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Genomics and introgression： Discovery and mapping of thousands of species-diagnostic SNPs using RAD sequencing

Current Zoology 2015年第1期61卷 146-154页

作者： Brian K. HAND Tyler D. HETHER Ryan P. KOVACH Clint C. MUHLFELD Stephen J. AMISH Matthew C. BOYER sean M. O'ROURKE michael R. MILLER Winsor H. LOWE Paul A. HOHENLOHE Gordon LUIKART Flathead Lake Biological Station Fish and Wildlife Genomics Group University of Montana Poison MT 59860 USA Institute for Bioinformatics and Evolutionary Studies Department of Biological Sciences University of Idaho Moscow ID 83844 USA U. S. Geological Survey Northem Rocky Mountain Science Center Glacier National Park West Glacier Montana 59936 USA Fish and Wildlife Genomics Group Division of Biological Sciences The University of Montana Missoula Montana 59812USA Montana Fish Wildlife and Parks Kalispell Montana 59901 USA Department of Animal Science University of California Davis One Shields Avenue Davis CA 95616 USA University of Montana Division of Biological Sciences Missoula Montana 59812 USA

Invasive hybridization and introgression pose a serious threat to the persistence of many native species. Understand- ing the effects of hybridization on native populations （e.g., fitness consequences） requires numerous species-diagnostic loci dis- tributed genome-wide. Here we used RAD sequencing to discover thousands of single-nucleotide polymorphisms （SNPs） that are diagnostic between rainbow trout （RBT, Oncorhynchus mykiss）, the world＇s most widely introduced fish, and native westslope cutthroat trout （WCT, （9. clarkii lewisi） in the northern Rocky Mountains, USA. We advanced previous work that identified 4,914 species-diagnostic loci by using longer sequence reads （100 bp vs. 60 bp） and a larger set of individuals （n = 84）. We sequenced RAD libraries for individuals from diverse sampling sources, including native populations of WCT and hatchery broodstocks of WCT and RBT. We also took advantage of a newly released reference genome assembly for RBT to align our RAD loci. In total, we discovered 16,788 putatively diagnostic SNPs, 10,267 of which we mapped to anchored chromosome locations on the RBT genome. A small portion of previously discovered putative diagnostic loci （325 of 4,914） were no longer diagnostic （i.e., fixed between species） based on our wider survey of non-hybridized RBT and WCT individuals. Our study suggests that RAD loci mapped to a draft genome assembly could provide the marker density required to identify genes and chromosomal regions in- fluencing selection in admixed populations of conservation concern and evolutionary interest [Current Zoology 61 （1）： 146-154, 2015].

关键词： Conservation genetics Hybridization Invasive species Next generation sequencing Salmonid fish SNP discovery

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A mimic of soft tissue infection: intra-arterial injection drug use producing hand swelling and digital ischemia

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World Journal of Emergency Medicine 2015年第3期6卷 233-236页

作者： sean D.Foster michael S.Lyons Christopher M.Runyan Edward J.Otten Department of Emergency Medicine University of Cincinnati Department of Plastic Reconstructive & Hand Surgery University of Cincinnati

BACKGROUND: Inadvertent intra-arterial injection of illicit substances is a known complication of injection drug use and can lead to severe complications, including infection, ischemia and compartment syndrome. Identifying complications of intra-arterial injection can be difficult, as clinical manifestations overlap with other more common conditions such as cellulitis and soft tissue infection, and a history of injection drug use is frequently not ***: A 37-year-old male patient presented with 24 hours of right hand pain, erythema and swelling. Despite classic "track marks", he denied a history of injection drug use, and vascular insults were not initially considered. After failing to respond to three days of aggressive treatment for suspected deep-space infection, an arteriogram demonstrated findings consistent with digital ischemia of embolic ***: As a result of the delay in diagnosis, the lesion was not amenable to reperfusion and the patient required amputation of the distal ***: Practitioners should be alert to the possibility of intra-arterial injection and resulting complications when evaluating unusual extremity infections or unexplained ischemic symptoms, even in the absence of a definite history of injection drug use.

关键词： Intra-arterial injection Opioid abuse Injection drug use Digital ischemia

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视觉维生素

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汽车生活 2011年第9期 116-117页

作者： Randerla sean michael Beolchini 张娟

当知道兰博基尼现在推出Gallardo的＂双色＂特别版本时,我问自己：那有多出奇、多吸引眼球呢？应该只比你在沙漠找到一堆黄沙,抑或在动物园邂运一头大象多一点点惊喜吧？这特别版车款提供Giallo Midas、ArancioBorealis、Grigio Telesto... 详细信息

当知道兰博基尼现在推出Gallardo的＂双色＂特别版本时,我问自己：那有多出奇、多吸引眼球呢？应该只比你在沙漠找到一堆黄沙,抑或在动物园邂运一头大象多一点点惊喜吧？这特别版车款提供Giallo Midas、ArancioBorealis、Grigio Telesto、Bianco

关键词：维生素视觉 Midas 兰博基尼动物园眼球大象

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泰国Khao Yai国家公园豹猫和云豹的生态和保护(英文)

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动物学报 2007年第1期53卷 1-14页

作者： sean C.AUSTIN michael E.TEWES Lon I.GRASSMAN Jr. Nova J.SILVY Caesar Kleberg Wildlife Research Institute MSC 218700 University Blvd.Texas A&M University-KingsvilleKingsvilleTX 78363USA Department of Wildlife and Fisheries Sciences 210 Nagle HallTexas A&M UniversityCollege StationTX 77843USA

于1997年10月到1999年10月在泰国KhaoYai国家公园对两种同域分布的物种(即豹猫和云豹)进行了研究。使用带诱饵的陷阱捕捉了这些动物,进行麻醉,确定了性别、年龄,并戴上了无线电项圈,对6只雌性豹猫和4只雄性豹猫进行了1-18个月的无线电... 详细信息

于1997年10月到1999年10月在泰国KhaoYai国家公园对两种同域分布的物种(即豹猫和云豹)进行了研究。使用带诱饵的陷阱捕捉了这些动物,进行麻醉,确定了性别、年龄,并戴上了无线电项圈,对6只雌性豹猫和4只雄性豹猫进行了1-18个月的无线电追踪。豹猫在干旱季节的利用区域大于雨季,雄性利用的区域大于雌性。在夜间和晨昏时节,豹猫活动增加,但是并没有节律性活动。所有豹猫个体在旱季和雨季的活动都相似,但雄性个体的白天活动多于雌性。豹猫的行走距离有性别差异但是没有季节差异;其食物以鼠类为主。分别对1只雌性云豹和1只雄性云豹进行了17个月和7个月的无线电追踪,雌性个体的活动面积为39.4km2,而雄性个体活动面积为42.2km2,核心区都是2.9km2。云豹对半绿林的使用大于其它类型的植被,在晨昏和夜间的活动增加。

关键词：云豹豹猫保护生态泰国

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双电源信号电平转换的优势

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电子产品世界 2004年第04B期11卷 63-64页

作者： sean Clark michael J. Rauth Fairchild Semiconductor Fairchild Semiconductor

很多电子系统继续向更低的电压信号水平转移.这个发展潮流背后的动力是对减少功耗的需求.更快的整流速度和降低信号噪声等方面的进步既方便了设计者,也向他们提出了新的挑战.

关键词：过压容限双轨转换器信号电平转换双电源器件

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泰国Khao Yai国家公园豹猫的道路生态学(英文)

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动物学报 2007年第2期53卷 373-377页

作者： sean C. AUSTIN michael E. TEWES Lon I. GRASSMAN Jr Nova J. SILVY Feline Research Program Caesar Kleberg Wildlife Research Institute MSC 218700 University Blvd. Texas A&M University-Kingsville Kingsville TX 78363 USA Department of Wildlife and Fisheries Sciences 210 Nagle Hall Texas A&M University College Station TX 77843 USA

为了解道路对豹猫(Prionailurus bengalensis)空间生态和时间生态的影响,使用无线电追踪技术对6只雌性个体和4只雄性个体进行了为期1-18个月的监测。道路上的车辆主要在白天出现,似乎不影响豹猫的位置或活动,即便在周末或假期车辆增加时... 详细信息

为了解道路对豹猫(Prionailurus bengalensis)空间生态和时间生态的影响,使用无线电追踪技术对6只雌性个体和4只雄性个体进行了为期1-18个月的监测。道路上的车辆主要在白天出现,似乎不影响豹猫的位置或活动,即便在周末或假期车辆增加时,情形也是如此。需要更多的研究来确定本文报道的结果是否代表了该物种的整体情况,或者仅仅特定于Kao Yai国家公园。

关键词：豹猫道路生态学泰国

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Physiological effects of nickel chloride on the freshwater cyanobacterium <i>Synechococcus</i>sp. IU 625

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Advances in Bioscience and Biotechnology 2013年第7期4卷 10-14页

作者： Brian Nohomovich Bao T. Nguyen michael Quintanilla Lee H. Lee sean R. Murray Tin-Chun Chu Department of Biological Sciences Seton Hall University South Orange USA Department of Biology & Molecular Biology Montclair State University Montclair USA Department of Biology California State University Northridge Northridge USA

Harmful algal blooms (HABs) are a serious environmental problem globally. The ability of cyanobacteria, one of the major causative agents of HABs, to grow in heavy metal polluted areas is proving a challenge to environmental restoration initiatives. Some cyanobacteria secrete toxins, such as microcystin, that are potentially dangerous to animals and humans. In this study, the physiology of a cyanobacterium was assessed to nickel chloride exposure. Cell growths were monitored throughout the study with various nickel chloride concentrations (0, 10, 25 or 50 mg/L). Morphological abnormalities were observed with microscopic image analyses. Inductively coupled plasma mass spectrometry (ICP-MS) was carried out to trace the distribution of nickel during the growth period. This study provides insight on potential nickel response mechanisms in freshwater cyanobacteria, which may lead to effective HAB prevention strategy development.

关键词： Harmful Algal Blooms (HABs) Cyanobacteria Nickel Chloride Stress Response ICP-MS

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探索MOOC教学方法在mLearning中的运用

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中国远程教育 2012年第5期 23-29页

作者： Inge DE Waard Apostolos Koutropoulos Nilgün zdamar Keskin sean C.Abajian Rebecca Hogue C.Osvaldo Rodriguez michael sean Gallagher 何伏刚马东明孙海民比利时热带医学研究所美国麻省大学波士顿校区土耳其阿纳多卢大学美国加州州立大学北岭分校加拿大渥太华大学阿根廷拉普拉塔国立大学英国爱丁堡大学北京师范大学教育学部中国人民公安大学信息安全工程系河北民族师范学院网络信息中心

本文把大型开放式网络课程(Massively Open Online Course,以下简称MOOC)作为适应移动学习(mLearning)的一种可能的教学方法,这种教学方法建立在与当前学习或教学形式相适宜的基础上。本文呈现了一个MobiMOOC应用的案例研究,该案例使用M... 详细信息

本文把大型开放式网络课程(Massively Open Online Course,以下简称MOOC)作为适应移动学习(mLearning)的一种可能的教学方法,这种教学方法建立在与当前学习或教学形式相适宜的基础上。本文呈现了一个MobiMOOC应用的案例研究,该案例使用MOOC形式创建一门课程,研究展示了MOOC和mLearning之间的协同特性,并将当前数字化的协作学习和知识建构这两个理想领域结合在一起。MobiMOOC是聚焦于mlearning、为期六周的网上课程,于2011年的4月到5月之间进行。MobiMOOC是免费开放的课程,有556位学习者加入了课程谷歌群组。课程结束时的调查结果有力地证明了MOOCs和mLearning之间的协同作用。本篇论文对时间和地点的独立性、情境学习、协作学习、潜在的跨学科信息交流,以及应用于网上学习的技术,如社交媒体,移动设备等方面进行了探讨。

关键词：移动学习大型开放式网络课程(MOOC) 联通主义协作学习开放教育资源

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哈德逊广场10号与30号美国纽约州纽约市

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世界建筑导报 2018年第6期33卷 64-67页

作者： michael Moran(摄影) Pamela Pasco(摄影) sean Zaccheo(摄影) Martin Tang(摄影) 无不详 uap

彩釉玻璃的组合从哈德逊广场10号与30号大楼最高处向下延伸至它们与高线公园的交界处。后者启发了我们使用丰富的天然材质以便为两栋大楼打造引人注目的入口。10号楼与30号楼位于纽约市哈德逊广场东区,与曼哈顿西区主流的类型建筑直接... 详细信息

彩釉玻璃的组合从哈德逊广场10号与30号大楼最高处向下延伸至它们与高线公园的交界处。后者启发了我们使用丰富的天然材质以便为两栋大楼打造引人注目的入口。10号楼与30号楼位于纽约市哈德逊广场东区,与曼哈顿西区主流的类型建筑直接相连。设计团队受街区现状与未来发展趋势的启发,采用数字科技及传统的制造方法来表现大楼所用材质。

关键词：纽约市美国纽约州广场天然材质彩釉玻璃发展趋势数字科技交界处

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Disruption of Drug Effects (Dopamine, Nicotine, Pilocarpine, κ-Opioid) in Planarians by UV Light

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Pharmacology & Pharmacy 2012年第3期3卷 358-363页

作者： Robert B. Raffa Christopher S. Tallarida Aruj Choudhry Nadia Sanni-Adam sean McGonigle michael Baron Zhuo L. Chen Scott M. Rawls Ronald J. Tallarida Department of Pharmaceutical Sciences Temple University School of Pharmacy Philadelphia PA U.S.A. Department of Pharmacology Temple University School of Medicine and Center for Substance Abuse Research Temple University Philadelphia PA U.S.A.

Based on previous work, it has been hypothesized that the energetics of ultraviolet (UV) light disrupts effects induced by receptor-binding ligands. If this hypothesis is true, then UV light should (i) disrupt a broad variety of endpoints and (ii) disrupt effects produced by ligands that bind to diverse receptor types. This was tested directly in the present study by using ligands selective for four different receptors (one ionotropic, three metabotropic) and three different behavioral endpoints. The selective dopamine D2 receptor antagonist (–)sulpiride (0.1 uM) dose-relatedly decreased spontaneous locomotor velocity, the selective nicotinic acetylcholine receptor agonist nicotine (1, 3, 5 mM) and the selective muscarinic acetylcholine receptor agonist pilocarpine (20, 30, 50 mM) induced seizure-like activity, and the selective-opioid receptor agonist U-50,488H (10 uM) produced physical dependence (manifested as abstinence-induced withdrawal) in planarian models. Each of these diverse ligand and receptor-mediated effects were attenuated by UV light (254 nm = 7.83 × 10–19 J = 4.89 eV). These findings provide further evidence that UV light disrupts ligand-receptor mediated interactions and that UV light might provide a useful tool for examining drug-receptor interactions.

关键词： UV Light Drug-Receptor Interaction Locomotor Activity Seizure Physical Dependence Planarian

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