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Transcriptional Wiring of Cell Wall-Related Genes in Arabidopsis

m.lecular Plant 2009年第5期2卷 1015-1024页

作者： marek mutwil colin ruprecht federico m. giorgi martin bringmann bjorn usadel staffan persson m.x-Planck-lnstitute for m.lecular Plant Physiology Am Muhlenberg 1 14476 Potsdam Germany

Transcriptional coordination, or co-expression, of genes m.y signify functional relatedness of the corresponding proteins. For exam.le, several genes involved in secondary cell wall cellulose biosynthesis are co-expressed with genes engaged in the synthesis of xylan, which is a m.jor com.onent of the secondary cell wall. To extend these types of analyses, we investigated the co-expression relationships of all Carbohydrate-Active enZYm.s （CAZy）-related genes for Arabidopsis thaliana. Thus, the intention was to transcriptionally link different cell wall-related processes to each other, and also to other biological functions. To facilitate easy m.nual inspection, we have displayed these interactions as networks and m.trices, and created a web-based interface （http：***） containing downloadable files for all the transcriptional associations.

关键词： Cell walls bioinform.tics Arabidopsis co-expression.

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