200 were uniquely enriched in ion binding terms,including cation binding,iron ion binding,and transition metal ion binding.Hyper-DMRs between Pb200 and Control exhibited a decreasing trend of methylation under Pb_50MT treatment.A few critical upregulated antioxidant genes(e.g.,RsAPX2,RsPOD52 and RsGST)exhibited decreased methylation levels under MT treatment,which enabled the radish plants to scavenge lead-induced reactive oxygen species(ROS)and decrease oxidative stress.Notably,several MT-induced HM transporter genes with low methylation(e.g.,RsABCF5,RsYSL7 and RsHMT)and transcription factors(e.g.,RsWRKY41 and RsMYB2)were involved in reducing Pb accumulation in radish roots.These findings could facilitate comprehensive elucidation of the molecular mechanism underlying MT-mediated Pb accumulation and detoxification in radish and other root vegetable crops.

关键词： Melatonin stress treatment

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Neddylation inhibitor MLN4924 suppresses cilia formation by modulating AKT1

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Protein & Cell 2019年第10期10卷 726-744页

作者： Hongmei Mao Zaiming tang Hua Li Bo Sun mingjia Tan Shaohua Fan Yuan Zhu Yi Sun The Cancer Institute of the Second Affiliated Hospital and Institute of Translational MedicineZhejiang University School of MedicineHangzhou 310029China Division of Radiation and Cancer Biology Department of Radiati on OncologyUniversity of MichiganAnn ArborMl 48109USA Gilbert Family Neurofibromatosis In stitute Center for Cancer and Immuno logy ResearchChildren's Research In stituteChildren's National Medical CenterWashingtonDC 20010USA

The primary cilium is a microtubule-based sensory organelle.The molecular mechanism that regulates ciliary dynamics remains elusive.Here,we report an unexpected finding that MLN4924,a small molecule inhibitor of NEDD8-activating enzyme(NAE),blocks primary ciliary formation by inhibiting synthesis/assembly and promoting disassembly.This is mainly mediated by MLN4924-induced phosphorylation of AKT1 at Ser473 under serum-starved,ciliary-promoting conditions.Indeed,pharmaceutical inhibition(by MK2206)or genetic depletion(via siRNA)of AKT1 rescues MLN4924 effect,indicating its causai role.Interestingly,pAKT 1-Ser473 activity regulates both ciliary synthesis/assembly and disassembly in a MLN4924 dependent manner,whereas pAKT-Thr308 determines the ciliary length in MLN4924-independent but VHL-dependent manner.Finally,MLN4924 inhibits mouse hair regrowth,a process requires ciliogenesis?Collectively,our study dem on strates an unexpected role of a neddylation inhibitor in regulation of ciliogenesis via AKT1,and pro?vides a proof-of-concept for potential utility of MLN4924 in the treatment of human diseases associated with abnormal ciliogenesis.

关键词： AKT Cilia MLN4924 neddylation siRNA VHL

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毛细管电泳法测定针剂中亚硫酸氢钠甲萘醌的含量

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分析化学 2005年第6期33卷 828-830页

作者：唐亚军吴明嘉中国科学院研究生院中国科学院长春应用化学研究所国家电化学和光谱分析研究中心中国科学院长春应用化学研究所国家电化学和光谱分析研究中心长春130022 北京100039

建立了亚硫酸氢钠甲萘醌的高效毛细管电泳紫外测定方法。以未涂层融硅石英毛细管(55cm×75μm)为分离柱,40mmol/L磷酸盐+50mmol/LSDS(pH=7.5)为电泳介质,在分离电压为15kV,紫外检测波长为231nm的条件下对亚硫酸氢钠甲萘醌进行测定。讨... 详细信息

建立了亚硫酸氢钠甲萘醌的高效毛细管电泳紫外测定方法。以未涂层融硅石英毛细管(55cm×75μm)为分离柱,40mmol/L磷酸盐+50mmol/LSDS(pH=7.5)为电泳介质,在分离电压为15kV,紫外检测波长为231nm的条件下对亚硫酸氢钠甲萘醌进行测定。讨论了缓冲溶液、pH值的选择,并着重研究了十二烷基硫酸钠对亚硫酸氢钠甲萘醌增溶作用机理。以磷酸吡哆醛为内标对亚硫酸氢钠甲萘醌注射液进行测定,方法简单可行且结果良好。

关键词：毛细管电泳亚硫酸氢钠甲萘醌十二烷基硫酸钠

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番茄响应光温逆境的生理分子机制研究进展

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园艺学报 2022年第10期49卷 2174-2188页

作者：唐明佳徐进林锐宋珈凝喻景权周艳虹浙江大学农业与生物技术学院园艺系农业农村部园艺植物生长发育重点实验室杭州310058

设施栽培冬春生产中的低温逆境严重影响番茄等喜温作物的光合作用,而不适宜的光强、光周期、光质等光环境加剧了作物的低温光抑制,导致产量降低和品质变劣。因此,解析植物响应光温逆境的生理分子机制对冬春季节生产中作物抗逆性调控不... 详细信息

设施栽培冬春生产中的低温逆境严重影响番茄等喜温作物的光合作用,而不适宜的光强、光周期、光质等光环境加剧了作物的低温光抑制,导致产量降低和品质变劣。因此,解析植物响应光温逆境的生理分子机制对冬春季节生产中作物抗逆性调控不可或缺。近年来,植物响应光温逆境的分子机制逐渐清晰,然而光温信号整合因子及其功能还有待进一步挖掘。基于此,对番茄响应光温逆境的生理分子机制进行了综述,重点讨论了光及其信号对植物低温抗性的影响,并分析了此领域研究中存在的问题及今后研究的方向,以期为减轻番茄的逆境危害、提高产量和品质等提供参考,也为深入探索新的光温互作因子及其功能奠定基础。

关键词：番茄光照温度光信号逆境胁迫

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毛细管电泳在食品分析中的应用

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分析化学 2005年第12期33卷 1794-1798+1783页

作者：许元红唐亚军吴明嘉中国科学院长春应用化学研究所国家电化学和光谱研究分析中心长春130022 中国科学院研究生院北京100039 中国科学院长春应用化学研究所国家电化学和光谱研究分析中心

介绍了近年来国内外毛细管电泳(CE)在食品分析中的应用,包括蛋白质、氨基酸、生物胺、维生素、碳水化合物、无机离子、有机酸、食品添加剂、农药和抗生素残留、生物毒素等食品中一些物质的测定。引用文献59篇。

关键词：毛细管电泳食品分析评述

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茭白热激转录因子基因的鉴定与分析

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浙江大学学报（农业与生命科学版） 2023年第2期49卷 269-279页

作者：蔡溧聪唐明佳徐进齐振宇范飞军周艳虹浙江大学农业与生物技术学院浙江杭州310058 浙江大学农业试验站浙江杭州310058 丽水市农业农村局浙江丽水323000

为探究热激转录因子(heat shock transcription factor,HSF)基因家族在茭白耐热性中的功能及潜在应用,本试验以‘龙茭2号’为材料,利用生物信息学手段,鉴定出28个茭白HSF蛋白并对其进行分析。理化性质分析表明,茭白HSF家族蛋白的理论等... 详细信息

为探究热激转录因子(heat shock transcription factor,HSF)基因家族在茭白耐热性中的功能及潜在应用,本试验以‘龙茭2号’为材料,利用生物信息学手段,鉴定出28个茭白HSF蛋白并对其进行分析。理化性质分析表明,茭白HSF家族蛋白的理论等电点为4.77~11.63,分子量为16.77~101.29 kDa,氨基酸长度为239~661个氨基酸,不稳定系数均大于40。多序列比对发现其DNA结合域具有高度保守性,长约为100个氨基酸。通过MEGA 7.0软件构建茭白、拟南芥、毛竹和水稻的HSF蛋白系统发育树,发现HSF蛋白可以分为A、B、C 3个分支,茭白HSF家族中含有17个A类成员、7个B类成员、4个C类成员。进一步通过实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescent quantitative polymerase chain reaction,qRT-PCR)分析高温胁迫下茭白HSF基因家族的表达模式和热胁迫生理指标,结果表明,有14个HSF基因在高温胁迫(42℃,12 h)后处于高表达水平(表达量提高10倍以上),其中Zl HSF-04、ZlHSF-12、ZlHSF-27表达量上调最明显,与常温对照组(CK)相比分别上调37倍、36倍、44倍;同时,高温胁迫下茭白幼苗叶片出现大面积失水失绿的现象,叶片干枯卷曲,且光系统Ⅱ最大光化学效率较CK降低了49.9%,而相对电导率,丙二醛、脯氨酸、过氧化氢含量与CK相比分别增加了409%、97%、396%和99%。本结果为进一步研究HSF基因家族在茭白热激响应中的功能提供了理论依据。

关键词：茭白热激转录因子基因家族表达分析

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杭州市小学师生近视防控信念共性与差异研究

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中国学校卫生 2022年第2期43卷 198-202页

作者：高铭佳刘淑美孙欣苏敏吕佳颢张梓瑗唐国忠邵森弟杭州师范大学经亨颐教育学院浙江311121 杭州师范大学附属仓前实验小学杭州师范大学附属五常中心小学

目的探讨小学生及教师在关于学生近视防控信念方面的共性与差异,为近视防控教育方案的制定提供理论依据。方法采用方便抽样法,选取杭州市2所小学三至四年级的14名学生及16名教师进行一对一深入访谈,并运用Nvivo 11.0软件对访谈结果进行... 详细信息

目的探讨小学生及教师在关于学生近视防控信念方面的共性与差异,为近视防控教育方案的制定提供理论依据。方法采用方便抽样法,选取杭州市2所小学三至四年级的14名学生及16名教师进行一对一深入访谈,并运用Nvivo 11.0软件对访谈结果进行编码分析。结果师生在近视防控信念的自觉罹患性、自觉严重性、自觉有效性和自觉障碍性方面存在共性,共性关键词共被提及114次,其中自觉严重性、自觉有效性和自觉障碍性的共性较明显;师生在自觉罹患性、自觉严重性与自觉障碍性方面上存在差异,差异关键词共被提及63次,其中自觉罹患性和自觉障碍性的差异较明显。结论师生在近视防控信念的自觉罹患性、自觉严重性、自觉有效性和自觉障碍性方面存在共性;在自觉罹患性、自觉严重性与自觉障碍性方面上存在差异。学生应提升近视防控自觉严重性认知,强化近视防控信念;学校应开展近视防控健康教育活动,提升师生近视防控能力;政府应落实“双减”政策,完善户外活动安全保险制度。

关键词：近视综合预防健康教育学生

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肝片吸虫蚴虫的形态学及分子学鉴定

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畜牧与兽医 2016年第6期48卷 6-9页

作者：郭明佳陈刚唐洁李英青海大学农牧学院动物医学系青海西宁810016

为了找到青海地区肝片吸虫(Fasciola hepatica)的主要中间宿主,并对椎实螺(Lymnaeidae snails)体内的蚴虫进行虫种鉴定。对青海部分地区的椎实螺进行压片镜检,结果发现椭圆萝卜螺(Radix swinhoei)内无肝片吸虫蚴虫感染。狭萝卜螺(Radix ... 详细信息

为了找到青海地区肝片吸虫(Fasciola hepatica)的主要中间宿主,并对椎实螺(Lymnaeidae snails)体内的蚴虫进行虫种鉴定。对青海部分地区的椎实螺进行压片镜检,结果发现椭圆萝卜螺(Radix swinhoei)内无肝片吸虫蚴虫感染。狭萝卜螺(Radix lagotis)体内发现雷蚴,雷蚴为肝片吸虫的蚴虫,但是感染率较低为10%。青海萝卜螺(Radix cucnnorica)体内发现了雷蚴和尾蚴,并在养殖青海萝卜螺的水中青菜叶子上收集到囊蚴,经初步鉴定均为肝片吸虫的蚴虫,感染率较高为41.89%。主要中间宿主螺为青海萝卜螺。提取蚴虫体内DNA,通过PCR扩增18S rRNA片段并测序。将测序用DNAMAN软件进行比对后发现,与Gen Bank中发布的大片吸虫(Fasciola gigantica)和肝片吸虫的18S rRNA的序列进行比对其相似度分别为99.12%和92.03%。可以进一步确定所收集的蚴虫为肝片吸虫的蚴虫。

关键词：椎实螺感染率 18S rRNA 肝片吸虫

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